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Genomics 基因体学
■Genomics (基因体学) ■History of DNA sequencing (DNA定序历史) ■The first-generation DNA sequencing (第㇐代DNA定序) ■Next-generation sequencing (NGS,次世代定序) ■CRISPR/cas9 genome editing (基因编辑技术) ■Genome analysis (基因体分析)
支持信息是适体...
化学和解决方案。氯化镁（MGCL 2），碳酸氢铵（NH 4 HCO 3），L-甘氨酸，Trizma®碱基，Tween-20，乙醇胺（EA），N-（3-二甲基氨基氨基丙基）-N'-乙基甲基二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二酰基（EDC） bovine serum albumin (BSA), sodium hydroxide, sodium chloride, 4-morpholineethanesulfonic acid monohydrate (MES), hydrochloric acid, formic acid (FA), streptavidin-alkaline phosphatase from Streptomyces avidinii conjugate (Strep-ALP) and lysozyme from chicken egg white were purchased from Merck （意大利米兰）。磷酸钾（KH 2 PO 4），二氯磷酸二硫酸氢钾（K 2 HPO 4），磷酸钠二迪巴斯二硫酸二硫代十二碳水化酸盐（Na 2 HPO 4·12H 2 O），氯化钾和无rnase含水量和无RNase水的含量是从Carlo Erba（Cornaredo Erba（Cornaredo）（Cornaredo）（Cornaredo）（Cornaredo）（Cornaredo），Milan，Milan，Milan，Milan，Milan，Italan，Italan，Italy。氢喹酮双磷酸（HQDP）由Metrohm Italiana（Origgio，意大利Varese）提供。通过Milli-Q Element A10系统（Millipore，旧金山，加利福尼亚州，美国）获得了去离子水，并用于缓冲溶液制备。缓冲溶液的组成如下。无RNase缓冲液用于所有RNA适体的实验中。单链DNA序列购自Biomers.net（德国ULM），而C80RNA序列是从代替（Carlo Erba，Carlo Erba，Milan，意大利）。所有的寡核酸均处于干燥状态，适当地等分以避免反复的冻结/解冻周期。在Milli-Q水中以DNA寡核素进行了冻干等分试样的重悬，而C80RNA的无RNase水中的水则达到了供应商建议的100μM终浓度。库存溶液存储在-20°C。MES缓冲液：25毫米ME（pH 5.0）; Tris缓冲液：0.1 MTrizma®基础，5 mm MGCL 2（pH 7.4）; TRIS-T缓冲液：0.1 MTrizma®基础，5 mm MGCL 2，0.05％w/vtween®20（pH 7.4）; TRIS盐水缓冲液：20 mMTrizma®基础，5 mM MGCL 2，0.1 M NaCl（pH 7.4）;含镁离子（PBS-MG 2+）的磷酸盐缓冲盐盐水：1.5 mm kH 2 PO 4，8 mm Na 2 HPO 4，137 mm NaCl，2.7 mm KCl，1 mm MGCL 2（pH 7.4）；从Thermo Fisher Scientific（美国马萨诸塞州沃尔瑟姆）购买磷酸盐缓冲盐水（PBS）作为干燥粉末，其溶解后具有以下成分：0.1 m Na 2 HPO 4，0.15 m NaCl（pH 7.2）； Tris甘氨酸钾（TGK）缓冲液：25 mMTrizma®基础，192 mm L-甘氨酸，5 mm K 2 HPO 4（pH 8.3）。
新的单倍型解析火鸡基因组，用于火鸡遗传学和基因组学研究
结果：通过采用三重分箱方法，我们能够利用长读技术和全基因组染色质相互作用数据 (Hi-C) 组装出高质量的染色体水平 F1 组装体和 2 个亲本单倍型组装体。从总共 40 条染色体 (2n = 80) 中，我们在单个支架中捕获了 35 条染色体，与旧的组装体相比，基因组完整性和连续性得到了很大的改善。这 3 个组装体的质量高于之前的草图质量组装体，与鸡组装体 (GRCg7) 相当，最大的重叠群 N50 (26.6 Mb) 和可比的 BUSCO 基因集完整性得分 (96-97%) 也显示出了这一点。比较分析证实了之前发现的 Z 染色体上约 19 Mbp 的大倒位，而其他鸡形目动物中没有发现这种倒位。已发现亲本单倍型之间的结构变异，这为育种提供了潜在的新目标基因。
将适体修饰的纳米移液器与神经元介质和离体脑组织连接起来
摘要：适体功能化的生物传感器在监测复杂环境中的神经递质方面表现出高选择性。我们将纳米级适体修饰的纳米移液器传感器转化为检测体外和离体内源性多巴胺的释放。这些传感器采用具有纳米级孔（直径约 10 纳米）的石英纳米移液器，其用适体功能化，从而能够通过目标特定的构象变化选择性捕获多巴胺。多巴胺结合后适体结构的动态行为导致纳米孔内表面电荷的重排，从而导致可测量的离子电流变化。为了实时评估传感器性能，我们设计了一个流体平台来表征纳米移液器传感器的时间动态。然后，我们通过在生物环境中部署用非特异性 DNA 修饰的对照传感器以及多巴胺特异性传感器来进行差异生物传感。我们的研究结果证实了适体修饰的纳米移液器可用于直接测量未稀释的复杂流体，特别是在人类诱导多能干细胞衍生的多巴胺能神经元的培养基中。此外，传感器植入和急性脑切片中的重复测量是可能的，这可能是由于纳米级 DNA 填充孔内的受保护传感区域，最大限度地减少了非特异性干扰物的暴露并防止堵塞。此外，背外侧纹状体通过电刺激释放的内源性多巴胺的差异记录表明适体修饰的纳米移液器具有以前所未有的空间分辨率和减少的组织损伤进行体外记录的潜力。关键词：生物传感器、DNA、多巴胺、流体学、诱导多能干细胞衍生的神经元、纳米孔■简介
外泌体和牙周组织工程中的外泌体复合支架
促进受损牙周组织的完全牙周再生，包括牙髓，牙周韧带和肺泡骨，是治疗牙周炎的挑战之一。因此，迫切需要探索牙周炎的新治疗策略。由干细胞产生的外泌体现在是干细胞疗法的有前途的替代品，其治疗结果与其爆炸细胞的替代效果相当。它在调节免疫功能，炎症，微生物群和组织再生方面具有巨大潜力，并且在牙周组织再生中表现出良好的影响。此外，牙周组织工程将外泌体与生物材料支架相结合，以最大程度地提高外泌体的治疗优势。因此，本文回顾了牙周再生中外泌体和外泌体复合支架的进度，挑战和前景。