•NCBI网站•RefSeq FAQ页面•Blast Web服务器什么是BLAST?1个爆炸代表了b osal a strignment s earch t ool,是一个在数据库中查询(输入)序列和序列之间相似区域(在核苷酸或蛋白质水平上)的程序。BLAST使用一个可靠的统计框架,该框架确定两个序列之间的比对在统计学上是显着的(即,仅偶然性产生报告的比对的可能性较低)。检测序列相似性的能力允许科学家确定基因或蛋白质是否与同一物种或其他物种中的其他已知基因或蛋白质有关。进化论是基于所有通过物种形成从共同祖先降下来的生物。在分子水平上,祖先DNA序列随时间差异(通过点突变的积累,重复,缺失,转置,重组事件等)在活生物体的基因组中产生多种序列。如果这些序列起源于同一祖先基因,则将其分类为同源物。突变具有更高的有害生物体的可能性,并且不太可能固定在人群中。这样的序列被认为是负数的,这会导致它们随着时间的推移而防止变化。这种相似性是通过爆炸搜索检测到的“信号”。使用NCBI 2因此,预计功能序列的两个同源拷贝将显示出比两个不在强度负面选择的无关序列或两个序列相比,比两个无关序列或两个序列更高的序列保守度(在核苷酸水平上观察到基碱基相似性)。
机器学习的核心元素是灵活的通用函数逼近器,可以对其进行训练并适应数据。现代机器学习的主要挑战之一是理解非线性和复杂性在这些通用函数逼近器中的作用。在本研究中,我们专注于非线性复杂系统,并展示它们在表示和学习不同函数方面的能力。复杂的非线性动力学和混沌自然会产生几乎无限多样的动态行为和功能。物理、生物和工程系统可以利用这种多样性来实现自适应、鲁棒的行为和操作。非线性动态系统可以被视为不同可能行为或功能的集合的体现,从中可以选择不同的行为或功能来响应不同的条件或问题。这个选择过程可以是手动的,即可以通过直接设置参数手动挑选正确的功能。或者,我们可以自动化这个过程,让系统本身学习如何去做。这创建了一种机器学习方法,其中非线性动力学表示并体现不同的可能功能,并且它通过训练学习如何从这个功能空间中选择正确的功能。我们报告了如何利用非线性动力学和混沌来设计和制造基于非线性动力学的可变形硅硬件,作为不同可能功能的物理体现。我们展示了这种灵活的可变形硬件如何通过学习和搜索算法(例如遗传算法)来学习以实现不同的所需功能。在这种方法中,我们将两种强大的自然和生物现象——达尔文进化论和非线性动力学与混沌结合起来,作为一种面向动力学的方法来设计具有应用的智能自适应系统。非线性动力学在硬件层面体现不同的功能,同时利用进化方法来找到实现正确功能的参数。
Leda Cosmides & John Tooby 简介 进化心理学的研究目标是发现和理解人类思维的设计。进化心理学是一种心理学方法,其中进化生物学的知识和原理被用于研究人类思维结构。它不是一个研究领域,如视觉、推理或社会行为。它是一种思考心理学的方式,可以应用于其中的任何主题。从这个角度来看,思维是一组信息处理机器,由自然选择设计出来,以解决我们的狩猎采集者祖先面临的适应性问题。这种思考大脑、思维和行为的方式正在改变科学家处理旧课题的方式,并开辟新的课题。本章是对激发它的概念和论点的入门介绍。 放纵心灵:进化心理学的过去和现在 在《物种起源》的最后几页,在提出自然选择进化论之后,达尔文做出了一个大胆的预测:“在遥远的未来,我看到了更重要的研究领域。心理学将建立在一个新的基础之上,即每一种心理力量和能力都必须逐步获得。” 三十年后,威廉·詹姆斯在他的开创性著作《心理学原理》中试图做到这一点,该书是实验心理学的奠基之作之一(詹姆斯,1890 年)。在《心理学原理》中,詹姆斯多次谈到“本能”。这个术语大致是指一个物种的每个成员所共有的专门的神经回路,是该物种进化史的产物。总而言之,这些回路构成了(我们自己物种的)人们所认为的“人性”。过去(现在也是)人们普遍认为其他动物受“本能”支配,而人类失去了本能,受“理性”支配,这就是为什么我们比其他动物更灵活聪明的原因。威廉·詹姆斯持相反观点。他认为人类行为比其他动物更灵活聪明,因为我们比它们拥有更多本能,而不是更少。然而,我们往往对这些本能的存在视而不见,正是因为它们运作良好——因为它们处理信息如此轻松,而且
