6.1黄素腺嘌呤二核苷酸的结构。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。39 6.2不同相互作用幅度的对数图。。。。。。。。。。42 6.3 FAD自由基对系统的单线产量。。。。。。。。。。。。。。。。。。45 6.4 FAD分子的开放和闭合构型。。。。。。。。。。。46 6.5腺嘌呤和异丙沙嗪环之间的距离。。。。。。47 6.6 FAD光化学反应方案。。。。。。。。。。。。。。。。。。48 6.7单线和三重状态的时间演变。。。。。。。。。。。。。。。。。51 6.8瞬态吸收∆ a的时间曲线(b = 20mt,t)。。。。。。。。。。。。。53 6.9计算的FAD和实验MFE。。。。。。。。。。。。。。。。。。54 S.1电子偶极 - 偶极耦合和其他相互作用的幅度。。。58 S.2不同HFCC的MFE曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。 。 。 。 。 59 S.4信号的时间曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 59 S.5单线收益。 。58 S.2不同HFCC的MFE曲线。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。 。 。 。 。 59 S.4信号的时间曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 59 S.5单线收益。 。58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。。。。。59 S.4信号的时间曲线。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。59 S.5单线收益。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。60 S.6腺嘌呤和异丙沙嗪环质量中心之间的平均版本。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。60 S.7非对角线术语的时间演变。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。61
范可尼贫血 (FA) 是一种使人衰弱的遗传性疾病,具有多种严重症状,包括骨髓衰竭和癌症易感性。CRISPR-Cas 基因组编辑通过利用 DNA 修复来操纵基因型,并已被提议作为 FA 的潜在治疗方法。但 FA 是由 DNA 修复本身的缺陷引起的,从而阻止使用同源定向修复等编辑策略。最近开发的碱基编辑 (BE) 系统不依赖于双链 DNA 断裂,可能用于靶向 FA 基因中的突变,但这仍有待测试。在这里,我们开发了一种概念验证治疗性碱基编辑策略,以解决患者造血干细胞和祖细胞中最常见的两种 FANCA 突变。我们发现,优化腺嘌呤碱基编辑器构建体、载体类型、向导 RNA 格式和递送条件可在多种 FA 患者背景中产生非常有效的基因修饰。优化的碱基编辑恢复了 FANCA 表达、FA 通路的分子功能以及对交联剂的表型抗性。ABE8e 介导的编辑在 FA 患者的原代造血干细胞和祖细胞中既具有基因型有效性,又恢复了 FA 通路功能,表明碱基编辑策略在未来 FA 临床应用中具有潜力。
血色素沉着症是白人种群中最常见的遗传代谢疾病之一,主要起源于HFE基因中的纯合C282Y突变。g>在基因的845位置的转变会导致HFE蛋白的折叠折叠,最终导致其在细胞膜上不存在。因此,与转素受体1和2缺乏相互作用导致系统性铁超载。我们在高度精确的细胞培养分析中筛选了潜在的GRNA,并应用了表达腺嘌呤基础编辑器ABE7.10的AAV8拆分矢量,并在129- HFE TM.1.1.1NCA小鼠中筛选了我们的候选GRNA。在这里,我们表明我们的治疗载体单次注射导致基因校正率> 10%,并且肝脏中铁代谢的改善。我们的研究提出了针对影响人类最常见的遗传疾病之一的靶向基因矫正疗法的概念验证。
摘要 碱基编辑有可能改善农业中的重要经济性状,并且可以精确地将 DNA 或 RNA 序列中的单个核苷酸转换为最小的双链 DNA 断裂 (DSB)。腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 是最近出现的用于将目标 A:T 转换为 G:C 的碱基编辑工具,但尚未在绵羊身上使用。ABEmax 是 ABE 的最新版本之一,它由催化受损的核酸酶和实验室进化的 DNA 腺苷脱氨酶组成。骨形态发生蛋白受体 1B (BMPR1B) 基因中的 Booroola 繁殖力 (FecB B) 突变 (g.A746G, p.Q249R) 会影响许多绵羊品种的繁殖力。在本研究中,通过使用 ABEmax,我们成功获得了具有确定点突变的羔羊,这些突变导致氨基酸替换 (p.Gln249Arg)。在新生羔羊中,定义的点突变效率为 75%,因为六只羔羊在 FecB B 突变位点 (g.A746G, p.Q249R) 处为杂合子,两只羔羊为野生型。我们在八只经过编辑的羔羊中未检测到脱靶突变。在此,我们报告了由 ABE 生成的首只基因编辑绵羊的验证,并强调了其改善牲畜经济重要性状的潜力。
1 苏黎世大学药理学和毒理学研究所,瑞士苏黎世。2 Acuitas Therapeutics Inc.,加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华。3 Oncode 研究所,马克西玛公主儿科肿瘤中心,荷兰乌得勒支。4 苏黎世功能基因组学中心,苏黎世联邦理工学院/苏黎世大学,瑞士苏黎世。5 苏黎世联邦理工学院分子健康科学研究所生物系,瑞士苏黎世。6 苏黎世大学医院和大学病理学和分子病理学系,瑞士苏黎世。7 苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系,瑞士苏黎世。8 Synthego Corporation,美国加利福尼亚州雷德伍德城。9 苏黎世大学生物化学系,瑞士苏黎世。10 苏黎世联邦理工学院基因组工程与测量实验室,瑞士苏黎世。 11 宾夕法尼亚大学医学系,美国宾夕法尼亚州费城。12 苏黎世大学儿童医院代谢与儿童研究中心分部,瑞士苏黎世。13 苏黎世综合人体生理学中心,瑞士苏黎世。14 苏黎世神经科学中心,瑞士苏黎世。15 苏黎世大学分子生命科学研究所,瑞士苏黎世。✉ 电子邮件:ssemple@acuitastx.com;schwank@pharma.uzh.ch
