摘要 本应用说明展示了将 sgRNA 序列插入 9.5 kb 载体进行靶向 DNA 组装的便利性。与必须合成并重新退火两个寡核苷酸的传统克隆方法不同,此新方案提供了一种简单的方法来设计寡核苷酸并将其与所需载体组装。NEBuilder HiFi DNA 组装主混合物比传统方法有了显著的改进,特别是在节省时间、易于使用和成本方面。
摘要 本应用说明展示了将 sgRNA 序列插入 9.5 kb 载体进行靶向 DNA 组装的便利性。与必须合成并重新退火两个寡核苷酸的传统克隆方法不同,此新方案提供了一种简单的方法来设计寡核苷酸并将其与所需载体组装。NEBuilder HiFi DNA 组装主混合物比传统方法有了显著的改进,特别是在节省时间、易于使用和成本方面。
摘要 本应用说明展示了将 sgRNA 序列插入 9.5 kb 载体进行靶向 DNA 组装的便利性。与必须合成并重新退火两个寡核苷酸的传统克隆方法不同,此新方案提供了一种简单的方法来设计寡核苷酸并将其与所需载体组装。NEBuilder HiFi DNA 组装主混合物比传统方法有了显著的改进,特别是在节省时间、易于使用和成本方面。
摘要 — 机器学习 (ML) 和人工智能 (AI) 依赖数据源通过其算法进行训练、改进和预测。随着数字革命和物联网等当前范式的发展,这些信息正在从静态数据转变为连续数据流。然而,目前使用的大多数 ML/AI 框架都没有为这场革命做好充分准备。在本文中,我们提出了 Kafka-ML,这是一个开源框架,可通过数据流 (Apache Kafka) 管理 TensorFlow ML/AI 管道。Kafka-ML 提供了一个可访问且用户友好的 Web 用户界面,用户可以轻松定义 ML 模型,然后对其进行训练、评估和部署以进行推理。Kafka-ML 本身及其部署的组件完全通过容器化技术进行管理,从而确保其可移植性和易于分发性以及容错性和高可用性等其他特性。最后,引入了一种管理和重用数据流的新方法,这可能导致(不)使用数据存储和文件系统。
虽然在将细菌行为与电极联系起来方面取得了令人瞩目的进展,但促进合成生物学进步的一个有吸引力的观察结果是,细菌菌落的生长可以通过随时间变化的阻抗变化来确定。在这里,我们通过调节带电代谢物积累的工程群体动态将合成生物学与微电子技术相结合。我们通过群体控制电路展示了细菌对重金属反应的电检测。然后,我们将这种方法应用于同步遗传振荡器,从工程细菌中获得振荡阻抗曲线。最后,我们将电极阵列小型化以形成“细菌集成电路”,并展示其作为遗传电路接口的适用性。这种方法为合成生物学、分析化学和微电子技术的新进展铺平了道路。
高通量测序在生物医学领域已变得无处不在。随着新技术的出现和测序成本的下降,可用数据的多样性和数量呈指数级增长,成功浏览数据变得更具挑战性。尽管数据集通常由公共存储库托管,但科学家必须依靠不一致的注释来识别和解释有意义的数据。此外,高通量生物数据的实验异质性和广泛的质量意味着即使具有所需细胞系、组织类型或分子靶标的数据也可能不易解释或整合。我们开发了 ORSO(社交组学在线资源)作为一个易于使用的 Web 应用程序,将生命科学家与基因组学数据联系起来。在 ORSO 中,用户在数据驱动的社交网络中交互,他们可以收藏数据集并关注其他用户。除了来自主要生物医学联盟的 30,000 多个数据集外,用户还可以将自己的数据贡献给 ORSO,以方便其他用户发现它。 ORSO 利用用户交互,提供了一种新颖的推荐系统,可自动将用户与托管数据连接起来。除了社交互动之外,推荐系统还考虑了主要读取覆盖率信息和带注释的元数据。ORSO 以图形显示方式呈现推荐系统使用的相似性,从而允许探索数据集关联。网络图的拓扑结构反映了已建立的生物学,相关系统的样本被分组在一起。我们使用从胚胎干细胞分化到心肌细胞的 RNA 序列时间过程数据集测试了推荐系统。ORSO 推荐系统正确地预测早期数据点源为胚胎干细胞,晚期数据点源为心脏和肌肉样本,从而推荐了相关数据集。通过将科学家与相关数据联系起来,ORSO 提供了一种重要的新服务,促进了广泛的研究兴趣。
摘要:本论文由 FREJA Transport & Logistics Oy 委托撰写。该研究的目的是调查如何使用 DMAIC 模型开发当前的出口空运流程。出口空运流程大部分已外包,公司自有资源的利用程度有限。该研究仅限于从芬兰出发飞往欧洲以外目的地的航空运输。论文的理论部分分为两个独立的部分。第一部分讨论业务流程开发、六西格玛、DMAIC 模型和 SCOR 指标。第二部分涉及空运货物。通过六个不同的主题对航空货运概念进行了研究:航空货运需求、飞机、运输单位、航空货运运营商、航空货运成本和市场未来。最终形成了通用的出口空运货物流程,为研究的实证部分奠定了基础。在研究的实证部分,根据DMAIC模型逐步开展当前的出口空运流程,以寻找自身资源利用率低的原因。流程效率低下的主要原因是流程的各个阶段被外包,并且流程中涉及到多个中介机构。解决方案是利用公司自己的运输车队和网络来处理从发货人到出发机场的公路运输。结果表明,改进的流程可以在不影响服务水平的情况下降低流程的运营成本。噓
1996 年是 W. K. 伦琴发现 X 射线一百周年,人们庆祝了这种“奇异射线”提供的深刻见解。除了普遍用于对视觉不透明系统的内部结构进行成像之外,X 射线在阐明物质的几何结构和电子结构方面也具有重要应用。除了同步辐射设备外,在普通实验室环境中可用的传统 X 射线源的波长非常适合揭示晶体固体和生物分子中的原子排列。此外,吸收和发射的 X 射线的光谱可以揭示原子、分子和材料的电子结构。类似地,核 β 射线反映原子核的能级结构,其波长范围远低于 X 射线波长,就像 X 射线波长低于可见光波长一样。 1912 年首次报道的 X 射线衍射将 X 射线波长与晶格尺寸联系起来,但未能将这两个尺度与宏观物体的尺寸联系起来。从 20 世纪 30 年代初到 70 年代初,X 射线光谱对确定 N A 、h/e 和 hc/e 等基本常数做出了重要贡献。然而,这些测量受到 X 射线尺度与可见参考波长之间联系不确定性的限制。直到七十年代中期,唯一确立的直接联系是