内生生活方式的特征是真菌与其寄主植物之间的共生关系,在整个真菌王国中普遍存在。但是,所有真菌是否都有具有内生生活方式的祖先的问题仍然是持续辩论的话题。本评论的本文旨在通过研究真菌中内生物的进化史,内生真菌的多样性以及影响内生生活方式的进化和多样化的生态和宿主特定因素来探讨这个问题。很明显,并非所有真菌都来自内生祖先,但真菌系统发育中内生植物的流行和多样性表明,这种生活方式已随着各种生态和宿主特异性压力而多次演变。未来的研究,整合了现代基因组工具和实验方法,可能会更多地阐明内生真菌的复杂进化轨迹,并有可能促进农业,工业和医学的应用。关键字 - 内生祖先 - 进化 - 真菌 - 系统发育 - 植物相互作用简介
噬菌体是感染细菌并使用其宿主机械复制的病毒。它们是生物圈中最普遍,最多样化的生物学实体之一,具有较长的进化史。由于抗菌素耐药性(AMR)水平的增加和新发育的抗生素数量减少,人们对噬菌体治疗剂的兴趣更新。噬菌体在食品安全,水质,生物防治,疫苗和全球营养周期中也有应用。细菌和噬菌体都采用内部和外部自卫策略相互竞争,从而驱动基因组进化。虽然已经对许多噬菌体基因组进行了测序和注释,但噬菌体的蛋白质组学和脂肪组谱却几乎没有被探索,尤其是在感染阶段和溶酶体方面。本评论强调了在添加机器学习等工具的情况下,需要在-omics级别表征噬菌体 - 宿主关系。通过进一步了解噬菌体及其宿主之间的动态相互作用,可以利用合成生物学来设计新的解决方案,以应对我们当前的全球健康,农业和环境挑战。
图1。光转传成分基因家族和真核生物中的分布的进化史。重建了所有常见(a),横幅特异性(b)和睫状特异性(c)成分的每个基因家族的演变(每个部分顶部的基因树),并且它们的分布均映射在eukarya的主要群体中(每个部分左侧的物种树)。的存在用一个完全彩色的圆表示。在每个基因家族中,含有D. melanogaster(红色),H。sapiens(绿色)或(蓝色)基因(S)在光转传途径中起作用的(蓝色)基因(S)的感兴趣的亚家族。在几个基因家族中,根据系统发育,某些注释较差的序列与感兴趣的群体非常遥远。这些进化枝被标记为“不确定”。实际上,它们可以代表基因家族的真正相关成员,因为它们是在数据挖掘过程中检索并在管道期间保留的。但是,不能排除他们宁愿属于另一个基因家族。
摘要:Cervidae家族由于适应了许多生态环境而具有广泛的分布,这使其能够在消化道中发展出多样化的微生物群落。最近,研究集中在全球不同子宫颈物种的肠道和粪便菌群的分类学组成和功能上,以及它们在不同相关因素(例如年龄,性别,性别,饮食,饮食,分布和季节性变异)下的微生物多样性和变异。此外,还特别感兴趣地知道子宫颈如何充当人畜共患病原体生物的储层,这代表了对公共卫生的威胁。本综述提供了全球子宫颈中微生物群测定领域增长的综合,专注于使用16S下一代测序的肠道和粪便样品。它还记录了影响微生物多样性和组成的因素,据报道为致病性/人畜共患病的微生物以及有关这些物种保护的观点。知道细菌与宫颈健康之间的相互作用可以推动这些物种的管理和保护策略,并有助于了解其进化史以及与新兴疾病的微生物的相互作用。
动物认知的进化史似乎涉及一些重大转变:这些重大变化为认知开辟了新的系统发育可能性。在这里,我们回顾并对比了当前认知进化的过渡性解释。我们讨论了进化过渡的一个重要特征应该是它改变了可进化的东西,因此过渡前后的可能表型空间是不同的。我们开发了一种认知进化的解释,重点关注选择如何影响神经系统的计算架构。对操作效率或稳健性的选择可以推动计算架构的变化,从而使新类型的认知可进化。我们提出了动物神经系统进化的五个主要转变。每一个都产生了不同类型的计算架构,改变了谱系的可进化性并允许新认知能力的进化。过渡性解释的价值在于,它们通过关注具有重大后果的变化,允许宏观进化的宏观视角。然而,对于认知进化,我们认为最有用的是关注改变可进化内容的神经系统的进化变化,而不是关注特定的认知能力。