1 法国巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所染色质和发育过程中基因调控实验室;2 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗临床研究中心;3 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所人类淋巴造血实验室;4 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗系;5 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所生物信息学平台;6 意大利米兰圣拉斐尔科学研究所 (IRCCS) 里维埃拉与克拉特雷松基因治疗研究所 (SR-TIGET); 7 生命健康圣拉斐尔大学,米兰,意大利
图 1. NAD + 生物合成和补救。生物体 NAD + 来自饮食前体来源,以蓝色矩形背景表示。NAD + 前体通过犬尿氨酸(黄色)和 Preiss-Handler(橙色)生物合成途径流动或被纳入补救途径(灰色)。大部分细胞 NAD + 来自补救途径。NAD + 被 PARP 和 sirtuins 等酶作为底物(补救途径中的星号)消耗。KYNU、HAAO 和 NADSYN1 基因的功能丧失突变(编码生物合成途径中的酶)导致 NAD + 耗竭和 CNDD。
主要的文献参考和用于编译SDS毒物和疾病注册机构(ATSDR)的数据来源 Environmental Protection Agency Federal Insecticide, Fungicide, and Rodenticide Act U.S. Environmental Protection Agency High Production Volume Chemicals Food Research Journal Hazardous Substance Database International Uniform Chemical Information Database (IUCLID) National Institute of Technology and Evaluation (NITE) Australia National Industrial Chemicals Notification and Assessment Scheme (NICNAS) NIOSH (National Institute for Occupational Safety and Health) National Library of Medicine's ChemID Plus (NLM CIP) National Library of Medicine's PubMed数据库(NLM PubMed)美国国家毒理学计划(NTP)新西兰的化学分类和信息数据库(CCID)经济合作与发展环境,健康和安全出版物的经济合作与开发的安全出版物组织高生产力化学批量化学批量的经济合作和发展筛查信息筛查信息数据集
。CC-BY 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供(未经同行评审认证),作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2024 年 12 月 13 日发布了此版本。;https://doi.org/10.1101/2024.12.10.627690 doi:bioRxiv 预印本
败血症被识别为一种临界疾病,其特征是威胁生命的急性器官功能障碍,这是由宿主对感染的失调反应引起的(Singer等人。,2016年)。认识到败血症的重力,2017年,包括世界卫生大会和世界医疗保健组织在内的全球卫生组织将其检测,预防和治疗优先考虑全球(Reinhart等人(Reinhart等),2017年; Paoli等。,2018年)。估计败血症会影响4-6%的成人住院入院(Rhee等人 ,2017年; Giamarellos-Bourboulis等。 ,2023; Mellhammar等。 ,2023年),在重症监护病房中约有三分之一的患者(ICU)中发现(Sakr等人 ,2018年)。 仅在2017年,全球近4900万人就受到了败血症的影响,有1100万人屈服于这种情况,表明死亡率约为20%(Rudd等人。 ,2020)。 尤其是在美国,每年大约有170万例败血症病例,这种趋势每年都在增加。 这种情况仅在美国每年造成近25万人死亡,这使败血症成为非心脏ICU死亡的主要原因(Vincent等人。 ,2009年; Rhee等。 ,2017年)。 尽管从2002年到2012年,败血症患者对欧洲医院的ICU持续稳定,但该疾病的严重程度显着增加(Vincent等人。 ,2018年)。 死亡率差异很大,但据报道至少为10%,在涉及败血性休克的情况下跃升至40%(Vincent等人。 ,2014年; Rhee等。 ,2017年)。估计败血症会影响4-6%的成人住院入院(Rhee等人,2017年; Giamarellos-Bourboulis等。,2023; Mellhammar等。,2023年),在重症监护病房中约有三分之一的患者(ICU)中发现(Sakr等人,2018年)。仅在2017年,全球近4900万人就受到了败血症的影响,有1100万人屈服于这种情况,表明死亡率约为20%(Rudd等人。,2020)。尤其是在美国,每年大约有170万例败血症病例,这种趋势每年都在增加。这种情况仅在美国每年造成近25万人死亡,这使败血症成为非心脏ICU死亡的主要原因(Vincent等人。,2009年; Rhee等。,2017年)。尽管从2002年到2012年,败血症患者对欧洲医院的ICU持续稳定,但该疾病的严重程度显着增加(Vincent等人。,2018年)。死亡率差异很大,但据报道至少为10%,在涉及败血性休克的情况下跃升至40%(Vincent等人。,2014年; Rhee等。,2017年)。,2018年),当未经处理的败血症时,超过30%(Liu等人此外,败血症治疗的财务负担很大。在美国,败血症管理的医院费用在所有疾病中最高,2011年超过200亿美元,2013年超过230亿美元,持续的成本超过240亿美元,占美国医疗保健总支出的13%(Arefian等人。,2017年; Reinhart等。,2017年; Paoli等。,2018年; Buchman等。,2020)。