XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System菌株
类型标本和类型菌株的DNA序列
摘要。- 科学的名称允许人类和搜索引擎访问有关我们周围的生物多样性的知识，与DNA序列相关的名称在搜索和匹配识别过程中扮演着越来越多的角色。在这里，我们分析了国家生物技术信息中心（NCBI）的用户和策展人如何标记和策展序列，该序列是从命名自然型材料中得出的，这是提高长期运行中基于DNA的识别质量的唯一方法。对于原核生物，NCBI员工策划了18,281个基因组组件，并提高了原核生命名的质量。对于真菌，代表21,000多种物种的类型衍生序列对于真菌命名和识别至关重要。对于其余的真核生物而言，可识别为类型的序列的序列数量很小，仅代表739种节肢动物，1542个脊椎动物和125个胚胎。An increase in the production and curation of such sequences will come from (i) sequencing of types or topotypic specimens in museum collections, (ii) the March 2023 rule changes at the International Nucleotide Sequence Database Collaboration requiring more metadata for specimens, and (iii) efforts by data submitters to facilitate curation, including informing NCBI curators about a specimen's type status.我们说明了不同类型的data提交旅程，并提供了各种生物体的最佳实践示例。扩大DNA数据库中类型衍生的序列的数量，尤其是真核生物的序列，对于捕获，记录和保护生物多样性至关重要。[最佳实践示例；策划；数据提交； GenBank；博物馆学；命名类型；分类法。]
蘑菇形成真菌菌株之间的高表型和基因型可塑性
schizophyllum cumine是一种蘑菇形成的真菌，以其独特的结实物体具有分裂的g。它被用作研究蘑菇发育，木质纤维素降解和交配类型基因座的模型生物。这是一种高变量物种，菌株之间具有相当大的遗传和表型多样性。在这项研究中，我们系统地表现出16种硫化菌株，用于蘑菇发育方面和木质纤维素降解的18个单被子菌株。有关这些表型的菌株之间存在相当大的异质性。大多数菌株发展出具有不同形态的蘑菇，尽管有些菌株仅在经过测试的条件下营养生长。各种碳源上的生长显示出特异性特异性曲线。对七个单因子菌株的基因组进行了测序，并与六个前发表的基因组序列进行了分析。此外，对相关的物种进行了schizophyllum fasciatum。尽管基因组组件之间存在很大的遗传变异，但与蘑菇形成和木质纤维素降解有关的基因得到了很好的保守。这些测序的基因组与高表型多样性相结合，将为S. comuncom菌株的功能基因组学分析提供扎实的基础。
工程新型极限藻藻藻虫（Chlamydomonas Pacifica），用于高脂质和高淀粉的生产，作为发展商业相关菌株的途径
未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年7月19日。; https：//doi.org/10.1101/2024.07.18.604193 doi：biorxiv Preprint
扭伤 - 菌株和肌力性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征和纤维肌痛之间的因果关系
•2024年5月15日进行了全面而系统的文献搜索。• The search was done on commercial medical literature databases, including BIOSIS Previews (1969 to 2008), Embase (1974 to 2024 Week 19), Medline and Epub Ahead of Print, Medline In-Process, In-Data-Review & Other Non-Indexed Citations, Medline Daily and Medline (1946 to May 14, 2024), Joanna Briggs Institute Evidence Based Practice Database (Current to May 08, 2024年），Cochrane临床答案（2024年4月），可通过OVID平台获得。•我们通过研究扭伤/压力的作用以及ME/CFS或纤维肌痛的发展开始了搜索。在检查了我们关于扭伤/应变文献发现的标题和摘要之后，我们扩大了搜索，以包括对ME/CFS或纤维肌痛的发展的任何身体伤害的作用。这些文献搜索中采用了关键字的组合。这些关键字包括：