要理解当今普遍存在的肥胖问题,我们必须回顾过去,更准确地说,回顾人类新陈代谢的进化史。毕竟,我们的大脑和身体与我们的祖先一样。他们没有在糖湖里游泳,也没有从树上摘巧克力棒;相反,食物往往很少,人们经常挨饿。我们的新陈代谢在几个世纪中适应了这些生活条件。“进化教会了大脑和身体,食物并不总是随时可得。每当食物充足时,我们就会学会填饱肚子,为食物匮乏做好准备,”Tittgemeyer 解释道。例如,即使胃已经饱了,饱腹感信号也可能被激活我们的奖励系统所取代。神经递质多巴胺在这方面起着重要作用。另一个信号系统会估计一顿饭的能量含量,并在你的嘴巴咬下第一口之前为身体做好相应的准备。位于大脑下丘脑的神经细胞被称为“饥饿神经元”,参与了这一过程。 “这些细胞只有在我们吃饱的时候才会稍微活跃起来。但当我们饿的时候,它们就会变得非常活跃,”蒂特格梅尔解释道。
与精神疾病相关的大多数遗传变异位于基因组的非编码区域。为了调查其功能含义,我们整合了来自Psychencode联盟和其他已发表来源的表观遗传数据,以构建候选脑部顺式调节元素的全面地图集。使用深度学习,我们对这些元素的序列语法进行了建模,并预测谱系特异性文字因子的结合位点如何有助于各种类型的神经胶质和神经元中细胞类型特异性基因调节。元素的进化史表明,大脑中的新调节信息主要是通过保守的哺乳动物元素中的较小序列突变出现的,而不是全新的人类或灵长类动物特异性序列。然而,灵长类动物特异性的候选元素,尤其是在胎儿脑发育和兴奋性神经元和星形胶质细胞中活跃的元素,与脑相关的人类性状的遗传力有关。此外,我们介绍了一个基于Web的平台PsychScreen,该平台可在患有精神疾病和健康控制的个体中各种脑细胞类型的精神码产生的遗传和表观遗传数据的交互式可视化。
我们星球上海洋生物多样性最高的地区被称为珊瑚三角或印度 - 澳大利亚群岛(IAA)1,2。它的巨大生物多样性长期以来吸引了生物学家的兴趣。但是,IAA生物多样性热点的详细进化史仍然鲜为人知。3。在这里,我们通过使用全面的化石数据集来推断物种形成 - 膨胀动力学,对IAA的新生代多样性历史进行了高分辨率重建。我们发现,自大约2500万年前以来,IAA在大约260万年前的多样性高原上大致增加了,从2500万年前就表现出了单向多元化趋势。多样性的增长主要是由多样性依赖性和栖息地规模控制的,并且在1390万年前后减轻热压力的促进。在大约25、20、16、12和500万年前记录了不同的净多样化峰,除气候过渡外,这可能与重大的构造事件有关。关键的生物地理过程对IAA多样性具有深远的影响,如Tethyan后代的长期衰落与国际化和IAA分类单元的上蜡相比所示。最后,似乎没有重大灭绝和新生代冷却对于使IAA成为地球上最富有的海洋生物多样性热点至关重要。
进化史和与人为环境的早期关联使Saccha- romyces酿酒酵母成为典型的葡萄酒酵母。该物种通常主导任何自发的葡萄酒发酵,直到最近,几乎所有商业上可用的葡萄酒起动器都属于该物种。Crabtree效应以及在完全厌氧条件下增长的能力,在这种环境中的主导地位有决心。,但并非所有的酿酒酵母菌株都同样适合起始培养物。在本文中,我们回顾了酿酒酵母葡萄酒菌株的生理和遗传特征,以及通过进化而塑造它们的生物和非生物因素。这组酵母的有限遗传多样性可能是解决新的烯象学杂志的限制。然而,从基因工程和经典的遗传工具到将其他酵母菌物种纳入葡萄酒酵母目录中的其他多年的研究已经提供了增加这种多样性的工具来增加这种多样性。有时,这些较少的传统物种可能有助于与酿酒酵母的杂种杂种。因此,我们对葡萄酒葡萄酒和其他葡萄酒酵母的葡萄酒菌株的了解一直在扩大。在过去的几十年中,葡萄酒酵母研究一直是现代化的现代化的支柱,我们可以表达,酵母生物技术将不断为解决任何挑战(例如气候变化)做出贡献,例如我们将来可能面临的气候变化。
序言,在植物学的研究生课程水平是精心设计的,旨在使对植物科学的深刻了解,将严格的理论框架与广泛的实用应用和面向研究的学习相结合。该课程旨在培养对植物生物学的整体观点,包括从细胞的分子复杂性到生态系统中复杂相互作用的区域。这种全面的方法可确保学生为应对植物学和相关领域的当代挑战做好准备。该计划强调了尖端科学研究与实践技能的融合,促进创新和批判性思维。通过涵盖各种主题,包括细胞和分子生物学,植物生理学,生物化学,植物遗传学和生物技术,学生将开发一种多功能技能。此外,该计划还深入研究了各种植物群体的进化史和分类学,为了解植物多样性及其意义提供了强大的基础。该程序的独特功能是它的重点是植物知识的商业应用。关于经济植物学,资源利用和应用植物学的课程突出了农业,药品和环境管理等行业中植物学研究的实际意义。此外,该课程还包括知识产权(IPR)的重要组成部分,使学生能够在植物学研究和创新的道德和法律景观中做好准备。