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grna-seqret：靶向和基因组的通用工具 -
高通量遗传筛选经常用于与表型快速关联并建立序列功能关系。随着CRISPR技术的出现，可以使用合并的指南RNA（GRNA）库和基于测序的测定法对非模型生物进行功能询问以前的遗传性顽固生物，以定量评估并行的每个靶向轨迹。为了帮助构建合并的GRNA组件，我们使用GRNA序列区域提取工具（GRNA-Seqret）开发了用于GRNA选择的硅设计工作流。基于先前开发的CCTOP，GRNA-Seqret启用了针对用户规范区域的GRNA库的自动化，可扩展的设计，或任何原核生物或真核生物的整个基因组。此外，GRNA-Seqret相对于基因或其他特征的任何序列区域的批量提取自动化，有助于插入或缺失构建体的同源臂设计。我们还在计算机中评估了设计的GRNA文库在其他紧密相关的基因组中的应用，并证明对于密切相关的生物体，平均核苷酸同一性（ANI）> 95％> 95％的文库可能是相关的。可以通过https://grna.jgi.doe.gov访问GRNA-Seqret Web应用程序管道。源代码由免费的软件工具和自定义的Python脚本组成，可在https://bitbucket.org/ berkeleylab/grnadesigner/src/master/master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master访问（https://bitbucket.orgelelab/grnadadadeciendiable of。
构建系统收敛的途径？
○我们共同努力，改善了满足我们所有要求的通用工具。○SFT构建通用，HEPMC，仿真，分析和ML软件包组，并在CVMFS上分发它们，专门优化该工具，以使用CVMFs作为软件和可重复使用的产品的有效分发渠道。○使用相同工具的实验添加和维护其存储库，同时从共享的包装构建配方中受益。○不同的CI管道同时运行（可能在相同的共享构建基础架构上），优化了人力和计算资源的使用情况。○每个人都快乐
人工智能增强多功能雷达工程与数字孪生：迈向主动性
全数字化和软件定义的雷达，如海火和地火雷达，受益于可访问自由度的大幅增加，从而可以优化设计其操作模式。为了有效地利用这些设计选择并将其转化为作战能力，有必要开发使用人工智能的新工程工具。离散和连续域中的创新优化算法，加上雷达数字孪生，允许构建符合可用雷达时间预算的“搜索”模式设计（波束合成、波形和体积网格）的通用工具。这些算法的高计算速度表明该工具可用于“主动雷达”配置，这将动态地向操作员提出更适合环境、威胁和设备故障条件的操作模式。
tysserand-fast and from-div>的空间网络的准确重建
摘要：网络提供了一个强大的框架来分析空间OMICS实验。但是，我们缺少集成几种方法来轻松重建网络以与专用库进行进一步分析的工具。在附加过程中，选择适当的方法和参数可能具有挑战性。我们提出了python库Tysserand，以从空间解决的OMICS实验中重建空间网络。它是一种通用工具，生物信息学界可以添加新方法来重建网络，选择适当的参数，清洁结果网络和管道数据到其他库。可用性和实现：带有Jupyter笔记本的Tysserand软件和教程，可在https://github.com/verapancaldilab/tysserand上获得。联系人：Alexis.coullomb@inserm.fr或vera.pancaldi@inserm.fr补充信息：补充数据可在Bioinformatics Online上获得。
残疾学生服务 (SSD) 协调员概述 - 第 2 部分
