特发性炎症性肌病 (IIM) 或肌炎是一组异质性自身免疫性疾病,可影响多个器官,包括肌肉、皮肤、关节、肺、心脏和胃肠道。虽然有报道称 SARS-CoV-2 感染后会出现新发肌炎,但与 COVID-19 疫苗接种相关的病例仍然很少。我们描述了一名 22 岁男性的独特病例,该患者在接种 SARS-CoV-2 和流感疫苗一至两周后发病,该患者出现类似于血管性水肿的严重进行性水肿性面部肌炎。这最终导致诊断为全身性炎症性肌炎,广泛累及手臂和腿部的近端肌肉。我们概述了临床病程、诊断调查和治疗方法,并讨论了 SARS-CoV-2 感染或基于 mRNA 的疫苗接种引起的炎症性肌炎的潜在分子机制和现有文献。
在这项研究中,我们引入了StructMRNA,这是一种新的基于BERT的模型,该模型旨在详细分析mRNA序列和结构。DNABERT在理解具有双向编码器表示的非编码DNA的复杂语言方面的成功扩展到具有structMRNA的mRNA。这个新模型使用了一种特殊的双级掩蔽技术,该技术涵盖了序列和结构以及条件掩蔽。这使结构mRNA能够通过利用在广泛的数据集进行广泛的预培训期间学到的复杂序列结构相关性来熟练地生成有意义的mRNA序列嵌入mRNA序列。与诸如斯坦福大学OpenVaccine项目中的著名模型相比,结构mRNA在重要的任务中表现更好,例如预测RNA降解。因此,结构mRNA可以通过预测看不见的mRNA序列的二级结构和生物学功能来告知更好的基于RNA的治疗方法。通过严格的评估,进一步证实了该模型的熟练程度,揭示了其前所未有的跨各种生物体和条件的能力,从而在治疗设计的mRNA的预测分析中标志着显着进步。通过这项工作,我们旨在为mRNA分析设定新的标准,从而有助于更广泛的基因组学和治疗性发展领域。
图 2:a) DNA 和 RNA- GGGG 序列的水合壳中水分子的跳跃时间 τ jump 分布,分解为分配给疏水位点(“hpb”,蓝色)、H 键供体位点(橙色)和 H 键受体位点(绿色)的水分子的贡献。b) DNA 和 RNA- GGGG 序列的水合壳中与受体位点 H 键合的水分子的跳跃时间 τ jump 分布,分解为水合糖(粉色)、磷酸盐(蓝色)或碱基(红色)部分的水分子的贡献。使用 Matplotlib 绘制图表。51