XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System腺癌
BRD9-SMAD2/3在胰腺导管腺癌中编排的干性和肿瘤发生
这是CC下的开放访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）。通讯：地址：纳菲尔德骨科，风湿病学和肌肉骨骼科学系，牛津大学骨质医学和肌肉骨骼科学系的Siim Pauklin，博士学位，博特纳尔研究中心，牛津大学，旧路，霍丁顿，牛津牛津奥克斯，牛津奥克斯37LD，英国王国。siim.pauklin@ndorms.ox.ac.uk;或Wei Huang，医学博士，博士，心脏，肺和血管研究所，内科，辛辛那提大学心血管健康与疾病科，俄亥俄州辛辛那提大学45267。Huangwe@ucmail.ucmail.uc.uc.edu;或广东省人民医院（广东省医学院医学院），广东心血管研究所心脏病学系医学博士Lei Jiang，医学博士，博士学位。jianglei0731@gmail.com;或辛辛那提大学医学院病理学和实验室医学系医学博士Yigang Wang，俄亥俄州辛辛那提大学医学院45267。Wanyy@ucmail.uc.uc.edu。*作者共享联合第一作者身份。
肺腺癌与特发性肺纤维化共享基因和信号通路的探索
特发性肺纤维化（IPF）是一种原因不明的慢性、进行性、纤维化间质性肺疾病（ILD）（1）。IPF患者确诊后的中位生存期为3-5年（2）。IPF的主要特征之一是激活的肺成纤维细胞和肌成纤维细胞过度沉积细胞外基质（ECM）蛋白，导致气体交换减少，最终导致呼吸衰竭（3-5）。一项流行病学研究报告显示，IPF的发病率为每10,000人0.09人，患病率为1.30人（6）。IPF患者除了病情进一步进展导致的急性加重（AE）和慢性呼吸衰竭外，肺癌（LC）的发生也是该类患者死亡的主要原因之一（7）。研究报告称，大多数肿瘤通常位于下叶和肺周围，70% 的癌症出现在胸部纤维化区域 (8)。此外，研究表明，活化的间充质细胞在癌症和纤维化中起着至关重要的作用 (9)。其他研究也表明，IPF 的病理生理学与 IPF 患者腺癌恶性程度增加有关。然而，关于潜在过程的许多信息仍然未知。
肿瘤内微生物群落的特征反映了肺腺癌的发展
一些研究表明，某些mRNA分子与LUAD患者的进展有关（Chen等，2019）。Dong等。 （2021）发现，在肺癌患者中ZLC5被上调，其高表达预测了较短的总生存期（P = 0.007），并且作为肺癌的独立预后标记，HR = 2.892； 95％（Yang等，2021）CI：1.297–6.449; p = 0.009;张等。 （2019）发现，九个mRNA基因（HMMR，B4GALT1，SLC16A3，ANGPTL4，EXT1，GPC1，RBCK1，SOD1和AGRN）与肺癌患者的总生存率有关。 通过多元COX回归分析，九个基因特征的预后能力高于临床信息。 Xin等。 （2019）发现，肺癌患者中COX-2，CPLA2，COX-1，MPGES，PGE2和PGI2的mRNA水平明显高于健康人的MRNA，尤其是在MPGES和PGI2高表达的患者中。 5年生存率低于低表达MPGE和PGI2的患者，并且对于肺癌的预后具有统计学意义。 尽管一些研究已经确定了一些用于预测肺癌的分子标记，但由于单个OMICS缺乏信息，仍然很难实现高精度预测（Shi等，2022）。 同时，对患者组织微生物组状态的相关研究和预测评估仍然存在。Dong等。（2021）发现，在肺癌患者中ZLC5被上调，其高表达预测了较短的总生存期（P = 0.007），并且作为肺癌的独立预后标记，HR = 2.892； 95％（Yang等，2021）CI：1.297–6.449; p = 0.009;张等。（2019）发现，九个mRNA基因（HMMR，B4GALT1，SLC16A3，ANGPTL4，EXT1，GPC1，RBCK1，SOD1和AGRN）与肺癌患者的总生存率有关。通过多元COX回归分析，九个基因特征的预后能力高于临床信息。 Xin等。（2019）发现，肺癌患者中COX-2，CPLA2，COX-1，MPGES，PGE2和PGI2的mRNA水平明显高于健康人的MRNA，尤其是在MPGES和PGI2高表达的患者中。5年生存率低于低表达MPGE和PGI2的患者，并且对于肺癌的预后具有统计学意义。尽管一些研究已经确定了一些用于预测肺癌的分子标记，但由于单个OMICS缺乏信息，仍然很难实现高精度预测（Shi等，2022）。同时，对患者组织微生物组状态的相关研究和预测评估仍然存在。
胰腺腺癌的分子分类和发病机制以及靶向治疗：综述
