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World File Search System超家族
特刊 - 肌动型的多样性和分类法
拥有大约35,000种描述的物种，Scarabaeoidea是最大的甲虫超家族之一，包括多样化和受欢迎的群体，例如粪甲虫，鹿肉甲虫，六月甲虫，花奶酪，花香糖和犀牛。在化石记录中表现得很好，自侏罗纪以来就已经存在。它们是共生的，死亡的，植物的，腐生的和木质的，有些甚至是食肉。一些物种与人类竞争资源，被认为是严重的害虫，例如在棕榈中发展的日本甲虫和犀牛甲虫；其他人非常有益，例如甲虫，可以改善土壤质量和植物的生长。具有高度多样性的生态需求，全球分布和巨大的物种多样性，因此，甲壳虫是一个流行的研究目标，涵盖了从化学生态学到分类学和害虫控制的学科。本期特刊将展示Scarabaeoid研究的这些不同方面，特别关注分类法和多样性的各个方面。您可以选择我们的分类学共同特刊。
化学改良抑制剂的细胞验证鉴定出 OTUB2 上的单泛素化
摘要：泛素硫酯酶 OTUB2 是一种来自卵巢肿瘤 (OTU) 去泛素酶超家族的半胱氨酸蛋白酶，在肿瘤进展和转移过程中经常过度表达。因此，OTUB2 抑制剂的开发被认为具有治疗重要性，但针对 OTUB2 的有效且选择性小分子抑制剂却很少。本文，我们描述了一种改进的 OTUB2 抑制剂 LN5P45 的开发，该抑制剂包含一个与活性位点半胱氨酸残基共价反应的氯乙酰肼部分。LN5P45 在活细胞中表现出出色的靶标参与度和蛋白质组范围的选择性。重要的是，LN5P45 以及其他 OTUB2 抑制剂强烈诱导 OTUB2 在赖氨酸 31 上的单泛素化。我们提出了未来 OTUB2 相关治疗的途径，并表明本研究开发的 OTUB2 抑制剂有助于揭示相关生物学的新方面，并开启有关理解 OTUB2 在翻译后修饰水平上的调控的新问题。■ 介绍
细菌间 DNA 脱氨酶毒素直接诱变幸存的目标种群
摘要 当细菌细胞接触时，通常会通过毒素传递介导拮抗作用。此类接触对受体细胞产生长期有益影响的可能性尚未得到研究。在这里，我们研究了 DddA 中毒的影响，DddA 是一种胞嘧啶脱氨酶，通过伯克霍尔德菌的 VI 型分泌系统 (T6SS) 传递。尽管 DddA 具有杀灭潜力，但我们观察到几种细菌对 DddA 有抵抗力，反而会积累突变。这些突变可导致获得抗生素耐药性，这表明即使在没有杀灭的情况下，细菌间拮抗作用也会对目标群体产生深远影响。对脱氨酶超家族中其他毒素的研究表明，诱变活性是这些蛋白质的共同特征，包括我们展示的代表性毒素，它以单链 DNA 为目标，并显示出明显不同的结构。我们的研究结果表明，细菌间拮抗相互作用的一个令人惊讶的结果可能是通过直接诱变毒素的作用促进适应。
研究论文对PGM2L1作为胆管癌的预后生物标志物的新颖见解：对代谢重编程和肿瘤MicroENV
胆管癌（CCA）是一种高度致命的恶性肿瘤，是肝胆系统中最常见的腺癌。pgm2l1属于α-D-磷酸化酶超家族，作为葡萄糖1,6-双磷酸（G16BP）合酶的作用。越来越多的证据可以提供其与癌症代谢和进展的关联。然而，PGM2L1在CCA发育中的分子机制仍然缺乏证据。在这项研究中，我们发现PGM2L1表达高的CCA患者预后最差。我们确定了PGM2L1基因中的两个甲基化位点（CG15214137和CG03699633）及其预后相关性。我们进一步研究了PGM2L1表达与肿瘤浸润的免疫细胞之间的关系，特别关注CCA中性粒细胞。功能富集分析进一步表明，高PGM2L1表达与Wnt信号通路，糖酵解代谢和中性粒细胞的募集有关。共同表明，PGM2L1可以用作独立的预后生物标志物，并且与CCA中的肿瘤免疫浸润和代谢重编程密切相关。
药理学和毒理学年度回顾使用 DREADD 技术识别抗糖尿病药物的新靶点
G 蛋白偶联受体 (GPCR) 形成一个质膜受体超家族，可与四种主要的异三聚体 G 蛋白家族 G s 、 G i 、 G q 和 G 12 偶联。GPCR 是药物治疗的极佳靶点。由于各个 GPCR 由许多不同类型的细胞表达，因此特定细胞类型表达的特定 GPCR 的体内代谢作用尚不清楚。设计 GPCR 被称为 DREADD（仅由设计药物激活的设计受体），可选择性地与不同类别的异三聚体 G 蛋白偶联，极大地促进了该领域的研究。本综述重点介绍如何使用 DREADD 技术探索不同 GPCR/G 蛋白级联在几种代谢重要的细胞类型中的生理和病理生理作用。从这些研究中获得的新见解应促进基于 GPCR 的治疗方法的开发，以治疗 2 型糖尿病和肥胖症等主要代谢疾病。
