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实现观赏植物的可持续栽培
观赏植物市场具有全球经济意义，其中欧洲是主要参与者，2017 年荷兰的营业额达到 47 亿欧元（FloraHolland，2018 年）。人们不断寻求具有新特性和改良特性的栽培品种，例如花瓣/叶子颜色、增强的香味、改良的植物结构、生物/非生物胁迫和延长的采后寿命，例如对植物激素乙烯的耐受性（Azadi 等人，2016 年）。虽然通过常规和突变育种可以实现新特性的转移，但它也受到限制。例如，杂交障碍阻止了远亲物种特性的自然渗入（Kuligowska 等人，2016 年；Shibata，2008 年；Teixeira da Silva 等人，2011 年）。通过引导突变的基因工程已经获得了一种解决此问题的方法，这与观赏植物基因组测序计划的发展相协同（由 Azadi 等人，2016 年审查）。
al-Khater - 多哈 - 海湾时报
埃米尔谢赫塔米姆·本·哈马德·阿勒萨尼殿下和远亲谢赫哈马德·本·哈利法·阿勒萨尼殿下昨天参观了埃米尔大殿下的胡库姆宫殿。参观期间，他们听取了位于 Msheireb 的游客中心关于接待和组织参观的讲解，以及胡库姆宫殿之旅，旨在介绍埃米尔大殿的历史、卡塔尔国统治者的征程以及宫殿的城市特色。随后，殿下听取了宫殿内各站点的介绍，并听取了每个站点的讲解。他们还参观了胡库姆宫殿之旅的站点之一——谢赫阿卜杜拉·本·贾西姆·阿勒萨尼议会。多位阁下、部长和官员参加了此次参观。(问答) 第 5 页
Pristionchus pacificus 减数分裂分析揭示了线虫谱系中同源配对和联会的可塑性
摘要 减数分裂在真核生物中是保守的，但其执行细节各不相同。本文我们描述了一种用于减数分裂分子分析的新型比较模型系统，即线虫 Pristionchus pacificus，它是广泛研究的模型生物秀丽隐杆线虫的远亲。P. pacificus 具有许多解剖学和其他特征，这些特征有助于分析秀丽隐杆线虫的减数分裂。然而，秀丽隐杆线虫失去了减数分裂特异性重组酶 Dmc1 并进化出一种重组独立的机制来使其染色体联会，而 P. pacificus 同时表达 DMC-1 和 RAD-51。我们发现 SPO-11 和 DMC-1 是稳定同源配对、联会和交叉形成所必需的，而 RAD-51 对这些关键的减数分裂过程而言是可有可无的。 RAD-51 和 DMC-1 在减数分裂前期按顺序定位到染色体上，并显示不重叠的功能。我们还展示了 P. pacificus 的新遗传图谱，该图谱揭示了与 C. elegans 非常相似的交叉景观，尽管这些谱系之间在联会和交叉的调节方面存在明显差异。
在两性异态苔藓中建立 CRISPR-Cas9......
CRISPR 技术的发展为理解基本生物过程的进化和功能提供了强有力的工具。在这里，我们展示了在雌雄异株苔藓物种 Ceratodon purpureus 中成功的 CRISPR-Cas9 基因组编辑。利用远亲雌雄同体苔藓 Physcomitrium patens 的现有选择系统，我们通过使用 CRISPR 靶向诱变在天然 U6 snRNA 启动子表达下产生 APT 报告基因的敲除。接下来，我们使用天然同源定向修复 (HDR) 途径与 CRISPR-Cas9 相结合，在 C. purpureus 新开发的着陆点的内源性 RPS5A 启动子表达下敲入两个报告基因。我们的结果表明，在 P. patens 中开发的分子工具可以扩展到这个生态重要且发育多变的群体中的其他苔藓。这些发现为精确而有力的实验铺平了道路，旨在确定苔藓植物内部以及苔藓植物与其他陆地植物之间关键功能变异的遗传基础。
在大规模队列研究中使用高斯预测过程有效估计 SNP 遗传力
随着高通量遗传数据的出现，人们尝试使用线性混合模型 (LMM) 从远亲群体的全基因组 SNP 数据中估计遗传力。然而，在大型群体研究中拟合这样的 LMM 极具挑战性，因为它涉及高维线性代数运算。在本文中，我们提出了一种名为 PredLMM 的新方法，该方法近似于上述 LMM，其灵感来自遗传聚合和高斯预测过程的概念。PredLMM 的计算复杂度明显优于大多数现有的基于 LMM 的方法，因此为估计大规模群体研究中的遗传力提供了一种快速的替代方法。从理论上讲，我们表明，在遗传聚合模型下，我们近似的极限形式是著名的大高斯过程似然的预测过程近似，该近似具有完善的准确性标准。我们通过广泛的模拟研究说明了我们的方法，并用它来估计英国生物银行队列中多种数量性状的遗传性。
P9_TA(2024)0067 – 通过某些新型基因组技术获得的植物及其食品和饲料 – 欧洲议会于 2024 年 2 月 7 日通过的关于欧洲议会和理事会关于通过某些新型基因组技术获得的植物及其食品和饲料的条例提案的修正案，以及对 (EU) 2017/625 条例的修订 (COM(2023)0411 – C9-0238/2023 – 2023/0226(COD))（普通立法程序：一读）
