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计算机视觉支持的 GWAS 识别出大量毛果杨植物再生的候选调控因子
植物再生是植物繁殖的一个重要方面，也是转基因植物生产的关键步骤。然而，不同基因型和物种的再生能力差异很大，其分子基础在很大程度上是未知的。全基因组关联研究 (GWAS) 等关联作图方法早已证明能够帮助揭示植物性状变异的遗传基础；然而，这些方法的性能取决于表型分析的准确性和规模。为了对模型树杨树的植物愈伤组织和芽再生进行大规模 GWAS，我们开发了一个涉及语义分割的表型组学工作流程，以量化再生植物组织随时间的改变。我们发现得到的统计数据高度非正态分布，因此采用了变换或排列以避免违反 GWAS 中使用的线性模型的假设。我们报告了超过200个统计学上支持的数量性状基因位点（QTL），其中基因包含或接近顶级QTL，包括细胞粘附、应激信号和激素信号通路的调控因子，以及其他多种功能。我们的研究结果鼓励植物再生过程中激素信号转导模型除了通常考虑的生长素和细胞分裂素途径外，还应考虑应激相关信号（例如涉及茉莉酸和水杨酸）的关键作用。我们鉴定的假定调控基因和生物学过程为理解植物再生的生物学复杂性提供了新的见解，并可能成为改善顽固基因型和物种再生和转化的新方法。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎全部美国人口的去识别纵向数据研究了种族和族裔收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，代际差距的持续性在不同种族群体之间差异很大。例如，西班牙裔美国人在收入分配方面在代际间显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则更高，导致代际间存在巨大的收入差距。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间巨大的工资和就业率差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，家庭特征（例如父母婚姻状况、教育和财富）的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也无法解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人与白人之间的差距仍然存在。控制父母收入后，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。在低贫困地区，黑人和白人男孩的结果都更好，但在这些社区长大的男孩的黑人与白人之间的差距平均更大。黑人与白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人与白人的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
CoAt-Mixer：利用心电图检测左心室肥大的自注意力深度学习框架
左心室肥大是全因死亡和发病的重要独立危险因素，在心脏变化早期准确诊断具有重要的临床意义。心电图是初级保健中最方便、经济、无创的筛查方法。然而，实际的左心室肥大与诊断结果的符合率较低，因此人们对使用大数据和深度学习的算法的兴趣增加了。我们尝试使用大数据和深度学习算法来诊断左心室肥大，并旨在根据男性和女性的差异确认其诊断能力。这项回顾性研究使用了 2010 年 10 月至 2020 年 2 月在韩国原州延世大学原州 Severance 基督教医院获得的心电图。对左心室肥大的初步筛查进行了二元分类。实验中使用了三个数据集：男性、女性和整个数据集。二元分类的截止值定义为与筛选测试有意义的值（< 132 g/m 2 vs. 132 g/m 2 ，< 109 g/m 2 vs. 109 g/m 2 ）。分类任务使用了六种类型的输入。我们试图确定心电图是否具有对左心室肥大诊断的预测能力。对于整个数据集，该模型的受试者工作特征 (AUROC) 曲线下面积为 0.836（95% CI，0.833–838），灵敏度为 78.37%（95% CI，76.79–79.95）。对于男性数据集，AUROC 为 0.826（95% CI，0.822–830），灵敏度为 76.73%（95% CI，75.14–78.33）。对于女性数据集，AUROC 为 0.772（95% CI，0.769–775），灵敏度为 72.90%（95% CI，70.33–75.46）。我们的模型证实，左心室肥大可以在一定程度上通过心电图、人口统计学和心电图特征进行分类。特别是，我们构建了一个考虑性别差异的学习环境。因此，证实了男女之间的诊断能力差异。我们的模型将帮助疑似左心室肥大的患者以低成本接受筛查测试。此外，我们的
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
美国的种族和经济机会
我们使用 1989 年至 2015 年涵盖几乎整个美国人口的去识别纵向数据，研究了种族和民族收入差距的来源。我们记录了三组结果。首先，不同种族群体之间的代际收入差距持续性存在很大差异。例如，西班牙裔美国人的收入在代际分配中显著上升，因为他们的代际收入流动率相对较高。相比之下，黑人美国人的向上流动率远低于白人，向下流动率则高于白人，导致代际收入差距巨大。以父母收入为条件，黑人与白人的收入差距完全是由黑人和白人男性之间的工资和就业率的巨大差异造成的；黑人和白人女性之间不存在这样的差异。其次，父母婚姻状况、教育和财富等家庭特征的差异几乎无法解释以父母收入为条件的黑人与白人收入差距。能力差异也不能解释我们记录的代际流动模式。第三，即使是在同一个社区长大的男孩，黑人和白人之间的差距仍然存在。在控制父母收入的情况下，在 99% 的人口普查区，黑人男孩成年后的收入低于白人男孩。黑人和白人男孩在低贫困地区都有更好的结果，但对于在此类社区长大的男孩来说，黑人和白人之间的差距平均较大。黑人和白人之间的差距相对较小的少数地区往往是低贫困社区，白人的种族偏见程度较低，黑人的父亲在场率较高。在童年早期搬到这些社区的黑人男性收入更高，入狱的可能性更小。然而，只有不到 5% 的黑人儿童在这样的环境中长大。这些发现表明，缩小黑人和白人之间的收入差距需要做出跨越社区和阶级界限的努力，并提高黑人男性的向上流动性。
针对 las 或 pqs 群体感应的抗毒药物对囊性纤维化铜绿假单胞菌分离株的体外活性
铜绿假单胞菌引起的慢性肺部感染是囊性纤维化 (CF) 患者发病和死亡的主要原因。针对铜绿假单胞菌群体感应 (QS) 系统的抗毒力药物作为抗生素替代品或佐剂得到了深入研究。之前在非 CF 铜绿假单胞菌参考菌株中进行的研究表明，旧药物氯硝柳胺和氯福克醇可以成功地重新用作分别针对 las 和 pqs QS 系统的抗毒力药物。然而，CF 肺中频繁出现的 QS 缺陷突变体破坏了 QS 抑制剂在 CF 治疗中的应用。在这里，我们在 100 个铜绿假单胞菌 CF 分离株中研究了 QS 信号的产生和对氯硝柳胺和氯福克醇的敏感性，旨在拓宽目前对抗 QS 化合物在 CF 治疗中的潜力的认识。结果表明，我们收集的 CF 分离株中分别有 85%、78% 和 69% 能够熟练使用 pqs、rhl 和 las QS 系统。氯硝柳胺和氯福克醇在体外抑制 QS 和毒力的能力差异很大且因菌株而异。氯硝柳胺的活性范围总体较低，其对 las 信号产生的负面影响与毒力因子产生的减少无关。另一方面，氯福克醇在 CF 分离株中表现出更广泛的 QS 抑制作用，从而降低 pqs 控制的毒力因子绿脓菌素。总体而言，这项研究强调了在进行进一步的临床前研究之前针对大量铜绿假单胞菌 CF 临床分离株测试新型抗毒力药物的重要性，并证实了先前的证据，即 CF 分离株中存在对 QS 抑制剂具有天然耐药性的菌株。然而，研究还表明，对 pqs 抑制剂的耐药性低于对 las 抑制剂的耐药性，从而支持开发 pqs 抑制剂用于 CF 的抗毒力治疗。