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World File Search System质粒
宿主范围质粒RSF1010 DNA复制
广泛的宿主质粒RSF1010包含两个相反的启动信号SSIA和SSIB，用于DNA合成，取决于营养DNA复制的起源（ORIV）。如果已删除或倒置SSIA或SSIB，则在低拷贝数中保持了含有工程Orivs的RSF1010微型弹药，将其作为二聚体异常复制，并积聚了在Escherichia coil collewe preats fessefcef101010-Repcepcepcepcepcepc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc'repc''和Repc'repc'repc''''repc''和Repc。有趣的是，SOG原始酶（质粒Collb-P9的SOG基因产物）的附加细胞内供应与上述所有三个方面相反，这些微播的复制缺乏。对于RSF1010的微型杂粒也是如此，其中SSIA或SSIB被原始体组装位点（PAS）或G4型SSI信号（G位点）代替。此外，对两个相对定向的SSI信号对RSF1010的DNA复制的功能贡献的比较分析表明，无论其类型如何，SSI信号引起了DNA链伸出的启动，从而使Iterons远离Iteron的启动比在ITEREN中的功能更重要。我们认为该功能差异反映了RSF11O DNA复制的启动机械机械的固有特性。
甲烷营养型 Methanoperedens 古菌中广泛存在的一大类质粒
厌氧甲烷营养 (ANME) 古菌从甲烷分解中获取能量，但人们对它们的染色体外遗传元素了解甚少。本文我们描述了与 Methanoperedens 属的 ANME 古菌相关的大质粒，这些质粒在富集培养物和其他天然缺氧环境中存在。通过人工筛选，我们发现其中两个质粒很大（155,605 bp 和 191,912 bp），呈环状，并且可以双向复制。质粒的拷贝数与主染色体相同，并且质粒基因被积极转录。其中一个质粒编码三种 tRNA，即核糖体蛋白 uL16 和延伸因子 eEF2；这些基因似乎在宿主 Methanoperedens 基因组中缺失，表明质粒和宿主之间存在强制性的相互依赖性。我们的工作为开发遗传载体开辟了道路，以阐明 Methanoperedens 的生理学和生物化学，并可能对其进行基因编辑以增强生长并加速甲烷氧化速率。
Wuxi Biologics引入了新的平台，以增强重组蛋白和质粒DNA的产生
Effix平台是Wuxi Biologics的更广泛集成技术平台的组成部分，该平台基于微生物表达系统。这个全面的平台涵盖了早期研究，CMC开发和GMP制造，在下一代疗法领域的各种方式中，更快，更有效，更具成本效益的制造过程。
用于生成trichoderma koningiopsis的原生质体和质粒DNA
转换方案可以在一天之内进行PEG介导的转换和ATMT，而对于电穿孔和LiPofection，这两者都可以在半天内完成。但是，材料和设备设置部分中列出的缓冲区和材料的早期准备是必不可少的。要准备培养物，必须根据所选技术在3到5天之间生长真菌。菌丝体可以在3天后在液体培养中产生，但是对于孢子，必须在固体培养基上生长4-5天。转化后，必须将真菌种植2周，在此期间需要3个亚文化才能获得均应转化剂。全部，转换的时间表在3到4周之间。使用质粒PDHT/SK-CEP进行所有实验，为此，骨架是从Zhihua Zhou（addgene质粒＃92126）获得的。7
RNase 4（NEB＃M1284）MRNA 5´CAP结构的DNA探针指导分析| neb nebnext UltraExpress FS DNA库准备套件E3340手册 化学品安全技术说明书 使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌 君主质粒小型套件T1010手册 新英格兰Biolabs分析证书 胜任的细胞 基因组编辑 Authenticase M0689手册 R＆D和对... 的制造支持 新英格兰Biolabs分析证书 Authenticase M0689手册 裂解靠近DNA片段的末端（线性化矢量） Nebnext Ultra DNA库Prep套件，用于Illumina E7370手册 腺病毒2 Nebnext Ultra II DNA库Prep套件，用于Illumina，用于Illumina（独特的双索引UMI适配器DNA）E7645 E7645 E7103手动 NEBNEXT微生物组DNA富集试剂盒E2612手册 DNA组装与合成生物学 DNA组装与合成生物学 通过双链DNA片段的单链DNA寡桥构建SGRNA-CAS9表达载体 nebnext®快速DNA库预备组件454 Monarch MAG病毒DNA/RNA提取套件T4010手册 新英格兰Biolabs分析证书 T4 DNA连接酶（M0202）CHN 的安全数据表 翠鸟柔性自动隔离病毒DNA/RNA的方案| neb 基因编辑 φx174
已测试至少20 nt。探针可以用3´或5´生物素/Desthiobiotin亲和力组设计，用于链霉亲和素富集（NEB＃S1421）。为了获得最佳结果，受保护的DNA：RNA杂交区应为4或5个核苷酸
将质粒DNA转换为微圆
在此方案中，我们描述了一种将质粒DNA转化为DNA微圆的新方法，该方法仅由转基因序列组成。这种方法利用了质粒的可伸缩性，同时使用标准分子生物学方法将体外转化率转化为微圆，从而规定了对特殊生产细菌菌株的需求。
用Origen生成功能性质粒起源
1加州大学伯克利分校的创新基因组学研究所，伯克利，加利福尼亚州94720，美国†这些作者对这项工作也同样做出了贡献：杰米·欧文（Jamie Irvine），吉利亚萨·阿罗拉（Jamie Irvine），吉利亚萨·阿罗拉（Jigyasa Arora），杰纳森·阿罗拉（Jigyasa Arora），乔纳森（Jonathan N.V. Martinson）能够复制。专注于质粒作为最小复制系统，我们开发了Origen，这是一种语言模型，在维持基本功能元素的同时，会产生复制的新质粒起源。我们在实验上验证了Origen创建功能起源的能力，该功能与现有野生类型不同，这表明了该模型捕获生物复制的复杂且经常神秘的机制的能力。
通过计算设计的聚合物纳米颗粒（PNP）递送质粒DNA
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.22.639634 doi：Biorxiv Preprint
复制的合成起源的工程质粒
默认情况下，将RNase H处理的RNA结构折叠为RNA结构，以创建用于DNA聚合酶I（pol I）的底物以启动DNA复制。反义RNA是由重叠基因产生的，如果允许该基因与RNA底漆相互作用，则会诱导不启动DNA复制的替代折叠。由于反义RNA的浓度与质粒副本成正比，因此作为拷贝控制负反馈回路。（b）10
体外组装质粒DNA用于直接克隆lactiplantibacillus plantarum wcsf1
使用悬垂引物在PCR产物的末端添加悬垂序列来扩增感兴趣的序列。悬垂序列的长度取决于用于吉布森组件的商业套件。如果使用了来自新英格兰Biolabs（NEB）的HIFI组装主混合物，则足够的20个碱基对。