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葡萄渣提取物对不同种类微生物的抗菌活性
食品行业对葡萄渣产生了浓厚的兴趣，因为它具有众多健康益处，并且含有高浓度的生物活性化学物质。本研究调查了从白葡萄和蓝葡萄的副产品中获得的葡萄渣的抗菌特性。我们研究的目的是探究蓝葡萄品种（Alibernet、Dornfelder、Cabernet Sauvignon）和白葡萄品种（Blaufränkisch、Sauvignon Blanc、Welschriesling、Weisser Riesling、Irsai Oliver、Pinot Blanc、Palava、Müller-Thurgau、Grűner Veltliner 和 Feteasca Regala）葡萄渣提取物的抗菌活性。用纸片扩散法评估了葡萄渣提取物对九种微生物（革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和酵母）的抗菌活性。发现蓝葡萄渣提取物对枯草芽孢杆菌的抗菌活性最好。白葡萄品种 Sauvignon Blanc、Welschriesling、Weisser Riesling、Irsai Oliver、Pinot Blanc 果渣提取物对枯草芽孢杆菌最有效，Müller-Thurgau 葡萄果渣提取物对 C. koseri 最有效，Grűner Veltliner 和 Feteasca Regala 对枯草芽孢杆菌最有效。最敏感的细菌是枯草芽孢杆菌。
通过微型 CRISPR 进行高效基因组编辑......
一种微型 CRISPR-Cas12f 已被证明可作为一种有效的基因组编辑工具，用于革兰氏阴性细菌和人类细胞。在这里，我们开发了一种基于来自 Acidibacillusthiosans 的 AsCas12f1 核酸酶来编辑炭疽芽孢杆菌基因组的替代方法。当选择染色体上的 htrA 基因和质粒 pXO1 上的 lef 基因作为靶标时，CRISPR-AsCas12f1 系统表现出非常高的效率（100%）。同时，大片段删除也观察到较高的效率。我们的结果还表明，供体 DNA 同源臂的长度与编辑效率密切相关。此外，我们还构建了双质粒 CRISPR-AsCas12f1 系统，并与核酸内切酶 I-SceI 结合，用于潜在的多基因修饰。这代表了炭疽芽孢杆菌和其他蜡状芽孢杆菌群细菌的突变菌株构建和基因功能分析的新工具。
有效的大规模和无疤痕基因组工程可以构建和筛选枯草芽孢杆菌生物燃料过量生产
摘要：枯草芽孢杆菌是一种多功能的微生物细胞工厂，可以生产有价值的蛋白质和增值化学物质。长片段编辑技术对于加速细菌基因组工程以获得理想且遗传稳定的宿主菌株至关重要。在这里，我们开发了一种有效的CRISPR-CAS9方法，用于枯草芽孢杆菌基因组中的大规模和无疤痕基因组工程，该方法的阳性率为100％，最多可删除高达134.3 kb的DNA片段，是先前报告的3.5倍。还研究了使用异源NHEJ系统，线性供体DNA和各种供体DNA长度对工程效率的影响。然后将CRISPR-CAS9方法用于枯草芽孢杆菌基因组简化和一系列个体和累积的缺失突变体的构建，这些突变体进一步筛选了新一代生物燃料的异丁醇过度生产剂。这些结果表明该方法是一种强大的基因组工程工具，用于构建和筛选具有增强功能的工程宿主菌株，突出了合成生物学和代谢工程的潜力。
bsgatlas：统一的枯草芽孢杆菌基因组和转录组注释图集，具有增强的信息访问
