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NIST 材料测量实验室 LIMS 路线图
在过去十年中，实验室和计算科学领域的新兴技术通过加速数据的生产、处理和交换改变了研究格局。NIST 材料测量实验室社区认识到，要跟上测量科学向数字范式转变的步伐，实施实验室信息管理系统 (LIMS) 至关重要。在研究生命周期的早期有效引入 LIMS 可为实验的规划和执行以及加快研究生产力提供直接支持。从这个角度来看，LIMS 不是具有孤立交互的被动实体，而是支持协作、科学完整性和知识随时间转移的关键资源。它们充当组织对更广泛的联合数据社区贡献的交付系统，支持由研究的敏感性决定的受控和开放访问。成功的 LIMS 的总体目标是通过建立提供对实验室数据资源访问的通用工具来增强研究社区的能力。因此，现代 LIMS 应提供多项核心功能。核心功能和接触点
基础技术应用 TEKS 范围和...
我们的使命、目标和宗旨 BISD 使命：在伯德维尔独立学区，我们的使命是为小学生提供在日益技术化的世界中成为有生产力的公民所必需的技术技能。德克萨斯州基本知识和技能 (TEKS) 学科领域将决定我们是否有目的地使用计算机作为工具来加强研究、探索创造力、练习技能以及使用文本、声音和图像进行交流，从而提高学生成绩。学生将学习如何使用互联网和教育软件以及通用工具（如 Microsoft Word、Excel、PowerPoint、Kidspiration、Inspiration 和 KidPix）来收集、组织和呈现信息。学生还将理解和应用位于本文件末尾的 BISD 学区电子通信系统可接受使用政策（单击链接转到可接受使用政策文件）。技术应用技能是一组能力，使学生能够有效和高效地使用电子工具。掌握这些技能使学生能够对技术及其应用做出明智的决定。 BISD 目标： • 使 BISD 的学生、教师和管理员能够有效地整合
MultiCrispr：用于数千个目标的主要编辑和平行定位的GRNA设计
针对编码基因组通过CRISPR/ CAS9技术引入核苷酸缺失/插入已成为一种标准程序。它迅速产生了多种方法，例如素数编辑，顶点接近标记或同源性修复，但是，支持生物信息学工具的支持落后于此。新的CRISPR/CAS9应用程序通常会重新征询特定的GRNA设计功能，并且通常缺少一种通用工具。在这里，我们介绍了R/生物导体工具MulticRispr，旨在设计单个grnas和复杂的grna libraries。包装易于使用；在效率和特定的效率上，检测，分数和锻炼;每个目标或CRISPR/CAS9序列可视化和聚集结果；最后返回GRNA的范围和序列。是通用的，多晶状体定义的，并实现了基因组算术框架，作为便利适应最近引入的技术的基础，例如素数编辑或尚未出现。其性能和设计构想（例如目标集） - 特定过滤渲染多晶层在处理类似筛选的方法时选择的工具。
solax：带有神经网络支持的费米子量子系统的Python求解器
费米子多体量子系统的数值建模介绍了各个研究领域的类似challenges，需要使用通用工具，包括现状的机器学习技术。在这里，我们介绍了Solax，这是一个python库，旨在使用第二个量化的形式主义来计算和分析费米子量子系统。Solax提供了一个模块化框架，用于构建和操纵基础集，量子状态和操作员，促进电子结构的模拟并确定有限尺寸的Hilbert空间中的多体量子状态。库集成了机器学习能力，以减轻大量子群中希尔伯特空间尺寸的指数增长。使用最近开发的Python库Jax实现了核心低级功能。通过将其应用于单个杂质Anderson模型的应用，为研究人员提供了一种灵活而强大的工具，可用于应对各种领域的多体量子系统的挑战，包括原子物理学，量子化学和凝结物理学。
MACCS2 代码手册：第 1 卷，用户指南
本报告介绍了 MACCS2 代码的使用。该文件主要是用户指南，但包含了一些模型描述信息。MACCS2 是其前身 MACCS（MELCOR 事故后果代码系统）的重大改进。MACCS 自 1990 年以来由政府代码中心分发，旨在评估核电站严重事故对周围公众的影响。考虑的主要现象是时变气象下的大气输送和沉积、短期和长期缓解措施和暴露途径、确定性和随机健康影响以及经济成本。目前，没有其他公开的美国代码提供所有这些功能。MACCS2 是作为通用工具开发的，适用于由核管理委员会授权或由能源部或国防部运营的各种反应堆和非反应堆设施。MACCS2 软件包包括三个主要增强功能：(1) 更灵活的应急响应模型，(2) 扩展的放射性核素库，以及 (3) 半动态食物链模型。其他改进包括现象学建模和新输出选项。代码以 FORTRAN 77 编写，初始安装需要 486 或更高版本的 IBM 兼容 PC 和 8 MB RAM。
MACCS2 代码手册：第 1 卷，用户指南
