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World File Search System遗传变异
成瘾相关的遗传变异暗示着成瘾神经生物学中的脑细胞类型和特定区域的顺式调节元素
最近的大型基因组关联研究已经确定了与成瘾相关行为性状相关的多个自信风险基因座。与成瘾相关性状相关的大多数遗传变异位于基因组的非编码区域，可能破坏顺式调节元件（CRE）功能。cres倾向于特异性细胞类型，并可能有助于基本成瘾的神经回路的功能发展。然而，缺乏一种系统的系统方法，用于预测风险变异对特定细胞群体的影响。为了剖析与成瘾相关性状的细胞类型和大脑区域，我们应用了分层的连锁不平衡评分回归，以将全基因组关联研究与从人类和小鼠分析中收集的开放染色质收集的基因组区域进行比较，这与CRE活性有关。我们发现，在神经元（Neun 1）核中以开放式染色质（Neun 1）核中标志性的成瘾相关变体的富集，这些核是从多个前额叶皮质区域和已知在奖励和成瘾中起主要作用的主要角色的核心。为了进一步剖析与成瘾相关性状的细胞类型特异性基础，我们还确定了雌性和雄性小鼠神经元亚型的开放染色质区域的人类直系同源物的富集：皮质兴奋性，D1，D2和PV。最后，我们开发了机器学习模型，以预测小鼠细胞类型特异性开放染色质，从而使我们能够进一步对人Neun 1
遗传变异调节炎症体活性
在炎症体启动和激活后，对骨row衍生的巨噬细胞（BMDM）进行了白细胞介素-1 B释放的抽象定量性状基因座映射（BMDM）。最强的相关基因座映射到7号染色体上的Pycard基因，该基因座的染色体基因编码为炎症体适配器蛋白凋亡相关的斑点样蛋白（ASC）（ASC）。DBA/2和AKR Pycard基因在其3'未翻译区域（UTR）中仅在单核苷酸多态性（SNP）上有所不同。DBA/2与AKR BMDM的pycard mRNA表达和ASC蛋白水平升高，并增加了炎性体斑点的形成，这与Pycard mRNA稳定性的增加有关，而转录率没有提高。crispr/cas9基因编辑在DBA/2胚胎干细胞上进行，以将pycard 3'utr SNP从dba/2更改为AKR等位基因。由于pycard mRNA稳定性降低，将细胞分化为巨噬细胞后，这种单碱基的变化显着降低了Pycard表达和炎症体活性。
热休克蛋白的隐性遗传变异改变了影响秀丽隐杆线虫表皮干细胞发育的突变结果
医学遗传学的一个基本问题是遗传背景如何改变突变的表型结果。我们通过关注线虫表皮中表现出干细胞特性的接缝细胞来解决这个问题。我们证明，与接缝细胞命运维持有关的 GATA 转录因子 egl-18 的假定无效突变在夏威夷的 CB4856 分离株中比在布里斯托尔的实验室参考菌株 N2 中更耐受。我们确定了两个分离株之间表型表现力差异的多个数量性状基因座 (QTL)。这些 QTL 揭示了通过增强 Wnt 信号传导来强化接缝细胞命运的隐秘遗传变异。在一个 QTL 区域内，CB4856 中的热休克蛋白 HSP-110 中的单个氨基酸缺失足以改变 Wnt 信号传导和接缝细胞发育，强调保守的热休克蛋白的自然变异可以塑造表型表现力。
血压遗传变异与外周动脉疾病的终生风险增加
