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使用 cas 定向 LINE-1 逆转录酶进行大型遗传有效载荷的定向插入
一个困难的基因组编辑目标是大型遗传构建体的位点特异性插入。我们在此描述了 GENEWRITE 系统，其中 Cas 内切酶的位点特异性靶向活性与人类逆转录转座子 LINE-1 的 ORF2p 蛋白的逆转录酶活性相结合。这是通过提供两种 RNA 来实现的：一种靶向 Cas 内切酶活性的向导 RNA 和一种编码所需插入的适当设计的有效载荷 RNA。我们使用大肠杆菌作为开发和部署的简单平台，表明通过适当的有效载荷设计和辅助蛋白的共表达，GENEWRITE 可以使用所述方法将大型遗传有效载荷插入精确位置，尽管存在脱靶效应。基于这些结果，我们描述了在更复杂的系统中实施 GENEWRITE 的潜在策略。
抗逆转录病毒方案的耐受性和遵守性含有长效融合抑制剂albuvirvirtide用于HIV暴露后预防：中国的同类研究
（TDF）？lamivudine（3TC）（第2组）和DTG？tdf？3TC（第3组）。 所有招募的子主管在暴露后72小时内接受了PEP，并持续了28天，然后进行了12周。 结果：三组中共有330名参与者。 大多数参与者是男性（87.2％）。 性接触是最频繁的暴露方式（91.9％）。 接触治疗的平均时间为26.8±19.5 h。三个研究组在28天完成口服药物方面没有统计学上的差异。 与口头相比，28天的完成率显示出显着高度（88.9％对64.0％; p \ 0.0001），而ABT的依从性为94.4％，而口服PEP（p \ 0.0001）为75.7％。 含ABT组1的受试者表现出比第3组（87.3％vs. 72.9％; P \ 0.05）更高的依从性。 所有参与者都没有报告严重的不良药物反应，从而导致该研究退出。 所有药物方案均被发现安全且耐受性良好。 在研究期间未观察到HIV事件。 结论：含ABT的方案（ABT？） DTG还是ABT？ tdf？ 3TC）为HIV PEP提供了一个不错的选择，这是由于更高的完成率和依从性，而不是DTG？ tdf？ 3TC方案。 三组之间的总体安全性是可比的且可以接受的。3TC（第3组）。所有招募的子主管在暴露后72小时内接受了PEP，并持续了28天，然后进行了12周。结果：三组中共有330名参与者。大多数参与者是男性（87.2％）。性接触是最频繁的暴露方式（91.9％）。接触治疗的平均时间为26.8±19.5 h。三个研究组在28天完成口服药物方面没有统计学上的差异。与口头相比，28天的完成率显示出显着高度（88.9％对64.0％; p \ 0.0001），而ABT的依从性为94.4％，而口服PEP（p \ 0.0001）为75.7％。含ABT组1的受试者表现出比第3组（87.3％vs. 72.9％; P \ 0.05）更高的依从性。所有参与者都没有报告严重的不良药物反应，从而导致该研究退出。所有药物方案均被发现安全且耐受性良好。在研究期间未观察到HIV事件。结论：含ABT的方案（ABT？DTG还是ABT？tdf？3TC）为HIV PEP提供了一个不错的选择，这是由于更高的完成率和依从性，而不是DTG？tdf？3TC方案。 三组之间的总体安全性是可比的且可以接受的。3TC方案。三组之间的总体安全性是可比的且可以接受的。
通过CRISPR获取基于逆转录的遗传条形码
1 Gladstone数据科学与生物技术研究所，美国加利福尼亚州旧金山2号，美国2个神经生物学系，杜克大学医学中心，美国北卡罗来纳州杜克大学医学中心，美国3号遗传学系，哈佛医学院，马萨诸塞州波士顿，美国4 Wyss Institute fiologaligy Institute fiologaligy启发工程，哈佛大学，波斯顿，沃尔斯顿，美国5.美国6美国加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学生物工程和治疗科学系
CRISPR 基因组编辑应用于致病性逆转录病毒 HTLV-1
逆转录病毒原病毒的 CRISPR 编辑仅限于 HIV-1。我们提出人类 T 细胞白血病病毒 1 型 (HTLV-1) 是一种极好的模型，可用于推进 CRISPR/Cas9 基因组编辑技术以对抗活跃表达和潜伏性逆转录病毒原病毒。HTLV-1 是一种致瘤性人类逆转录病毒，导致白血病/淋巴瘤 (ATL) 和神经系统疾病 (HAM/TSP)。该病毒可永生化并持续存在于 CD4 + T 淋巴细胞中，这些细胞可在宿主的一生中存活。HTLV-1 介导的转化和增殖的最重要驱动因素是 tax 和 hbz 病毒基因。从正链或基因组链转录的 Tax 对于从头感染和细胞永生化至关重要。从负链转录的 Hbz 以蛋白质和 mRNA 形式支持受感染细胞的增殖和存活。通过基因组编辑和诱变双链断裂修复消除 tax 和/或 hbz 的功能或表达可能会使 HTLV-1 感染细胞生长/存活失效，并阻止免疫调节作用，最终导致 HTLV-1 相关疾病。此外，HTLV-1 病毒基因组高度保守，序列同质性显著，无论是在同一宿主内还是在不同的 HTLV 分离株之间。这提供了更有针对性的指导 RNA 靶向。此外，有几种成熟的动物模型可用于研究体内 HTLV-1 感染以及体外细胞永生化。因此，对 HTLV-1 的研究可能为评估和推进针对逆转录病毒感染的体内基因组编辑提供更好的基础。