来自特应性皮炎患者和健康个体的金黄色葡萄球菌菌株的不同预言基因谱
摘要金黄色葡萄球菌菌株与特应性皮炎（AD）表现出不同的关联，但是基于致病性的遗传决定因素尚未充分表征。为了揭示AD患者和健康个体（HE）的金黄色葡萄球菌菌株之间的遗传差异，我们开发并采用了随机的森林分类器来识别负责其表型变异的潜在标记基因。分类器能够有效地将菌株与AD和HE区分开。我们还发现了某些标记基因和噬菌体功能之间的牢固联系，噬菌体霍林出现为最关键的分化因子。对金黄色葡萄球菌基因含量的进一步研究强调了预言在推动与AD菌株之间分化的遗传多样性和功能意义。HE组表现出更大的基因含量多样性，在很大程度上受其预言的影响。虽然AD和他普遍容纳预言的菌株，但HE组中的菌株在应变水平上却明显更高。此外，尽管HE组中的预言表现出更高的差异功能的富集，但AD组在其预言中表现出显着的毒力因子的富集，强调了预言对AD相关菌株的发病机理的重要贡献。总体而言，预言显着塑造了金黄色葡萄球菌菌株的遗传和功能谱，阐明了其致病潜力，并阐明了AD和HE环境的表型变化背后的机制。
益生菌菌株LAC
摘要简介：神经退行性疾病的特征是神经元的易感性群体逐渐丧失。主要的临床特征（例如痴呆，帕金森氏症或运动神经元疾病），神经退行性的解剖分布（例如，额叶退化，锥形外疾病或脊椎脑脑外部疾病或脊椎脑脑外部疾病）或主要分子异常性都可以用于分类性神经疾病。随着世界上的人口的年龄，神经退行性疾病的频率每年都会增加。目前可用的药物缺乏有效性和严重的副作用，因此有必要从天然来源开发新的药物。目前的研究重点是评估益生菌乳杆菌的抗神经退行性活性。材料和方法：评估益生菌表征分析，例如对NaCl，苯酚和胆汁盐的耐受性。进行了五种标准抗生素。以五种不同的浓度进行乙酰胆碱酯酶抑制和酪氨酸酶抑制测定法。通过分析，发现嗜酸乳杆菌对NaCl，苯酚和胆汁盐耐受性。结果：发现嗜酸乳杆菌菌株对所有测试的抗生素敏感。在100μl的原油提取物为69.29±3.25％和53.18±2.89％时观察到明显的乙酰胆碱酯酶和酪氨酸酶。结论：可用于治疗和预防神经退行性疾病的乳酸乳杆菌作为益生菌补充剂。
从粪便样品中分离出的甲烷素史密斯菌株B181的基因组序列
3。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer， 人类胃鼻虫中的甲烷发育。 Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。 ：//doi.org/10.1038/s41575-022- 00673-z 4。 Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。 2013。 人类具有代谢标记的丰富性。 自然500：541–546。 https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer，人类胃鼻虫中的甲烷发育。Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。2013。人类具有代谢标记的丰富性。自然500：541–546。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。2016。非常综合征肠。Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。Word 10：932–938。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。1993。IMPL返回微生物59：1114–1119。59.4.4fastQC：数据集的质量控制。编织：http：//www.braham。B.2014。BBTools软件包装。编织：练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A.2020。使用组件的水疗中心。原始的Currish Bioinform 70：E102。https：//doi.org/10.1002/cpbi.102
使用CRISPR-CAS12A验证心脏菌株成像
1美国，德克萨斯州农工大学生物医学工程系，美国德克萨斯州大学站77843，美国2 Savoie Mont-Blanc University，Polytech Annecy-Chamb´ery，Le Bourget du Lac，法国3实验室TIMC-CNRS，UMR 5525，UMR 5525俄亥俄州辛辛那提市，美国45229，美国5休斯顿卫理公会Debakey心脏和血管中心，德克萨斯州休斯敦，77030，美国6，美国6辛辛那提大学心血管健康与疾病部，辛辛那提大学医学院，辛辛那提大学，辛辛那提大学，俄亥俄州俄亥俄州俄亥俄州45267休斯敦卫理公会学术研究所，美国德克萨斯州休斯顿市卫理公会学术研究所，美国9 J. Mike Walker '66机械工程系，德克萨斯州A＆M大学，美国学院站，美国德克萨斯州77843，美国