您将组装来自锯齿状铜菌菌株Cav1492的分离株。该菌株具有一个染色体和五个质粒。测序数据包含7,038个小小的读取,平均读取长度超过12,000 bp,一组Illumina读取了从同一菌株进行测序的读取。Illumina读取已被删除,以降低本教程中的分析时间。数据集中包含的参考基因组是由深层覆盖的PACBIO和配对末端测序数据制成的。可从https://ncbi.nlm.nih.gov/datasets/ genome/gca_001022215.1/。
碱基调用是纳米孔测序分析中的一个重要步骤,其中纳米孔测序仪的原始信号被转换成核苷酸序列,即读取。最先进的碱基调用器使用复杂的深度学习模型来实现高碱基调用准确性。这使得碱基调用在计算上效率低下且耗费内存,成为整个基因组分析流程的瓶颈。然而,对于许多应用而言,大多数读取与感兴趣的参考基因组(即目标参考)不匹配,因此在基因组学流程的后续步骤中被丢弃,浪费了碱基调用计算。为了解决这个问题,我们提出了 TargetCall,这是第一个预碱基调用过滤器,以消除碱基调用中浪费的计算。TargetCall 的主要思想是在碱基调用之前丢弃与目标参考不匹配的读取(即脱靶读取)。 TargetCall 由两个主要组件组成:(1) LightCall,一种产生噪声读取的轻量级神经网络碱基调用器,以及 (2) 相似性检查,它通过将这些噪声读取与目标参考进行匹配,将每个噪声读取标记为在靶或脱靶。我们彻底的实验评估表明,TargetCall 1) 将最先进的碱基调用器的端到端碱基调用运行时性能提高了 3.31 倍,同时在保持目标读取方面的高 (98.88%) 召回率,2) 在下游分析中保持高准确率,以及 3) 与以前的工作相比,实现了更好的运行时性能、吞吐量、召回率、准确率和通用性。TargetCall 可在 https://github.com/CMU-SAFARI/TargetCall 获得。
两步结核病皮肤测试记录 此表格用于记录所需的首字母两步结核病皮肤测试,是计划健康表的一部分。请注意,建议每次测试间隔 1 至 3 周。步骤 1 结核病测试:批号 ___________________________________________ 注射部位:_______________________________________ 注射日期:_______________________________ 注射时间:____________________________________ 医疗保健提供者签名:___________________________________________________________________________ 48-72 小时读取日期:_______________________ 读取时间:____________________ 结果:______________(mm) 医疗保健提供者签名:___________________________________________________________________________ 姓名___________________________ 出生日期 ______________ 横幅 ID 号 ____________ 步骤 2 结核病测试:批号 ___________________________________________ 注射部位:_________________________________________ 注射日期:_______________________________ 注射时间:____________________________________ 医疗保健提供者签名:___________________________________________________________________________ 48-72 小时读取日期:_______________________ 读取时间:____________________ 结果:______________(mm) 医疗保健提供者签名:___________________________________________________________________________
图1:Braker3管道的示意图。所需的输入是基因组序列,简短读取RNA-seq数据和蛋白质数据库。RNA-Seq数据可以以三种不同的形式提供:在序列读取存档中可用的库的ID(Leinonen等,2010),未对齐的读取或对齐的读取。如果给出了库ID,则Braker3使用SRA工具包(https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/traces/traces/sra/sra/sra/sra.cgi?view=software)下载RAW RNA-SEQ,并使用HisAT2(Kim等,2019,2019年)与基因组对齐。使用多个库时也可以使用这些格式的组合。
编写并执行以下 C 程序:1. 读取圆的半径并求出面积和周长。2. 读取数字并找出三个中最大的一个。3. 检查数字是否为质数。4. 求二次方程的根。5. 读取数字,求出各位数字之和,反转数字并检查其是否为回文。6. 连续从键盘读取数字直到用户按下 999 并求出仅正数之和。7. 读取分数百分比并显示适当的信息。如果百分比为 70 及以上 - 优异,60-69 - 一等,50-59 - 二等,40-49 及格,低于 40 - 不及格。(演示 if-else 阶梯)8. 模拟一个带有加、减、乘、除功能的简单计算器,并使用 switch case 显示除以零的错误消息。 9. 读取 n 名学生的成绩并计算平均成绩(一维数组演示) 10. 删除一维数组中的重复元素。 11. 求一个数的阶乘。 12. 生成斐波那契数列。 13. 使用嵌套 for 循环设计以下模式:
RaspberryPi 使用 Shield PiEEG 测量 EEG、ECG、EMG 和 EOG 本文介绍了用于通过单板计算机系列(RaspberryPi、OrangePi、BananaPi 等)读取信号的屏蔽 PiEEG 的硬件和软件。本文主要提供了如何实现该设备的技术信息。该设备旨在熟悉神经科学,是开始进行 EEG 测量的最简单方法之一。 Ildar Rakhmatulin,博士,PiEEG,ildarr2016@gmail.com 来源 https://github.com/Ildaron/EEGwithRaspberryPI 演示 https://youtu.be/uK8QF2liO5U 关键词:RaspberryPi 和 EEG、ECG、EMG 和 EOG;脑机接口;RaspberryPi 屏蔽 1. 简介 脑机接口是一种读取脑信号的设备,以识别可用于实际目的的任何相关性。 2021 年,我们开发了脑机接口 - ironbci [1,2,3],但芯片短缺大大增加了设备的成本,之后我们改用 PiEEG 屏蔽,这使得降低设备成本和简化安装过程成为可能。PiEEG 设备在会议 [4] 和出版物 [10] 中进行了一般性介绍。在本文中,我们将更多地关注该设备实现的技术细节。2. 安全建议开发的设备仅针对 Raspberry Pi 进行了测试。在测试期间,禁止将设备连接到电源,这是出于安全考虑并避免网络干扰。通过电网供电时不能使用此设备,并且只能在使用 5V 电池(容量不超过 2000 mAh)时使用它。图 1 是设备完整组装的概览。
远程感知可以将电池充电时间减少50%。28SI配备了远程感知,该感觉利用了第二条电线,该电线读取电池处的实际电压。这标志着交流发电机以增加输出以补偿电压降,从而确保电池处的14伏。适当的电压力更多地进入电池,使其达到车辆停靠之间的全部充电状态。
• 它可以连接到所有 Teknim 可寻址设备 • 它可以通过特殊终端连接到所有设备,无论编程方向如何 • 实现快速简便的编程 • 通过“记忆”功能保存内存中的最后一个地址并防止重复地址错误 • “智能等待时间”功能可在设备不使用时切换到待机模式 • 它用于写入-读取地址、更改现有地址、读取版本、读取序列号和生产日期。
现在,许多仪表已被“智能仪表”取代,智能仪表可自动读取,因此精度更高。但是,每年读取一到两次仪表读数仍然很重要,以确保自动读取过程的准确性。许多仪表尚未被替换,需要读取这些仪表以避免账单估算过高。输入数据很简单,系统会验证每个条目。此外,您可以根据需要随时提交读数,因此虽然您可能每季度才收到账单,但没有什么可以阻止您每周输入读数以建立真正准确的记录。过去,可能使用手动系统(如仪表读数卡或传真)来实现此目的。Web 报告系统通过让您在线访问数据库,使流程更简单、更快捷。