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安徽理工大学医学院研究生导师简况表
基于前期开发的功能性高分子生物材料构建了一系列可注射水凝胶体系，包括基 于 “ thiol-ene ” 点击化学反应构建的超支化聚合物/巯基功能化细胞外基质材料交 联水凝胶体系【Acta Biomaterialia 2018, 75, 63; Biomater.Sci.2021, 9, 4139】、基于动态共价化学交联的自愈合可注射水凝胶体系【ACS Appl.Mater.Interfaces 2020, 12, 38918; Applied Materials Today 2021, 22, 100967】 以及基于离子交联和氢键作用的双网络水凝胶体系【Adv.Funct.Mater.2024, 2313322】。创建的超支化聚合物与巯基功能化透明质酸/硫酸软骨素水凝胶可结 合干细胞作为复合型组织修复材料，在创面愈合以及软骨修复方面展现出了显着 的组织再生效果。开发的基于席夫碱动态化学交联水凝胶具有良好的可注射性、 自愈合性以及组织粘附性，在生物3D 打印以及软组织粘附生物胶水方面展现出了 优越的应用前景。
1 基于表位的嵌合肽疫苗设计……
** 通信至：16 17 M. Anwar Hossain，博士 18 教授 19 微生物学系 20 达卡大学，孟加拉国达卡 21 电子邮件：hossaina@du.ac.bd 22 或者，23 Drs.马里兰州Mizanur Rahaman 24 助理教授 25 微生物学系 26 达卡大学，孟加拉国达卡 27 电子邮件：razu002@du.ac.bd 28 29 30 31 32
174 个 SARS-CoV-2 表位的预测与验证
最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒，体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此，通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 15 种表位-HLA 结合预测工具，并使用体外肽 MHC 稳定性测定法，我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中，我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同，并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此，设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里，我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位，这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
多种抗原表位的计算预测
摘要。由于密码子字母的高变性，从密码子到氨基酸的映射是溢出的，这表明密码子空间可能具有更高的信息含量。嵌入密码子语言模型最近在各种下游任务中表现出成功。然而，磷酸化位点的预测模型，可以说是研究最多的翻译后修饰（PTM）和PTM位点，主要依赖于氨基酸级表示。这项工作引入了一种新的方法，通过通过近来开发的密码子语言模型的嵌入来预测磷酸化位点，该方法专门培训了蛋白质编码DNA序列。蛋白质序列首先精心映射到可靠的编码序列，并使用此编码器编码以生成密码子感知的嵌入。然后将这些嵌入与通过早期融合策略从蛋白质语言模型获得的氨基酸感知的嵌入整合。随后，从定义的窗框内的融合嵌入式形成了感兴趣的位点的窗口级表示。Convbigru网络提取物具有捕获窗口内近端残基之间的时空相关性，然后是基于高斯（Dog）小波范围函数的衍生物的Kolmogorov-Arnold网络（KAN），以产生该站点的预测推断。我们将整体模型配音为Calmphoskan。在独立测试中使用丝氨酸 - 硫代氨酸（合并）和酪氨酸测试集，Calmphoskan优于现有方法。此外，我们证明了该模型在预测蛋白质内在无序区域内的位点的有效性。总体而言，Calmphoskan成为蛋白质中一般磷酸材料的强大预测指标。Calmphoskan将很快公开发布。
174 个 SARS-CoV-2 表位的预测与验证
