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World File Search System菌素
利用抗菌肽和孢子形成因子的靶向基因编辑对短小芽孢杆菌菌株进行表征
摘要：许多芽孢杆菌属物种因能够产生可防止疾病生长的抗菌肽而对植物有益。在本研究中，我们研究了芽孢杆菌3-19菌株及其衍生物在靶向基因组编辑后的拮抗活性。利用CRISPR-Cas9系统特异性地失活了芽孢杆菌3-19基因组中的两个具有抗菌作用的肽基因——芽孢杆菌素 (bac) 和细菌素 (bact)，以及编码孢子形成西格玛因子的sig F基因。由于芽孢杆菌3-19基因组中靶基因的失活，对蜡状芽孢杆菌和布伦纳泛菌的抗菌活性降低，其中对芽孢杆菌素的影响明显。当 bac 、 bact 和 sig F 基因失活时，培养物的生长动态发生变化，并且变异菌株的蛋白水解活性较低。通过失活 sig F 基因获得了 B. pumilus 3-19 的无孢子突变体。已经证明，bacilysin 在 B. pumilus 3-19 对土壤微生物的拮抗作用的形成中起着独特的作用。
算法，专家还是两者？评估特征选择方法对用户偏好和Reliance
sof umer洞穴是一个未开发的极端环境，可容纳新型微生物和潜在的遗传资源。来自洞穴的微生物组已被遗传适应以产生各种生物活性代谢产物，使它们能够生存并耐受苛刻的结合。然而，尚未探索Sof umer Cave微生物中与生物合成相关的基因簇标志。因此，使用高通量shot弹枪测序来探索sof umer Cave的微生物组中与生物合成相关的基因簇（BGC）。Geneall DNA土壤迷你试剂盒用于从均质样品中提取高分子量DNA，并使用Novaseq PE150对纯化的DNA进行测序。根据微-RN数据库，乌默洞穴中最常见的微生物属是原细菌，静脉细菌，verrucomicrobobiota和蓝细菌。对与生物合成相关的基因簇进行了注释并分类，并使用抗石和NAPDOS1预先对BGC进行预令。确定了编码广泛的二级代谢物的BGC的460个推定区域，包括RIPP（47.82％），萜烯（19.57％），NRPS（13.04％），杂种（2.18％）和其他新的注释（10.87％）com punds。此外，NAPDOS管道还从链霉菌素的链霉菌素（链霉菌素基因肌链霉菌素）中鉴定出钙依赖性的抗生素基因簇，来自链霉菌Chrysomallus的放线菌素基因簇和来自链霉菌链霉菌的博霉素基因簇。这些发现突出了Sof Umer Cave微生物组的未开发的生物合成潜力，以及其发现天然产物的潜力。
通过表达伊维菌素对MDBK细胞系诱导的DNA损伤反应基因的表达评估遗传毒性效应
伊维菌素（IVM）是一种抗寄生虫药物，用于治疗寄生虫。它已在人类中用于治疗肠道强质虫病和尾cer虫病，目前，研究人员正在研究其治疗冠状病毒SARS-COV-2的潜力。由于其广泛的活性，IVM过度使用了动物，这引起了研究人员研究其毒性作用的兴趣。由于过度使用IVM，已经报道了动物的细胞毒性和毒性作用。因此，本研究旨在通过检查DNA损伤响应基因的表达（OGG1）的表达来评估IVM对Madin-Darby-Bovine-Kidney（MDBK）细胞系的细胞毒性和遗传毒性作用。使用测定法（MTT 3-（4,5-二甲基噻唑-2-基）-2,5-二苯基四唑溴化物）测试IVM的细胞毒性，而使用彗星分析以及微核测定法对基因毒性进行了评估。此外，在使用Trizol方法从MDBK细胞系中提取RNA后，通过QRT-PCR测量了DNA大坝反应基因（OGG1）的基因表达，并通过反向转移酶PCR将RNA转化为cDNA。在实验过程中，以不同剂量的IVM（即25％，50％，75％）以及LC50/2，LC50和LC50 * 2进行测量细胞活力百分比。观察到，随着IVM浓度的增加，OGG1的基因表达增加。确定IVM对MDBK细胞系具有细胞毒性和遗传毒性作用。进一步，建议应进行与分子水平和其他模型生物的毒性作用有关的研究，以打击其危险效应。
第 13 卷 • 第 1 期 • 2025 年 1 月
本期，我们选择了题为“microRNA 对链脲佐菌素诱发的糖尿病大鼠模型中心肌病的影响”的研究作为封面图片。在这项由 Doğan AŞ 等人进行的研究中，他们指出 miRNA 在糖尿病性心肌病中发挥了作用，并在链脲佐菌素 (STZ) 诱发的糖尿病大鼠模型中评估了使用 miRNA 作为诊断和治疗生物标志物的潜力。他们强调，miR-200c-3p 具有诊断价值，可以作为生物标志物的候选物。封面图片显示了对照组和糖尿病组样本中心肌细胞肥大的苏木精和伊红染色。此外，本期的其他文章旨在通过多学科方法为健康科学做出贡献。我们收录的一些文章包括：
抗真菌治疗 - SCH