几年前,我休假一个学期,在伦敦肯辛顿花园附近租了一套公寓,由别人出钱。在那个学期,我有幸白天阅读进化生物学,研究进化论在当代心灵哲学问题中的应用,晚上则在高档酒吧或家中观看出奇精彩的英国电视节目。(在我们伦敦的公寓里,我们能收到四个频道,从中寻找有趣的节目总是比在一百个美国频道中寻找要容易得多。)一天晚上,我在家里偶然看到英国广播公司一档引人入胜的节目的结尾。我确信在美国电视上看不到一个场景,一对裸体异性恋情侣正在做爱。片刻之后,画面切换到另一个场景,我发现自己正在经历一场爱因斯坦从未想象过的旅程。您可能还记得,爱因斯坦在他的一个著名思想实验中,要求我们想象在光束中的观察者眼中,事件会是什么样子。我想,这一切都非常有趣,但对于一个对人类性行为有着持久兴趣而非严格意义上的专业兴趣的人来说,这根本无法与我当时的经历相比,我当时是一个突然成为 BBC 忠实观众的人。因为摄像机被绑在男性勃起的阴茎上,我骑在男性的阴茎上,从女性出奇明亮的阴道内观看交配行为。经过多次阴茎抽插和阴道收缩后,射精不可避免地到来了。片刻之后,我(毫无疑问还有无数其他着迷的英国观众)目睹了女性的子宫颈多次“浸入”阴道后部积聚的精液中。叙述者——我后来发现是德斯蒙德·莫里斯——解释说,子宫颈正在“吸入”精液进入子宫,以“增加受精的机会”。 1 我们随后得知,女性可以通过“改变
授予:蝴蝶迁移的基因组和表观基因组特征(PID2023-152239NB-I00)项目概述:我们正在邀请诸如研究蝴蝶中迁移行为的基因组和表观基因组的PHD职位的应用。该项目旨在发现影响蝴蝶迁移的关键遗传特征和监管机制,以响应环境提示。重点领域包括适应迁移鸿沟,运动方向的季节性转移,感觉基因家族的演变以及对快速环境压力源的表观遗传反应。该研究将涉及实地研究,实验室行为研究以及基因组,转录组和表观基因组数据的分析。博士计划将在此框架内灵活,并根据其利益与选定的候选人一起量身定制。博士候选人将加入一个跨学科团队,并接受进化基因组学,动物行为和移民生态学的培训。地点:西班牙(www.ibb.csic.es)IBB IBB是巴塞罗那的研究中心,IBB是加泰罗尼亚的生物多样性研究中心领先的研究中心,为进化生物学,生态学和基因组学和基因组学的尖端研究提供了充满活力的学术环境。研究小组:候选人将加入昆虫迁移和系统多样性实验室(www.phylomigrationlab.com)。我们的实验室专门研究迁徙昆虫的行为,运动生态学,植物地理学和基因组进化。我们现任的团队包括三名博士生,一名实验室技术员,三名硕士学生,两个来访的学生和主要研究员(PI)。我们与乌普萨拉大学(瑞典),渥太华大学(加拿大)和爱丁堡大学(苏格兰)的同事保持着牢固的合作关系,并将鼓励研究留在国外。我们的实验室培养了我们团队和国际合作伙伴的协作和相互支持的文化。候选人要求:我们正在寻求一个对基因组学,昆虫学,生物信息学,植物地理学,进化和行为的兴趣浓厚的积极性的人。资格:•硕士学位与生物科学,生物信息学,遗传学或相关养育有关。•英语中出色的沟通技巧。•基因组数据分析,种群基因组学,进化论的经验和知识,
