摘要 生命科学领域的最新技术进步极大地提高了我们以前所未有的深度在分子水平上解决科学问题的能力。自推出以来,下一代测序 (NGS) 实现了高通量分析,随着时间的推移,变得越来越普及和负担得起,塑造了研究和临床应用的未来。空间分辨转录组学 (SRT),特别是原位测序 (ISS),提供单细胞转录组数据,同时保留周围组织微环境的组织病理学背景。本论文探讨了挂锁探针与原位测序 (ISS) 或下一代测序 (NGS) 结合的应用,以解决与特定疾病相关的问题。在论文 I 中,我们研究了结核分枝杆菌 (Mtb) 与结核病感染小鼠肺中免疫细胞之间的空间相互作用,绘制了细菌簇和单个细菌附近的免疫相关转录本。我们的研究结果表明,在 Mtb 抗性的 C57BL/6 小鼠中,靠近单个细菌的巨噬细胞活化。相比之下,在易感染结核分枝杆菌的 C3HeB/FeJ 小鼠的肺组织中占主导地位的组织化肉芽肿未富集免疫激活转录本。这种方法提供了对结核病免疫反应的见解,并强调了空间分辨转录组学在研究宿主-病原体相互作用方面的能力。在论文 II 中,我们研究了非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的肿瘤微环境,重点研究了 T 细胞克隆性的影响。我们将 TCR 克隆性与基因突变、肿瘤免疫特征和对免疫疗法的反应联系起来。我们的数据显示,高 TCR 克隆性与高肿瘤突变负担、发炎的肿瘤表型以及对检查点抑制剂的反应改善有关,这表明其有可能成为 NSCLC 个性化免疫治疗的生物标志物。在论文 III 中,我们在空间上探索了新辅助治疗期间选定的 NSCLC 组织中的 TCR 模式和免疫细胞分布,这些组织具有匹配的未受影响的淋巴结,以及 HER2+ 乳腺癌病例。我们注意到,与匹配的淋巴结相比,癌症组织中的 TCR 多样性较低。我们的数据进一步揭示了扩增克隆型(主要是 CD8 T 细胞)的区域优势,这些克隆型位于靠近癌症区。总体而言,这些结果证明了 ISS 在提供诊断组织样本中肿瘤免疫微环境中克隆 T 细胞扩增之间相互作用的关键空间细节方面的实用性,特别是在治疗环境中。在论文 IV 中,我们开发了一种基于分子倒置探针 (MIP) 的经济高效的检测血液样本中微生物病原体和抗菌素耐药性标志物的检测方法,即使在资源匮乏的环境中也能提供高特异性和灵敏度。MIP 方法简化了病原体检测,无需进行大量的样品制备或生物信息学分析,使其成为资源匮乏地区监测传染病的便捷工具。总的来说,这项工作展示了挂锁探针和先进技术的应用,以加深我们对疾病的了解并改善诊断和个性化治疗。
VBM 数据 ● 使用默认值分割数据(对纵向数据使用分段纵向数据)。现在可用于 VBM 的结果分割保存在“mri”文件夹中,灰质的分割名为“mwp1”,白质的分割名为“mwp2”。如果您使用了纵向管道,则灰质的默认分割名为“mwp1r”或“mwmwp1r”(如果选择了用于检测较大变化的纵向模型)。 ● 获取总颅内容积 (TIV) 以校正不同的脑部大小和体积。选择保存在“报告”文件夹中的 xml 文件。 ● 使用检查样本检查 VBM 数据的数据质量(可选择将 TIV 和年龄视为干扰变量)。从第一步中选择灰质或白质分割。 ● 平滑数据(建议起始值为 6-8mm 1)。从第一步中选择灰质或白质分割。 ● 指定具有平滑灰质或白质分割的二级模型,并检查设计正交性和样本同质性:
LRRK2致病变体的载体显示出一个温和的,1个帕金森氏病的解剖学上不同的大脑签名2 3 Kopal,Jakub 1,2; VO,Andrew 3; Tao,QIN 3,Simuni,Tanya 4; Chahine,Lana M. 5; Bzdok,4 Danilo 2,3,6*; Dagher,Alain 3,7* 5 1 1精神病学中心,心理健康与成瘾司,奥斯陆临床6医学研究所,奥斯陆大学,奥斯陆,奥斯陆大学,挪威7 2 2 2美国西北大学Feinberg医学院神经病学,美国12 IL,美国13 5 5 5 LRRK2基因变体是家族性和零星19帕金森氏病(PD)的主要遗传危险因素,为该疾病的机制和20种潜在疗法打开了无人看管的窗口。