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World File Search System金霉素
重新提出将 Eravacycline 作为 MMP 抑制剂的计算机模拟研究
考虑到基质金属蛋白酶 (MMP) 在包括癌症在内的各种病理状况中的作用，它们被视为当今药物发现的良好靶点。四环素类抗生素已被重新用于其抗癌活性。在这里，我们通过计算机模拟方法分析了一些四环素化合物，例如去甲金霉素、埃拉环素、莱姆环素和奥马环素与两组 MMP（即胶原酶和明胶酶）的结合亲和力，对其进行了研究。埃拉环素与不同 MMP 相互作用的 ΔG 值范围从 MMP1 的 -8.6 Kcal/mol 到 MMP9 的 -9.7 Kcal/mol，表明结合亲和力强。进一步的分子动力学模拟研究表明，MMP9-埃拉环素相互作用在虚拟生理条件下高度稳定且持久。在所分析的四种四环素中，埃拉环素对所有胶原酶和明胶酶表现出强大的广谱抑制潜力。因此，建议对该抗生素进行进一步的体外和临床前验证研究，以促进其在临床上的重新利用。
一种针对神经元精确基因组编辑的优化CRISPR/CAS9方法
摘要在非分裂细胞（如神经元）中，大型DNA片段对标记内源性蛋白的有效敲入仍然尤其具有挑战性。，我们以T WO（TKIT）指南为基于CRISPR/CAS9的新方法开发了T ARGE，以高效且精确的基因组敲入。通过靶向非编码区域TKIT对indel突变具有抗性。我们证明了具有各种标签的内源性突触蛋白的TKIT标记，在小鼠原发性培养的神经元中的效率高达42％。在小鼠中利用子宫电穿孔或病毒注射，可以将AMPAR亚基标记为超超金霉素，从而可以使用两光子显微镜在体内可视化内源性AMPARS。我们进一步使用TKIT来评估内源性AMPAR的迁移率，并在光漂白后荧光回收率。最后，我们表明TKIT可用于标记大鼠神经元中的AMPAR，在另一种模型生物体中证明了精确的基因组编辑，并突出了TKIT作为可视化内源性蛋白质的方法的广泛潜力。
不确定性和空间变异性的量化... - DTU Orbit
3 IRSA，意大利罗马 4 国家研究委员会，意大利罗马 在畜牧业中使用抗生素作为生长促进剂导致了令人担忧的抗生素耐药性的产生。为了评估抗生素暴露对土壤微生物种群的长期影响，1999 年在加拿大安大略省伦敦建立了一系列田间地块，从那时起每年施用磺胺二甲嘧啶、泰乐菌素和金霉素混合物，浓度分别为 0、0.1、1.0 和 10 mg/kg 土壤），相当于每年施用用药猪粪的浓度。在十年年度施用之后，对这些药物的生物降解潜力和持久性进行了评估。与未经处理的对照土壤相比，在有药物暴露史的土壤中，磺胺二甲嘧啶和泰乐菌素的残留物（而非金霉素）的去除速度要快得多。在经过历史处理的土壤中，14 C-磺胺二甲嘧啶的残留物迅速彻底地矿化为 14 CO 2，但在未处理的土壤中则完全没有。从经过历史处理的土壤中获得了能够降解磺胺二甲嘧啶的细菌的富集培养物，但未处理的土壤中没有。通过显微镜评估了活菌的丰度及其在主要细菌系统发育群中的相对分布。使用 DAPI 和 Molecular Probes Live/Dead 染色剂，处理对活菌的丰度没有影响。
不确定性和空间变异性的量化... - CORE
3 IRSA，意大利罗马 4 国家研究委员会，意大利罗马 在畜牧业中使用抗生素作为生长促进剂导致了越来越令人担忧的抗生素耐药性的发展。为了评估抗生素暴露对土壤微生物种群的长期影响，1999 年在加拿大安大略省伦敦建立了一系列田间试验地，此后每年施用磺胺二甲嘧啶、泰乐菌素和金霉素混合物，浓度（0、0.1、1.0 和 10 mg/kg 土壤）相当于每年施用药物猪粪所产生的浓度。经过十年的年度应用，对这些药物的生物降解潜力和持久性进行了评估。在有药物暴露史的土壤中，磺胺二甲嘧啶和泰乐菌素的残留物（而非金霉素）的去除速度比在未经处理的对照土壤中快得多。在经过历史处理的土壤中，14 C-磺胺二甲嘧啶的残留物迅速彻底地矿化为 14 CO 2，但在未经处理的土壤中则完全没有。从经过历史处理的土壤中获得了能够降解磺胺二甲嘧啶的细菌的富集培养物，但未处理的土壤中没有。在显微镜下评估了活菌的丰度及其在主要细菌系统发育群中的相对分布。使用 DAPI 和 Molecular Probes Live/Dead 染色剂，处理对活菌的丰度没有影响。就 Alpha- 变形菌、Beta- 变形菌、Gamma- 变形菌、低 GC 和高 GC 革兰氏阳性菌的相对丰度而言，不同处理之间没有差异。处理过程中浮霉菌和噬细胞菌-黄杆菌群的丰度存在差异，但这些差异并不表明存在一致的剂量反应。长期处理改变了功能性微生物种群，这是使用污染诱导群落耐受性 (PICT) 测试检测到的，该测试使用单独存在的每种抗生素或混合物进行评估。总体而言，这些结果表明土壤细菌在功能上适应长期接触某些兽用抗生素，特别是导致药物持久性急剧降低。暴露于农业、废水或制药生产废水的基质中抗生素的加速生物降解会减弱抗生素的环境暴露，并且值得在评估环境中抗生素耐药性发展的潜在风险的背景下进行研究。