摘要:神经退行性疾病(NDDS)是无法治愈的,令人衰弱的疾病,导致中枢神经系统(CNS)中神经细胞的进行性变性和/或死亡。对CNS疾病的可行治疗靶标和新治疗方法的认同,尤其是NDD是药物发现领域的主要挑战。 这些困难可以归因于所涉及的细胞的多样性,神经回路的极端复杂性,组织再生的能力有限以及我们对基本病理过程的不完全理解。 药物发现是一个复杂而多学科的过程。 当前药物发现方案中的筛查速率意味着只有一种可行的药物可能是由于数百万筛查的化合物而产生的,因此需要改善发现技术和方案以解决多种损耗原因。 这已经确定需要筛选较大的库,其中使用有效的高通量筛选(HTS)成为发现过程中的关键。 HT可以每天研究成千上万种化合物的含量。 但是,如果可以筛选较少的化合物并损害成功的可能性,则成本和时间将大大降低。 为此,计算机辅助设计,计算机库中的最新进展以及分子对接软件结合了基于细胞平台的升级,已进化,以提高筛选效率,并具有更高的可预测性和临床适用性。对CNS疾病的可行治疗靶标和新治疗方法的认同,尤其是NDD是药物发现领域的主要挑战。这些困难可以归因于所涉及的细胞的多样性,神经回路的极端复杂性,组织再生的能力有限以及我们对基本病理过程的不完全理解。药物发现是一个复杂而多学科的过程。当前药物发现方案中的筛查速率意味着只有一种可行的药物可能是由于数百万筛查的化合物而产生的,因此需要改善发现技术和方案以解决多种损耗原因。这已经确定需要筛选较大的库,其中使用有效的高通量筛选(HTS)成为发现过程中的关键。HT可以每天研究成千上万种化合物的含量。但是,如果可以筛选较少的化合物并损害成功的可能性,则成本和时间将大大降低。为此,计算机辅助设计,计算机库中的最新进展以及分子对接软件结合了基于细胞平台的升级,已进化,以提高筛选效率,并具有更高的可预测性和临床适用性。我们在这里审查了HT在当代药物发现过程中,尤其是NDD的越来越多的作用,并评估其成功应用的标准。我们还讨论了HTS对新型NDD疗法的需求,并研究了验证新药物靶标和开发NDD的新疗法的当前主要挑战。
致谢:这项工作由欧洲地区发展基金(ERDF),通过2020 Centro区域运营计划以及竞争的2020年竞争 - 竞争力和国际化运营计划以及葡萄牙国家基金通过FCT,项目下的Project [s]:expl/bia -bia -bqm/1361/2021/2020/2020/2020/2020/2020/2020/2020/2020/2020/2020年。PAS GRAS项目已从欧盟的地平线欧洲获得资金。H. Gerardo(SFRH/BD/147316/2019和COVID/BD/153559/2024)和J. Teixeira(2020.01560.Ceecind)承认FCT,I.P。研究合同。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年1月16日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.14.631240 doi:biorxiv Preprint
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供(未经同行评审认证),作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2024 年 12 月 23 日发布了此版本。;https://doi.org/10.1101/2024.12.22.629679 doi:bioRxiv 预印本
摘要。泥炭地管理实践,例如排水和恢复,对北方泥炭地甲烷(CH 4)伏克会产生强大影响。此外,CH 4倍孔受到局部环境条件的强烈控制,例如土壤水文,温度和植被,它们都因气候变化而导致了很大的变化。在本世纪,管理实践和气候变化都预计会影响Peatland CH 4倍孔,但是这些变化的幅度和净影响仍然没有足够的了解。在这项研究中,我们模拟了两种森林管理实践的实践,旋转林业和连续覆盖林业以及泥炭地修复,并使用陆地模型JENA模型(Jena)跨越了Biosphere-Atmother-atmopher peater anber peater anber peater y的山地模型,以假设的林地泥土跨越了芬兰(Finland)的泥炭地( Himmeli(赫尔辛基的甲烷积聚和泥炭地发射模型)。我们使用两个RCP(代表性浓度途径)发射方案进一步模拟了气候变暖的影响,RCP2.6和RCP4.5。我们研究了CH 4浮雕,土壤水位水平(WTL),土壤温度和土壤碳动力学对管理实践和气候变化的反应。我们的结果表明,管理实践对泥炭地WTL和CH 4排放有很大的影响,这些排放持续了数十年,并且恢复后的排放量增加,并且