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摘要：NUR77属于核受体超家族的NR4A亚组。与其他核受体不同，尚未确定NUR77的天然配体。但是，一些小分子可以与该受体相互作用，并诱导构象变化以介导其活性。使用各种生理和病理刺激可以快速增加NUR77的表达和激活。体内和体外研究表明，通过参与细胞分化，凋亡，代谢，线粒体稳态和其他过程，其在多个系统的组织和细胞中的调节作用。尽管目前在中枢神经系统（CNS）的病理生理学中对NUR77的研究受到限制，但目前的数据支持了NUR77参与许多神经系统疾病，例如中风，多发性硬化症，帕金森氏病。这表明NUR77的激活在治疗这些疾病方面具有很大的潜力。本综述总结了中枢神经系统疾病中NUR77的调节机制，并为其作为靶向疗法的潜力提供了可用的证据，尤其是与脑血管和炎症相关的中枢神经系统疾病。
前列腺癌进展中雄激素受体的表观遗传功能
雄激素和雄激素剥夺（cast割）疗法（包括雄激素受体拮抗剂）在临床上用于治疗前列腺癌患者。然而，在延长基于雄激素的治疗后，大多数激素依赖性前列腺癌患者以激素依赖性（被称为cast割（药物） - 耐药性前列腺癌（CRPC））的丧失而发展为恶性状态。即使在具有不可逆转的恶性肿瘤的CRPC状态下，雄激素受体（AR）表达也可以检测到。可以在前列腺癌患者中推测由AR介导的雄激素作用引起的CRPC的表观遗传过渡。雄激素受体属于人类中有48个成员的核受体超家族，并充当配体依赖性的转录因子，从而导致局部染色质重组配体依赖性基因调节。在这篇综述中，我们讨论了AR的转录/表观遗传调节功能，重点是AR配体，AR蛋白共同调节剂和AR RNA Coregulator（增强剂RNA）的临床应用（尤其是在染色质重组中），尤其是在染色质重组中。
GDF15：肥胖和心脏代谢疾病的新兴生物学和治疗应用
肥胖是一个全球性的健康问题，它推动了心脏代谢疾病的发展，包括 2 型糖尿病 (T2DM)、非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 和心血管疾病 (CVD) 1、2。肥胖会导致 NAFLD 和胰岛素抵抗，这两者都是 2 型糖尿病发展的前兆 3。NAFLD 还会发展为非酒精性脂肪性肝炎 (NASH)，这是肝硬化和肝细胞癌的主要原因 4。总的来说，2 型糖尿病和 NAFLD 是 CVD 的重要危险因素，而 CVD 是全球最大的死亡原因 5。虽然饮食和生活方式干预可以有效减少肥胖，但长期成功率很低 6。因此，人们开发了药物疗法来治疗肥胖症，但迄今为止，这些药物通常会导致约 5-8% 的体重减轻，这可能不足以纠正某些人的肥胖相关合并症 7 。因此，迫切需要新的肥胖疗法来治疗心脏代谢疾病。生长分化因子 15 (GDF15) 是转化生长因子-β (TGFβ) 超家族的远亲，以 ~25 kDa 同型二聚体的形式循环，由两个 112 个氨基酸多肽链组成，
基因组调控和生理学模型系统 - OPARU
糖皮质激素受体 (GR) 是一种真正的配体调节转录因子。GR 于 80 年代被克隆，现已成为核受体超家族中研究最深入、临床意义最重大的成员之一。GR 与其他转录因子和大量共调节因子的协同作用有助于对内源性和药理学糖皮质激素 (GC) 产生组织和环境特异性反应。此外，细胞质中的非转录活性正在成为 GR 的一项附加功能。在过去的 40 年里，GR 作用机制的概念一直在不断变化。分子生物学研究的前基因组和基因组时代的不同方法以及单细胞和单分子分析的最新尖端技术正在稳步发展人们对 GR 和转录调控如何在生理和病理过程中发挥作用的看法。除了开发 GR 分析技术外，使用模型生物还可以深入了解 GR 在体内如何在组织稳态、炎症和能量代谢中发挥 GC 作用。模型生物包括小鼠，还有大鼠、斑马鱼和最近的水果
奥斯卡·皮特（Oscar Piette）
我拥有马德里大学（UAM）大学的生物化学学位，目前正在马德里大学（UPM）获得硕士学位。我的利益主要是生物信息学的领域，例如基因组学，进化生物学，生物物理学和生物系统建模。对于我的最终学位项目，我曾在Biogulogiar分子Severo Ochoa（CBMSO）的生物信息学单元（CBMSO）工作。该项目于2021年2月至2021年12月在生物信息学部门Ugo Bastolla的负责人的监督下进行。我在研究了用于研究蛋白质超家族演化的不同相似性措施的同时，大大提高了我在数据管理任务中的技能和bash的技能。由于主人和实践的多样性，该硕士学位帮助我成为计算生物学的横向研究人员。我还大大提高了我的编程技能，并扩大了我对机器学习技术及其应用的了解。此外，作为我硕士论文的一部分，我目前正在UPM的本体论工程小组实习。该项目的结果将是一个自动，定期审查与19 covid-19相关信息源的系统，并将此新信息集成到知识图中。