2020年7月29日收到； 2021年1月11日接受；于2021年2月4日出版：作者隶属关系：1个非编码RNA技术与健康中心，哥本哈根大学兽医和动物科学系，1871年，丹麦Frederiksberg，哥本哈根大学； 2荷兰荷兰癌症研究所的致癌基因组学司，荷兰阿姆斯特丹1066； 3哥本哈根大学生物学系计算和RNA生物学部分，丹麦哥本哈根1165；丹麦的Bagsværd4 Novozymes。*通信：Jan Gorodkin，Gorodkin@rth。DK关键字：B。uttilis;基因组注释；非编码和结构化RNA；操纵子。缩写：Asrna，反义RNA； CD，编码序列；去，基因本体论； GRNA，导向RNA； Ji，Jaccard索引； ncRNA，非编码RNA； SRNA，小RNA； TMRNA，转移Messenger RNA； TSS，转录开始站点； TTS，转录终止位点； TU，转录单元； UTR，未翻译区域。†目前地址：英国索尔福德大学科学，工程与环境学院。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用四个补充表和九个补充数据。000524©2021作者
通过其分泌的代谢物揭示枯草芽孢杆菌DSM 29784家禽益生菌的好处：一种体外方法
摘要益生菌枯草芽孢杆菌29784（BS29784）通过生物活性代谢物低黄嘌呤（HPX），烟酸（NIA）（NIA）和Pantothenate（PTH）来维持鸡的肠道健康，从而增强动物的韧性和性能。在这里，使用肠球菌在体外模型中，我们确定了这些代谢产物与肠道弹性的三个支柱之间的功能联系：免疫反应，肠壁和微生物群。我们在体外评估了BS29784营养细胞，孢子和代谢产物的能力，以调节全球免疫调节剂（使用HT-29-NF-κB和HT-29-AP-1报道细胞），肠道完整性），肠道完整性（HT-29-MUC2报道细胞）（HT-29-MUC2报道细胞和CACO-2细胞）以及CACO细胞（CACO-2），以及CACO-2-2。最后，我们使用鸡肉肠含量作为接种，模拟了肠发酵，以确定BS29784代谢产物对微生物群及其发酵型的影响。BS29784营养细胞比孢子更有效地降低了炎症反应，这表明它们的益处与代谢活性有关。为了评估这一假设，我们分别研究了BS29784代谢产物。结果表明，每个代谢产物都有不同的有益作用。pth和niA降低了促炎性途径AP-1和NF-κB的激活。HPX通过增强MUC2表达上调粘蛋白的产生。HPX，NIA和PTH增加了细胞增殖。PTH和HPX通过限制渗透性的增加来提高上皮弹性对炎症挑战。在盲肠发酵中，nia增加了乙酸乙酸盐，HPX增加了丁酸酯，而PTH则增加了乙酸乙酸酯，丁酸酯和丙酸酯。在回肠发酵中，PTH增加了丁酸酯。 所有分子调节菌群，解释了不同的发酵模式。 总的来说，我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用，从而影响了肠道健康。在回肠发酵中，PTH增加了丁酸酯。所有分子调节菌群，解释了不同的发酵模式。总的来说，我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用，从而影响了肠道健康。
有益微生物酵母芽孢杆菌GP-P8的潜力，可抑制炭疽病病原体和胡椒植物生长促进
这项研究是为了筛选针对colletotrichum acutatum，colletotrichum dematium和colletotrichum coccodes的抗真菌性抗真菌性。细菌ISO从胡椒土壤中的GP-P8晚期GP-P8在体外双重培养测定中的平均抑制率为70.7％有效。16S rRNA基因测序分析结果表明，有效的细菌分离株是锡安森。还进行了GP-P8的生化表征。根据结果，蛋白酶和纤维素，铁载体产生，磷酸盐溶解，淀粉水解和吲哚-3-乙酸的产生。使用特定的引物，涉及抗生素产生的基因，例如ITURIN，富霉素，艰难蛋白，比蛋白，杆菌蛋白，杆菌素，表面蛋白，大乳糖素，大糖锡和芽孢杆菌，以及siamensis gp-p8中也被检测到。通过固相微萃取/气相色谱 - 质谱法（SPME/GC-MS）对挥发性有机化合物的鉴定和分析表明，分离株GP-P8产生了乙酰酸和2,3-丁烷二醇。体内测试表明，GP-P8 SIG极大地降低了由阿司霉菌引起的炭疽病疾病，并增强了胡椒植物的生长。