研究致病性变异在LRRK2基因对21大脑结构的影响是实现早期诊断和个性化治疗的关键步骤。22然而,尽管具有重要意义,但LRRK2基因型影响大脑结构的方式23仍未探索。在该领域的工作受到小样本量和队列组成的24个差异的困扰,这可能会掩盖临床25个亚组之间的真实区别。我们33进一步分析了脑脊液34和萎缩中骨骼α-核蛋白之间的关系。在这项研究中,我们通过结合显式26人口背景变化和模式匹配来克服如此重要的局限性。具体来说,我们27个利用了大量的641名参与者(包括364名具有PD诊断的参与者),以检查28种与LRRK2致病变体有关的MRI可检测性皮质萎缩模式,其中29名PD和非术中的人。LRRK2 PD患者表现出较轻的皮质30稀疏,在颞和枕骨31个区域中具有显着保存,表明神经变性的模式明显。非操纵LRRK2载体32没有明显的皮质萎缩,表明没有亚临床PD的结构迹象。我们发现那些有骨骼α-突触核蛋白的证据的人会经历35个明显的神经变性并增加皮质稀疏,可能会定义另外36个攻击性的PD亚型。我们的发现重点介绍了区分PD亚型的途径,37可以导致更具针对性的治疗方法以及对帕金森氏病进展的38个理解。39
Sullivan,27 Dempsey,28 Ishitani,29和其他30-32岁,就其地面和激发态特性研究了不同的rhenium(I)羰基配合物。在这些配合物的设计中,持续的挑战是它们的吸收扩展到电磁谱的可见和近红外(NIR)区域。我们已经表明,通过在配体框架的远程位置引入像NME 2这样的强有力的捐赠组,激发状态的角色发生了变化(例如,在复合物1a和1b之间,方案1)从金属到配体电荷转移(MLCT)到内聚电荷转移(ILCT)。这导致了Ca的红移。100 nm的吸收最大值和B 200倍的寿命增加,伴随着B灭绝系数增加了5倍。24
作者的完整列表:Alessandri,Giulia;帕尔马大学,兽医医学系米兰,莱昂纳多克里斯蒂安·曼卡贝利;帕尔马大学,生命科学Mangifesta,Marta;帕尔马大学,生命科学Lugli,Gabriele Andrea;帕尔马大学,化学,生命科学与环境可持续性系Alice,Alice;帕尔马大学,Genprobio Srl Duranti,Sabrina Turroni,Francesca Ossiprandi,Maria;帕尔马大学,医学兽医科学系,杜威(Douwe);爱尔兰国立大学,Marco微生物学系;帕尔马大学生命科学
在人类功能,病变和动物数据中抽象的多行证据表明,小脑角色,尤其是Crus I,Crus II和Lobule VIIB,在认知功能中。然而,缺少将认知功能的不同方面映射到小脑结构。我们分析了来自健康脑网络(HBN)的结构神经影像学数据。小脑包裹。规范相关分析(CCA)检查了与认知功能相关的区域灰质体积(GMV)差异(用NIH工具箱认知域,NIH-TB量化),对心理病理学的严重程度,年龄,性别,性别,性别,扫描位置和内部体积进行了考虑。多变量CCA发现了两个需要潜在认知规范(NIH-TB子量表)和脑规范变量(小脑GMV和颅内体积,ICV)的两个组件之间的显着相关性。组件对应于部分共享的小脑 - 认知功能关系,其中的第一个映射涉及认知灵活性(r = 0.89),处理速度(r = 0.65)以及与CRUS II(r = 0.57)和LOBULE X(r = 0.59)的区域GMV相关的工作记忆(r = 0.52),包括crus x(r = 0.59)。 r = 0.49)与工作记忆相关(r = 0.51)。我们展示了在转诊样品中认知功能的小脑形态的结构性典型化的证据。
