在空间测量多模式数据的能力中,可以为在转录,翻译和代谢水平上全面探索分子调节的前所未有的机会,以获取对基于健康和疾病的细胞活动的见解。但是,目前缺乏分析工具来整合不同空间 - 词素数据模式的互补信息,尤其是在空间代谢组学数据方面,这变得越来越宝贵。我们介绍了SPAMTP,这是一种多功能软件,该软件实现了空间代谢组学和转录组学数据的端到端集成分析。基于R,SPAMTP Bridges处理功能,用于来自Cardinal的代谢组学数据,并在Seurat中实施了以用户友好的细胞为中心分析。此外,SPAMTP的综合分析管道涵盖(1)自动质量到电荷比(M/Z)代谢物注释; (2)广泛的基于代谢物的下游统计分析,包括差异表达,途径分析和相关分析; (3)综合空间词分析; (4)一套可视化函数。为了灵活性和互操作性,SPAMTP包括用于数据导入/导出和对象转换的各种功能,从而可以与其他R和Python软件包无缝集成。我们证明了SPAMTP通过分析两个生物系统来吸引新的生物学理解的实用性。我们认为,该软件和实施方法将广泛用于空间多媒体和空间代谢组学分析中。
神经振荡在语音理解过程中跟踪语言信息(Ding等,2016; Keitel等,2018),并且已知通过声学里标和语音清晰度来调节(Doelling等,2014; Zoefel和Vanrullen,2015)。然而,研究语言跟踪的研究依赖于非自然的等级刺激,或者无法完全控制韵律。因此,尚不清楚低频活动是否在自然语音期间跟踪语言结构,在语言结构中,语言结构不遵循如此明显的时间模式。在这里,我们测量了脑电图(EEG),并操纵语义和句法信息外,除了它们发生的时间范围外,同时仔细控制了信号中的声学促销和词汇信息信息。eeg,而29名成年母语者(22名女性,7名男性)听取了荷兰语的口语句子,带有词素和句子韵律的jabberwocky控件,具有词汇内容的单词列表,但没有短语结构,但落后的声音匹配的控件。Mutual information (MI) analysis revealed sensitivity to linguistic con- tent: MI was highest for sentences at the phrasal (0.8 – 1.1Hz) and lexical (1.9 – 2.8Hz) timescales, suggesting that the delta-band is modulated by lexically driven combinatorial processing beyond prosody, and that linguistic content (i.e., structure and meaning) organizes neural oscillations beyond the刺激的时间尺度和节奏性。这种模式与神经生理启发的语言理解模型一致(Martin,2016,2020; Martin and Doumas,2017),其中振荡在外来或刺激驱动的时机和节奏和节奏信息上编码了内源性产生的语言内容。
人类胃肠道(肠道)微生物组在维持宿主健康中起着至关重要的作用,并且越来越被认为是精确医学的重要因素。高通量测序技术已彻底改变了 - 组数据的生成,促进了人类肠道微生物组的表征,并具有出色的分辨率。通过揭示有关功能基因,微生物组成,聚糖和代谢产物的信息,对各种 - 组数据的分析,包括荟萃分析,元基因组学,糖基因组和代谢组学。这种多词方法不仅为肠道微生物组在各种疾病中的作用提供了见解,而且还促进了微生物生物标志物用于诊断,预后和治疗的鉴定。机器学习算法已成为从复杂数据集中提取有意义的见解的强大工具,并且最近通过有效地识别微生物特征,预测疾病状态并确定潜在的治疗靶标,将其应用于宏基因组学数据。尽管有这些快速的进步,但仍然存在一些挑战,例如关键知识差距,算法选择和生物信息学软件参数化。在这个迷你审查中,我们的主要重点是宏基因组学,同时认识到其他 - 词素可以增强我们对生物功能多样性及其与宿主的相互作用的理解。我们旨在探索当前的多词,精密医学和机器学习的交集,以促进我们对肠道微生物组的理解。一种多学科的方法有望在精确医学时代改善患者的结果,因为我们揭示了微生物组与人类健康之间的复杂相互作用。
