玉米是世界许多国家人类生活中卡路里和蛋白质的重要来源,是非洲的主要主食食品,特别是在非洲东部。在苏丹,玉米的低收益主要是由于使用低屈服的陆地。有必要执行繁殖计划,以处理高产,适应性新品种的生产。因此,本研究旨在估计特征之间的遗传变异性,遗传力,基因型性能和相互关系。在2021年和2022年的两个季节中,在农业研究公司(ARC)的WAD MEDANI SUDAN的Kosti White Nile Research Station Farm评估了十种玉米基因型。大多数评估的基因型在11个测得的特征中表现出广泛而显着的变化。在两个季节中,记录了几天的变异和遗传进展的基因型基因型系数,每行耳朵直径(CM),每行谷物数量(T/HA)。记录了高遗传力和遗传进展的谷物产量,耳长,耳朵高度,植物高度,每耳朵的行,耳朵重量,天数至50%的流苏,100粒的重量以及天数至50%丝线。超过了,谷物产量与每耳的行数(r = 0.479),耳朵长度(r = 0.381),100粒重量(r = 0.344)和天数到50%的流苏(r = 0.214)。在整个季节中,最高的五种基因型是TZCOM1/ZDPSYN(4.2 T/HA),EEPVAH-3(4.2 T/HA),F2TWLY131228(4.1 T/HA)(4.1 T/HA),PVA SYN6F2(3.9 T/HA)和MAIMIE SIMIED MAIMIES SURGITION和EEPVAH-9(3.8 T/HA),以使其稳定稳定。释放的声音建议。
饲料效率不是牛肉行业的新话题。从历史上看,该主题每10至15年都被该行业重新审视,对生产者的好处几乎没有好处。缺乏理解饲料效率遗传学的进展源于试图准确测量个体摄入量的困难,再加上极端成本和长期的间隔。饲料效率很难定义,需要在生产的女性以及生长/整理动物中进行评估。饲料效率的遗传力估计为中等,值在.28 -.44不等。 这些值表明肉牛种群之间和内部的差异确实存在以提高饲料效率。 这意味着遗传选择将作为提高饲料效率的工具。 了解饲料效率的遗传学和开发提高效率的工具的主要好处是生产成本降低。 ,牛肉生产总成本的70-80%是饲料成本,饲料效率的丝毫提高将对多个牛肉生产领域的盈利能力产生重大影响。 技术已经发展到我们可以更好地衡量,记录,分析和实施能源效率的选择。饲料效率的遗传力估计为中等,值在.28 -.44不等。这些值表明肉牛种群之间和内部的差异确实存在以提高饲料效率。这意味着遗传选择将作为提高饲料效率的工具。了解饲料效率的遗传学和开发提高效率的工具的主要好处是生产成本降低。,牛肉生产总成本的70-80%是饲料成本,饲料效率的丝毫提高将对多个牛肉生产领域的盈利能力产生重大影响。技术已经发展到我们可以更好地衡量,记录,分析和实施能源效率的选择。
4方法20 4.1研究队列。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20 4.2基因分型和插补。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。21 4.3 DNA甲基化分析和数据处理。。。。。。。。。。。。。。。21 4.4 DNA甲基化数据调整。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22 4.5遗传力估计。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22 4.6全基因组甲基化的关联。。。。。。。。。。。。。。。。23 4.7特定于细胞类型的MEQTL。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。24 4.8连锁不平衡(LD)基于MEQTL的结块。。。。。。。。。。24 4.9 MEDIP-SEQ数据。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。24 4.10功能注释。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。25 4.11富集分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26 4.12基于基因表达数据的基于摘要的孟德尔随机化。。。27 4.13带有GWAS数据的基于摘要的Mendelian随机化。。。。。。。。28