抽象背景重复和受限行为和利益(RRBI)是具有复杂实体的自闭症的核心症状,通常被分类为“运动驱动”和“认知驱动”。RRBI症状学取决于个人的临床环境,限制了对RRBI生理学的理解,尤其是其相关的神经解剖结构。复杂的RRBI异质性需要通过整合临床环境(自闭症个体,其亲戚和典型发展(TD)个体)来探索整个RRBI频谱。我们假设通过探索RRBI的整个谱系将出现不同的RRBI维度,并且这些维度与神经解剖学特征(涉及皮层和皮层下区域)有关。方法,由267名自闭症受试者组成的792个个体,其370个一级亲戚和155个TD个体的样本已参与研究。,我们使用重复行为量表重新定义和耶鲁棕色的强迫性量表来评估每个个体中RRBI的整个模式。我们使用MRI扫描仪对受试者的子样本进行了估计脑量(n = 152、42 ASD,89个亲戚和13 TD)。我们首先通过对所有这些量表的所有项目进行主成分分析,并包括所有采样群体,首先研究了RRBI的尺寸。然后,我们使用线性恢复模型探索了RRBI衍生的因素与脑量之间的关系。
目的:本研究的目的是在初次诊断脑肿瘤时确定癫痫发作的相关风险因素,并开发和验证基于机器学习的预测,以允许基于风险的抗癫痫疗法进行量身定制。方法:临床,电生理和高分辨率成像数据是从1051例新诊断的脑肿瘤的连续队列中获得的。与因子相关的癫痫发作风险差异允许确定特定地形,人口统计学和组织病理学变量在诊断时可用的癫痫发作风险时可用的相关性。数据以70/30的比例分为培训和测试集。在选择高性能的同时选择其可追溯性的广义添加剂模型(GAM)之前,对基于机器学习的不同预测模型进行了评估。基于风险因素的临床分层,对三个不同的GAM进行了培训和内部验证。结果:总共923名患者有完整的数据并包括在内。可以确定驱动癫痫发作风险的特定地形解剖模式。脑肿瘤的异质,介质或原发性运动/s骨或躯体的新染色性结构导致癫痫发作风险的显着且临床上相关的增加。虽然地形输入与GAM最相关,但最好的预测是通过形态,人口统计学和组织病理学信息的组合来实现的(验证:AUC:0.79,准确性:0.72,灵敏度:0.81,特异性:0.66)。结论:本研究将特定的系统发育解剖模式鉴定为癫痫驱动因素。GAM允许使用地形,人口统计学和组织病理学数据预测癫痫发作风险,从而在保持透明度的同时实现了公平的表现。
慢性疼痛是同伴动物中普遍存在的状况,并带来了巨大的福利挑战。为了有效地解决这些问题,兽医临床医生必须对伤害感受的神经解剖学以及疼痛感知的复杂过程有全面的了解。此知识对于计划和实施目标治疗策略至关重要。但是,有关疼痛机制的许多现有信息来自对啮齿动物或人类的研究,强调需要进行进一步的翻译研究以弥合兽医应用的这一差距。本综述旨在为兽医提供对狗和猫的脊柱伤害感受途径的深入概述,从而追踪从伤害感受器激活到大脑皮质处理的旅程。此外,该评论探讨了影响伤害感受信号传导和疼痛感知的因素。通过增强对这些基本生理过程的理解,这项工作旨在为开发有效的疗法奠定基础,以管理伴侣动物中慢性疼痛的复杂性。
“当代教育和宗教多元化的价值观在当代个人主义和极端主义的景观中”是我们文明生存的基础,它们的意义对记忆是基于记忆的。因此,它们的记忆是我们的教育至关重要的,因为它们通常会受到失真或健忘的影响。作为一种认知系统,记忆会培养想象力和触发情绪。这是一种普遍的文化经历,诗歌的缪斯女神,人类状况的戏剧以及一种以身份,传说,传统,传统和作为想象的行为来约束时期的方式。记忆的生理学以及纪念与想象力之间相互依存的意义来自首先保留,然后回忆并与新的感觉和思想相关的事件。相反,健忘不仅是经过时间或生理缺陷的功能。这也是冲突和抑制,大脑卫生,健忘症,错误记忆和神经可塑性的结果。在精神上,记忆是一种脑运动,也是一种精致的仪式行为,包括身体实践,戒断,冥想,戏剧,戏剧,公共规范等。它与外周不见了的认识论以及数学上的平行分布处理。对于基督教来说,记忆是启示,救赎和礼仪实践的核心。除了基督教之外,记忆仍然是一个神圣的禁忌,因为对于犹太人来说,Zekhirah(记住)是哈拉氏症(法律)义务,而穆斯林的主要职责是Dhikr(记住)由使徒传统建立了宣传(毫不屈服于圣灵)与圣灵圣灵(圣灵的唤起)之间的有机关系,使徒的传统确定,如果没有过去的神行为的最初回忆,就无法唤起圣灵。