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World File Search System遗传变异
共表达分析揭示了由反式作用遗传变异控制的可解释的基因模块
抽象理解导致疾病发作和进展的因果过程对于发展新型疗法至关重要。尽管反式 - 作用表达定量性状基因座（反式-EQTL）可以直接揭示由疾病变体调节的细胞过程，但由于其小效应大小，检测反式eqtls仍然具有挑战性。在这里，我们分析了来自226至710个个体的六种血细胞类型的基因表达和基因型数据。我们使用从基因表达数据中推断出使用五种方法的共表达模块作为反式-EQTL分析中的特征来限制多重测试并提高可解释性。除了复制三个已建立的关联外，我们还发现了SLC39A8附近的一种新颖的反式 - EQTL，它调节了LPS刺激的单核细胞中的金属硫蛋白基因模块。有趣的是，这种效应是由瞬态顺式-EQTL介导的，仅在早期LPS响应中存在，并且在反式效应出现之前就丢失了。我们的分析重点介绍了共表达与功能富集分析的结合如何改善当应用于新兴细胞类型特异性数据集时，可以改善反式-EQTL的识别和优先级。
qSanger：通过桑格测序对细菌培养物中的遗传变异进行量化
所有培养生物体中都会自发出现突变和重组等遗传变异。虽然可以通过选择或反选择来识别非中性突变，但在异质群体中识别中性突变通常需要昂贵且耗时的方法，例如定量或液滴聚合酶链反应和高通量测序。在不断变化的环境条件下，中性突变甚至可能成为主导，从而强制进行暂时选择或反选择。我们提出了一种新方法，我们称之为 qSanger，使用来自混合 Sanger 测序读数的对齐电泳图峰的振幅比来量化 DNA。表达增强型绿色荧光蛋白和 mCherry 荧光标记的质粒用于通过定量聚合酶链反应和荧光定量在体外和共转化大肠杆菌中验证 qSanger。我们表明，qSanger 允许从混合 Sanger 测序读数中量化遗传变异，包括单碱基天然多态性或从头突变，与标准方法相比，大大减少了劳动力和成本。
遗传变异可能使人们在长期杀虫剂暴露后使人患帕金森氏病，研究发现
”该研究支持以下假设：遗传易感性来自与溶酶体功能相关的基因的微小变化。”“每天，这些变体没有太大影响。但在适当的压力下，例如暴露于某些农药，它们可能会失败，并且随着时间的流逝，这可能会导致帕金森氏病的发展。这称为基因环境相互作用。”
热休克蛋白的隐性遗传变异改变了影响秀丽隐杆线虫表皮干细胞发育的突变结果
医学遗传学的一个基本问题是遗传背景如何改变突变的表型结果。我们通过关注线虫表皮中表现出干细胞特性的接缝细胞来解决这个问题。我们证明，与接缝细胞命运维持有关的 GATA 转录因子 egl-18 的假定无效突变在夏威夷的 CB4856 分离株中比在布里斯托尔的实验室参考菌株 N2 中更耐受。我们确定了两个分离株之间表型表现力差异的多个数量性状基因座 (QTL)。这些 QTL 揭示了通过增强 Wnt 信号传导来强化接缝细胞命运的隐秘遗传变异。在一个 QTL 区域内，CB4856 中的热休克蛋白 HSP-110 中的单个氨基酸缺失足以改变 Wnt 信号传导和接缝细胞发育，强调保守的热休克蛋白的自然变异可以塑造表型表现力。
使用基因敲除小鼠和工程软骨来鉴定具有骨关节炎高风险的遗传变异
Tillgren V 、Ho JCS、Önnerfjord P、Kalamajski S。新型富含亮氨酸的小蛋白软骨粘连素样 (CHADL) 在软骨中表达并调节软骨细胞分化。生物化学杂志。2015 年；290(2):918-925。doi: 10.1074/jbc.M114.593541。Styrkarsdottir U 等人。全基因组测序确定了与髋关节骨关节炎高风险相关的 COMP 和 CHADL 中的罕见基因型。自然遗传学。2017 年；49(5):801-805。doi: 10.1038/ng.3816。D'Costa S、Rich MJ、Diekman BO。由纯合敲除细胞周期抑制剂 p21 的原代人类软骨细胞制成的工程软骨。正在出版，《组织工程》。
伊朗人口中线粒体基因组SNP的单倍群结构和遗传变异分析
引言人线粒体DNA（mtDNA）是圆形双链体，由16 569个碱基对（BPS）组成。1 mtDNA变体是在没有进行重组的情况下进行母体传播的，从而使它们在连续的世代上积累。mtDNA的这种特征使其成为研究人群遗传学，系统发育进化，人类迁移以及医学和法医研究的流行工具。许多关于mtDNA分析的研究已经发表。2-11线粒体单倍群包括具有相同累积mtDNA变体的个体，通常在特定地理区域中发现，并且可以通过母体谱系进行追踪。这些单倍体在线粒体系统发育树中构成不同的分支。某些单倍体主要与特定地理区域相关。单倍群L0 – L6通常在撒哈拉以南非洲人中发现，而R5 – R8，M2 – M6和M4 –
