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阿尔茨海默病的深度学习：绘制大规模组织学 tau 蛋白图谱以进行神经影像生物标志物验证
异常的 tau 内含物是阿尔茨海默病的标志，也是临床衰退的预测指标。有几种 tau PET 示踪剂可用于神经退行性疾病研究，为体内分子诊断开辟了途径。然而，很少有人获准用于临床。了解 PET 信号验证的神经生物学基础仍然存在问题，因为它需要 PET 和（免疫）组织学信号之间大规模的体素到体素相关性。整个人脑的维度很大，组织变形会影响配准，而处理 TB 级信息的计算要求阻碍了正确的验证。我们开发了一个计算管道，用于识别和分割十亿像素数字病理图像中的感兴趣粒子，以生成定量的 3D 密度图。针对免疫组织化学样本的拟议卷积神经网络 IHCNet 是该管道的核心。我们已成功使用三种磷酸化 tau 抗体（AT100、AT8 和 MC1）处理并免疫染色了来自两个完整人脑的 500 多张载玻片，这些载玻片包含数 TB 的图像。我们的人工神经网络从大脑图像中估计了 tau 的包含情况，其对 AT100、AT8 和 MC1 的 ROC AUC 分别为 0.87、0.85 和 0.91。自省研究进一步评估了我们训练的模型学习 tau 相关特征的能力。我们提出了一种端到端流程来创建 TB 级的 3D tau 包含密度图，并将其与 MRI 联合配准，以方便验证 PET 示踪剂。
深度学习治疗阿尔茨海默病
异常的 tau 内含物是阿尔茨海默病的标志，也是临床衰退的预测指标。有几种 tau PET 示踪剂可用于神经退行性疾病研究，为体内分子诊断开辟了途径。然而，很少有人获准用于临床。了解 PET 信号验证的神经生物学基础仍然存在问题，因为它需要 PET 和（免疫）组织学信号之间大规模的体素到体素相关性。整个人脑的维度很大，组织变形会影响配准，而处理 TB 级信息的计算要求阻碍了正确的验证。我们开发了一个计算管道，用于识别和分割十亿像素数字病理图像中的感兴趣粒子，以生成定量的 3D 密度图。针对免疫组织化学样本的拟议卷积神经网络 IHCNet 是该管道的核心。我们已成功使用三种磷酸化 tau 抗体（AT100、AT8 和 MC1）处理并免疫染色了来自两个完整人脑的 500 多张载玻片，这些载玻片包含数 TB 的图像。我们的人工神经网络从大脑图像中估计了 tau 的包含情况，其对 AT100、AT8 和 MC1 的 ROC AUC 分别为 0.87、0.85 和 0.91。自省研究进一步评估了我们训练的模型学习 tau 相关特征的能力。我们提出了一种端到端流程来创建 TB 级的 3D tau 包含密度图，并将其与 MRI 联合配准，以方便验证 PET 示踪剂。
2025年2月28日，NIH记录，第1卷。 LXVII，不。 5）
上面的载玻片在皮肤定殖后，在该室内显示了小鼠耳朵真皮（皮肤更深层）和免疫细胞，并具有有益和无害的共生细菌表皮（人类皮肤微生物组的成员）。第一幻灯片显示抗原呈递细胞（绿色）和适应性免疫细胞（白色）；第二个幻灯片显示自适应免疫细胞（白色）和专门的皮肤抗原抗原细胞，称为Langerhan的细胞（红色）毛囊周围（白色/红细胞簇的中心绿色区域）。第三个幻灯片显示出与淋巴结相似的结构的抗体（绿色）分泌细胞（红色）。
大鼠运动皮层脑电极界面的空间转录组学研究
研究异物对大脑植入电极的反应是未来神经假体和实验电生理学发展的一个重要研究领域。在大脑中植入电极后，小胶质细胞活化、反应性星形胶质增生和神经元细胞死亡会在电极周围形成一个与稳态截然不同的环境。为了揭示可能影响设备功能和寿命的生理变化，在这项初步研究中实施了空间转录组学，以确定由电极植入引起的基因表达变化。这种 RNA 测序技术 (10x Genomics, Visium) 使用显微镜载玻片上的空间编码、RNA 结合寡核苷酸来空间识别每个测序读数。对于这些实验，植入密歇根式硅电极的大鼠运动皮层切片被安装在 Visium 载玻片上进行处理。每个组织切片都使用免疫组织化学标记神经元和星形胶质细胞，以提供相对于设备道映射每个测序读数的空间参考。植入后 24 小时、1 周和 6 周，大鼠运动皮层的结果显示，植入和非植入组织切片之间存在多达 5811 个差异表达基因。这些基因中有许多与之前在异物对植入电极反应的研究中报告的生物机制有关，而其他基因则是本研究中的新发现。这些结果将为未来的工作奠定基础，以改进和衡量基因表达对大脑植入电极记录长期稳定性的影响。随着我们对大脑在电极植入后发生的动态分子变化有了更好的了解，正在进行的工作将扩大这些初步观察。