甲状腺癌中的端粒酶逆转录酶启动子突变：精确肿瘤学的含义 - 叙事评论
v600e），或RAS突变或RET -PTC融合，而大多数FTC具有PAX8 -PPARγ融合或RAS突变，但很少表现出改变的BRAF。同时，BRAF和RAS突变都经常出现在PDTC和ATC中，并且抑制肿瘤抑制剂TP53的失活很常见，尤其是在ATC中（7,9,10）。此外，在大约三分之一和十分之一的ATC中看到了其他肿瘤抑制剂（包括CDKN2A-RB1和PTEN）的畸变（7,9）。与分化的FTC或PTC相比，肿瘤抑制器的失活显然是未分化的PDTC和ATC的定义特征。总体而言，上面的基因组和表观遗传改变以及对患者特定临床特征的认识的越来越多，使TC护理中的精确药物成为疾病诊断，风险分层，预后和治疗决策或靶向治疗药物的实现范式。
Spen 将 RNA 介导的内源性逆转录病毒沉默与 X 染色体失活联系起来
摘要 Xist lncRNA 介导 X 染色体失活 (XCI)。我们在此表明，Spen 是一种对 XCI 至关重要的 Xist 结合阻遏蛋白，它与古老的逆转录病毒 RNA 结合，发挥监视作用，将染色质沉默机制招募到这些寄生基因座。Spen 的丢失会激活小鼠胚胎干细胞中的一组内源性逆转录病毒 (ERV) 元素，从而获得染色质可及性、活性组蛋白修饰和 ERV RNA 转录。Spen 直接与 ERV RNA 结合，这些 RNA 显示出与 Xist 的 A 重复序列的结构相似性，而 Xist 的 A 重复序列是 Xist 介导的基因沉默的关键区域。ERV RNA 和 Xist A 重复序列以竞争性方式结合 Spen 的 RRM 结构域。将 ERV 插入 A 重复序列缺陷的 Xist 可挽救 Xist RNA 与 Spen 的结合，并导致顺式中严格的局部基因沉默。这些结果表明，Xist 可能利用转座因子 RNA-蛋白质相互作用来重新利用强大的抗病毒染色质沉默机制来进行性染色体剂量补偿。
通过 CRISPR/Cas9 靶向基因组编辑在商业鸡品系中获得对逆转录病毒感染的抗性
基因组编辑技术为动物育种提供了新的可能性，并有助于理解宿主-病原体相互作用。在家禽中，逆转录病毒是最难通过常规策略（例如疫苗接种）控制的病原体之一。禽白血病病毒亚群 J (ALV-J) 是一种致癌、免疫抑制性逆转录病毒，可导致鸡的髓性白血病和其他肿瘤。由于根除策略低效和缺乏有效疫苗，ALV-J 造成的严重经济损失在世界许多地方仍然是一个未解决的问题。ALV-J 附着和进入是通过特定受体鸡 Na + /H + 交换器 1 型 (chNHE1) 介导的。chNHE1 中非保守氨基酸色氨酸 38 (W38) 对病毒进入至关重要，使其成为引入抗病性的有利靶标。在本研究中，我们利用 CRISPR/Cas9 系统结合同源定向修复，通过精确删除 chNHE1 W38，在商业鸡系中获得了 ALV-J 抗性。基因改造完全保护细胞免受 J 亚组逆转录病毒的感染。W38 删除对基因编辑鸡的发育和总体健康状况均没有负面影响。总体而言，通过精确基因编辑产生 ALV-J 抗性鸟类表明这种方法作为家禽替代疾病控制策略的巨大潜力。
针对饮酒和抗逆转录病毒治疗依从性的认知行为疗法短信干预的初步疗效：一项随机临床试验
到目前为止，还没有研究报告使用短信向感染 HIV 的酗酒者提供认知行为疗法 (CBT)。我们开发并评估了一个基于短信的程序，为患有酒精使用障碍和共病 HIV 的成年人提供针对饮酒和抗逆转录病毒 (ART) 药物依从性的 CBT。参与者被随机分配接受 12 周的基于 CBT 的短信干预 (ALC-TXT-CBT)，针对 ART 依从性和饮酒 (n = 18)；或接受包含侧重于饮酒和药物依从性的教育内容的信息小册子 (INFO) (n = 17)。使用混合模型回归分析和配对 t 检验，在基线和 12 周（即治疗结束）评估中比较了 ALC-TXT-CBT 和 INFO 中 ART 依从性和饮酒情况。相对于 INFO 中的受试者，ALC-TXT-CBT 参与者的 ART 依从性有所提高，以电话未通知的药片数量（β = 0.16，p = 0.04）和生化病毒载量（t = -2.0，p = 0.04）来衡量。ALC-TXT-CBT 参与还与治疗结束时酗酒减少有关（t = 2.7，p = 0.02），而各组之间的总体饮酒频率没有显着差异（t = 1.5，p = 0.07）。研究结果表明，ALC-TXT-CBT 在改善药物依从性和减少患有酒精使用障碍和合并 HIV 感染的个体的酗酒方面的疗效具有良好的初步证据。
细菌中高效的逆转录因子介导的 DNA 书写
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2020 年 2 月 22 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.02.21.958983 doi：bioRxiv 预印本