达尔文的物种起源(1859)几乎没有提到人类进化。对人类进化的最初避免并不是监督的,而是一个仔细的算法:达尔文很清楚他的理论将与科学家,神职人员和外行公众相遇的广泛抵抗,并提及人类进化论可能产生了无情的反对。,但达尔文的许多对手迅速抓住了人类的思想,尤其是语言,是与他的新思维方式的战斗中的有力武器。阿尔弗雷德·华莱士(Alfred Wallace)的独立发现自然选择原则促使达尔文(Darwin)最终在1859年发表了他长期发展的该理论的“大纲”,他没有帮助自然选择无法解释人类思想的起源。尽管华莱士对思想的所有进化方法有所保留,但由于语言学和语言学在维多利亚时代的科学中的可观地位,人类语言提供了最有力的论点。达尔文在语言阵线上最强大的敌人是牛津大学语言学教授弗里德里希·马克斯·米勒(FriederichMaxMüller),这是一位非常知名且受人尊敬的学者(Stam,1976)。在他的“语言科学演讲”中,于1861年在英国皇家机构发表,此后迅速发表(MüLler,1861年),MüLler在“达尔文和达尔文主义”上发起了全面攻击,利用他的“语言科学”作为强大的Blud-Geon-Geon-Geon。müller的立场并不复杂:“语言是将人与野兽分开的rubicon,没有动物会越过它。。。。语言的科学将使我们能够承受达尔文人的极端理论,并在人和蛮族之间划定一条艰难而快速的界限”(引用于1917年,1917年,第73 - 74页)。对于müller来说,语言是将人类与所有动物区分开来的关键特征。müller的论点令人信服:他的学生将他称为“大思想的达尔文”,并将其视为“唯一的平等,不是说上级,反对者,他们已经对阵达尔文的竞技场”(Noiré,1917年,第1917年,第73页)。müller关于人类语言与各种形式的动物交流之间不可思议的质不同的论点,合并
第一单元:生命的起源和进化 生物多样性的进化史,早期地球和生命的起源,自发,生物起源,巴斯德的实验,疾病的细菌理论;生命史上的重大事件,生命多样性的分类,生命王国——原核生物、真核生物、古细菌,达尔文的生命观和物种起源,达尔文的进化论。第二单元:微生物多样性 微生物的分类- R. H. Whittaker的五界概念,Carl Woese的域系统。细菌特殊群体的简要介绍-古细菌、支原体、衣原体、放线菌、立克次体和蓝藻。第三单元:生物分子 碳水化合物:命名和分类。脂质:储存和结构脂质的定义和主要类别。蛋白质:氨基酸的结构;蛋白质结构的层次。核酸:核苷酸的结构和功能;核酸的类型。单元 4:生物学的遗传方法 遗传模式和生物学问题;孟德尔定律的变化;遗传信息的分子基础;遗传信息从 DNA 到 RNA 再到蛋白质的流动。实践 1.学习 a) 显微镜的使用 b) 固定和染色的原理。2.制备正常、摩尔和标准溶液、磷酸盐缓冲液、连续稀释液 3.使用微量移液器 4.通过纸色谱法分离 A) 氨基酸 B) 叶绿体色素。5.对细菌进行革兰氏染色。6.从永久载玻片研究细胞/组织中核酸和粘多糖的细胞化学分布。7.使用 Lowry 法定量估计蛋白质。使用绘制的标准曲线确定未知样品的浓度。8.通过薄层色谱法分离和定量糖。9.培养大肠杆菌并用浊度法估计培养物密度。根据现有数据绘制生长曲线。10.从大肠杆菌中分离基因组 DNA。建议阅读 1.Campbell, N.A.和 Reece, J.B.(2008) 生物学第 8 版,Pearson Benjamin Cummings,旧金山。2.Raven, P.H 等人 (2006) 生物学第 7 版 Tata McGrawHill Publications,新德里 3.Griffiths, A.J.F 等人 (2008) 遗传分析简介,第 9 版,W.H.Freeman & Co. NY