足以建立生化途径的功能网络(经典的例子是糖酵解途径和克雷布斯循环),从而使人们对分子函数的理解可能被视为分子事件的何种词素 - next静态图片。仍然,只有详细的定量物理模拟(与详细的实验具有较高的空间和时间分辨率),将允许高度置信地提取这种图片。经典的分子动力学模拟提供有效的模型,并且可以基于量子力学进行严格的模型(从技术上讲,这是通过Born-Oppenheimer近似近似,该近似是电子和核运动,然后将后者鉴定为经典动力学中的原子运动)。不幸的是,对量子机械方程的更详细的模拟非常困难,只有少数原子才有可能。但是,如果我们要通过当前的硬件和算法开发所推动的量子计算来推进分子模拟,[9-13]我们可能想知道生物分子模拟在多大程度上会从多大程度上受益于这种发展,以及量子计算是否会成为计算量子分子生物学的关键。[15–18]提到的是,问题是,量子计算的新兴分支是否最终可以比传统方法带来重大进步。换句话说,反应虽然正在进行深入的搜索以对生物学功能的量子作用进行深入的搜索,但[19-22]最重要的量子效应首先是植根于生物分子的电子结构,在较小程度上,在其量子核运动中(例如,提高到隧道和动力学同位素效应)。分子的电子结构确实是定量理论描述和通过反应能量和通过Born-Oppenheimer势能表面进行化学反应的定量理论描述和预测的关键(PES;见图1)。
单细胞分子工具在过去的五年中以令人难以置信的速度开发了,随着测序成本继续下降,并且已经与测序读数进行了许多分子测定。技术发展的快速时期促进了单个分子特征的描述,包括基因组,转录组,表观基因组和单个细胞的蛋白质组,从而导致了控制复杂生物学系统的分子网络的前所未有的分辨率。通过在细胞异质性是关键特征(例如干细胞生物学,免疫学和肿瘤细胞生物学)的系统中,单细胞分子筛选的巨大功能特别强调了。单细胞 - 词素技术已经有助于鉴定出新型疾病生物标志物,细胞亚群,治疗靶标和诊断,其中许多是通过大量测序方法无法检测到的。最近,将单细胞多摩斯与单细胞功能输出和/或物理位置集成在一起的努力已经具有挑战性,但导致了很大的进步。也许最令人兴奋的是,有一些新兴的机会可以超越对静态细胞状态的描述,而最近通过CRISPR技术调节细胞的进步,尤其是基础编辑者的发展,这极大地提高了细胞和基因疗法的前景。在这篇综述中,我们简要概述了新兴的单细胞技术,并讨论了当前整合单细胞分子筛选并为临床应用进行单细胞多媒体的发展。我们还讨论了如何将单细胞分子测定与功能数据结合在一起,以取消细胞决策的机制。最后,我们反映了引入空间转录组学和蛋白质组学的引入,其与单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)(SCRNA-SEQ)的互补作用以及在细胞和基因治疗中的潜在应用。
总结重组词素3A(SEMA3A)对具有异丙肾上腺素(ISP)诱导的心力衰竭的小鼠心肌重塑的影响。C57BL/6J小鼠腹膜内接收的ISP(480 mg/kg/day,ISP组; n = 24)或盐水(对照组; n = 31),持续14天。在第7天和第11天静脉内接受了0.5 mg/kg SEMA3A(ISP+SEMA3A组),接受了0.5 mg/kg SEMA3A。在ISP治疗后激活了交感神经系统,但在SEMA3A给药后降低了交感神经系统。在ISP组中观察到的心肌组织纤维化大于控制组比控制组更大。但是,ISP+SEMA3A和对照组之间的纤维化并没有显着差异。裂缝缩短比对照组低,并在ISP+SEMA3A组中恢复(对照,53±8%; ISP,37±7%; ISP+SEMA3A,48±3%; 48±3%; P <0.05)。单相势势持续时间延长(MAPD 20),但这在SEMA3A给药时逆转(对照,29±3 msP; ISP,35±6 ms; ISP+Sema3a,29±3 ms; P <0.05)。QPCR显示ISP组的KV4.3,KCHIP2和SERCA2下调以及ISP+SEMA3A组的上调;但是,蛋白质印迹显示仅针对KV4.3(p <0.05)的变化类似。 静脉注射SEMA3A可以通过抑制心肌的交感神经并减少心肌组织损伤来维持心肌收缩性,此外还可以通过kv4.3恢复MAPD。QPCR显示ISP组的KV4.3,KCHIP2和SERCA2下调以及ISP+SEMA3A组的上调;但是,蛋白质印迹显示仅针对KV4.3(p <0.05)的变化类似。静脉注射SEMA3A可以通过抑制心肌的交感神经并减少心肌组织损伤来维持心肌收缩性,此外还可以通过kv4.3恢复MAPD。(INT心脏J 2023; 64:453-461)关键词:交感神经系统,收缩功能,钾通道,心脏重塑
