.................................................................................................................................................... 61 图 24 DLM 估计的时间序列中每个种群的估计趋势。 ... 62 图 25. 在夏季在参考点进行的浮潜调查中,每 5 公里成年夏季钢头鳟的年峰值数量。参考点位于奥林匹克国家公园的六条河流中,X 轴的标签报告了每年重复调查的次数 n。计数包括自然和孵化场来源的成年鳟鱼(见表 5)。详情请参阅 Brenkman 和 Connolly (2008)。 ............................................................................................................. 64 图 26. 在连续浮潜调查中计数的成年夏季钢头鳟的分布和相对丰度(见表 6)。成年钢头鳟的纵向剖面以 1 公里的空间尺度绘制,以箱长表示。 ........................................................................................... 68 图 27. 估计冬季径流种群的 15 年逃逸趋势(切断后总逃逸量)。点显示估计的随时间变化的趋势和个别种群的 95% 置信区间。15 年窗口的结束时间是 x 轴上的年份。仅显示至少有 2 个观测值(数据点)位于前 5 年且有 2 个观测值位于后 5 年的 15 年窗口。请注意,海峡 JF 组中的种群要小得多(图 22)。 ........................................................................................................................................... 70 图 28. 估计的 Busby(1977-1994 年)和后 Busby(1995-2022 年)时期的冬季径流种群的逃逸趋势(切断后总逃逸量)。点显示估计的趋势和 95% 置信区间。 ........................................................................................................................... 72 图 29. 冬季径流库存的 15 年平均逃逸量估算值(截断后的总逃逸量)。各点显示截至 x 轴年份的 15 年期间各个库存的估计平均值。仅显示至少有 2 年在前 5 年、2 年在后 5 年的 15 年窗口。x 轴上的年份是 15 年期的结束年份。 ........................................................................................................................... 74 图 30. 冬季径流库存的平均逃逸量估算值(3 月 15 日截断后的总逃逸量),前期(1989-1993 年)和后期(2018-2023 年)。请注意,y 轴为 log10 刻度。 ........................................................................................................................... 75 图 31.联合管理者报告的自然(3 月捕捞期后逃逸)冬季洄游鲑鱼的捕捞死亡率。这是捕捞量/捕捞量。娱乐性钓鱼(捕获和释放)死亡率仅包含在霍河数据中。...................................................................................... 78 图 32. 有捕捞和无捕捞期间 OP 鲑鱼海峡种群增长的一年估计值。估计值来自 DLM 输出。垂直线显示平均值和 95% 置信区间。............................................................................................................. 80 图 33. 有捕捞和无捕捞期间 OP 鲑鱼海峡种群的种群增长率。估计值来自 DLM 输出。垂直线显示平均值和 95% 置信区间。............................................................................................................. 81 图 34. 联合管理者报告的自然(3 月捕捞期后)冬季洄游鲑鱼逃逸和捕捞的原始数据。 ........................................................................................................... 83 图 35. 估计的对数尺度种群增长率(亩)、估计的年收获死亡率(F)和净种群增长率(亩 + F)。对于“F”和“亩 + F”,每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。 ............................................................................................................................................. 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。(摘自 Moore 1960 年)。 ............................................................................................................................................. 88估计的对数尺度种群增长率(亩)、估计的年收获死亡率(F)和净种群增长率(亩 + F)。对于“F”和“亩 + F”,每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。...................................................................................................................................................... 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。(来自 Moore 1960)。...................................................................................................................................................... 88估计的对数尺度种群增长率(亩)、估计的年收获死亡率(F)和净种群增长率(亩 + F)。对于“F”和“亩 + F”,每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。...................................................................................................................................................... 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。(来自 Moore 1960)。...................................................................................................................................................... 88
Joseph A. Lewnard Sara Y. Tartof 2121 Way 100 South Los Robles Berkeley,California,加利福尼亚州94720 Pasadena,California,加利福尼亚州91101 jlewnard@berkeley.edu sara.edu sara.y.y.tartof@kp.org@kp.org 510-664-4050 626-626-26-26-626-4264-3001键入 进化。许多SARS-COV-2谱系的出现与逃避疫苗接种和感染导致种群免疫力的能力的提高有关。在这里,我们显示了新兴XBB/XBB.1.5 Omicron Lineage的疫苗来源和感染衍生的免疫力的逃逸趋势。Among 31,739 patients tested in ambulatory settings in Southern California from December, 2022 to February, 2023, adjusted odds of prior receipt of 2, 3, 4, and ≥5 COVID-19 vaccine doses were 10% (95% confidence interval: 1-18%), 11% (3-19%), 13% (3-21%), and 25% (15-34%) lower, respectively, among cases被XBB/XBB.1.5感染的情况比感染了其他共同循环谱系的情况。类似地,与非-XBB/XBB/XBB.1.5病例相比,先前的疫苗接种与对Xbb/XBB.1.5病例的进展更大的保护有关,比非XBB/XBB.1.5病例(分别为70%[30-87%]和48%[7-71%],[7-71%],对于≥4剂量的受体)。相比之下,感染XBB/XBB.1.5的病例分别具有17%(11-24%)和40%(19-65%)的调整后几率,分别经历了1和≥2个先前记录的感染,包括前疗法变体。由于从SARS-COV-2感染中获得的免疫力变得越来越普遍,因此与XBB/XBB.1.5中疫苗敏感性增强相关的适应性成本可能会因避免感染衍生的宿主反应的能力而抵消。宿主免疫反应是影响病原体进化动力学的选择性压力的关键来源。1–3在扩大人口免疫力的背景下,连续的SARS-COV-2谱系显示,在整个COVID-19-19的大流行过程中,逃避疫苗衍生和感染衍生的免疫反应的能力增加了。4,5,而对Epsilon,Gamma,Delta和其他早期变体的保护减少通常被认为是适度的,6-9的Omicron Ba.1谱系与≥1.8倍的差异相关,与Delta相比,通过感染效率高于10–13的效果,以及效率低下的效率高于1.8倍,以及效率低下的效果,以及标志性的效果。 保护。14–16尽管流行病学研究并未发现疫苗衍生或感染衍生的对BA.BA.2谱系的差异证据。2与BA.1相比,随后的BA.4和BA.5谱系与早期相对于早期的OMICRON LINEA的重新感染的风险增加了效果,以及效果效率均可降低。21,22监测新兴谱系逃避免于疫苗接种或事先感染的免疫力的能力,这对于旨在减轻SARS-COV-2负担的持续努力是至关重要的,类似于针对流感,23肺炎,24肺炎,24和其他感染性疾病患者的疫苗经验。25,26 XBB/XBB.1.5 OMICRON通过重组BA.2.10.1和BA.2.75 Sublineages并超过BQ.1/bq.1.1,以及其他BA.5与其他BA.5相关的血统,以及1月下旬的我们的主要原因。27虽然XBB/XBB.1.5通过感染衍生的抗体逃避中和,但28,29例早期观察性研究报告说,更新的(双重)Covid-19促进疫苗赋予了对症状性XBB/XBB.1.1.5感染的实质性保护。30尚不清楚XBB/XBB.1.5是否与BA.5相关谱系有所不同,其对通过先前疫苗接种或感染获得的宿主反应的敏感性。