单元-I复制第1章:开花植物的有性繁殖;男女配子体的发展;授粉 - 类型,机构和例子;繁殖装置;花粉 - 杆子相互作用;双重施肥;施肥事件事件 - 胚乳和胚胎的发展,种子的发展和果实的形成;特殊模式 - pomixis,parthenocarpy,polyembryony;种子分散和果实形成的意义。第2章:人类繁殖男性和女性生殖系统;睾丸和卵巢的微观解剖学;配子发生 - 植物发生和卵子发生;月经周期;受精,胚胎发育直至胚泡形成,植入;怀孕和胎盘形成(基本思想);分娩(基本思想);哺乳(基本思想)。第3章:生殖健康需求生殖健康和预防性传播疾病(STD);节育 - 妊娠的需求和方法,避孕和医疗终止(MTP);羊膜穿刺术;不育和辅助生殖技术-IVF,ZIFT,礼物(一般意识的基本思想)。第5章:遗传搜索遗传物质和DNA作为遗传物质的分子基础; DNA和RNA的结构; DNA包装; DNA复制;中央教条;转录,遗传密码,翻译;基因表达和调节-Lac操纵子;基因组,人类和水稻基因组项目; DNA指纹。单位-III:生物学与人类福利单元II遗传学和演变第4章:遗传和变异遗传和变异的原理:Mendelian继承;偏离孟德尔主义 - 不完全的优势,共同主导,多个等位基因和血型的继承,多效性;多基因继承的基本思想;继承理论;染色体和基因;性别决定 - 在人类,鸟类和蜜蜂中;连锁和交叉;性别联系的继承 - 血友病,色盲;人类中的孟德尔疾病 - 丘脑贫血;人类的染色体疾病;唐的综合症,特纳和克莱恩·费尔特的综合症。第6章:生命的进化起源;生物进化的生物进化和证据(古生物学,比较解剖学,胚胎学和分子证据);达尔文的贡献,现代的综合进化论;进化的机制 - 变异(突变和重组)和自然选择,示例,自然选择的类型;基因流和遗传漂移;哈迪 - 温伯格的原则;自适应辐射;人类进化。
版权所有:John Gowdy 和 Lisi Krall,2024 您可以在 http://rwer.wordpress.com/comments-on-rwer-issue-no-108/ 上对本文发表评论 简介 自 1970 年代以来,稳定状态经济 (SSE) 的概念一直是可持续发展辩论的核心 (Daly, 1973, 1977)。 尤其是在北美,生态经济学与 SSE 有着强烈的联系。 其最著名的倡导者 Herman Daly 使用这一概念对经济增长进行了雄辩的批评,帮助建立了生态经济学的基础。 他孜孜不倦地普及经济增长对人类福祉和自然 ZRUOd 的不利影响。 如果不研究它的创造论核心,我们就无法完全理解 aUgXe WhaW DaO\¶ 对 SSE 的表述。 1 在许多文章中,包括一篇他死后在本期刊上发表的文章(Daly,2022),他对进化和进化理论的既定事实提出了虚假的主张。他的观点没有任何可靠的证据或相关科学文献的参考。戴利拒绝接受当代进化生物学的基本理解及其对生命起源和人类在生物圈中地位的自然主义(非超自然)解释。对戴利来说,接受新达尔文主义 2 进化论就等于接受一种极端观点,即我们周围的世界是严格预先确定的,没有人类能动性和目的的空间。这个想法是他制定 SSE 的出发点。他认为,走出这种僵局的方法是拒绝新达尔文主义唯物主义,接受一种价值体系,这种价值体系将提供一种客观评价不同 VWaWeV Rf Whe ZRUOd aQd gXide SROic\ 的方法。 IQ DaO\¶V YieZ, RbjecWiYe YaOXe iV giYeQ b\ JXdeR -基督教和这个系统 Rf YaOXe ZiOO Oead WR Whe VWead\ VWaWe。每一个 cRPSRQeQW Rf DaO\¶V fUaPeZRUN iV 都是有问题的,连接它们的逻辑也是如此。