电子邮件:lekhnitskaya.polina@gmail.com 摘要:在自然语音感知范式中尚未研究过单词预测机制,因此本研究的目的是:探索自然语音感知过程中 EEG 反应功能与省略单词之间的联系、训练语言模型的置信度得分。 14 名神经典型受试者(平均年龄 - 23.5 岁;5 名男性)参与了这项研究。EEG 包括 24 个通道。研究对象被要求听故事并理解它。所得结果显示,在 T3、T5、P3 电极中,听省略单词和非省略单词存在差异。为了模拟神经信号和自然语音刺激之间的联系,应用了 mTRF。该研究未来可能的方向之一是探索这一范式中的交流过程。 介绍 人脑是一个复杂的动力系统,可以不断处理输入信息。对于声音刺激,与其他类型的感官信息一样,区分信号和噪声非常重要;通过理解信号的特征,人们可以轻松地感知语音。近年来,研究人员开始将注意力转向使用连续的自然语音来探索大脑评估听觉刺激的方式 [3]。其中一种可能的方法称为系统识别,即根据语音刺激对获得的数据进行建模 [3]。在这种情况下,大脑被视为一个“黑匣子”,其中输入语音的特征与神经生理反应之间存在一些映射。这样的黑匣子可以表示为线性时不变系统,通过 EEG 与声学和语言特征之间的联系获得所谓的时间响应函数 (TRF) [3]。据我们所知,在这个范式中还没有研究过单词预测的机制。在语音感知过程中,单词嵌入在更广泛的上下文中,这有助于意义的解释。接收者还可以对即将到来的话语中可能出现的特定词素做出预测。此任务类似于掩码语言建模,其中预训练模型通过双向关注标记来预测句子中的掩码标记(通常标记为 [MASK])。在这种情况下,模型还会根据上下文对该词进行预测 [7]。现在,感知和理解的神经科学
9月4日星期三9月19日星期三 - 21:00欢迎接待,信息学论坛,Crichton Street,EH8 9AB,9月5日,星期四,9月5日,星期四,注册和欢迎咖啡08:45-09:00开放09:00-09:00-09:00-09:45 Keynote 1:Liina Pyla pylkkanen语言:我们的临时订购:我们的临时订购:输入?09:45 - 10:25 Session 1 - Comprehenders use consecutive cues to update prediction incrementally: Evidence from eye-tracking and ERPs [Kayla Keyue Chen, Fan Xia, Suiping Wang, Wing-Yee Chow] - Metaphor processing between images and propositions: an EEG study [Federico Frau, Paolo Canal, Maddalena Bressler, Chiara Pompei, Valentina Bambini] 10:25-11:40咖啡和星期四早晨的海报11:40-13:00会议2-视觉系统可以识别遮盖的词素吗?来自他加禄语预固定的行为和MEG证据[Dave Kenneth Cayado,Samantha Wray,Marco Chia -ho Lai,Adam Chong,Linnaea Stockall] - 使用鼠标跟踪(MOTR)来调查协议的处理(Metehanoğuz,cui fiential fiential fiention for)吸引力:希伯来语中虚幻特征连词的证据[Mandy Cartner,Maayan Keshev,Stav Lipitz,Brian Dillon,Aya Meltzer- Asscher] - 语义与协议:是什么决定了对德国括号范式的解释?来自他加禄语预固定的行为和MEG证据[Dave Kenneth Cayado,Samantha Wray,Marco Chia -ho Lai,Adam Chong,Linnaea Stockall] - 使用鼠标跟踪(MOTR)来调查协议的处理(Metehanoğuz,cui fiential fiential fiention for)吸引力:希伯来语中虚幻特征连词的证据[Mandy Cartner,Maayan Keshev,Stav Lipitz,Brian Dillon,Aya Meltzer- Asscher] - 语义与协议:是什么决定了对德国括号范式的解释?