春季通讯2024 -UPMC病理学
为了处理我们的集体UPMC实验室每年收到的2400万实验室测试，我们依靠人们来执行许多关键和复杂任务。他们所做的大部分时间都是手动和征税。在此过程中，我们还可以来回移动数百万资产（例如纸，试管，标本，组织块，载玻片）。这有时是必要的，但效率低下，会减慢我们的周转时间，并且容易出现人为错误。此外，流行后我们不再有劳动力来支持这些手动工作流程。因此，我们需要发挥创造力，在框外思考并改变我们的一些过程。这包括合并（例如集中实验室服务）和利用技术。我们需要尝试自动化更多流程。此外，我们需要将数字病理进一步部署到我们所有的设施。
2023 封面 - Imagene AI
Imagene 凭借其经过验证的准确性从竞争解决方案中脱颖而出。它建立了接近临床流程的基础设施和部署模型，以验证临床环境中的生物标志物检测模式。该公司了解在临床环境中证明其解决方案的独特价值的重要性。Imagene 进行了多项合作研究和验证。Ichilov 和 Sheba 医疗中心的肺癌患者也在接受新技术的测试。最近与 Sheba 医疗中心在《现代病理学》上发表了一篇科学论文，研究：“使用深度学习算法从苏木精和伊红染色的载玻片中直接识别非小细胞肺癌中的 ALK 和 ROS1 融合”呈现出前所未有的准确度，可与金标准技术相媲美。4
juniperus squamata buch的木材解剖学特征。
研究了木制的sm squamata buch.-ham的木材解剖特征。ex。D. Don，来自尼泊尔中部曼尼山区跨山区的高山。我们研究了喜马拉雅杜松的解剖学特征和从平均海平面4600 m收集的30种不同木材样本（MSL）收集的喜马拉雅杜松的解剖参数之间的相互关系。在烤箱中以100ºC煮沸的木材样品，并使用KD-3390半自动微型集团进行切片。然后将切片在用1％safranin和快速绿色溶液染色的酒精中脱水，并在显微镜下制备永久载玻片并观察到永久性载玻片。J. squamata是一种软木物种，其特征是存在独特的狭窄年生长环，逐渐从早期伍德到莱特伍德的突然过渡。早期木材和莱特伍德气管均包含正方形的多边形细胞，圆形边框凹坑和排列在宽松的切向带中的树脂细胞。发现射线完全是单性的和同质的。大多数射线细胞都包含棱柱形晶体，而果皮坑则存在于射线细胞中。年度宽度与早期木材和晚木宽度均呈正相关，但与气管长度有负相关。在杜松等软木物种中，气管长度不仅是木材和纤维质量的重要特征，而且对于树的液压结构而言。此外，这也与该物种在干旱跨性别 - 希马拉亚地区地区恶劣的气候条件下的适应性相结合。矮人的生长环尺寸降低并增加气管长度的个体可确保有效的水运输到射击系统。因此，J。Squamata的木材解剖学特征的这种内部特异性变化是由于微途径类型的变异所致。
HER2 阳性 BTC 新闻稿
关于 PATHWAY® 抗 HER2/neu (4B5) 兔单克隆原抗体 PATHWAY 抗 HER2/neu (4B5) 兔单克隆原抗体可提供及时、清晰和可靠的结果，从而使治疗决策能够为患者带来更好的结果。该检测已被证明可帮助识别适合使用 Herceptin®、KADCYLA® 或 ENHERTU® 7 进行 HER2 靶向治疗的乳腺癌患者，该检测与全自动 VENTANA BenchMark 载玻片染色仪结合使用。BTC 新适应症的引入代表着该检测临床实用性的显著扩展。该检测是罗氏综合胃肠道癌症解决方案产品组合的重要组成部分，旨在提高诊断确定性，从而做出改变人生的癌症治疗决策。
福尔马林固定石蜡嵌入心脏组织分析的方法
在FFPE过程中，通过交联蛋白保留了组织样品，然后将其嵌入石蜡蜡块中，从而可以轻松切割适合的切片，以安装在显微镜载玻片上进行检查。对于这个实验室，组织是普渡大学研究人员的FFPE。对于他们的方法，从鼠模型中获取了短轴心脏梗塞样品。切除后立即将组织浸入10％中性缓冲甲醛的溶液中。这种浸入过程发生24小时。在此过程中组织变硬。使用70％乙醇洗涤的组织脱水的组织。洗涤后，样品被嵌入石蜡中。重要的是要适当地脱水，并且鉴于要固定的24小时，否则将无法保留组织。然后通过邮件将这些样本发送到田纳西大学，在那里使用各种准备方法为MALDI-MSI的样本做准备[10,11]。