最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒，体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此，通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 19 种表位-HLA 结合预测工具，并使用体外肽 MHC 稳定性测定法，我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中，我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同，并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此，设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里，我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位，这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
NK Cover 相关 pdf - ClassNK
欢迎阅读 2000 年 ClassNK 年度报告。继去年庆祝公司成立 100 周年的兴奋之情之后，我曾一度认为今年可能会有些低迷。但我向你保证，事实并非如此。NK 继续稳步增长，总吨位现已超过 1.11 亿吨，而我们的国际网络也不断扩大，包括美国的诺福克，更不用说在日本仙台的新办事处了。虽然国内市场有所改善，但我必须说，韩国和中国造船业的增长率显然为新世纪带来了最大的机遇，同时也带来了最大的挑战。发展新业务关系的机会几乎每天都在出现，正如你稍后将读到的，NK 正在韩国、中国、越南和新加坡等国监督新建造项目。此外，随着贸易的增长，特别是随着中国加入世贸组织，预计该地区的常规调查工作量也会增加。毋庸置疑，NK 在中国的 8 个办事处和韩国的 3 个办事处是最繁忙的办事处之一。但与任何不断扩展的服务网络一样，最大的挑战在于保持最高质量，同时满足客户日益增长的需求。我相信人力资源和培训是应对这一挑战的关键。因此我们
NK 表纸关系 pdf - ClassNK
欢迎阅读 2000 年 ClassNK 年度报告。继去年庆祝我们成立 100 周年的兴奋之后，有人偶尔向我暗示，今年可能会有所下滑。但请让我向您保证，事实并非如此。NK 继续稳步增长，总吨位现已超过 1.11 亿吨，而我们的国际网络也不断扩大，包括美国的诺福克，更不用说在日本仙台的新办事处了。虽然国内市场有所改善，但我必须说，韩国和中国造船业的增长率显然为新世纪带来了最大的机遇，同时也带来了最大的挑战。几乎每天都会出现发展新业务关系的机会，正如您稍后将读到的，NK 正在韩国、中国、越南和新加坡等地监管新建筑项目。此外，贸易增长，特别是随着中国加入世贸组织，预计也将导致该地区的定期调查工作量增加。毋庸置疑，NK 在中国的 8 个办事处和韩国的 3 个办事处是最繁忙的办事处之一。但与任何扩展的服务网络一样，最大的挑战在于保持最高质量，同时满足客户日益增长的需求。我认为人力资源和培训是应对这一挑战的关键。因此我们
在疫苗设计的表位硅表征中
摘要简介：大肠杆菌血红素利润（CHUA）蛋白是一种外膜蛋白，已显示为疫苗设计研究的可正常靶标。在本研究中，我们旨在识别和表征Chua蛋白最有效的B和T细胞表位，以揭示其最免疫原性的区域。材料和方法：在本研究中，调用同源性建模以确定大肠杆菌血红素利润蛋白（CHUA）的三维（3D）结构。，为CHUA预测了CHUA的CHUA，线性和构象B细胞表位和T细胞表位的膜拓扑，配体结合位点，表面可及性和裂缝。在分子对接分析后，绘制了最有效的T细胞表位与HLA-A020和HLA-DRB0101结构之间的2D和3D相互作用图。结果：我们的结果表明Chua是血红素配体转运蛋白，它形成了常见的β-桶结构。它通过22个膜跨度区域位于膜中。基于残余的口袋和裂缝在Chua蛋白上鉴定出来。免疫学分析显示9个高效的B细胞表位。在预测的T细胞表位2中2分析了大多数有效的表位，以通过分子对接进行HLA结合。YSKQPGYG和FAAATTMSY表位显示与HLA-A020和HLA-DRB0101的相互作用稳定。结论：我们的免疫学，生化和功能分析强调了CHUA蛋白的区域，该区域具有最高的免疫原性，以实现疫苗接种的目的。J Appl BiotechnolRep。2024; 11（1）：1207-1219。 doi：10.30491/jabr.2023.388522.1612我们采用3D结构预测和表位预测结果的策略可以被视为在各种平台中有效疫苗设计的一种可正常的方法。关键字：尿路感染，疫苗，铁受体，生物信息学，OMP引用：Sefid F，Payandeh Z，Khalili S，Hashemi ZS，Zakeri A，Zakeri A，Alagheband Bahrami A等。基于血红素利润蛋白的疫苗设计的表位硅化表征。