(2) NGT 是一组不同的基因组技术，每一种技术都可以以不同的方式使用，以实现不同的结果和产品。它们可以产生与传统育种方法获得的生物体相同的修饰，也可以产生具有更复杂修饰的生物体。在 NGT 中，定向诱变和同源基因（包括基因内杂交）引入遗传修饰，而无需插入不可杂交物种的遗传物质（转基因）。它们仅依赖于育种者的基因库，即可用于常规育种的全部遗传信息，包括可通过先进育种技术杂交的远亲植物物种。定向诱变技术可对生物体基因组中精确位置的 DNA 序列进行修饰。同源基因技术可将育种者基因库中已经存在的遗传物质插入生物体基因组中。内部遗传是同源遗传的一个子集，其结果是在基因组中插入由育种者基因库中已经存在的两个或多个 DNA 序列组成的重排遗传物质拷贝。
GDF15：肥胖和心脏代谢疾病的新兴生物学和治疗应用
肥胖是一个全球性的健康问题，它推动了心脏代谢疾病的发展，包括 2 型糖尿病 (T2DM)、非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 和心血管疾病 (CVD) 1、2。肥胖会导致 NAFLD 和胰岛素抵抗，这两者都是 2 型糖尿病发展的前兆 3。NAFLD 还会发展为非酒精性脂肪性肝炎 (NASH)，这是肝硬化和肝细胞癌的主要原因 4。总的来说，2 型糖尿病和 NAFLD 是 CVD 的重要危险因素，而 CVD 是全球最大的死亡原因 5。虽然饮食和生活方式干预可以有效减少肥胖，但长期成功率很低 6。因此，人们开发了药物疗法来治疗肥胖症，但迄今为止，这些药物通常会导致约 5-8% 的体重减轻，这可能不足以纠正某些人的肥胖相关合并症 7 。因此，迫切需要新的肥胖疗法来治疗心脏代谢疾病。生长分化因子 15 (GDF15) 是转化生长因子-β (TGFβ) 超家族的远亲，以 ~25 kDa 同型二聚体的形式循环，由两个 112 个氨基酸多肽链组成，
欧洲议会通过的文本
(2) NGT 是一组不同的基因组技术，每一种技术都可以以不同的方式使用，以实现不同的结果和产品。它们可以产生与传统育种方法获得的生物体相同的修饰，也可以产生具有更复杂修饰的生物体。在 NGT 中，定向诱变和同源遗传（包括同源遗传）引入遗传修饰，而无需插入不可杂交物种的遗传物质（转基因）。它们仅依赖于育种者的基因库，即常规育种可用的全部遗传信息，包括可以通过先进育种技术杂交的远亲植物物种。定向诱变技术可对生物体基因组中精确位置的 DNA 序列进行修饰。同源遗传技术可将育种者基因库中已经存在的遗传物质插入生物体的基因组中。同源遗传是顺源遗传的一个子集，其结果是在基因组中插入由育种者基因库中已经存在的两个或多个 DNA 序列组成的重新排列的遗传物质副本。
绿色甲藻的比较质体基因组学揭示了平行基因组压缩和 RNA 编辑
甲藻的质体在色素沉着和进化背景上都多种多样。甲藻中发现的一种质体类型含有叶绿素 a 和 b (Chl a + b )，源自一小群绿藻类（Pedinophyceae）的内共生体。含有 Chl a + b 的质体已在三种远亲甲藻 Lepidodinium spp.、菌株 MGD 和菌株 TGD 中发现，并被认为源自甲藻（宿主）和藻绿藻（内共生体）之间的独立伙伴关系。在本研究之前，只有 L. chlorophorum 的质体基因组序列可用，据报道它具有在排藻绿藻 Pedinomonas minor 中未发现的特征，Pedinomonas minor 被认为是产生当前含 Chl a + b 质体的内共生体的近亲。在本研究中，我们对菌株 MGD 和 TGD 的质体基因组进行了测序，以与 L. chlorophorum 以及排藻绿藻的基因组进行比较。相应质体基因组上的 RNA 测序读数映射鉴定了三种甲藻中质体基因转录本上的 RNA 编辑。此外，比较质体基因组学显示，三种甲藻的质体基因组同时实现了几个特征，这些特征在迄今为止确定的排藻质体基因组中没有发现或不明显得多。
人类研究中定量遗传关联模型中主成分的局限性
摘要 主成分分析 (PCA) 和线性混合效应模型 (LMM) 有时结合使用，是最常见的遗传关联模型。先前的 PCA-LMM 比较给出了混合结果、不明确的指导，并且有几个局限性，包括不改变主成分 (PC) 的数量、模拟简单的种群结构以及对真实数据和功效评估的使用不一致。我们在现实基因型和复杂性状模拟中评估了不同数量的 PC 的 PCA 和 LMM，包括混合家庭、亚种群树和具有模拟性状的真实多民族人类数据集。我们发现没有 PC 的 LMM 通常表现最佳，在家庭模拟和没有环境影响的真实人类数据集和性状中具有最大的效果。人类数据集上 PCA 表现不佳主要是由大量远亲而不是较少数量的近亲造成的。虽然 PCA 已知无法处理家庭数据，但我们报告了家庭相关性在遗传多样化的人类数据集中的强烈影响，而这无法通过修剪近亲来避免。用 LMM（包括这些标签，而不是 PC）可以更好地建模由地理和种族驱动的环境影响。这项工作更好地描述了 PCA 与 LMM 相比在为关联研究建模多种族人类数据的复杂关联结构方面的严重局限性。