XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System鉴定
“结核分枝杆菌鉴定 - DNA（实时PCR）”“ MAC识别
关于列出的项目，我们公司使用的检查设备“ COBAS5800系统”出现故障，我们目前正在恢复产品。由于这种效果，在下面列出的适用日期之后提出请求时，测试结果的报告将延迟。
BigPICC：一种基于图的方法，用于鉴定突变数据中的致癌基因组合
来自癌症患者的基因组数据代表了患者基因突变的存在与癌症发生之间的关系。人类中不同类型的癌症被认为是由两个至九个基因突变的组合引起的。通过传统的详尽搜索来识别这些组合，需要与组合大小成倍扩展的计算量，即使对于尖端超级计算机也是棘手的。我们提出了一种无参数的启发式方法，该方法利用基因患者突变的内在拓扑来鉴定致癌组合。通过使用它们来预测以前看不见的样品中肿瘤的存在来测量鉴定组合的生物学相关性。所得的16种癌症类型的分类器在详尽的搜索结果中表现出色，平均敏感性为80.1％的敏感性和91.6％的特异性，每种癌症类型的命中率最佳选择。我们的方法能够找到较高的致癌组合靶向，这将需要多年的计算进行详尽的搜索。
生物信息学方法，用于鉴定肾脏透明细胞癌的新型肿瘤抑制基因和癌症途径
背景：透明细胞肾细胞癌（CCRCC，KIRC）是RCC的最普遍的亚型，即使使用不同的可用疗法，平均无进展的无进展生存率也会更糟。因此，鉴定新分子靶标可能有助于其治疗目的。材料和方法：我们使用癌症基因组图集对KIRC中可能抑制肿瘤作用的基因进行生物信息学分析。目的：本研究旨在确定这种类型的癌症的新预后生物标志物和潜在的治疗靶标。结果：我们确定了以前尚未研究或研究不足的KIRC中的14个下调基因，其中大多数受启动子甲基化的影响。八个基因显示出较短的总生存期和较差的预后，表明它们作为肿瘤抑制子的功能，六个基因显示出良好的预后。来自8个基因C7orf41和CTXN3的在大多数癌症中仅显示下调，提出它们是高潜在的肿瘤抑制剂。 在这8个基因中，CTXN3在癌症中的功能尚不清楚。 此外，我们将CWH43基因确定为KIRC的主要特征。 此外，我们发现不同的基因是KIRC肿瘤阶段和成绩的特征。 结论：我们的结果可能会阐明鉴定KIRC发病机理并为肾脏癌（主要是KIRC）开发有效的治疗靶标。在大多数癌症中仅显示下调，提出它们是高潜在的肿瘤抑制剂。在这8个基因中，CTXN3在癌症中的功能尚不清楚。此外，我们将CWH43基因确定为KIRC的主要特征。此外，我们发现不同的基因是KIRC肿瘤阶段和成绩的特征。结论：我们的结果可能会阐明鉴定KIRC发病机理并为肾脏癌（主要是KIRC）开发有效的治疗靶标。
猫栉首蚤的分子鉴定...
文章历史：24-704 收到日期：2024 年 11 月 10 日 修订日期：2024 年 12 月 20 日 接受日期：2024 年 12 月 24 日 在线优先：2025 年 1 月 7 日 摘要 本研究旨在从分子水平上鉴别栉首蚤种类并从寄生在越南狗和猫身上的跳蚤中检测犬复孔绦虫。研究样本包括从狗和猫身上采集的 20 个混合跳蚤样本。方法上，从跳蚤中提取的 DNA 用于 PCR 扩增跳蚤 18S rDNA 基因的 1200bp 区域和犬复孔绦虫 28S rDNA 基因的 653bp 片段。随后，选择两个跳蚤阳性 PCR 产物和两个犬复孔绦虫阳性 PCR 产物（分别来自狗和猫）进行系统发育树分析。结果表明，在第一次 PCR 中所有 20 个样本均为阳性，显示 1200bp 的条带，与跳蚤 18S rDNA 基因的估计大小相对应。此外，在第二次 PCR 中，20 个样本中有 4 个显示约 653bp 的条带，与 D. caninum 28S rDNA 基因的预期大小一致。系统发育分析进一步表明分离的跳蚤为猫栉首蚤。本研究中两种 D. caninum 分离株之间的百分比同一性为 94.1%，表明这两种分离株属于两种不同的基因型（猫栉首蚤和犬栉首蚤基因型）。本研究是越南首次报告从狗和猫跳蚤中检测出 D. caninum 绦虫。此外，本研究还提醒狗和猫的主人，从他们的伴侣动物身上消灭跳蚤以防止感染复孔绦虫非常重要。关键词: Ctenocephalides sp., Dipylidium caninum, 狗, 猫, 越南
