引言系统性血管性高血压是全球范围内心血管疾病最大的可改变危险因素 (1)。尽管人们在抗高血压药物研发方面投入了大量资金,但大约 50% 的高血压患者未能达到目标血压 (2),这表明迫切需要发现新的治疗靶点。血压具有显著的遗传成分,占其变异的 30%–50% (3)。识别影响血压的遗传变异对于发现新的有效治疗靶点具有巨大潜力 (4)。对血压特征——收缩压 (SBP)、舒张压 (DBP) 和脉压 (PP)——的全基因组发现分析已经识别出数百个与血压特征相关的基因座 (5),但致病基因仍然很大程度上未知。在西欧(6)、芬兰(7)以及东亚和南亚血统(8)的个体中,全基因组关联研究(GWAS)表明,Chr5q23.2 上 PRDM6 基因座的几种遗传变异与 BP 特征有关。
摘要化疗引起的心血管毒性 (CICT) 是癌症幸存者的已知风险,可导致心力衰竭、心律失常、血管功能障碍和动脉粥样硬化等疾病。随着我们对每种化疗药物的确切心血管风险的了解不断提高,很明显基因组学是预测哪些患者将经历心血管毒性的最有影响力的因素之一。最近,以 GWAS 为主导的自上而下的方法已经确定了与 CICT 具有统计相关性的新型遗传变异及其相关基因。重要的是,人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 模型的出现提供了一个系统,可以通过实验在体外测试这些基因组发现的影响,查询潜在机制,并制定新策略来减轻这些机制造成的心血管毒性。在这里,我们回顾了化疗药物的心血管毒性,讨论了如何在体外模拟这些毒性,并提出了如何使用这些模型来验证导致患者易受这些影响的遗传变异。
两种增加乳腺癌风险的遗传变异基因分别是 BRCA1 和 BRCA2。如果癌细胞受到损伤,携带有缺陷的 BRCA 基因的癌细胞自我修复能力较差。PARP 抑制剂还可以帮助阻止癌细胞自我修复,并使它们受到的损伤太大而无法存活。
抽象背景药物遗传学有望更好地控制心脏血管疾病(CVD)等疾病。乙酰基酸酸,阿司匹林可防止形成血小板聚集和血管收缩的激活剂,并用于预防CVD。尽管如此,由于遗传变异的改变了导致阿司匹林耐药性(AR)的代谢,因此患者可能会导致治疗失败。目标是实现系统文献综述,以确定遗传变异对AR的影响。的方法文章已系统地筛选在Medline/PubMed,Cochrane,Scopus,Lilacs和Scielo数据库中。总共确定了290篇文章,因此排除了269篇文章,因为它们不符合先前确定的纳入标准。总共包括20个病例对照研究和1个队列。结果遗传变体RS1126643(ITGA2),RS3842787(PTGS1),RS20417(PTGS2)和RS5918(ITGB3)是研究最多的。关于相关性,在通过文章评估的64种遗传变异中,至少一篇文章具有统计学意义(p <0.05; 95%的置信间隔[CI])。Among them, the following have had unanimous results: rs1371097 ( P2RY1 ), rs1045642 ( MDR1 ), rs1051931 and rs7756935 ( PLA2G7 ), rs2071746 ( HO1 ), rs1131882 and rs4523 ( TBXA2R ), rs434473 ( ALOX12),RS9315042(ALOX5AP)和RS662(PON1),而这些在AR:RS5918(ITGB3),RS2243093(GP1BA)(GP1BA)的实际干扰方面有所不同,RS1330344(PTGS1)(PTGS1),以及RS20417(PTGS1)(PTGS2)。作为研究局限性,我们强调了分析的文章和人口差异的非均匀方法。结论值得注意的是,药物遗传学是一个扩展的区域。因此,需要进一步的研究以更好地了解遗传变异与AR之间的关联。
在样品收据上,分析了您的狗的DNA,以确定其祖先中存在的品种和/或存在与某些疾病和特征相关的遗传变异,并具有合理的确定性。我们的程序旨在提供可靠,准确的结果。在服用拭子样本或可能造成的任何伤害或损失的同时,任何错误都没有接受任何责任。
自闭症谱系障碍(ASD)是一种常见的神经发育障碍,其特征是社会交流和受限,重复行为或利益受损(Masi等,2017; Lord等,2018; Hirota and King,King,2023)。在美国,ASD影响了8岁儿童约2.3%(Hirota and King,2023)。ASD的一个重要方面是其异质临床特征。例如,有些人表现出智力障碍(ID)和有限的语言能力,而另一些人则表现出运动障碍(Hirota and King,2023年)。这种异质性归因于多种遗传变异和环境因素(Baron-Cohen,2017; Bai等,2019)。遗传变异与等位基因效应大小和种群频率不同。此外,遗传变异存在于连续体中,从单核苷酸变化到染色体水平的基因组变化。小规模的变化包括单核苷酸多态性(SNP)以及短DNA序列的插入或缺失(indels),而典型的大规模变化包括拷贝数变化(CNV)和染色体重排(Sebat等,2007)。