种系遗传变异与免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的胰岛素依赖性糖尿病的发展有关
抽象背景大多数收养细胞疗法（ACT）无法控制治疗细胞在将其移植到患者之后的行为。因此，抑制，激活，区分或终止患者后的行为的努力可能是徒劳的，因为所需的药物会不利地影响患者中的其他细胞。方法我们在这里描述了一个两个结构域融合受体，该融合受体由与回收域相关的配体结合域组成，该结构域允许构成内部化和运输融合受体回到细胞表面。由于配体结合结构域被设计为结合通常在人类中不存在的配体，因此与该配体结合的任何药物都会选择性地结合并内吞作用。导致了我们策略的两个实施例，我们将人类叶酸受体α的慢性内吞作用结构融合到结合荧光素或人类FK506结合蛋白的鼠SCFV，从而结合FK506，从而产生由人类大部分组成的融合受体。然后，我们通过将任何所需的药物结合到荧光素或FK506，从而产生靶向配体的药物，从而产生与约10 -9 m的融合受体亲和力的配体毒剂结合物。使用这些工具，我们证明了CAR T细胞活动可以在体外敏感或关闭，并在将其重新输入肿瘤轴承小鼠后严格控制。结论我们建议，可以利用这种“嵌合内吞食受体”，不仅可以操纵汽车T细胞，而且还可以在将其恢复为患者后的其他作用。努力发展为治疗疾病，包括糖尿病，心力衰竭，骨关节炎，癌症和镰状细胞贫血的疾病，我们认为在灌注后操纵ACT活动的能力将很重要。
KDR遗传变异对化学疗法难治性转移CRC患者疗效和安全性的影响
摘要：最近三年在理解偏见因素和升级有关肝细胞癌（HCC）的治疗方法方面取得了显着进展。直到最近，还无法承受与病毒肝炎相关的肝硬化向HCC的进展。对疾病的分子机制，生物标志物的使用以及随访的更深入的了解使我们意识到，常规的化学药品APY未能增加晚期HCC患者的生存率，往往会流放临床实践。多激酶抑制剂（TKI），例如索拉非尼，lenvatinib，主要针对血管内皮生长因子受体1-3 VEGFRS 1-3直到最近提供了这些患者的护理标准，作为一线或二线治疗。自2020年5月以来，Atezolizumab Plus Bevacizumab组合（免疫疗法加抗VEGF）已成为一线HCC治疗的新参考标准。此外，反编程的细胞死亡蛋白1（抗PD-1）免疫疗法可用作一线治疗失败后的第二线治疗。III期临床试验最近提出了新型抗血管生成因子（例如Cabozantinib和Ramucir Umab）作为二线治疗选择的疗效。考虑到引起毒性的考虑，临床试验正在研究上述靶向疗法的组合，并作为一线治疗。本文旨在进行系统的综述，描述过去几十年中HCC不断发展的治疗方案，从新辅助治疗到高级HCC的全身治疗。随着HCC治疗的景观，将新的治疗算法构成HCC的新药物似乎是必须的。关键词：肝细胞癌，免疫疗法，靶向疗法，酪氨酸激酶抑制剂，生物标志物
拟南芥中的文章映射遗传变异，以响应植物促进生长的细菌azoarcus olearius dqs-4t
摘要：促进植物生长细菌（PGPB）可以通过促进养分摄取，氮固定，防止病原体，胁迫耐受性和/或增强植物产生的生产来增强植物健康。驱动植物 - 细菌关联的遗传决定因素仍在研究中。为了鉴定与对PGPB有反应的性状高度相关的遗传基因座，我们使用了用Azoarcus olearius dqs-4 t处理的拟南芥种群进行了全基因组关联研究（GWAS）。表型，通过改善，抑制或不影响根系或射击特征，对细菌治疗的305次拟南芥饰物对细菌治疗的反应不同。GWA映射分析鉴定了几个与初级根长或根新鲜重量相关的预测基因座。进行了两项统计分析，以缩小潜在基因候选物，然后进行单倍型块分析，从而鉴定出与拟南芥根新鲜重量对细菌接种的反应性相关的11个基因座。我们的结果表明，植物对A. olearius dqs-4 T响应接种的能力的差异很大，同时揭示了与所测量的生长性状相关的基因座的相当复杂性。这项研究是可持续繁殖策略的有希望的起点，用于未来的种植实践，可以采用有益的微生物和/或根部微生物组的修改。
基因检测：下一代测序，MPM 29.0
临床实验室诊断测试可以包括预测与一种或多种遗传变异相关的风险的测试。此外，体外伴侣诊断实验室测试提供了遗传变异结果的报告，对于安全有效地使用相应的治疗产品至关重要。下一代测序（NGS）是一种可以测量一种或多种遗传变异作为实验室诊断测试的技术，例如当用作体外诊断测试的伴侣时。癌症患者可以复发，复发，难治性，转移性和/或晚期阶段III或IV阶段。临床研究表明，患者癌症的遗传变异可以与临床因素协同作用，可以预测每个人对特定治疗的反应。