XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System遗传变异
据称与反社会行为相关的遗传变异在不同人群中平均分布
摘要：人类行为取决于遗传和环境因素的复杂相互作用。几项研究表明，人类行为与众多遗传变异之间的不同关联。特别是，SLC6A4，MAOA，DRD4和DRD2中的等位基因变体显示出与重度抑郁症，反社会行为，精神分裂症和双相情感障碍的统计关联； BDNF多态性变体与抑郁，双相和精神分裂症疾病有关，并且在单极抑郁症的患者和注意力减轻血症性治疗障碍（ADHD）的患者中发现TPH2变体。独立研究未能确认与犯罪和侵略行为相关的多态性变体。在本研究中，从与以前与犯罪行为相关的人中选择了一系列涉及5-羟色胺能，多巴胺能和神经生物学途径的遗传变异。在全球人群中比较了这些遗传变异的分布。虽然单一多态性变体的数据显示在人群之间的分布差异，但是当对已发表变体的总数进行全面分析时，这些差异并没有显着。迄今为止发表的遗传关联数据缺乏可重复性，统计关联的弱点，表型的异质性以及环境对人类行为的巨大影响不允许我们将这些遗传变异视为无疑与反社会行为相关的这些遗传变异。此外，这些数据证实了对积极和犯罪行为的缺乏种族倾向。
使用机器学习将跨哺乳动物的增强子遗传变异与复杂表型相关联
*通讯作者。ikaplow@cs.cmu.edu（i.m.k.）; apfenning@cmu.edu（a.r.p.）。†这些作者为这项工作做出了同样的贡献。•目前的地址：美国马萨诸塞州剑桥市史丹利精神病学研究中心。§§地址：美国华盛顿州西雅图的艾伦脑科学研究所。¶刊登地址：美国马萨诸塞州剑桥大学的癌症计划。#Present地址：美国爱荷华州爱荷华州法学院，美国爱荷华州，美国。**动物联盟合作者和分支机构在本文的结尾列出。作者贡献：I.M.K.，A.J.L。和D.E.S.以姓氏为单位的顺序被列为联合第一作者，因为它们对手稿也同样贡献。概念化：I.M.K。和A.R.P.数据策划：I.M.K.，C.S.，B.N.P.，A.J.L.，W.K.M.，K.F。和D.P.G.正式分析：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.和B.N.P. 资金收购：A.R.P.，A.J.L.，B.N.P.，E.K.K.，D.P.G。和K.L.-T。调查：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S.，M.E.W.，H.H.S.，B.N.P.，K.P.，A.R.B。和A.R.P. 方法论开发：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S。和A.R.P. 监督：I.M.K.，A.R.P.，A.J.L.，M.E.W.，E.K.K。和K.L.-T。软件实施：D.E.S.，I.M.K.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.，M.E.W.，W.K.M.，X.Z.和K.F. 可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P. 手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S. 手稿评论和编辑：所有作者。正式分析：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.和B.N.P.资金收购：A.R.P.，A.J.L.，B.N.P.，E.K.K.，D.P.G。和K.L.-T。调查：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S.，M.E.W.，H.H.S.，B.N.P.，K.P.，A.R.B。和A.R.P.方法论开发：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S。和A.R.P.监督：I.M.K.，A.R.P.，A.J.L.，M.E.W.，E.K.K。和K.L.-T。软件实施：D.E.S.，I.M.K.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.，M.E.W.，W.K.M.，X.Z.和K.F.可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P. 手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S. 手稿评论和编辑：所有作者。可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P.手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S.手稿评论和编辑：所有作者。