精神分裂症(SCZ)遗传风险对脑中基因表达的影响仍然存在。这一问题的一种流行方法是基因共表达网络算法(例如WGCNA)的应用。要通过这种方法提高可靠性,至关重要的是要消除不良方差的来源,同时也保留了感兴趣的生物学信号。在这项WCGNA研究的RNA-seq数据研究中,我们的后额叶前皮层(78个神经型供体,欧洲血统)测试了SCZ遗传风险对共表达网络的影响。具体而言,我们实施了一种新颖的设计,在该设计中,通过线性回归模型调整了基因表达,以保存或消除通过生物学兴趣信号解释的方差(SCZ风险的GWAS基因组评分) - (GS-SCZ),(GS-SCZ),基因组分数,高度(GS-HT)作为负面对照的高度(GS-HT),同时删除了covariat diment covariat dixpect files coeriat covariat from covariat。我们通过调整后的表达(GS-SCZ和GS-HT保留或删除)计算了共表达网络,以及它们之间的共识(代表“背景”网络无基因组得分效应的“背景”网络)。然后,我们测试了GS-SCZ保留的模块和背景网络之间的重叠,该模块的重叠减少的模块将受到GS-SCZ生物学的影响最大。此外,我们还测试了这些模块的SCZ风险收敛性(即,PGC3 SCZ GWAS优先基因的富集,SCZ风险遗传力的富集和相关的生物本体论。总的来说,我们的结果表明我们的结果突出了GS-SCZ对大脑共同辅助网络的影响的关键方面,特别是:1)保存/删除SCZ遗传风险改变了共同表达模块; 2)富含GS-SCZ影响的模块中的生物学途径暗示转录,翻译和代谢过程,这些过程会融合到影响突触传播的影响; 3)优先级PGC3 SCZ GWAS基因和SCZ风险遗传力富含与GS-SCZ效应相关的模块。
1。Papapanou PN,Wennstrom JL,Grondhal K.与年龄和牙齿类型有关的牙周状态。一项横断面射线照相研究。J Clin Accentoltol。1988; 15:469-478。 2。 Petersen PE,Bourgeois D,Ogawa H,Estupinan-Day S,NdiayeC。口腔疾病的全球负担和口腔健康风险。 公牛谁。 2005; 83:661-669。 3。 Jenkins WMM,Kinane DF。 牙周炎中的“高风险”组。 br dent j。 1989; 167:168–171。 4。DeCoo A,Cruz R,Quintela I等。 2013范围内的III/IV期C级牙周炎(前侵略性牙周炎)的协会研究西班牙人口。 J Clin Accentoltol。 2021; 48:896-906。 5。 Div> Divaris K,Monda KL,North Ke等。 探索慢性牙周炎的遗传基础:全基因组关联研究。 hum mol Genet。 2013; 22:2312-2324。 6。 Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。 牙周炎的遗传力是什么? 系统评价。 j dent res。 2019; 98:632-641。 7。 Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。 芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。 BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究1988; 15:469-478。2。Petersen PE,Bourgeois D,Ogawa H,Estupinan-Day S,NdiayeC。口腔疾病的全球负担和口腔健康风险。公牛谁。2005; 83:661-669。 3。 Jenkins WMM,Kinane DF。 牙周炎中的“高风险”组。 br dent j。 1989; 167:168–171。 4。DeCoo A,Cruz R,Quintela I等。 2013范围内的III/IV期C级牙周炎(前侵略性牙周炎)的协会研究西班牙人口。 J Clin Accentoltol。 2021; 48:896-906。 5。 Div> Divaris K,Monda KL,North Ke等。 探索慢性牙周炎的遗传基础:全基因组关联研究。 hum mol Genet。 2013; 22:2312-2324。 6。 Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。 牙周炎的遗传力是什么? 系统评价。 j dent res。 2019; 98:632-641。 7。 Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。 芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。 BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究2005; 83:661-669。3。Jenkins WMM,Kinane DF。牙周炎中的“高风险”组。br dent j。1989; 167:168–171。 4。DeCoo A,Cruz R,Quintela I等。 2013范围内的III/IV期C级牙周炎(前侵略性牙周炎)的协会研究西班牙人口。 J Clin Accentoltol。 2021; 48:896-906。 5。 Div> Divaris K,Monda KL,North Ke等。 探索慢性牙周炎的遗传基础:全基因组关联研究。 hum mol Genet。 2013; 22:2312-2324。 6。 Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。 牙周炎的遗传力是什么? 系统评价。 j dent res。 2019; 98:632-641。 7。 Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。 芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。 BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究1989; 167:168–171。4。DeCoo A,Cruz R,Quintela I等。2013范围内的III/IV期C级牙周炎(前侵略性牙周炎)的协会研究西班牙人口。 J Clin Accentoltol。 2021; 48:896-906。 5。 Div> Divaris K,Monda KL,North Ke等。 探索慢性牙周炎的遗传基础:全基因组关联研究。 hum mol Genet。 2013; 22:2312-2324。 6。 Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。 牙周炎的遗传力是什么? 系统评价。 j dent res。 2019; 98:632-641。 7。 Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。 芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。 BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究2013范围内的III/IV期C级牙周炎(前侵略性牙周炎)的协会研究西班牙人口。J Clin Accentoltol。2021; 48:896-906。5。Div> Divaris K,Monda KL,North Ke等。探索慢性牙周炎的遗传基础:全基因组关联研究。hum mol Genet。2013; 22:2312-2324。 6。 Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。 牙周炎的遗传力是什么? 系统评价。 j dent res。 2019; 98:632-641。 7。 Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。 芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。 BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究2013; 22:2312-2324。6。Nibali L,Bayliss-Chapman J,Almofareh SA,Zhou Y,Divaris K,Vieira AR。牙周炎的遗传力是什么?系统评价。j dent res。2019; 98:632-641。7。Tegelberg P,Leppilahti JM,YlöstaloA等。芬兰成年人牙周袋的全基因组囊化研究。BMC口腔健康。 2021; 21(1):611。 8。 欢迎信托基金案件控制联盟。 全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和的病例研究BMC口腔健康。2021; 21(1):611。8。欢迎信托基金案件控制联盟。全基因组的AS-AS-AS-AS-ASICIAT研究,对14,000例常见疾病和
引言帕金森氏病(PD)是一种具有复杂病因的多因素疾病。最大的全基因组关联研究(GWAS)包括37,688例病例,18,618例代理案例(未受影响的第一级亲戚)和140万个来自欧洲血统的控制,以及在78个基因组区域中确定的90个独立风险信号;其中38个是新颖的信号1。尽管有这些进展,但PD GWAS目前受到规模的限制,关注欧洲人群以及与临床表型数据的集成有限。基于2019 GWAS数据的功率计算表明,加入额外的〜99,000个案例将使效应大小较小的变体有助于多基因风险(p-值切断:1.35×10 - 3),以达到全基因组范围内的意义。因此,将PD GWA扩展到至少这种大小将导致识别额外的风险基因座并改善PD的遗传预测。可以使用双研究或统计遗传学方法来估计PD的遗传力,并被认为在欧洲人群中占22%至40%。已知的基因组广泛的基因座目前解释了PD 1的遗传力的16%。使用多基因风险评分分析(包括未达到基因组宽重要的基因座)表明,可能有大量的基因座导致尚未定义的PD风险。我们的功率分析表明,将需要99,000个PD病例以80%的功率定义基因座,次要等位基因频率为0.21,并且与当前的最新分析相似。在PD中观察到的表型的变异性可能具有遗传基础2 - 4。对基因型和临床结果之间关联的了解将使临床医生能够为患者提供更准确的预后。了解负责特定PD特征的基因到表型路径将提供一个机会,以开发针对表型的治疗