考试概览 • 考试窗口 • 数字 SAT 套件系统 – 2024 年春季 • 通用工具 验证考试日的便利条件 • 州数据管理系统 • 放弃便利条件 • 强制匹配便利条件 在考试日工具包中将学生分配到考场 • 考试小组 • 考试票 考试设置和模拟考试 • 蓝皮书中的考试设置 • 蓝皮书中的模拟考试 常见便利条件和时间表 • 数字便利条件 • 时间表 • 纸质考试 英语学习者支持 • 一小时半 • 翻译的考试说明和字对字的双语词典 蓝皮书中的辅助技术 • 屏幕阅读器（文本到语音）和语音识别（听写/语音到文本） • Microsoft、Windows、Chrome 和 Apple 辅助功能 资源 问答
纠缠转移，积累和通过基于量子步行的Qubit – Qudit Dynamics
摘要高维系统中量子相关性的产生和控制是量子技术当前景观的主要挑战。实现这种非古典高维资源将有可能解锁量子加密，通信和计算的增强功能。我们提出了一种能够通过基于量子 - 步行（QW）基于涉及硬币和沃克自由度的机制的量子 - 步行（QW）转移和累积机制来实现D尺寸系统的纠缠状态的方案。调查QW的选择是由于它们在多种物理系统中的成功实施而得到补充的一般性和多功能性。因此，鉴于QW跨量子信息的横切作用，我们的协议潜在地代表了控制各种实验平台中高维纠缠产生的多功能通用工具。特别是我们说明了可能的光子实现，其中信息是在轨道角动量和单个光子自由度的极化程度中编码的。
广谱 CRISPR-Cas13a 可实现高效的噬菌体基因组编辑
CRISPR-Cas13 蛋白是 RNA 引导的 RNA 核酸酶，通过与互补的靶噬菌体转录本结合，然后进行一般的非特异性 RNA 降解，来防御入侵的 RNA 和 DNA 噬菌体。在这里，我们分析了 Leptotrichia buccalis 的 LbuCas13a 的防御能力，发现它具有强大的抗病毒活性，不受靶噬菌体基因的必要性、基因表达时间或靶序列位置的影响。此外，我们发现 LbuCas13a 的抗病毒活性对各种噬菌体具有广泛效果，方法是将 LbuCas13a 与来自不同系统发育群的九种大肠杆菌噬菌体进行对抗。利用 LbuCas13a 靶向的多功能性和效力，我们将 LbuCas13a 应用于广谱噬菌体编辑。使用两步噬菌体编辑和富集方法，我们在三种不同的噬菌体中实现了七次无标记基因组编辑，效率高达 100%，包括多基因删除和替换单个密码子等编辑。Cas13a 可用作编辑地球上最丰富、最多样化的生物实体的通用工具。
进化生物学家的生物信息学
本独立的教科书涵盖了进化生物学中序列分析的基本方面，包括序列比对，系统发育重建和融合模拟。它通过一系列超过400个计算机问题来解决这些方面，从基础到研究级别，再到完成学习。学生在科学数十年的相同计算环境中解决了问题 - UNIX命令行。这在PC的所有三个主要操作系统上都可用：Microsoft Windows，Mac-OSX和Linux。要使用此功能强大的系统学习，学生通过应用通用工具，生物信息学软件以及专门为本课程编写的40多个程序来分析样本序列数据。包括所有问题的解决方案，这本书是自学的理想之选。问题分为以引言和新概念和程序列表为首的部分。通过使用实用计算来探索进化概念和序列数据，该书使读者能够解决自己的计算问题。
人工智能对关键能源基础设施的潜在利益和风险
与风险类别 2 不同，此类别并不关注对 AI 模型本身的操纵，而是分析 AI 软件供应链可能面临的传统网络安全风险——例如目前能源系统运营中使用的许多数字系统中常见的风险。由于 AI 是软件，因此它面临与其他软件相同的网络安全风险——正如评估通过检查最近的网络供应链攻击所探索的那样。对手可能不仅利用 AI 软件攻击 AI 系统，而且还将其作为入侵受害者更广泛能源基础设施系统的媒介。这可能通过专有和开源软件发生，AI 系统通常严重依赖这些软件——这可能是一个特别令人担忧的问题，因为 AI 工具（尤其是那些依赖生成 AI 技术的工具）从定制设计转向依赖通用工具、库，在某些情况下，甚至是基础模型。因此，网络安全和能源系统供应链安全最佳实践对于确保 AI 软件供应链安全至关重要。