本报告介绍了 MACCS2 代码的使用。该文件主要是用户指南，但包含了一些模型描述信息。MACCS2 是其前身 MACCS（MELCOR 事故后果代码系统）的重大改进。MACCS 自 1990 年以来由政府代码中心分发，旨在评估核电站严重事故对周围公众的影响。考虑的主要现象是时变气象下的大气输送和沉积、短期和长期缓解措施和暴露途径、确定性和随机健康影响以及经济成本。目前，没有其他公开的美国代码提供所有这些功能。MACCS2 是作为通用工具开发的，适用于由核管理委员会授权或由能源部或国防部运营的各种反应堆和非反应堆设施。MACCS2 软件包包括三个主要增强功能：(1) 更灵活的应急响应模型，(2) 扩展的放射性核素库，以及 (3) 半动态食物链模型。其他改进包括现象学建模和新输出选项。代码以 FORTRAN 77 编写，初始安装需要 486 或更高版本的 IBM 兼容 PC 和 8 MB RAM。
复杂生物分子组件的简单合成：结构生物学中的小麦生殖细胞蛋白表达
无细胞的蛋白质合成（CFP）系统随着基础研究，应用科学和产品开发的通用工具而变得越来越重要，并随着其应用而出现的新技术。使用CFP的合成生物学领域取得了巨大进展，以开发用于技术应用和治疗的新蛋白质。从可用的CFPS系统中，无小麦生殖细胞蛋白质合成（WG-CFP）与使用真核核糖体的最高产量合并，这使其成为合成复杂真核蛋白质（包括蛋白质复合物和膜蛋白）的绝佳方法。将翻译反应与其他细胞过程分开，CFP提供了一种灵活的手段，以适应蛋白质需求的翻译反应。对这种有效，易于使用的快速蛋白质表达系统的需求很大，它们在驱动生化和结构生物学研究方面最适合蛋白质需求。我们在这里总结了小麦细菌系统的一般工作流，该过程提供了文献中的例子，以及用于我们自己的结构生物学研究的应用。通过这篇综述，我们希望强调快速发展且通用性的CFPS系统的巨大潜力，从而使它们更广泛地用作常见工具，以重组准备特别具有挑战性的重组真核蛋白。
动态大视场光子谐振吸收显微镜，用于核酸和蛋白质生物标志物的超灵敏数字分辨率检测
在本文中，我们描述了一种基于我们之前开发的光子谐振吸收显微镜 (PRAM) 的生物传感仪器，该仪器结合了自动对焦、金纳米粒子 (AuNP) 积累的数字表示以及收集 AuNP 附着和脱离光子晶体 (PC) 表面的时间序列图像序列的能力。这些组合功能用于在生物分子分析过程中完全自动化 PRAM 图像收集，从而能够平铺 PRAM 图像以提供毫米级视野。该仪器还可以收集 PRAM“电影”，从而实现数字展示和动态计数 AuNP 到达和离开 PC 表面时的情况。我们在两种生物分子分析中利用这些功能来检测传统 AuNP 标记夹层格式的蛋白质生物标志物。利用测定过程中 AuNP 附着和分离事件的动态计数，我们提出了一种 10 分钟、室温、无酶方法检测低至 1 aM 的 microRNA-375 (miRNA- 375) 的方法，同时揭示了生物分子相互作用的结合率和解离率的特征。我们的仪器可能在多路复用即时诊断测试中得到广泛应用，并可作为以单分子分辨率定量表征生物分子结合动力学的通用工具。
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![arXiv:2006.01610v1 [cs.AI] 2020 年 6 月 2 日](/simg/g:\will\search\icon\source\c\c14b5ee8297f1f5ec8a1eefd93238c5c993dbd04.png)
arXiv:2006.01610v1 [cs.AI] 2020 年 6 月 2 日
组合优化已应用于从航空航天到交通规划和经济学等众多领域。其目标是在有限的可能性集合中找到最佳解决方案。组合优化面临的众所周知的挑战是状态空间爆炸问题：可能性的数量随着问题规模的增加而呈指数增长，这使得解决大问题变得困难。近年来，深度强化学习 (DRL) 已显示出其在设计专门用于解决 NP 难组合优化问题的良好启发式方法方面的前景。然而，当前的方法有两个缺点：（1）它们主要关注标准旅行商问题，不能轻易扩展到其他问题，（2）它们仅提供近似解，没有系统的方法来改进它或证明最优性。在另一个背景下，约束规划 (CP) 是解决组合优化问题的通用工具。基于完整的搜索过程，如果我们允许执行时间足够长，它将始终找到最佳解决方案。一个关键的设计选择是分支决策，它决定了如何探索搜索空间，这使得 CP 在实践中变得不可或缺。在这项工作中，我们提出了一种基于 DRL 和 CP 的通用混合方法来解决组合优化问题。我们方法的核心是基于动态规划公式，它充当了两种技术之间的桥梁。我们通过实验表明，我们的求解器可以有效解决两个具有挑战性的问题：带有时间窗口的旅行商问题和 4 矩投资组合优化问题。获得的结果表明，引入的框架优于独立的 RL 和 CP 解决方案，同时与工业求解器具有竞争力。