对方差的分析显示,除了二级分支的数量,中间叶片的叶柄长度,平均胶囊宽度和平均胶囊厚度外,所研究的22个字符的种质之间存在显着差异。这表明大多数研究字符的种质中存在许多遗传变异。高遗传力与植物高度,初级分支,上叶的长度,开花的天数,天数到50%开花的天数,豆荚轴承区,每株植物的种子产量和细菌斑点反应记录了高遗传进展,表明这些特征是由添加基因效应控制的,从而有效地选择了这些字符的特征,可以进一步繁殖。这项研究中获得的结果将通过繁殖和保存芝麻遗传资源来促进气候友好的芝麻品种的改善。
引言糖尿病患病率的上升以及发病率和死亡率的增加归因于并发症和肾脏疾病的发展仍然是全球终末期肾脏疾病(ESRD)的导致原因(1)。尽管对血糖的严格控制可以降低糖尿病性肾病(DN)(2)的风险,但尽管血糖控制充足,但许多人仍会发展为DN,而其他人则仍然无并发症,尽管血糖控制差(3)。更重要的是,很少有家庭研究表明,遗传因素在疾病进展中的作用(4),肾病患者的糖尿病患者的发生率是肾病患者的3倍以上,而不是没有肾脏疾病(5,6)。DN的遗传力仍然无法解释(7)。尽管使用国际疾病的全基因组关联研究(GWAS)进行了高通量映射的进步,包括芬兰的糖尿病性肾病(Finndi-Ane)研究,但仅确定了少数基因并说明
摘要藜麦(Chenopodium Quinoa willd。)是一种伪谷物,因为其营养状况,用作超级食品。这项研究的重点是36种藜麦基因型的形态和分子表征,旨在评估其遗传多样性和繁殖潜力。选择了十个定性特征进行形态学分析,揭示了诸如Spikelet颜色,叶长度和植物高度等性状的显着变化。方差分析表明,大多数定量性状,包括花至50%开花和种子产量,在基因型之间显示出显着差异,表明遗传变异性很大。高遗传力和遗传进步,这表明遗传改善的强大潜力。基因型性能突出了基因型ACQS1,EC 896115,IGKVC-12,ACQS8,EC 896208和EC 896219中的出色特征,用于叶片长度,节间的数量,叶片的数量,叶片宽度,叶片宽度,叶柄长度,叶柄长度,植物长度,植物高度,植物高度,繁殖时间和花序数量。基因型EC 896065,EC 896213,EC 896201,SHQ4,SHQ5,ACQS1,ACQS1,ACQS2,ACQS3和EC 896218表现出更高的种子重量,而EC 896109,ACQS3,ACQS1,ACQS1和EC 896219显示出更高的收益率。High genotypic and phenotypic coefficient of variation (GCV and PCV) were recorded for leaf length (31.22, 34.71), leaf width (43.64, 44.91), number of internodes (40.47, 40.59), petiole length (35.46, 36.04), plant height (33.35, 54.47), length of inflorescence (36.41, 36.99)和种子产量(33.58,34.53)。关键字:聚类分析,遗传进步,遗传力,ISSR,藜麦,变体。的遗传力对于节间的数量最高(99.38%),并且在诸如叶片长度(57.86%)和种子产量(67.28%)等性状中观察到了显着的遗传进步。种子重量显示出最高的正直接效应(0.701),其次是每植物的花序数量(0.700),而天数为50%开花(-0.768)显示出最高的负面直接效应。使用16个ISSR标记的分子多样性分析显示,多态性率为56.1%,标志物之间存在显着的等位基因变化。 多态性信息内容(PIC)值在0.274到0.797之间,表明标记信息的水平不同。 聚类分析将基因型分为两个主要簇,证明了研究的基因型之间的遗传多样性。 探索关键特征的遗传基础并进行进一步的分子表征可以为藜麦的遗传结构提供更深入的见解。 此外,结合更先进的基因组工具并扩展基因型池可以促进高产物,弹性藜麦品种的发展。使用16个ISSR标记的分子多样性分析显示,多态性率为56.1%,标志物之间存在显着的等位基因变化。多态性信息内容(PIC)值在0.274到0.797之间,表明标记信息的水平不同。聚类分析将基因型分为两个主要簇,证明了研究的基因型之间的遗传多样性。探索关键特征的遗传基础并进行进一步的分子表征可以为藜麦的遗传结构提供更深入的见解。此外,结合更先进的基因组工具并扩展基因型池可以促进高产物,弹性藜麦品种的发展。
CRISPR/CAS介导的编辑彻底改变了作物工程。由于这项技术的广泛范围和潜力,在过去十年中,已经进行了许多研究,以优化基因组编辑结构。显然,用于驱动GRNA和CAS9表达的启动子的选择对于达到高编辑效率,精度和遗传力至关重要。虽然选择启动子的一些重要考虑因素包括靶标的数量和性质,宿主有机体,转化方式和实验的目标,但使用组织特异性或诱导启动子对Cas9表达的时空调节可以实现更高的遗传能力和较高的靶向诱变型具有降低靶向诱变的效果。在这篇综述中,我们讨论了特定的研究,这些研究强调了与基因组编辑的启动子选择相关的前景和权衡,并强调需要进行归纳探索和发现,以进一步推进作物植物研究领域的这一领域。