血压遗传变异与外周动脉疾病的终生风险增加
方法和结果：全基因组关联研究摘要统计数据是BP，周围动脉疾病（PAD）和冠状动脉疾病的。通过使用一系列的多效性方法，通过2样本Mendelian随机化估算BP对PAD的因果关系。增加收缩压（SBP），舒张性BP，平均动脉压（MAP）和脉压增加了PAD的风险（SBP优势比[OR]，1.20 [1.16-1.25]，每10 mm Hg每10 mm Hg增加，P = 1×10-24； 1.26 [1.19–1.33]，p = 6×10 -16; 1.31 [1.24-1.39]，p = 9×10 -23）。冠状动脉疾病的SBP，舒张性BP和MAP的影响大于PAD（SBP的比率或[ROR]，1.06 [1.0-1.12]，P = 0.04； OR，1.15 [1.06–1.26]的MAP比率[1.06–1.26]，P = 8.6×10-4; diasolot Bp Bap oh or，1.21 [1.21] = 6.9×10 -4）。共同考虑，脉压和MAP都直接增加了PAD的风险（脉压或1.26 [1.17-1.35]，p = 3×10 -10; MAP OR，1.14 [1.06–1.23]，p = 2×10 -4）。使用遗传仪器估算了降压药的作用。SBP-lowering via β -blocker (OR, 0.74 per 10 mm Hg decrease in SBP [95% CI, 0.65–0.84]; P =5×10 −6 ), loop diuretic (OR, 0.66 [0.48–0.91], P =0.01), and thiazide diuretic (OR, 0.57 [0.41–0.79], P = 6×10 -4）相关变体是对PAD的保护性。
全球资源用于探索和利用高粱作物野生亲戚的遗传变异
The publication and annotation of a reference genome sequence for sorghum, based on the elite grain type BTx623 (Paterson et al., 2009 ), has fast-tracked gene and novel sequence variants discovery and has enabled resequencing studies (Mace et al., 2013 , Zheng et al., 2011 ) to identify millions of sequence variants and signatures of domestica- tion.像所有栽培作物一样，高粱经历了与驯化相关的遗传瓶颈，而重新定制研究确定了对现代，耕种线条多样性的巨大限制。因此，培养的种质系仅采样了一小部分，这些物种的遗传多样性受第一农民选择的基因限制的物种。这些包括在早期农业中有价值的基因，偶然选择的等位基因以及随后出现的新突变。随后的气候和农业系统的变化意味着，第一农民选择的初始基因将不包含我们当前挑战所需的所有变化。考虑到这一点，应强烈考虑探索和利用高粱特别丰富的CWR的变化。
在弗里德里希共济失调中人类frataxin蛋白的遗传变异和结构建模的计算机分析
摘要：弗里德里希（Friedreich）的共济失调（FRDA）是最普遍的遗传性共济失调形式，以渐进的运动性共济失调，振动敏感性的丧失和骨骼畸形为标志，严重影响了日常功能。迄今为止，唯一可用于治疗FRDA的药物是最近获得FDA批准的Omaveloxolone（Skyclarys®）。负责细胞内铁稳态调节的人frataxin（FXN）基因内的错义突变与FRDA发育有关。这些突变会诱导FXN功能障碍，促进线粒体铁的积累并增强氧化应激，最终触发神经元细胞死亡途径。这项研究合并了来自文献和数据库搜索的226个FXN遗传变异，并只有18个先前表征。预测分析表明，FXN突变的有害和不稳定预测的发生率显着，主要影响对蛋白质功能至关重要的保守残基。此外，构建了人类FXN的准确，全面的三维模型，是生成遗传变异I154F和W155R的基础。这些变体的严重临床意义，进行了分子动力学（MD）模拟，在其N末端段中揭示了灵活性和基本动态变化，其中包括FXN42，FXN56和FXN78领域的蛋白质成熟。因此，我们的发现表明在I154F和W155R突变引起的FXN42，FXN56和FXN78域中的潜在相互作用曲线干扰，与现有文献保持一致。