方法和结果：全基因组关联研究摘要统计数据是BP，周围动脉疾病（PAD）和冠状动脉疾病的。通过使用一系列的多效性方法，通过2样本Mendelian随机化估算BP对PAD的因果关系。增加收缩压（SBP），舒张性BP，平均动脉压（MAP）和脉压增加了PAD的风险（SBP优势比[OR]，1.20 [1.16-1.25]，每10 mm Hg每10 mm Hg增加，P = 1×10-24； 1.26 [1.19–1.33]，p = 6×10 -16; 1.31 [1.24-1.39]，p = 9×10 -23）。冠状动脉疾病的SBP，舒张性BP和MAP的影响大于PAD（SBP的比率或[ROR]，1.06 [1.0-1.12]，P = 0.04； OR，1.15 [1.06–1.26]的MAP比率[1.06–1.26]，P = 8.6×10-4; diasolot Bp Bap oh or，1.21 [1.21] = 6.9×10 -4）。共同考虑，脉压和MAP都直接增加了PAD的风险（脉压或1.26 [1.17-1.35]，p = 3×10 -10; MAP OR，1.14 [1.06–1.23]，p = 2×10 -4）。使用遗传仪器估算了降压药的作用。SBP-lowering via β -blocker (OR, 0.74 per 10 mm Hg decrease in SBP [95% CI, 0.65–0.84]; P =5×10 −6 ), loop diuretic (OR, 0.66 [0.48–0.91], P =0.01), and thiazide diuretic (OR, 0.57 [0.41–0.79], P = 6×10 -4）相关变体是对PAD的保护性。
KDR遗传变异对化学疗法难治性转移CRC患者疗效和安全性的影响
摘要：最近三年在理解偏见因素和升级有关肝细胞癌（HCC）的治疗方法方面取得了显着进展。直到最近，还无法承受与病毒肝炎相关的肝硬化向HCC的进展。对疾病的分子机制，生物标志物的使用以及随访的更深入的了解使我们意识到，常规的化学药品APY未能增加晚期HCC患者的生存率，往往会流放临床实践。多激酶抑制剂（TKI），例如索拉非尼，lenvatinib，主要针对血管内皮生长因子受体1-3 VEGFRS 1-3直到最近提供了这些患者的护理标准，作为一线或二线治疗。自2020年5月以来，Atezolizumab Plus Bevacizumab组合（免疫疗法加抗VEGF）已成为一线HCC治疗的新参考标准。此外，反编程的细胞死亡蛋白1（抗PD-1）免疫疗法可用作一线治疗失败后的第二线治疗。III期临床试验最近提出了新型抗血管生成因子（例如Cabozantinib和Ramucir Umab）作为二线治疗选择的疗效。考虑到引起毒性的考虑，临床试验正在研究上述靶向疗法的组合，并作为一线治疗。本文旨在进行系统的综述，描述过去几十年中HCC不断发展的治疗方案，从新辅助治疗到高级HCC的全身治疗。随着HCC治疗的景观，将新的治疗算法构成HCC的新药物似乎是必须的。关键词：肝细胞癌，免疫疗法，靶向疗法，酪氨酸激酶抑制剂，生物标志物
使用遗传变异来评估降低胆固醇对头颈癌风险的因果影响：孟德尔随机化研究
1 MRC 综合流行病学部，人口健康科学系，布里斯托尔医学院，布里斯托尔大学，英国布里斯托尔，2 布里斯托尔牙科医院和学院，布里斯托尔大学，英国布里斯托尔，3 布里斯托尔医学院，布里斯托尔大学，英国布里斯托尔，4 布里斯托尔大学医院和韦斯顿 NHS 基金会信托国家健康研究所布里斯托尔生物医学研究中心，布里斯托尔大学，英国布里斯托尔，5 埃克塞特大学医学院，RILD 大楼，RD&E 医院，埃克塞特，英国，6 世界卫生组织遗传流行病学组，国际癌症研究机构，法国里昂，7 意大利罗马天主教圣心大学生命科学与公共卫生系卫生科，8 妇女儿童健康和公共卫生部，公共卫生领域，基金会意大利罗马 A. Gemelli IRCCS 大学综合医院，9 美国北卡罗来纳州教堂山北卡罗来纳大学吉林斯全球公共卫生学院流行病学系，10 美国宾夕法尼亚州匹兹堡匹兹堡大学公共卫生研究生院和 UPMC Hillman 癌症中心人类遗传学系，11 加拿大多伦多西奈医疗系统 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所 Prosserman 人口健康研究中心，12 加拿大多伦多多伦多大学 Dalla Lana 公共卫生学院，13 加拿大多伦多玛格丽特公主癌症中心，14 英国布里斯托尔布里斯托尔大学细胞与分子医学学院，15 巴西圣保罗圣何塞杜里奥普雷图医学院，16 以色列阿尔伯特医院阿尔伯特爱因斯坦研究与教育研究所爱因斯坦，巴西圣保罗，17 荷兰马斯特里赫特大学医学中心 GROW 研究所耳鼻咽喉科和头颈外科系
