1 贵州省遵义医科大学附属医院心血管内科,2 四川大学华西医院血液科,四川省成都/四川大学华西护理学院,四川省成都。3 贵州省遵义医科大学护理学院。
1 四川农业大学园艺学院,成都 611130;2021305054@stu.sicau.edu.cn(WH);zhengaihong@stu.sicau.edu.cn(AZ);hh820423@163.com(HH);2021205028@stu.sicau.edu.cn(XL);2022205029@stu.sicau.edu.cn(QL);201906195@stu.sicau.edu.cn(LL);2022205026@stu.sicau.edu.cn(RL);huangzhi@sicau.edu.cn(ZH);13185@sicau.edu.cn(YQ);13920@sicau.edu.cn(YT);10650@sicau.edu.cn(HL); zhangf@sicau.edu.cn (FZ) 2 遵义师范学院生物与农业技术学院,遵义 563006,浙江;czf810@163.com 3 毕节市农业科学研究所,毕节 551700,浙江;majie_011@126.com 4 浙江大学园艺系,杭州 310058,浙江 * 通讯地址:qmwang@zju.edu.cn (QW); bsun@sicau.edu.cn (BS); 电话:+86-571-88982278 (QW); +86-28-86291848 (BS) † 这些作者对本文贡献相同。
1. 哈尔滨医科大学附属第二医院肝胆胰外科,黑龙江哈尔滨 150086。2. 空军军医大学唐都医院普外科,陕西西安 710032。3. 遵义医科大学基础药理教育部重点实验室,贵州遵义 563006。4. 厦门医学院福建省高校功能与临床转化医学重点实验室,福建厦门 361000。5. 北京大学深圳研究生院化学基因组学国家重点实验室,化学肿瘤基因组学重点实验室,广州深圳 518055。6. 盐城师范学院江苏省肿瘤靶向纳米诊断治疗材料工程研究中心,江苏盐城 224007。 7. 浙江省生物标志物与体外诊断转化重点实验室,浙江杭州 310000。8. 福建医科大学基础医学院,福建省消化道肿瘤教育部重点实验室,福建福州 350122。9. 哈尔滨医科大学卫生管理学院,黑龙江哈尔滨 150086。
4 5 1 遵义医科大学附属口腔医院口腔颌面外科,贵州省遵义市。7 2 遵义医科大学口腔医学院、口腔医院,贵州省遵义市。8 3 遵义医药高等专科学校信息技术网络管理中心,贵州省遵义市。10 11 # 这些作者对本文贡献相同。12 ‡ 这些作者对本文贡献相同。13 * 通讯作者:宋庆高 (814641639@qq.com)14 15 摘要16 目前,慢性牙周炎 (CP) 的治疗仍面临挑战。本研究旨在利用孟德尔随机化(MR)方法在可用药物基因组中鉴定出治疗慢性牙周炎的新药物靶点。在本研究中,基于 4479 个药物基因靶点列表,在血液表达数量性状位点(eQTL)中选择了重叠基因,然后对其进行双样本 MR(TSMR),并使用来自 CP 的全基因组关联研究(GWAS)数据验证了融合转录组关联研究(TWAS),以确认与 CP 遗传相关的药物基因,并使用基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)分析和共定位测试多重效应。最后,对确定的药物靶点进行表型组关联研究(PheWAS)。我们应用SMR、TSMR、Fusion TWAS和一系列共定位方式来评估可用药靶点与CP之间的遗传关联。综上所述,金属蛋白酶25(MMP25)被认为是最有前途的药物靶点,此外,我们对TNFRSF18、CDC25B、STK10和ACVR2B也抱有一定信心。最后,PheWAS-MR结果显示,应用MMP25抑制剂的可能副作用包括外耳炎以及一些代谢紊乱等。综上所述,我们利用TSMR、Fusion TWAS、SMR和共定位等一系列方法确定了五个潜在的CP药物靶点,其中MMP25通过了所有测试。这一发现为未来CP药物开发提供了学术基础,并在一定程度上缩短了药物开发时间和经济成本。关键词:慢性牙周炎,全基因组孟德尔随机化,靶基因。