猪 细小 蛋白 NRPS 基因 的 生物 勘探 及 检测
摘要 ：弧菌病和败血症是由细菌引起的感染，给水产养殖业带来了许多问题。海参等海洋生物被广泛认为含有具有抗菌潜力的共生微生物，因此生物勘探前景十分广阔。本研究旨在分析海参单疣刺参共生菌对嗜水气单胞菌和哈维氏弧菌的抗菌潜力并检测其NRPS基因。研究方法包括海参单疣刺参肠道共生菌的分离、抗菌活性筛选、16S rRNA鉴定和NRPS基因簇检测。共分离出16株细菌，其中12株分离株对病原菌嗜水气单胞菌有抑制潜力，7株分离株对病原菌哈维氏弧菌有抑制潜力。经16S rRNA鉴定，能够抑制A. hydrophila生长的共生菌为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），而能够抑制V. harveyi病原菌的共生菌为弯曲芽孢杆菌（Bacillus flexus），在枯草芽孢杆菌和弯曲芽孢杆菌中均检测到NRPS基因簇，扩增子大小约为250 bp。
外泌体在肿瘤免疫中的应用
摘要：芽孢杆菌和相关属是药物生产环境中最重要的污染物之一，在物种水平上鉴定这些微生物有助于研究污染的来源以及预防性和纠正性决策。这项研究的目的是评估三种方法，以表征从巴西里约热内卢的药物单位分离出的内孢子的有氧细菌菌株。MALDI-TOF MS，并使用Sanger方法进行了完整的16S rRNA基因测序。结果表明芽孢杆菌属（n = 9; 36.0％），priestia（n = 5; 20.0％）和佩尼比曲霉（N = 4; 16.0％）的流行率。三个（20.0％）菌株显示出<98.7％的DNA测序相似性在ezbiocloud数据库上，表明可能的新物种。此外，将芽孢杆菌杆菌的重新分类为Priestia属，为Priestia pseudoflexus sp。nov。提出了。总而言之，16S rRNA和MALDI TOF/MS不足以识别物种水平的所有菌株，并且需要进行互补分析。
Burkholderia的差异遗传策略
摘要Burkholderia越南语LMG10929和Paraburkholderia Kururiensis M130是细菌大米生长促进模型。除了这种常见的生态莱基外，伯克霍尔德属的物种也被发现为机会性人类病原体，而帕拉伯克霍顿物种大多是环境和植物构成的。在这项研究中，我们比较了越南芽孢杆菌和库里氏芽孢杆菌使用的遗传策略，以定居其共同宿主的两个亚种Oryza sativa subsp。japonica（cv。nipponbare）和O. sativa subsp。indica（cv。ir64）。我们使用了转座子插入突变库文库（TN-SEQ）的高吞吐量筛选来推断哪些遗传元件在接种后7天后在根表面定植期间具有最高的效果。总的来说，我们在越南芽孢杆菌中检测到的基因比库里林斯假发疟原虫的基因多两倍，其中包括促进植物防御能力的基因，这表明越南芽孢杆菌的不良反应比越南b。越南人比对kuriensisp。kuriensis的不利反应。对于这两种菌株，与japon-ica相比，在定植Indica水稻时，细菌耐性取决于较高的基因。宿主对细菌适应压力的这些分歧可能部分与品种氮同化的差异有关。我们检测到了两种细菌菌株中的根定植的功能，例如entner-doudoroff（ed）糖酵解。在特定方面的频率较低，较多的菌株中，我们检测到限制了根定植的功能，例如越南芽孢杆菌中的生物膜产生和库鲁里氏菌中的法定感应。通过TN-SEQ程序鉴定的基因参与是有助于根定植的，即ED途径，C-DI-GMP循环和钴胺素合成，通过定向的诱变和野生型（WT）菌株的竞争来验证。