几十年来,Daly 在许多出版物中都支持这些观点(Daly,1977、1995、1999、2002、2013b、2019、2022)。AOWhRXgh he dReV QRW XVe Whe WeUP,DaO\ adYRcaWeV ³iQWeOOigeQW deVigQ´ aV aQ aOWeUQaWiYe WR eYROXWiRQaU\ 生物学。他认为,如果没有神的干预,生命就不可能从非生命中起源,同样,人类的思想(意识、智力、灵魂)也无法用科学来解释,必须 aOVR 是 Whe UeVXOW Rf diYiQe iQWeUYeQWiRQ。 DaO\ XVeV WheVe cOaiPV WR aWWacN ³PaWeUiaOiVW QaWXUaOiVP´ aV a
1圣乔治大学和圣乔治大学医院NHS基金会信托基金会,英国伦敦,圣乔治大学和圣乔治大学医院; 2曼彻斯特的真菌学参考中心,曼彻斯特学术健康科学中心,Wythenshawe医院,曼彻斯特大学NHS基金会信托基金会和进化论,感染与基因组学部,英国曼彻斯特大学生物学,医学与健康学院; 3意大利罗马的Superiore Di Sanita Instituto Superiore Di Sanita Instituto Superiore Di Sanita系感染,寄生和免疫介导的疾病系; 4Unitéde MycologieMoléculaire,法国巴黎的巴斯德研究所; 5英国加迪夫大学感染,免疫和生物化学系和医学院; 6巴黎大学,寄生虫学杂志实验室,HôpitalSaint-Louis,APHP,巴黎,法国; 7新南威尔士州临床病理学与医学研究所,新南威尔士州健康病理学研究所,澳大利亚威斯特米德医院,临床病理与医学研究所,临床病理与医学研究所,临床病理与医学研究所; 8亨利·蒙多医院的血液学和干细胞移植部门和法国克里蒂尔大学的巴黎 - 最佳克雷特尔大学; 9 Fungal PCR倡议,意大利维罗纳国际人类和动物真菌学会的工作组; 10 Med。诊所II,Caritas Hospital Bad Mergentheim,德国; 11英国格拉斯哥大学感染,免疫和炎症研究所; 12 Karolinska Institutet,瑞典斯德哥尔摩的Karolinska大学医院实验室医学系; 13 Medizinische Klinik II,LaborWü4i,Universitätsklinikumwürzburg,德国; 14临床微生物学学科,都柏林三一学院,爱尔兰都柏林圣詹姆斯医院校园; 15曼彻斯特大学NHS大学NHS基金会信托基金会,曼彻斯特大学的曼彻斯特真菌参考中心和传染病系,曼彻斯特Wythenshawe医院;威尔士大学医院公共卫生医院Cardiff公共卫生参考实验室和16个公共卫生健康参考实验室,威尔士大学医院和试验中心研究/感染与免疫部,加迪夫大学,英国加的夫大学诊所II,Caritas Hospital Bad Mergentheim,德国; 11英国格拉斯哥大学感染,免疫和炎症研究所; 12 Karolinska Institutet,瑞典斯德哥尔摩的Karolinska大学医院实验室医学系; 13 Medizinische Klinik II,LaborWü4i,Universitätsklinikumwürzburg,德国; 14临床微生物学学科,都柏林三一学院,爱尔兰都柏林圣詹姆斯医院校园; 15曼彻斯特大学NHS大学NHS基金会信托基金会,曼彻斯特大学的曼彻斯特真菌参考中心和传染病系,曼彻斯特Wythenshawe医院;威尔士大学医院公共卫生医院Cardiff公共卫生参考实验室和16个公共卫生健康参考实验室,威尔士大学医院和试验中心研究/感染与免疫部,加迪夫大学,英国加的夫大学