据称与反社会行为相关的遗传变异在不同人群中平均分布
摘要：人类行为取决于遗传和环境因素的复杂相互作用。几项研究表明，人类行为与众多遗传变异之间的不同关联。特别是，SLC6A4，MAOA，DRD4和DRD2中的等位基因变体显示出与重度抑郁症，反社会行为，精神分裂症和双相情感障碍的统计关联； BDNF多态性变体与抑郁，双相和精神分裂症疾病有关，并且在单极抑郁症的患者和注意力减轻血症性治疗障碍（ADHD）的患者中发现TPH2变体。独立研究未能确认与犯罪和侵略行为相关的多态性变体。在本研究中，从与以前与犯罪行为相关的人中选择了一系列涉及5-羟色胺能，多巴胺能和神经生物学途径的遗传变异。在全球人群中比较了这些遗传变异的分布。虽然单一多态性变体的数据显示在人群之间的分布差异，但是当对已发表变体的总数进行全面分析时，这些差异并没有显着。迄今为止发表的遗传关联数据缺乏可重复性，统计关联的弱点，表型的异质性以及环境对人类行为的巨大影响不允许我们将这些遗传变异视为无疑与反社会行为相关的这些遗传变异。此外，这些数据证实了对积极和犯罪行为的缺乏种族倾向。
鉴定增加前列腺癌风险和影响恶性疾病发展的种系遗传变异
摘要：前列腺癌 (PrCa) 是一种异质性疾病，在个体患者中表现出多种表型，从惰性到致命形式。目前尚无可靠的生物标记物可用于常规筛查 PrCa 或区分具有临床意义的形式，因此晚期疾病的晚期识别和无症状疾病的过度诊断和过度治疗仍然是医疗保健领域关注的领域。PrCa 具有大量可遗传成分，自人类基因组计划完成以来，技术进步促进了对影响家庭和人群中疾病易感性的遗传因素的更好识别。这些遗传标记有望使我们更好地了解 PrCa 发展背后的生物学机制，促进基于遗传的 PrCa 筛查计划并指导适当的治疗。然而，对于其表现的许多方面仍然缺乏了解；尤其是与侵袭性表型相关的基因、非欧洲人群的风险因素以及能够准确分层高风险和低风险个体的适当方法。本综述讨论了用于阐明负责调节 PrCa 易感性的基因位点、基因和个体因果变异的方法；目前对导致 PrCa 风险的等位基因谱的理解状态；以及这些发现在基因组学和个性化医疗发展时代未来的转化应用前景。
灌木（桤木）全新世叶绿体遗传变异
图 5 在七个 Alnus alnobetula 个体的整个叶绿体侏儒排列中检测到的单核苷酸多态性 (SNP)。随后绘制了参考叶绿体基因组和通过杂交捕获和散弹枪测序方法从核心样本中检索到的 sedaDNA，以评估它们与 SNP 位置相对应的变体。SNP 的位置对应于参考叶绿体基因组。如果 SNP 位于基因内，则在第一行中给出相应的基因名称。如果未从核心样本中检索到任何读数，则不会报告任何变体。颜色代码：Taymyr 特定变异 = 黄色；Omoloy 特定变异 = 橙色；Kolyma 特定变异 = 绿色；Taymyr 地理歧视的潜在标记 = 以红色突出显示的位置；Kolyma 地理歧视的潜在标记 = 以蓝色突出显示的位置；Omoloy 地理歧视的潜在标记 = 以浅绿色突出显示的位置
作者更正：通过人类功能丧失的遗传变异评估药物靶点
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