通常,稀有变体的效果大小比共同变体具有更大的效果大小(Grove等,2019)。存在许多具有不同效应大小和等位基因频率的变体,以及它们与环境因素的相互作用,产生了ASD的高度复杂的遗传结构(Timpson等,2018)。有针对性的面板测序允许对具有高灵敏度的变体有效检测(Mellone等,2022)。尽管全基因组和全异常下一代测序(NGS)已被用于对这种多基因疾病的全面分析,但这些方法相对昂贵(Mellone等,2022)。迄今为止,几项大型队列研究已经确定了越来越多的ASD相关遗传变异。已使用全基因组测序和传播和从头结合的测试确定了超过一千个ASD相关的稀有变体(Murtaza等,2022)。通过外来分析的日本人口分析,Kimura等人。(2022)识别稀有突触功能相关的变体。但是,这些大型队列研究可能包括具有不同程度的自闭症特征和ID严重程度的个体。此外,遗传变异与单个ASD特征之间的关系,例如语音发展,社会反应能力和智力,在很大程度上尚未得到探索。在这项研究中,我们进行了病例对照NGS分析,并对日本ASD儿童进行心理评估,主要是具有高功能自闭症(HFA)。由于HFA不被认为是独特且绝对的诊断类别,因此我们将其评估为ASD的一种形式,在表型中是高度异质的。患有智能商(IQ)为70或以上的ASD的儿童被定义为具有HFA的儿童(Alvares等,2020)。使用基于短阅读的方法,我们分析了SNP和简短的Indels,无论它们在人口频率上是罕见还是常见。我们旨在通过阐明与ASD相关的变体与个体ASD特征之间的关系来进一步了解ASD。
基于人工智能的方法的最新进展彻底改变了结构生物学领域。与此同时,高通量测序和功能基因组学产生了前所未有的遗传变异。然而,需要有效的工具和资源来链接不同的数据类型——将变异“映射”到蛋白质结构上,更好地了解变异如何导致疾病,从而设计治疗方法。在这里,我们介绍了 Genomics 2 Proteins 门户网站 ( https://g2p.broadinstitute.org/ ):这是一种人类蛋白质组范围的资源,将 20,076,998 个遗传变异映射到 42,413 个蛋白质序列和 77,923 个结构上,具有一套全面的结构和功能特征。此外,Genomics 2 Proteins 门户网站允许用户以交互方式上传蛋白质残基注释(例如,变异和分数)以及数据库之外的蛋白质结构,以建立基因组学与蛋白质之间的联系。该门户网站是一个易于使用的发现工具,可供研究人员和科学家假设自然或合成变异与其分子表型之间的结构-功能关系。
建议将抗抑郁药作为中度至重度抑郁症的第一线治疗。但是,对抗抑郁治疗的反应和缓解率仍然令人失望。迄今为止最大的务实治疗抑郁症的务实临床试验是缓解抑郁症(Star * d)试验的测序治疗替代方法,报告说,只有48.6%的患者对初始抗抑郁药治疗有反应,而36.8%的患者可以缓解缓解。2要客观地评估治疗的效率和预后,并选择适当的治疗,有必要准确评估对特定抗抑郁药反应的抑郁症的特征,并开发有助于预测治疗效率的生物标志物。在遗传变异,基因表达培养,蛋白质组学,代谢组学,神经内科学,电生理学和神经影像学的遗传变异,基因表达培养,蛋白质组学和神经影像学领域已经报道了抑郁症患者治疗反应的几种有希望的生物标志物。3建立治疗反应生物标志物
尽管肾脏移植方面取得了显着进步,但免疫抑制疗法对于防止移植排斥仍然至关重要。他克莫司(TAC)在这方面起关键作用。在1984年发现,TAC抑制了T淋巴细胞的激活,通过破坏与早期T细胞激活有关的关键基因的转录来防止急性排斥。但是,TAC的使用并非没有挑战。该药物表现出严重的副作用,狭窄的治疗指数和不可预测的药代动力学。治疗药物监测(TDM)必须在治疗范围内保持TAC血液浓度。本文献综述深入研究了影响TAC代谢的遗传方面,重点是CYP3A5,CYP3A4和ABCB1基因中的关键多态性。CYP3A5的遗传变异,这是TAC代谢的主要酶,影响酶活性,需要实现个性化给药策略。 CYP3A4多态性,尤其是CYP3A4*22,证明了与TAC清除和剂量要求改变的关联。 ABCB1基因编码了TAC药代动力学的另一位p-糖蛋白,也表现出影响药物吸收和分布的多态性。 ABCB1 3435C> t变体,显示出对他克莫司生物利用度的潜在影响。 了解这些遗传变异有助于开发个性化剂量方案。 研究表明,基于CYP3A5基因型的定制TAC剂量显着提高了达到治疗浓度的患者的比例。 。CYP3A5的遗传变异,这是TAC代谢的主要酶,影响酶活性,需要实现个性化给药策略。CYP3A4多态性,尤其是CYP3A4*22,证明了与TAC清除和剂量要求改变的关联。ABCB1基因编码了TAC药代动力学的另一位p-糖蛋白,也表现出影响药物吸收和分布的多态性。ABCB1 3435C> t变体,显示出对他克莫司生物利用度的潜在影响。了解这些遗传变异有助于开发个性化剂量方案。研究表明,基于CYP3A5基因型的定制TAC剂量显着提高了达到治疗浓度的患者的比例。。此外,将遗传信息(尤其是CYP3A4*22)纳入给药策略增加了TAC治疗的精度,从而降低了不良影响的风险。