摘要 - BioInformatics应用程序通常需要根据其与特定序列目标的相似性过滤FastQ测序读取,例如消除与特定病毒相关的污染或隔离读取。尽管基于对齐的方法对这些任务有效,但它们表现出降低的灵敏度并可能引入高估,尤其是在面对较低的相似性搜索时。在本文中,我们使用一种新颖的无对齐方法来过滤FASTQ根据定义的相似性阈值读取。与基于对齐方式的方法不同,即使在相似性较低的方案中,例如在古代DNA中,我们的方法也保持较高的灵敏度。此外,我们的方法是基于压缩的,可以减轻其他方法固有的高估风险。我们在各种应用程序中演示了我们方法的多功能性,并提供了一种称为磁铁的公共开源物。磁铁提供了用于加速处理的多线程功能,并且可以在https://github.com/cobilab/magnet上自由访问。索引项 - 数据压缩,生物信息学,计算生物学,测序读取,数据滤波器
摘要 - 在事件相关的电位(ERP)信号分类中,在特定时间范围内识别相关的局部峰对于特征提取和随后的分类任务至关重要,尤其是在有关精神分裂症等精神疾病的研究中。但是,精神分裂症研究中的ERP数据通常包含许多对分类过程贡献的小峰。因此,至关重要的是,仅辨别和保留为改进分类结果传达特定特征的显着峰值。最近,基于高档和降尺度表示(UDR)技术的基于视觉的平滑算法已经证明了其在保留突出峰的特征时的有效性,同时从信号波形中滤除了非平衡峰。在UDR的操作下,输入信号在图像域中可视化。输入形状受到稀疏算法的影响,并将所得骨骼投射回信号域。此过程类似于神经科医生对信号的目视检查,在该信号中标记了突出的峰,而无关的峰被忽略了特征提取。这项研究将UDR应用于两个精神分裂症和匹配对照患者中记录的ERP的数据集,以评估其在信号分类中的有效性。此外,当使用较少的ERP通道时,我们分析了UDR对分类准确性的影响。我们使用多个分类器测试了这些效果。索引项 - 与事件相关电位(ERP),精神分裂症,平滑过滤器,信号处理,UDR,高档和下限表示实验结果表明,当在所有通道上应用UDR时,EEGNET表现出最显着的增强,精度增加了2.55%。此外,当信号时期的数量减半时,UDR在7个模型中有4个促进了增强,浅孔convnet的提高最高2.4%。值得注意的是,在仅FZ,CZ和PZ电极位置的信号形成的子数据集中使用UDR时,可以在更多模型上观察到精度增强。这些发现强调了UDR在增强精神分裂症分类准确性方面的有希望的潜力,尤其是应用于关注关键通道的数据集时。
各种过滤和空气净化技术(包括管道内和室内)的有效性取决于空气污染物的性质、HVAC 布局和空气净化器在空间中产生的气流速率和模式、过滤和空气净化技术的工作原理及其正确应用。同行评议文献中的实验数据表明,一些过滤和空气净化技术可以有效去除或灭活空气污染物。然而,关于各种过滤和空气净化设备对人类健康的直接影响(包括短期和长期影响)的研究存在很大差异,这通常表明研究不足,无法得出确切的结论。此外,过滤和空气净化可能会产生积极和消极的次要后果,包括改变能源使用、影响工作表现、学习和旷工、排放空气净化的副产品以及改变建筑物居住者对室内环境的看法。与健康影响类似,关于其中一些后果的证据通常有限,无法得出确切的结论。
生物过滤是一种低成本的低能技术,它采用了多孔培养基的生物活化床来减少源水中溶解有机物(DOM)池的可生物降解部分,从而导致饮用水的产生。在生物滤池内不同床深度的微生物群落在降解和去除溶解有机碳(DOC)中起着至关重要的作用,最终影响了其性能。然而,居住在不同生物滤池深度的微生物群落组成与它们对各种DOC馏分的使用之间的关系仍然很少。为了解决这一知识差距,我们进行了一项实验研究,其中从上部(即前10厘米)和下部(即底部10厘米)的小型群落进行了30厘米长的实验室尺度生物滤器的部分。然后使用与生物滤器进水量相同的源水单独孵育10天。