XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System菌属
尼加拉瓜食品行业使用紫外线灯进行细菌控制
在确定为水污染物的细菌中，已分离出革兰氏阴性菌，特别是属于假单胞菌属、黄杆菌属、加利昂氏菌属、气单胞菌属、弧菌属、无色杆菌属、产碱杆菌属、博德特氏菌属、奈瑟菌属、莫拉菌属和不动杆菌属的细菌。然而，符合水质潜在生物指标特征的细菌群是大肠菌群、肠杆菌科或肠杆菌科，兼性厌氧、不产生孢子、产气和糖酵解乳糖发酵菌，最终产物为酸。它们占人类和动物肠道微生物的 10%，因此它们在水中的存在与粪便污染有关，表明处理不充分或随后受到污染。（Ríos-Tobón 等人，2017 年）
将人乳寡糖代谢和早期肠道肠道菌属联系起来：双歧杆菌和超越
摘要人乳寡糖（HMOS）是人类母乳中存在的复杂的多功能聚糖。它们代表了异质结构的复杂混合物，这些结构在抵抗胃肠道消化时以完整形式到达婴儿肠。因此，他们直接和/或间接地向发展中国家赋予了许多好处。某些双歧杆菌物种是母乳喂养婴儿的最早肠道殖民者之一，具有适应性的功能能力来代谢各种HMO结构。通常在婴儿相关的双歧杆菌RIA中观察到这种能力，而不是与成熟的菌群相关的双歧杆菌。近年来，有关这些婴儿相关的双歧杆菌以及某些其他类群如何能够吸收HMO的信息，包括如何使其获取和消费的机械策略。此外，HMO促进的微生物之间发生了复杂的代谢相互作用，包括利用HMO降解释放的分解产物。对HMO介导的微生物组成和功能变化的兴趣一直是众多研究的焦点，在近期，由于单个生物合成HMO的可用性，其中一些现在通常包含在婴儿配方中。在这篇综述中，我们概述了婴儿相关双歧杆菌采用的主要HMO同化和分解代谢策略，讨论其他具有母乳聚糖降解能力的类群，并涵盖了HMO支持的交叉食物相互作用和相关的代谢物，因此已经描述过。
利福昔明调节肠道菌群治疗非酒精性脂肪性肝病的研究进展
异常及其患病率每年增加。其发育与肠道微生物群的不平衡密切相关，诸如肠道肝轴的破坏，对睾丸屏障的损害以及内毒素血症在其发病机理中起关键作用。近年来，肠道菌群的调节已成为NAFLD治疗的热门话题。Rifaximin是一种口服施用的不可吸收抗生素，在改善肠道菌群，减少氧毒素和减少炎症因子方面已显示出潜力。虽然短期使用已显示出积极的影响，但长期使用的安全及其对有益细菌的影响仍需要进一步研究。future研究应着重于优化利福昔明治疗策略，以为NAFLD提供更有效的治疗选择。
肠道菌群丰度与宫颈癌的发病机理之间的因果关系：双向孟德尔随机研究
Results: In primary outcomes, we found that a higher abundance of class Clostridia, family Family XI, genus Alloprevotella, genus Ruminiclostridium 9, and order Clostridiales predicted higher risk of CC, and a higher abundance of class Lentisphaeria, family Acidaminococcaceae, genus Christensenellaceae R7 group, genus Marvinbryantia, order维多利亚菌，肌动杆菌和小扁豆门预测CC的风险较低。在可验证的结果中，我们发现甲甲基类，家族放线菌科，家族甲状腺杆菌科，lachnospiraceae ucg属010，甲苯基菌科属，甲苯基逆葡萄菌属，命令放线菌和甲基甲基甲基菌属越高的风险和cccccund ccccccc，链球菌科，属媒介物和细菌植物属预测CC的风险较低，反之亦然。
与宿主分类属于同一物种的微生物的DNA
时，并且学术论文揭示了基因交换在自然界中发生，而这些物种是微生物，是微生物源自供体，宿主和表达质粒的微生物，用于生产的微生物中的DNA的质粒属于这些物种。 1）在同行评审论文中出版2）由多位专家（例如学术社会的职位论文）所证明的论文。
植物相关微生物在植物健康和发育中的作用：以沙雷氏菌属为例
摘要 沙雷氏菌属是肠杆菌科的一种菌种，存在于多种生态环境中。近年来，沙雷氏菌已成为促进植物生长和防御植物病虫害的多方面贡献者。本综述探讨了沙雷氏菌诱导植物生长和缓解非生物和生物胁迫的机制。沙雷氏菌与植物生态系统的无缝整合使沙雷氏菌能够产生群体感应分子 N-酰基高丝氨酸内酯 (AHL)，促进植物组织的定植并利用植物分泌物中的营养。这种错综复杂的通讯网络使沙雷氏菌能够产生植物激素并分解土壤中的必需营养物质供植物吸收。面对生态竞争对手，许多沙雷氏菌菌株表现出非凡的适应性，产生多种水解酶和抗菌、抗真菌或杀虫化合物，有效控制有害细菌、真菌和害虫。此外，有益的沙雷氏菌菌株还分别使用诱导系统抗性 (ISR) 和耐受性 (IST) 来缓解生物和非生物胁迫。沙雷氏菌的各种农业应用包括直接使用细菌细胞进行种子包衣、叶面喷洒和土壤接种，或将其生物活性化合物单独或与其他材料结合应用于植物的各个部位。这些努力旨在增强植物健康、抑制疾病和控制害虫种群。尽管应用前景广阔，但有报道称植物和动物具有机会性致病性。因此，应考虑几种安全方法和使用毒力因子突变菌株。沙雷氏菌在农业中的应用趋势预计将持续下去。
从2013年到2021年，产生碳青霉酶的摩根菌属的传播：一项比较基因组研究
