。cc-by-nd 4.0国际许可在A未获得Peer Review的认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人(该版本发布于2023年4月12日。; https://doi.org/10.1101/2023.02.21.529381 doi:biorxiv Preprint
与哺乳动物相比,斑马鱼可以再生其受损的感光体。这种能力取决于MüllerGlia(Mg)的内在可塑性。在这里,我们确定了转基因记者Careg是重生和心脏的标志,也参与了斑马鱼的视网膜恢复。甲基硝基库(MNU)处理后,视网膜变质并包含受损的细胞类型,包括杆,紫外线敏感锥和外丛状层。该表型与Mg子集中的Careg表达诱导有关,直到光感受器突触层的重建为止。单细胞RNA测序(SCRNASEQ)对再生视网膜的分析表明,未成熟的棒群,通过高淡有关蛋白的高表达和纤毛生成基因MEIG1的定义,但光转导基因的表达较低。此外,锥体对视网膜损伤的反应显示了对代谢和视觉感知基因的放松管制。CAREG:EGFP表达和非表达MG之间的比较表明,这两个亚群的特征是不同的分子特征,表明它们对再生程序的异源反应性。核糖体蛋白S6磷酸化的动力学表明,TOR信号逐渐从MG转换为祖细胞。用雷帕霉素抑制TOR可以降低细胞周期活性,但既不影响CAREG:MG中的EGFP表达,也没有阻止恢复视网膜结构。这表明MG重编程和祖细胞增殖可能受不同的机制调节。总而言之,Careg Reporter检测到活化的MG,并在包括视网膜在内的各种斑马器官中提供了竞争能力的细胞的共同标记。
Jonas JW Kuiper , Shumnalieva,10个秘密,11inakötter, 19,20名忠实居民,21,22NatašaVidovia,23,24和Talgal-Tutkun的折磨, 32FabianLötscher,33 Floor G Schance, 28,29 Ahmet Gul,40 John Bowes ,41,42 Rik Ju Loris ,19.20 MHC-I-Opathies研究
。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年3月15日。 https://doi.org/10.1101/2023.02.21.529381 doi:Biorxiv Preprint
1。引言氯胺酮(KET)由Calvin Stevens于1962年合成为麻醉剂,最初由Corssen&Domino在1965年使用。自1970年代以来,它已被广泛用于临床实践[1]。这是唯一具有催眠(诱导睡眠),镇痛(疼痛降低)和失忆症(短期记忆丧失)影响的药物;因此,它是一种“独特的药物” [1]。它通过非竞争性阻断N-甲基-D-天冬氨酸和谷氨酸受体的非竞争性阻断导致了解离性麻醉[2]。它被广泛使用,尤其是在儿童中,由于其快速发作,功能持续时间短,血液动力学安全性,上呼吸道反射保护,缺乏呼吸道抑郁和强大的镇痛特性。目前,它甚至被用作阿片类药物诱发的呼吸道抑郁症拮抗剂,用于治疗慢性疼痛和耐药性抑郁症[2-6]。
信用著作贡献声明萨曼莎·史密斯(Samantha M. Smith),首席作者。Software, Formal analysis, Investigation, Data curation, Writing, Review and Editing, Visualization, Project Administration Elena L. Garcia , Formal analysis, Investigation, Writing, Visualization Caroline G. Davidson , Formal analysis, Writing, Visualization John Thompson , Investigation Sarah D. Lovett , Investigation Nedi Ferekides , Investigation, Formal Analysis, Visualization Quinten Federico , Investigation Argyle V. Bumanglag , Supervision Abbi R. Hernandez,调查,审查和编辑,可视化,项目管理和执行Jose F. Abisambra,概念化,资源,审查和编辑,资助收购Sara N. Burke,相应的作者。概念化,方法,资源,审查和编辑,项目管理,资金获取