我们的研究表明,与顶级微生物社区相比,底部微生物群落的多样性较低,但其成员之间具有更高程度的互连网络。此外,我们在微生物群落的组成和网络结构之间建立了直接相关性,以及它们在DOM池中使用各种DOM化合物的能力。有趣的是,尽管在孵化开始时,与顶级社区相比,底部微生物社区仅占总细胞丰度的20%,但它使用了,因此从DOM池中删除了比顶级社区多的总DOC约60%。虽然两个群落都迅速利用了不稳定的碳分数,例如低分子 - 重量中性,但使用更多难治性的碳馏分,例如高分子重量腐殖质的腐殖质,平均分子量比CA的平均分子量更高。1451 g/mol,是底部微生物群落独有的。通过采用捕获微生物多样性的技术(即流式细胞术和16S rRNA扩增子测序),并考虑DOM的复杂性(即LC - OCD),我们的研究提供了微生物社区结构如何影响微生物介导的工程生产的重要过程。最后,我们的发现可以通过工程干预措施来改善生物滤器性能,从而塑造生物滤器微生物群落的组成,并增强其对DOM的利用率和去除,最尤其是更经典的谦卑和耐用性DOM -DOM AFTER。
Kirk Paul Lafler,sasNerd 摘要 电子表格已成为有史以来最流行、最成功的数据工具。据估计,全球有超过 7.5 亿 Excel 用户。电子表格的简单性和易用性是 Excel 在全球范围内增长和广泛使用的两个原因。其他增值功能也有助于在越来越多的用户中扩大电子表格的实用性,包括其协作功能、可自定义、处理数据的能力、数据可视化技术的应用、移动设备使用、重复任务的自动化、与其他软件的集成、数据分析和使用自动过滤器的过滤功能。最后一个增值功能,即使用自动过滤器进行过滤,是本文的主题。将说明一个示例应用程序,该应用程序使用内置自动过滤器或过滤器创建自定义 Excel 电子表格,这些过滤器使用户能够从文本、数字或日期值列表中进行选择,以快速找到感兴趣的数据,使用 SAS® 输出交付系统 (ODS) Excel 目标和 REPORT 过程。关键词:sas、excel、excel 电子表格、ods、ods excel、proc 报告、自动过滤器、过滤器简介在 Excel 电子表格中使用自定义自动过滤器使用户能够查找、显示或隐藏文本、数字和/或日期值。用户可以使用 SAS 输出交付系统 (ODS) Excel 目标从任何 SAS 数据集构建带有内置自动过滤器的自定义 Excel 电子表格。生成的 Excel 电子表格中,一列、两列或多列或变量可用作自动过滤器。过滤第一列后,用户可以通过过滤两列或更多列来优化过滤结果。本文介绍了使用 SAS® 输出交付系统 (ODS) Excel 目标和 REPORT 过程构建带有内置自动过滤器的自定义 Excel 电子表格的分步方法。示例中使用的数据集创建了一个 SAS 数据集,其中包含位于圣地亚哥市中心地区的热门餐馆。该数据集包含 87 个观测值(或餐厅)和 17 个变量,如下所示。
抽象的微型塑料(MP)是一种污染物,越来越威胁到淡水生态系统,需要有效的解决方案才能去除。本研究的目的是审查用于从淡水环境中删除MP的当前过滤方法。本研究使用了有关去除MPS的过滤技术的现有文献的系统综述方法。数据是从2015年至2023年之间发表的各种科学来源收集的。分析的过滤技术包括传统过滤和高级过滤技术。研究结果表明,诸如纳米过滤和生物过滤之类的先进过滤技术在从淡水中去除MP具有很高的潜力。但是,每种技术都有自己的挑战,包括删除效率和实施成本。结论是过滤是处理淡水生态系统中MP污染的有效方法。但是,需要进一步的研究来应对现有的挑战。这项研究提供了深入的见解,可以帮助制定更有效的政策和技术来管理MP污染。
