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一个高质量的基因组和两个针对新的梅托纳斯种类的转录组数据集，这是一个深部的真核生物
mantamonads被认为代表了真核生物树中的“孤儿”谱系，可能在真核生物根部最常假定的位置附近分支。最近的系统基因分析将它们与“ crums”超组的一部分以及胶状果糖和核纤维相同。这个超组似乎是在氨甲基底部分支的，这对于理解真核生物的深层进化历史至关重要。但是，缺乏代表性物种和与之相关的完整基因组数据阻碍了其生物学和进化的研究。在这里，我们隔离并描述了两种新的Mantamonads，Mantamonas vickermani sp。nov。和mantamonas sphyraenae sp。nov。，对于我们生成的转录组序列数据以及后者的高质量基因组。Sphyraenae基因组的估计尺寸为25 MB；我们的从头组装似乎是高度连续的，并具有9,416个预测的蛋白质编码基因。这个近染色体规模的基因组组装是CRUMS超级组的第一个描述。
与抗逆转录病毒药物的药物相互作用
药效学：药效学描述了药物的关系及其对人体受体的影响，这可能会受受体，药物浓度和遗传学的数量和亲和力的影响。此外，遗传多态性可以影响特定药物的受体数量和受体亲和力的表达和可用性。药代动力学：药代动力学是指体内药物的吸收，分布，代谢和排泄，通常受各种生物学，生理和化学因素的影响。[1]药代动力学研究定义了特定药物的稳态浓度，考虑到剂量，生物利用度和清除率，以及可以改变共同药物的全身浓度的药物相互作用。[1]在吸收，代谢或消除阶段伴随使用抗逆转录病毒和其他药物之间的药代动力学相互作用。
优化基于转录组的合成致死性预测以改善早期乳腺癌的精度肿瘤学：BC-SELECT
Optimizing transcriptome-based synthetic lethality predictions to improve precision oncology in early-stage breast cancer: BC-SELECT Yewon Kim 1 , Matthew Nagy 2 , Rebecca Pollard 1 , *Padma Sheila Rajagopal 1,3 1 Cancer and Data Science Laboratory, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD 2 Boston Children's Hospital, Boston, MD 3 Women's恶性分支，癌症研究中心，国家癌症研究所，贝塞斯达，医学博士摘要单词计数：246个单词单词计数：3,649个单词参考文献：75参考图 /表计数：图：4表：2表：2补充图：2补充表：2补充表：3个补充表：3个通信作者：PADMA SHEILA RAJAGOPAL，MD MSC MSSC MSSC PORDICAIN 4B PRODENATIAN：10贝塞斯达，医学博士20892电子邮件：sheila.rajagopal@nih.gov电话：240-858-3169跑步标题：BC-SELECT：早期乳腺癌的治疗反应预测
转录因子抑制园艺作物中花青素生物合成
抽象的花色苷是园艺作物中的重要质量特征。转录因子（TFS）在花青素的生物合成中起关键的调节作用。许多TF在园艺作物中众所周知是花青素生物合成的转录激活剂，而最近已经承认抑制花青素合成的TFS。在这里，我们关注的是最近在园艺作物中对TF的作用和机制负调节花青素生物合成的最新进展。我们讨论了TFS抑制激活复合物的功能，调节阻遏物的TFS和抑制基序，以及转录后调节，翻译后修饰以及TFS的甲基化以及抑制峰基素生物合成的甲基化。这些信息将为这些TF的未来利用提供见解，以提高园艺作物的质量。
鉴定了与种子发育过程中甘蓝纳普斯干旱反应相关的转录模块，并通过早期生物胁迫缓解
图1甘蓝纳普斯的种子发育（cv。在各种压力条件下）。A.种子水含量（虚线）和种子发育过程中的干重（DW，实线）的演变。未成熟的种子。热时间在增长12（GDD）中给出。数据表示为每种处理的五种种子的三个生物学重复的平均值±SE。B.平均值（实线）在八个（C和WS）或四个（PB和PB + WS）中的土壤水电位（MBAR）的标准偏差（虚线）上，在20天的窗口上构成了干旱胁迫的应用。C。在不同条件下生长的梅氏芽孢杆菌植物的成熟叶片中RD20（QRT-PCR）的相对表达水平（每个生物学众多代表）。D.在WS应用开始时评估具有Clubroot症状的植物数量（4个众多植物）或农作物周期结束时（4个众议员30植物）。c，控制； WS，缺水； PB，P。Brassicae接种； PB + WS，P。Brassicae接种和水短缺；众议员，生物复制。
在小儿软组织肉瘤中复杂阐明原始细胞：从概念到现实生活，通过表观遗传和转录重编程
摘要：软组织肉瘤（STS）包括一大批间充质恶性肿瘤，具有异质性细胞形态，增殖指数，遗传病变以及更重要的是临床特征。对这种广泛的多样性进行全面阐明仍然是改善其治疗管理和细胞 - 原始肿瘤的身份的核心问题，这些肿瘤是这种谜团的一部分。细胞重编程允许表型或身份之间成熟细胞的过渡，并代表肿瘤异质性的一个关键驱动力。在这里，我们讨论了驱动基因在STS中介导的细胞重编程如何深刻地重塑转化的细胞的分子和形态特征，并导致对其原始细胞的错误解释。本评论质疑必须将遗传改变的表观遗传环境视为STS肿瘤启动和进展的关键决定因素。重试癌症引发细胞及其克隆进化，尤其是通过表观遗传学方法，似乎是了解这些肿瘤起源并改善其临床管理的关键杠杆。
寄生虫负荷对绦虫及其蚂蚁中间宿主转录活性和形态的影响
图 2 对 122 个蚂蚁差异表达基因中的 120 个进行聚类和可视化。根据基因的表达模式，可将其分为三个簇：（a）簇 1、（b）簇 2 和（c）簇 3。使用 topGO 和 weight01 算法计算这些簇的 GO 富集分析（簇 1 为 d、簇 2 为 e、簇 3 为 f），并使用 Fisher 精确检验将簇的生物学过程的 GO 注释与整个转录组进行比较。每个条形图代表每个簇中显著富集的 GO 术语，x 轴代表显著基因的数量。
SP6 体外转录反应方案（M0207）
注意：通过将 rNTP 浓度分别提高至 4 mM，可以获得更高的 RNA 产量。MgCl 浓度也应提高至 20mM（比总 rNTP 浓度 16 mM 高 4 mM）。
用于细菌中同时转录和翻译控制的 CRISPR-Cas 工具
此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 10 月 12 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.10.11.561958 doi：bioRxiv preprint
MORC驱动的转录开关控制弓形虫发育轨迹和性承诺
T. gondii具有复杂的生命周期，该生命周期是脊椎动物发生的无性发育，并且仅在FELID中发生的有性繁殖，因此研究较少。发育过渡依赖于基因表达模式的变化，最近的研究为包括组蛋白修饰在内的染色质塑料作用，在为每个给定阶段建立特定的表观遗传程序中。在这里，我们将T. gondii Microrchidia（Morc）蛋白确定为性承诺的上游转录阻遏物。MORC与Apetala（AP2）转录因子合作，显示出募集组蛋白脱乙酰基酶HDAC3，从而阻碍了预定的基因的染色质可及性，该基因预定了在性阶段独家表达。我们发现，缺乏Morc的细胞发生了明显的转录变化，从而表达了特定的基因曲目，并揭示了从无性增殖到性别分化的转变。MORC充当指导次级AP2因子层次表达的主调节剂，后者可能有助于