伏立康唑、泊沙康唑、脂质体两性霉素 B (L-AmB；Ambisome®) 和棘白菌素类药物（如米卡芬净）可能适用于 IFI 高风险儿童，包括霉菌和酵母菌感染。关于其中一种药物优于其他药物的证据有限。然而，这些药物在可用配方和毒性方面确实有所不同。药物相互作用和患者间/患者内药代动力学差异（需要治疗药物监测）也是重要的限制因素，尤其是对于年幼儿童使用唑类抗真菌药物，尽管这些药物比两性霉素 B 和棘白菌素类药物有优势，因为目前有口服配方。选择预防措施时应考虑个体患者因素、药品福利计划批准的适应症、给药的便利性和成本。
原始研究Deguelin和Paclitaxel负载PEG-PCL纳米丝菌素，用于抑制乳腺癌细胞的增殖和诱导凋亡
背景：Deguelin（DGL）是一种天然类黄酮，据报道在乳腺癌（BC）中表现出抗肿瘤作用。PEG-PCL（聚乙烯甘氨酸聚二苯乙酮），作为聚合物胶束具有生物降解性和生物相容性。这项研究的目的是研究纳米关节递送系统，PEG-PCL是否可以改善DGL抑制BC细胞增殖的生物利用度。方法：PEG-PCL聚合物首先是通过开环聚合物制备的，DGL和PACLITAXEL（PTX）负载的PEG- PCL纳米微粒是通过膜分散法制定的。通过核磁共振和傅立叶变换红外光谱（FTIR）光谱分析了PEG-PCL的组成和分子量。分别通过动态光散射，透射电子显微镜和溶血测定法评估了胶束的粒径，表面电位和溶血活性。然后用EDU染色，CCK-8，TUNEL染色和流式细胞仪测试了MDA-MB-231和MDA-MB-468细胞的增殖和凋亡。caspase 3表达也通过蛋白质印迹评估。结果：我们的结果首先表明PEG 2000 -PCL 2000已成功合成。DGL和PTX负载的PEG-PCL纳米微粒的形状为圆形，粒径为35.78±0.35 nm，表面电势为2.84±0.27 mV。胶束具有最小的溶血活性。此外，我们证明了DGL和PTX荷载PEG-PCL纳米细胞可以抑制BC细胞中的增殖并诱导凋亡。这为开发新的治疗策略提供了潜力。这项研究中构建的DGL和PTX负载的PEG-PCL纳米微粒具有显着的抑制作用，对BC细胞中的凋亡作用显着，并且在凋亡中具有显着的促销作用。结论：这项研究提出，PEG-PCL形成的纳米丝可以增强紫杉醇针对乳腺癌细胞的细胞毒性，同时，Deguelin的负载可能会进一步抑制细胞增殖。
研究所第三科学时代的计划...
CO-4-1：葡萄酒Millogo：位于布基纳Faso Co-1-2的金色平移地点和工业矿山的储水农场的污染和原始的牛奶农场污染幼虫伊维菌素抗性机制的拖曳选择
bpags：使用交替决策树，遗传算法和线性支持VECT
鉴于它们能够用宽阔和狭窄的自然光谱杀死细菌，因此在开发新药物来打击抗生素耐药性的新药中，出现了使用细菌素的使用。因此，对于可以准确预测新型细菌蛋白的精确且有效的计算模型产生了令人信服的要求。机器学习能够从细菌素序列中学习模式和特征的能力，这些序列很难使用基于序列匹配的方法捕获，这使其成为准确预测的潜在优越选择。使用机器学习方法，在本研究中创建了用于预测细菌素的Web应用程序。使用交替决策树（ADTREE），遗传算法（GA）和线性支持向量分类器（线性SVC）基于基于的特征评估方法选择了应用程序中使用的功能集。最初，从细菌蛋白和非细菌蛋白蛋白序列的物理化学，结构和序列属性属性中提取了潜在特征。我们使用Pearson相关系数评估了候选人的特征，然后对Adtree，GA和Lineare SVC进行了单独的评估，以消除不必要的特征。最后，我们构建了随机森林（RF），支持向量机（SVM），决策树（DT），Logistic回归（LR），K -Neart -Neart Neirbors（KNN）和GaussianNaïve的贝叶斯（GNB）模型，使用功能集降低。，我们使用具有ADTREE还原功能的SVM获得了总体性能模型，在测试数据集中获得了99.11％的精度，AUC值为0.9984。我们还评估了相对于我们先前开发的软件解决方案，一种基于序列对齐的工具和深度学习方法，每个还原功能集的最佳模型的预测能力。开发了一种标题为BPAGS（基于ADTREE，GA和Linear SVC的细菌素预测）的Web应用程序，以合并使用ADTREE，GA和基于线性SVC的特征集构建的预测模型。当前，基于Web的工具提供了具有关联概率值的分类结果，并具有在培训数据中添加新样本以提高预测效率的选项。bpags可以在https://shiny.tricities.wsu.edu/bacteriocin-预测中自由访问。
重组DNA和基因克隆
宿主对一种或多种抗菌剂，例如氯霉素，氨苄西林和汞的抗性。r质粒在临床微生物学中非常重要，因为它们通过天然种群传播，并且在细菌感染的治疗中可能产生深远的影响。示例RP 4。3。col质粒：它们代码为结菌素。这些结肠是