实时询问细胞过程的需求驱动了活细胞荧光生物传感器的膨胀工具箱的开发。尤其是,遗传编码的荧光生物传感器已解锁了复杂组织模型和体内生物体研究中实时单细胞代谢分析的潜力。荧光生物传感器还提出了一种有力的方法,可以在与高通量,自动化方法兼容的简单细胞培养系统中获得对活细胞代谢的定量见解。本申请说明为基于图像的自动分析的工作流程提供了胞质NAD+/NADH比率的基于图像的分析,这是细胞代谢和增殖的核心核心状态。在这里,单仪器解决方案结合了自动多通道图像采集,图像处理,细胞分析和比率信号定量。为了证明这种方法所产生的定量见解,我们探索了由常见历史但通常没有报告的细胞培养条件变化所塑造的代谢变化。
靶向二代测序在传染病应用与实践专家共识 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会 通讯作者:王晖,北京大学人民医院检验科,北京 100044,Email:whuibj@163. com;曹斌,中日友好医院呼吸与危重症医学科,北京 100029,Email:caobin_ben@163.com 【摘要】靶向二代测序(tNGS)技术通过设计特异的引物或捕获探针来检测临床样本中的病原微生物及耐药基因,为传染病的诊断、治疗和监测提供依据。但目前tNGS和宏基因组二代测序(mNGS)的临床应用场景尚不明确,不同厂家的tNGS系统质量和结果差异很大。该技术的临床适应症、实验室流程、质量控制、性能验证和报告解释等都亟待制定共识和标准。为规范tNGS在传染病领域的应用与实践,中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会的微生物学、传染病、呼吸道疾病、流行病学等领域的专家针对上述问题进行了探讨,撰写了tNGS在传染病领域应用与实践专家共识。
Fernando Bravo知识与技术转移负责Bravo博士在Rovira I Virgili大学(1997-2000)完成了博士学位。在埃默里大学(Emory University)(2001-2003)的博士后阶段之后,布拉沃(Bravo)博士被聘为GlaxoSmithkline Verona化学发展部(意大利; 2003-2010)的化学发展部的合成化学家,在那里他参加了各个阶段的开发阶段(从开发项目(从临时性注册到注册和发射)和开发化学团队的辅助化学家。Bravo博士于2010年加入ICIQ,目的是创建和领导CSOL部门直到2023年,重点关注ICIQ自己的技术的价值,并与行业管理合同研究项目。在这个职位上,他监督了大约40个价值项目的开发团队的一部分。Bravo博士一直是各个区域,国家和国际项目的首席研究员,并与工业合作伙伴(尤其是与制药部门有关的工业伙伴)协调合同研究项目。尤其是Bravo博士在设计,优化和扩展制药公司的优化和按需合成项目中的合成路线上应用了他的专业知识。他以> 30份出版物和8份专利申请进行计数。Bravo博士拥有AEI的R3认证。目前,他是ICIQ知识和技术转移部门的负责人。
Fernando Bravo知识与技术转移负责Bravo博士在Rovira I Virgili大学(1997-2000)完成了博士学位。在埃默里大学(Emory University)(2001-2003)的博士后阶段之后,布拉沃(Bravo)博士被聘为GlaxoSmithkline Verona化学发展部(意大利; 2003-2010)的化学发展部的合成化学家,在那里他参加了各个阶段的开发阶段(从开发项目(从临时性注册到注册和发射)和开发化学团队的辅助化学家。Bravo博士于2010年加入ICIQ,目的是创建和领导CSOL部门直到2023年,重点关注ICIQ自己的技术的价值,并与行业管理合同研究项目。在这个职位上,他监督了大约40个价值项目的开发团队的一部分。Bravo博士一直是各个区域,国家和国际项目的首席研究员,并与工业合作伙伴(尤其是与制药部门有关的工业伙伴)协调合同研究项目。尤其是Bravo博士在设计,优化和扩展制药公司的优化和按需合成项目中的合成路线上应用了他的专业知识。他以> 30份出版物和8份专利申请进行计数。Bravo博士拥有AEI的R3认证。目前,他是ICIQ知识和技术转移部门的负责人。
