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珊瑚礁底栖生物主要由珊瑚和藻类栖息,它们经常直接竞争空间。大量研究表明,珊瑚伴生细菌与周围海水不同,并且至少部分是物种特异性的(即同一种珊瑚上有同一种细菌)。在这里,我们将这些微生物研究扩展到珊瑚礁中发现的四种主要藻类生态功能群:直立和包覆钙化藻、肉质藻和草皮藻,并将结果与在造礁珊瑚 Montastraea annularis 上发现的群落进行比较。使用 16S rDNA 标签焦磷酸测序发现,不同的藻类属含有特征性的细菌群落,这些群落通常比珊瑚上的细菌群落更加多样化。虽然大多数与珊瑚有关的细菌与已知的异养生物有关,主要消耗富含碳的珊瑚粘液,但与藻类有关的群落含有大量自养生物。大多数与藻类有关的自养细菌是蓝藻,可能对藻类的氮循环很重要。与藻类相关的光合真核生物也种类丰富,包括