胰腺腺癌 (PDAC) 是一种 5 年生存率仅为 12% 的疾病。许多 PDAC 患者处于晚期疾病阶段，甚至早期疾病也常常以侵袭性肿瘤生物学为特征。转移性 PDAC 的标准治疗主要包括化疗方案，如 FOLFIRINOX、FOLFOX 或吉西他滨和白蛋白结合型紫杉醇。研究重点是对 PDAC 肿瘤进行测序，以更好地了解 PDAC 的突变情况和转录组学，目标是开发靶向疗法。靶向疗法可能会最大限度地降低化疗的毒性风险并提供长期生存益处。我们在此回顾了 PDAC 的潜在分子发病机制，以及根据当前测序数据创建的分类方案，以及与 PDAC 靶向治疗相关的最新更新。
利用DNA复制应力到肺腺癌中的RBM10缺乏症
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年12月6日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2023.02.19.529108 doi：Biorxiv Preprint
评估基因组分析对唾液腺癌临床试验治疗选择的价值
1 英国曼彻斯特 M20 4BX 克里斯蒂医院 NHS 基金会肿瘤内科部；sam.rack@nhs.net（SR）；h.adderley@nhs.net（HA）；laura.woodhouse3@nhs.net（LW）2 北爱尔兰癌症中心，贝尔法斯特市医院，利斯本路，贝尔法斯特 BT9 7AB，英国；laura.feeney@nhs.net 3 谢菲尔德教学医院 NHS 基金会，Glossop Road, Broomhall, 谢菲尔德 S10 2JF，英国；sonal.hapuarachi@nhs.net 4 曼彻斯特大学 NHS 基金会成人组织病理学部，牛津路，曼彻斯特 M13 9WL，英国； guy.betts@mft.nhs.uk 5 西北基因组实验室中心，曼彻斯特基因组医学中心，曼彻斯特大学 NHS 基金会信托，牛津路，曼彻斯特 M13 9WL，英国；george.burghel@mft.nhs.uk 6 皇家马斯登 NHS 基金会信托，富勒姆路，伦敦 SW3 6JJ，英国；kevin.harrington@icr.ac.uk * 通信地址：robert.metcalf1@nhs.net
星状细胞在胰腺导管腺癌中的作用：靶向透视
胰腺导管腺癌（PDAC）是一种胃肠道恶性肿瘤，临床结果令人沮丧。积累的证据表明，活化的胰腺星状细胞（PSC）是细胞外基质（ECM）的主要生产国（ECM），驱动PDAC中严重的基质/脱粒反应。此外，PSC，胰腺癌细胞（PCC）以及其他基质细胞之间的串扰可以建立PDAC的生长支持性肿瘤微环境（TME），从而增强肿瘤的生长，转移，转移和通过各种途径的化学症。最近，靶向基质已成为PDAC治疗的有前途的策略，并提出了几种新型策略。我们研究的目的是对PSC在PDAC进展中的作用以及靶向基质靶向策略的最新进展进行深入审查。
免疫检查点抑制剂治疗的临床结果，用于晚期肺腺癌
这项研究涉及从2017年11月至2021年10月在智师癌症医院诊断为肺ASC的患者的回顾性分析。所有患者均根据2021年世界卫生组织肺部肿瘤分类的标准在病理上证实了ASC（2）。所有诊断均通过免疫组织化学（IHC）分析验证。此外，根据肿瘤，节点，转移分期系统（第8版）（9），在患者中确认了IIIB，IIIC或IV阶段ASC，其东部合作肿瘤学组绩效状态（ECOG PS）为0-2。PD-L1的表达，其表达至少为1％。使用下一代测序（NGS）或放大难治性突变系统（ARM）技术进行突变的分子分析。所有患者接受了ICI治疗。该研究是根据赫尔辛基宣言（如2013年修订）进行的。该协议已获得智癌医院机构伦理委员会的批准（编号IRB-2022-187）并因研究的回顾性而放弃了书面知情同意。
肺腺癌相关靶基因预测及药物重定位
肺癌是全球癌症死亡的主要原因，而肺腺癌 (LUAD) 是最常见的肺癌类型。基因失调在 LUAD 的发展中起着至关重要的作用。基于药物靶基因和 LUAD 靶基因之间的关联进行药物重新定位有助于发现用于治疗 LUAD 的潜在新药，同时还可以降低新药发现和开发的金钱和时间成本。在这里，我们开发了一个基于机器学习的流程，通过已建立的图注意力网络 (GAT) 来预测潜在的 LUAD 相关靶基因。然后，我们通过基于基因巧合和基于基因网络距离的方法预测了用于治疗 LUAD 的潜在药物。使用来自 Cancer Genome Atlas 的 535 个 LUAD 组织样本和 59 个癌前组织样本的数据，鉴定出 48,597 个基因并用于构建 GAT 的预测模型。GAT 模型实现了良好的预测性能，受试者工作特征曲线下面积为 0.90。从GAT模型中识别出1597个潜在的LUAD相关基因。然后利用这些LUAD相关基因进行药物重新定位。计算了美国食品药品监督管理局批准的3070种药物和672种临床前化合物与靶基因的基因重叠和网络距离。其中，溴乙胺被预测为治疗LUAD的新型潜在临床前化合物，西咪替丁和苯溴马隆被预测为LUAD的潜在治疗药物。本研究建立的管线为开发LUAD的靶向疗法提供了新方法。