信用撰稿人贡献声明Jared Keith Averitt:写作 - 原始草案,评论,可视化,验证,资源,方法,软件,调查,资金获取,正式分析,数据策划,概念化,概念化。sajedeh pourianejad:写作 - 原始草稿,验证,方法论,调查,正式分析,数据策划。Olubunmi O. Ayodele:方法论,概念化。柯比·施密特(Kirby Schmidt):调查,数据策划。Anthony Trofe:数据策划。Joseph Starobin:写作 - 评论和编辑,监督,资源,资金获取。 Tetyana Ignatova:写作 - 审查和编辑,监督,资源,资金获取,概念化。 致谢J.K.A. 承认,该材料基于国家科学基金会(NSF)研究生研究奖学金的工作, [1945980]和这项工作在匹兹堡超级计算中心使用了桥梁-2通过分配[PHY220034],来自高级网络网络基础结构协调生态系统:服务与支持(访问)计划,由国家科学基金会#2138259,#2138259,#2138286,21386,#2133330,及#21333303.60,由国家科学基金会支持 T.I,J.K.A.,A.T。承认纳米技术的创新合作实验室赋予未来士兵的权力(ICONS),美国国防部[合同#W911QY2220006]与纳米科学和纳米工程联合学校之间的共同计划。 图1。Joseph Starobin:写作 - 评论和编辑,监督,资源,资金获取。Tetyana Ignatova:写作 - 审查和编辑,监督,资源,资金获取,概念化。致谢J.K.A.承认,该材料基于国家科学基金会(NSF)研究生研究奖学金的工作,[1945980]和这项工作在匹兹堡超级计算中心使用了桥梁-2通过分配[PHY220034],来自高级网络网络基础结构协调生态系统:服务与支持(访问)计划,由国家科学基金会#2138259,#2138259,#2138286,21386,#2133330,及#21333303.60,由国家科学基金会支持T.I,J.K.A.,A.T。承认纳米技术的创新合作实验室赋予未来士兵的权力(ICONS),美国国防部[合同#W911QY2220006]与纳米科学和纳米工程联合学校之间的共同计划。 图1。T.I,J.K.A.,A.T。承认纳米技术的创新合作实验室赋予未来士兵的权力(ICONS),美国国防部[合同#W911QY2220006]与纳米科学和纳米工程联合学校之间的共同计划。图1。这项工作是在纳米科学和纳米工程联合学校进行的,东南纳米技术基础设施走廊(SENIC)和国家纳米技术协调基础设施(NNCI)的成员,该基础设施(NNCI)得到了国家科学基金会[ECCS-1542174]的支持。J.K.A.,A.T。承认宾夕法尼亚州立大学二维水晶财团 - 材料创新平台(2DCC-MIP),该平台得到了NSF合作协议DMR-203935的支持。 使用NNP:神经网络潜力(机器学习的同义原子间潜在的同义)EDA-FF:能量分解分析 - 使用经典力场(结构优化后)GDAC:依赖性原子电荷BFGS:BROYDEN – FLOYDEN – FLOYDER-GLETCHER – FLETCHER-GOLDCHER-GOLDFARB – SHANNO ATSIS ATSIS ENTICAL DYMANSSSSSSSSSSS, (包含位置,质量,能量和力)DFT:密度功能理论(基于量子力学的电子结构计算方法)PMMA:聚甲基甲基丙烯酸酯(用于石墨烯转移的常用聚合物)ALP:Angelica Lactone Polymer(用于添加剂的生物量聚合物)。 (a)初始化AEV,(B)迭代NNP/MD优化几何(X,Y,Z),直到能量收敛为0.05 MeV,(C)计算表面接触的原子电荷(Q)和VDW面积。J.K.A.,A.T。承认宾夕法尼亚州立大学二维水晶财团 - 材料创新平台(2DCC-MIP),该平台得到了NSF合作协议DMR-203935的支持。使用NNP:神经网络潜力(机器学习的同义原子间潜在的同义)EDA-FF:能量分解分析 - 使用经典力场(结构优化后)GDAC:依赖性原子电荷BFGS:BROYDEN – FLOYDEN – FLOYDER-GLETCHER – FLETCHER-GOLDCHER-GOLDFARB – SHANNO ATSIS ATSIS ENTICAL DYMANSSSSSSSSSSS, (包含位置,质量,能量和力)DFT:密度功能理论(基于量子力学的电子结构计算方法)PMMA:聚甲基甲基丙烯酸酯(用于石墨烯转移的常用聚合物)ALP:Angelica Lactone Polymer(用于添加剂的生物量聚合物)。(a)初始化AEV,(B)迭代NNP/MD优化几何(X,Y,Z),直到能量收敛为0.05 MeV,(C)计算表面接触的原子电荷(Q)和VDW面积。