Methods This comparative genomic study included extensively drug-resistant Morganella spp isolates collected between Jan 1, 2013, and March 1, 2021, by the French National Reference Center (NRC; n=68) and European antimicrobial resistance reference centres in seven European countries (n=104), as well as one isolate from Canada, two reference strains from the Pasteur Institute collection (Paris, France), and two来自Bicêtre医院（法国克里姆林 - 比卡特）的可菌素敏感分离株。通过全基因组测序，抗菌敏感性测试和生化测试来表征分离株。也包括来自GenBank（n = 103）的完整基因组进行基因组分析，包括系统发育和核心基因组和抗性的测定。不同物种或亚种之间的遗传距离。通过将遗传分析与脂质A上的质谱分析相结合。
rmlst物种识别
PubMlST多人数据库中存在物种注释，例如非特异性Neisseria sp。已知属但未描述确切物种。如果观察到非特异性注释以及同一属中的物种注释，则计算出的LCTN是物种，例如奈瑟氏菌和奈瑟氏菌。，LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。 但是，如果Neisseria sp。 观察到与不同的属一起观察到，然后计算最低的公共节点。 例如 Neisseria sp。 和Kingella Oralis，计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。，LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。但是，如果Neisseria sp。与不同的属一起观察到，然后计算最低的公共节点。例如Neisseria sp。和Kingella Oralis，计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。
棉花属，鹅及其... -Agritrop
抽象的棉花，棉花属，包括〜50种分布在欧洲以外所有大陆的热带和亚热带地区的物种。在这里，我们提供了一个关于美国同种多倍体物种的山地植物和驯化的进化史的概要，从而整合了基本分类学研究，生物地理，分子遗传学，系统发育分析和考古学的数据。These diverse sources of information provide a temporal and phylogenetic perspective on diversification among the diploids and on polyploid formation, uncover multiple previously cryptic interspecific hybridizations, clarify and contribute to the taxonomy of the genus, and offer a firm foundation for understanding parallel domestications in Mesoamerica and South America, which led to the globally important cotton crop species G. barbadense and G. hirsutum .Gossypium因此提供了一个证明典型的例子，说明了基本植物发现的重要性和实用性，并结合了现代技术能力，以产生对进化史的基因组见解。We also review the current state of our knowledge regarding the archaeological history of cotton domestication and diffusion in the Americas, a seemingly unlikely story entailing parallel domestication origins and parallel directional selection tracing to 8,000 ( G. barbadense ) and 5,500 ( G. hirsutum ) years ago, transforming two geographically isolated wild short-day perennial shrubs having small capsules and seeds covered by short,棕褐色的表皮毛状体进入现代日间长度中的年度，具有丰富，细的白色纤维。几千年后，这种双重驯化是无意的且最近有意间的，随着两种物种在不同半球的初始驯化后接触，这是无意的，最近有意的。因此，重申了物种差异和生物团聚的循环，这次是在多倍体水平上。了解这种进化史对于我们对世界上最重要的纤维植物基因组建筑的理解至关重要，并为我们对一般生物学原理的理解做出了重大贡献。关键词：系统发育学；多倍体，杂交，驯化；考古学;山毛毛； Gossypium barbadense