提交日期:2023 年 11 月 13 日 修订日期:2024 年 4 月 6 日 接受日期:2024 年 6 月 22 日 摘要 聚合酶链式反应 (PCR) 是提高检测真菌感染(例如由黑曲霉引起的感染)灵敏度的重要技术。纯 DNA 和 DNA 分离技术的可用性是实施 PCR 的重要因素。本研究旨在比较使用基于过滤器的试剂盒方法和冷却分离黑曲霉 DNA 的质量和数量。实验研究设计使用琼脂糖凝胶电泳 (1.5%) 对 DNA 分离物进行定性测试,使用紫外可见分光光度计 (波长为 260 nm 和 280 nm) 进行定量 DNA 测试。数据分析比较了两种方法分离的 DNA 的定性和定量结果。结果表明,两种分离方法中都存在 DNA 带,基于过滤器的试剂盒方法中的带较粗使用基于过滤器的试剂盒分离后的 DNA 平均浓度 (6,478 ng/μl) 高于冷却方法 (5,994 ng/μl)。基于过滤器的试剂盒中的 DNA 纯度 (1.7) 也高于冷却方法 (1.1)。基于过滤器的试剂盒方法含有支持成功分离 DNA 的化学成分。可以得出结论,基于过滤器的试剂盒方法比冷却方法产生的黑曲霉 DNA 分离物质量更好、数量更多。这些发现意味着基于过滤器的试剂盒可能是实验室应用中分离黑曲霉 DNA 的更好选择。关键词:黑曲霉;冷却方法;基于过滤器的试剂盒 1. 简介
许多食品和饮料过程需要大量的水。至关重要的是,使用所用水受到颗粒或微生物污染,以确保过程操作不会无意中污染。可以使用几种方法来确保水不受污染。其中之一是添加臭氧,该臭氧充当抗菌和氧化剂,并在周围以及热水储存和分配系统中添加臭氧。通常,将水存储在装有灭菌级通风过滤器的水箱中,以确保可以正确排气储罐以填充和排空,而不会冒来自坦克环境的二次污染的风险。本文档将讨论选择用于臭氧化的热或环境水箱的通风过滤器的注意事项。
1医学与药学学院微生物,血液学和免疫学系,DSchang大学,P.O。Box 96, Dschang, Cameroon 2 Laboratory of Tropical and Emerging Infectious Diseases, Buea, Cameroon 3 Molecular Design and Synthesis, Department of Chemistry, KU Leuven, Celestijnenlaan 200F, Leuven B-3001, Belgium 4 Department of Biomedical Sciences, Faculty of Health Sciences, University of Bamenda, P.O.Box 39,Bambili,喀麦隆5综合系统生物学研究所(I2SYSBIO),Valencia的CSIC-大学,Paterna 46980,西班牙6日6医学实验室科学系,Bamenda大学卫生科学学院,P.O. BOX 39,BAMBILI,喀麦隆7动物生物学系,科学系,DSchang大学,P.O。 box 067,Dschang,喀麦隆8江西省传统中医学药理学主要实验室,国家工程研究中心现代化中国医学现代化研究中心 - 甘丹医科大学,甘尼医科大学,甘尼医学院,341000,中国>Box 39,Bambili,喀麦隆5综合系统生物学研究所(I2SYSBIO),Valencia的CSIC-大学,Paterna 46980,西班牙6日6医学实验室科学系,Bamenda大学卫生科学学院,P.O.BOX 39,BAMBILI,喀麦隆7动物生物学系,科学系,DSchang大学,P.O。 box 067,Dschang,喀麦隆8江西省传统中医学药理学主要实验室,国家工程研究中心现代化中国医学现代化研究中心 - 甘丹医科大学,甘尼医科大学,甘尼医学院,341000,中国>BOX 39,BAMBILI,喀麦隆7动物生物学系,科学系,DSchang大学,P.O。box 067,Dschang,喀麦隆8江西省传统中医学药理学主要实验室,国家工程研究中心现代化中国医学现代化研究中心 - 甘丹医科大学,甘尼医科大学,甘尼医学院,341000,中国