摘要:脑组织分割是使用多模态磁共振成像 (MR) 进行脑部疾病临床诊断的重要组成部分。文献中已通过许多无监督方法开发了脑组织分割。最常用的无监督方法是 K 均值、期望最大化和模糊聚类。与上述方法相比,模糊聚类方法具有相当大的优势,因为它们能够处理复杂、不确定性很大且不精确的脑图像。然而,这种方法存在数据采集过程中固有的噪声和强度不均匀性 (IIH)。为了解决这些问题,我们提出了一种模糊共识聚类算法,该算法定义了一个由投票方案产生的成员函数来对像素进行聚类。具体来说,我们首先预处理 MRI 数据,并采用基于传统模糊集和直觉集的几种分割技术。然后,我们采用投票方案来融合应用的聚类方法的结果。最后,为了评估所提出的方法,我们在两个公开可用的数据集(OASIS 和 IBSR18)上使用了众所周知的性能指标(边界测量、重叠测量和体积测量)。实验结果表明,与最近的最新技术相比,所提出的方法具有更优越的性能。所提出方法的性能还使用现实世界的自闭症谱系障碍检测问题进行了展示,与其他现有方法相比,其准确率更高。
a 爱尔兰都柏林圣文森特大学医院都柏林大学学院临床研究中心 b 澳大利亚和新西兰重症监护研究中心,莫纳什大学,墨尔本,维多利亚,澳大利亚 c 重症监护和高压氧医学系,阿尔弗雷德医院,墨尔本,维多利亚,澳大利亚 d 澳大利亚维多利亚州帕克维尔皇家墨尔本医院神经外科系 e 澳大利亚维多利亚州帕克维尔墨尔本大学外科系 f 澳大利亚维多利亚州帕克维尔皇家墨尔本医院重症监护室 g 澳大利亚维多利亚州墨尔本大学医学和放射学系 h 澳大利亚昆士兰州赫斯顿皇家布里斯班妇女医院重症监护系 i 澳大利亚新南威尔士州悉尼 Kogarah Gray 街圣乔治医院重症监护室 j 瑞士伯尔尼大学伯尔尼大学医院 Inselspital 重症监护医学系 k 澳大利亚维多利亚州墨尔本莫纳什大学电气与计算机系统工程系 l阿尔弗雷德医院神经外科,墨尔本,维多利亚,澳大利亚 m 莫纳什大学中央临床学院,墨尔本,维多利亚,澳大利亚 n 科廷大学皇家珀斯医院重症监护系,珀斯,西澳大利亚州,澳大利亚 o 剑桥大学阿登布鲁克医院麻醉科,英国剑桥 p 皇家阿德莱德医院重症监护室,阿德莱德南澳大利亚州 5000,港口路,澳大利亚阿德莱德 q 阿德莱德大学医学院,阿德莱德,南澳大利亚州,澳大利亚 r 新西兰医学研究所,惠灵顿,新西兰 s 惠灵顿地区医院重症监护室,惠灵顿,新西兰 t 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院神经病学系和脑损伤与修复中心,费城,宾夕法尼亚州 u 匹兹堡大学医学院/UPMC 医疗系统重症监护医学系,匹兹堡,宾夕法尼亚州,美国 v 都柏林大学学院医学院,都柏林,爱尔兰 w 临床研究爱尔兰都柏林大学学院中心、爱尔兰 Mater Misericordiae 大学医院肾脏病科 x 爱尔兰皇家外科医学院麻醉与重症监护系、爱尔兰都柏林博蒙特医院 y 爱尔兰皇家外科医学院神经外科系、爱尔兰都柏林
3D 偏振光成像 (3D-PLI) 方法测量组织学脑切片的双折射以确定神经纤维 (髓鞘轴突) 的空间走向。虽然可以高精度地确定平面内纤维方向,但计算平面外纤维倾角更具挑战性,因为它们是从双折射信号的幅度中得出的,而双折射信号的幅度取决于神经纤维的数量。提高精度的一种可能性是考虑平均透射光强度 (透射加权)。当前程序需要费力地手动调整参数和解剖知识。在这里,我们引入了一种自动化、优化的纤维倾角计算,从而可以更快、更可重复地确定 3D-PLI 中的纤维方向。根据髓鞘的程度,该算法使用不同的模型 (透射加权、不加权或线性组合),从而可以考虑区域特定行为。由于该算法是并行的和 GPU 优化的,因此可以应用于大型数据集。此外,它仅使用标准 3D-PLI 测量的图像(无倾斜),因此可以应用于以前测量的现有数据集。此功能已在黑长尾猴和大鼠脑的未染色冠状和矢状组织切片上得到验证。
摘要 1 H MRI 通过利用组织微环境中的不均匀性的多功能对比,非侵入性地映射大脑结构和功能。然而,由于 MRI 信号和细胞结构之间缺乏直接联系,从磁共振成像 (MRI) 结果推断组织病理学信息仍然具有挑战性。在这里,我们展示了使用小鼠大脑的共配准多对比 MRI 和组织学数据开发的深度卷积神经网络,可以直接从每个体素的 MRI 信号估计组织学染色强度。结果提供了轴突和髓鞘的三维图,其组织对比与目标组织学非常相似,并且与传统 MRI 标记相比具有增强的灵敏度和特异性。此外,网络内每个 MRI 对比的相对贡献可用于优化多对比 MRI 采集。我们预计我们的方法将成为将 MRI 结果转化为神经生物学家易于理解的虚拟组织学的起点,并为验证新型 MRI 技术提供资源。