[Anna Prysłopska, Titus von der Malsburg] 13:00 - 14:30 Lunch on your own 14:30 - 15:50 Session 3 - Priming motion event constructions within and across languages in heritage speakers [Ioli Baroncini, Anna Michelotti, Helen Engemann] - Frequent exposure to linguistic features affects constructional biases [Michelle Perdomo, Duane Watson] - To share or不分享:这是P共享问题[Austin Keen,Masaya Yoshida] - 精神词典中如何存储单词?A pupillometry study [Camilo R. Ronderos, Henriette Johansen, Ingrid Lossius Falkum] 15:50 - 17:10 Coffee & Thursday Afternoon Posters 17:10 - 17:50 Session 4 - On the relation between consciousness presentation and exempt reflexives [Christy Junyuan Gu, Hannah Rohde, Patrick Sturt] - fEMG as a window into conversational commitments [Harriet Yates,Peter de Swart,Bob Van Tiel,Corien Bary]
通过医学事务合作研究计划,肺(NSCLC),上胃肠道(GI)和妇科(GYN)癌症的研究进行了研究,Gilead支持学术机构,临床研究人员的研究工作,以及研究网络的研究网络,以评估促进癌症学发展的最佳方法。根据科学问题的有效性,数据差距的相关性以及研究询问的独创性,对提案进行评估,以确保它不会复制现有的工作或研究。此提案请求(RFP)计划的重点是研究以推进肺部(特别是NSCLC),上胃肠道(GI)和妇科(GYN)癌症的发展。非小细胞肺癌(NSCLC)是全球癌症死亡的主要原因,出现异质性患者,繁重的症状,低生活质量(QOL)和不良的预后,尤其是在转移阶段诊断出来的情况下,在超过一半的病例中发生,导致生存期限显着降低。在2022年的ASCO年度会议上提出的ARC-7研究1(NCT04262856)的13,14个结果表明,无进展生存率(PFS)和整体响应率(ORR)与Domvanalimab(Dom)和Zimberelimab(Zimbab(Zimberimab)与Zimberelimab相比,持续提高了无进展生存率(PFS)和整体响应率(ORR)。 TPS≥50%,没有EGFR/ALK突变。这项研究证明了FC-SiLent抗词素 /抗PD-1组合的潜在疗效,没有意外的安全信号,支持了NSCLC中正在进行的DOM和ZIM的3阶段注册研究。这些此外,吉利德(Gilead)还有多项研究,包括Immu-132-01(NCT01631552)9和Evoke-02(NCT05186974)10,这证明了sacituzumab govitecan(sg)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的sacituzumab govitecan(sg)和monother aptination和monother p.em and arnations and oserniz和combination combination。尽管第三阶段的研究Evoke-01(NCT05089734)11在NSCLC患者中未达到其主要终点(OS)的主要终点(OS),但PD-L1疗法和PD-L1疗法的数值在OS中的数值改善,而OS在OS中偏爱SG而不是在意图中的OSS(ITT)中的OSS(ITT)中的OSS中有所改善(ITT),ITT(ITT)的OSS中有任何改善,方案。这些发现支持正在进行的第3阶段Evoke-03(NCT05609968)12 SG研究与Pembrolizumab在一线转移性NSCLC(MNSCLC)中的结合,并继续对SG在肺癌中SG的潜在作用的持续兴趣。上GI癌症,包括食管,胃食管结和胃癌,代表着未满足的医疗需求的重要领域,可切除疾病的复发率很高,5年生存率为7%8。虽然在化学疗法中添加抗PD-1疗法已显示出一线环境中的结局有所改善,但很大一部分患者未能对免疫疗法加化学疗法产生令人满意的反应,并且对响应者的复发仍会发生。