小麦产量及产量相关性状的遗传变异、遗传力和遗传进步分析
《制药创新杂志》 2022；SP-11(5): 1105-1109 ISSN (E): 2277-7695 ISSN (P): 2349-8242 NAAS 评级：5.23 TPI 2022； SP-11(5): 1105-1109 © 2022 TPI www.thepharmajournal.com 收稿日期: 23-02-2022 接受日期: 31-04-2022 Pooja Khinchi 遗传学与植物育种，印度北方邦瓦拉纳西贝拿勒斯印度大学农业科学研究所 HK Jaiswa 遗传学与植物育种，印度北方邦瓦拉纳西贝拿勒斯印度大学农业科学研究所 Aarti Sharma 遗传学与植物育种，印度北方邦瓦拉纳西贝拿勒斯印度大学农业科学研究所 通讯作者 Pooja Khinchi 遗传学与植物育种，印度北方邦瓦拉纳西贝拿勒斯印度大学农业科学研究所
调节阿尔茨海默氏病的遗传变异风险如果蛋白质 - 蛋白质
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以显示预印本（未通过PEER REVIVE的认证）Preprint Preprint the版权所有此版本，该版本于2025年2月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.25322052 doi：medrxiv preprint
作者更正：通过人类功能丧失的遗传变异评估药物靶点
开放存取本文采用知识共享署名4.0国际许可证，允许以任何媒体或格式使用、共享、改编、分发和复制，只要您给予原作者和来源适当的信任，提供知识共享许可证的链接，并表明是否做了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的知识共享许可证中，除非在材料的信用额度中另有说明。如果材料未包含在文章的知识共享许可证中，并且您的预期用途不被法定规定允许或超出了允许的用途，您将需要直接从版权所有者处获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/。
鉴定增加前列腺癌风险和影响恶性疾病发展的种系遗传变异
摘要：前列腺癌 (PrCa) 是一种异质性疾病，在个体患者中表现出多种表型，从惰性到致命形式。目前尚无可靠的生物标记物可用于常规筛查 PrCa 或区分具有临床意义的形式，因此晚期疾病的晚期识别和无症状疾病的过度诊断和过度治疗仍然是医疗保健领域关注的领域。PrCa 具有大量可遗传成分，自人类基因组计划完成以来，技术进步促进了对影响家庭和人群中疾病易感性的遗传因素的更好识别。这些遗传标记有望使我们更好地了解 PrCa 发展背后的生物学机制，促进基于遗传的 PrCa 筛查计划并指导适当的治疗。然而，对于其表现的许多方面仍然缺乏了解；尤其是与侵袭性表型相关的基因、非欧洲人群的风险因素以及能够准确分层高风险和低风险个体的适当方法。本综述讨论了用于阐明负责调节 PrCa 易感性的基因位点、基因和个体因果变异的方法；目前对导致 PrCa 风险的等位基因谱的理解状态；以及这些发现在基因组学和个性化医疗发展时代未来的转化应用前景。
反义长期非编码RNA中的罕见遗传变异有助于强迫症
强迫症（OCD）是一种普遍的神经精神疾病，其遗传基础不完整，阻碍了靶向治疗方法。使用来自我们所有人队列的全基因组测序（2,276例OCD病例，13,517个对照），我们评估了反义长期非编码RNA（LNCRNA）中的稀有变体。OCD病例表现出这些变体的显着富集，尤其是在进化约束的反义转录本中（相对风险= 1.52，p = 0.005）。负担分析鉴定出与OCD：A2ML1-AS1（OR = 4.5，P = 0.001）和NFIB-AS1（OR = 3.6，P = 0.002）的两个LNCRNA。这些LNCRNA中的罕见变体位于影响相邻神经发育基因的调节区域，并与与OCD有关的脑区域中的基因表达相关。鉴于它们在基因调节，组织特异性表达和对细胞状态的反应性中的关键作用，反义LNCRNA代表了有希望的生物标志物和治疗靶标。我们的发现扩大了强迫症的遗传结构，并强调了基于RNA的精度疗法对个性化临床干预的潜力。