ARC-21/EDGE胃研究2(NCT05329766)的初步结果在2023年在ASCO虚拟全体会上提出,在上胃肠道癌中将DOM和ZIM与FOLFOX化学疗法结合起来,导致客观响应率和早期的无效生存,并具有与抗抗抗素的生存相比,并具有可比性的抗pd-pd-1 + Folffox- + Folfox。4这些发现有助于对第一线上层GI癌症治疗中3阶段Star-221研究3(NCT05568095)的支持。妇科癌症,包括子宫内膜,卵巢癌和宫颈癌,是多个具有高持久未满足需求的领域,尽管肿瘤进行了积极发展,但预计仍将持续存在。gilead具有多样化的投资组合,sacituzumab govitecan(SG)在GYN中获得了令人鼓舞的结果,这是一个潜在的基石,得到了2阶段研究Tropics-03 5(NCT03964727)的支持(NCT04251416)15。
*信函:odinita.chime@uniben.edu; doi:https://doi.org/10.52417/njls.v13i1%20&%202.374抽象的红辣椒(辣椒辣椒lim)是辣椒属中最经济重要的物种。他们属于茄科的茄科。它的形状,尺寸,颜色,风味,热量水平和营养特性变化。这项研究旨在确定从贝宁市都会和周围五个不同市场购买的新鲜辣椒辣椒的近端,矿物质和微生物评估。总共购买了25个胡椒样品;标准的生化方法用于分析其近端组成。The proximate composition included moisture (4.48±0.18 g/100g), ash (4.94±0.14 g/100g), carbohydrate (17.60±0.34 g/100g), protein (11.40±0.16 g/100g), fat (23.65±0.41 g/100g), crude protein (21.29±0.28 g/100g)和粗纤维(38.76±1.07 g/100g)。对矿物元素含量的分析表明,钾是最丰富的(654.12±5.46 mg/100g),其次是镁(237.59±3.63 mg/100g),钙(174.71±2.93 mg/100g),铁(17.49±0.49±0.25 mg/100g),Sodium(17.49)和锰(2.16±0.05 mg/100g)。对胡椒样品的微生物评估产生了八种微生物,包括芽孢杆菌,念珠菌,金黄色葡萄球菌,肠杆菌sp。和大肠杆菌。从Uselu市场采购的样品(32.1%)是微生物污染最多的样本,而来自Oliha市场的样本(12.5%)受感染最少。芽孢杆菌金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌是最普遍的微生物,每种生物的患病率为23.2%。在研究的新鲜红辣椒中,细菌污染不仅仅是真菌。也观察到,这些红辣椒的环境对它们的变质有很大贡献。这项研究的结果表明,胡椒可能是改善人类健康的重要饮食补充剂,但必须注意防止在处理和储存过程中微生物污染。关键字:近端,矿物质,胡椒,微生物,变质简介胡椒(Capsicum spp。)是标志性和多样化的植物物种(Bosland and Fotava,2002)。它们的大小,形状,颜色,风味,热量,营养价值和应用都不同。辣椒的品种与成长的地区和耕种者一样多。辣椒是全球使用的辛辣和非辣味的来源。辣椒是奇特的,因为它们被用作蔬菜(或严格地说是水果)和香料(Greenleaf,1986)。他们将菜肴赋予味道,颜色和辣味。此外,它们还提供重要的维生素,矿物质和营养。胡椒的提取物用于药物,化妆品,绘画和胡椒喷雾剂。除了用作饭菜,调味品和药物外,辣椒还用于其美学价值。它是茄科家族和亚家族词素科的成员,是由于其必不可少的应用而在全球范围内培养的,因为其食品,香料,装饰,药物,lachrymatories和Lachrymatories和Vitamins(A和C)(A和C)(Perry等,2007)。人类饮食中的微量营养素不足仍然是一个巨大的全球问题,很可能是几种慢性健康问题和疾病的根本原因。据估计,全世界有超过两(2)亿人在重要的矿物质和维生素(尤其是锌,碘,维生素A和铁)中不足,这主要是由于食用不良而导致的。只有在脆弱人群的饮食包括适当水平的所有基本要素时,才有可能以持续方式消除微量营养素的缺陷。在消除人类营养不足的几种策略中,食用各种食物,尤其是含有各种微量营养素的蔬菜,仍然被视为最可行的替代品。辣椒辣椒(辣椒辣椒)的广泛摄入量,以其丰富的营养含量(包括多种维生素,矿物质,植物化学物质和饮食纤维)而被认可,5月