在矿物材料上生长的嗜极古菌中代谢物提取和呼吸醌鉴定的改进方案
我们研究了在黄铁矿 (FeS 2 ) 上生长的铁和硫氧化、极嗜热酸的古菌 Metallosphaera sedula 的代谢组。由于细胞与矿物材料之间紧密接触和相互作用，从这些微生物中提取有机物是一项重大挑战。因此，我们应用了一种改进的方案来破坏微生物细胞并将其有机成分与矿物表面分离，通过液液萃取提取亲脂性化合物，并使用 MALDI-TOF MS 和 UHPLC-UHR-Q/TOF 进行代谢组学分析。通过这种方法，我们确定了几种参与中心碳代谢和古菌中发现的改良 Entner-Doudoroff 途径的分子、硫代谢相关化合物以及参与 M. sedula 适应极端环境（如金属耐受性和耐酸性）的分子。此外，我们还确定了参与微生物相互作用的分子，即通过生物膜形成进行的细胞表面相互作用和通过群体感应进行的细胞间相互作用，这依赖于信使分子进行微生物通讯。此外，我们利用高级化合物识别软件（MetaboScape）成功提取并识别了不同的饱和噻吩醌。这些醌是 M. sedula 的呼吸链电子载体，具有在极端环境条件下进行生命检测的生物标志物潜力。
Pallisentis Ophiocephali (...) 的分子鉴定
淡水鱼寄生虫的多样性因其生态和经济意义而引起了研究人员的极大关注。这项研究介绍了 Pallisentis ophiocephali (Acanthocephala) 的第一个分子实例，这种寄生虫通常存在于魣鱼 Xenentodon cancila 中，抑制了孟加拉国的淡水生态系统。该寄生虫的身份已通过形态学分析和分子技术得到确认，特别是线粒体细胞色素 C 氧化酶 I (COI) 基因测序的 PCR 扩增。经过彻底的系统发育分析，P. ophiocephali 被归类为 Acantho cephala 门。这项研究增进了我们对孟加拉国淡水生态系统中宿主-寄生虫关系的了解，并强调了分子工具在寄生虫鉴定中的重要性。
T淋巴细胞中调节免疫受体的替代剪接：一种新鉴定的抗癌药物免疫疗法的机制
替代剪接（AS）是一种在基因组中产生翻译多样性的机制。同样重要的是剪接机械的动态适应性，它可以优先于一种同工型，而不是由单个基因编码的其他同工型。这些同工型偏好会响应细胞的状态和功能而变化。尤其重要的是生理替代剪接在T淋巴细胞中的影响，其中特异性同工型可以增强或降低细胞对刺激的反应性。此过程使剪接同工型定义细胞态特征，以CD45剪接同工型为例，这表征了从天真到内存状态的过渡。两个发展加速了将AS动力学用于治疗干预措施：长阅读RNA测序的进步和核酸化学修饰的进展。改进的寡核苷酸稳定性已使其在将剪接引导到特定位点或修改序列以增强或沉默特定的剪接事件时使用。本综述强调了具有潜在意义的免疫调节剪接模式，以增强抗癌免疫疗法。
使用核酸探针鉴定微生物
Tansarli和Chapin（2019）的系统综述和荟萃分析检查了生物局部膜片脑膜炎/脑膜炎（ME）面板的诊断准确性。[2]对2016年至2019年进行的13项前瞻性和回顾性研究进行了审查（n = 3,764名患者）；荟萃分析中包括8例（n = 3,059例）。荟萃分析中包括的是Leber [2016]，[3]的研究，如下所述。研究中偏见的风险混合在一起，但倾向于低风险，指数测试方面最有问题。在任何研究中均未发现适用性。符合条件，与参考标准相比，研究必须提供灵敏度和特异性数据。研究中的患者感染了由面板上发现的多种成分引起的（细菌，病毒，加密型新羊角/gatti）。表2总结了准确性的灵敏度，特异性和其他测量值。假阳性结果的最高比例是肺炎链球菌（17.5％）和链球菌（15.4％）。对于单纯疱疹病毒1和2，肠病毒和C. neoformans/gatti，假阴性比例最高。使用ME面板的假阳性结果速率表明应谨慎使用此方法，应使用其他诊断方法来确认面板结果。
解释基于机器学习的预测模型和功能性元基因组方法，以鉴定HBCD降解中的关键基因
十六起核细胞环烷（HBCD）构成了严重的环境风险，并且由于微生物相互作用和代谢途径的复杂性，鉴定降解的Mi-Crobes及其酶促机制是具有挑战性的。本研究旨在通过两种方法来鉴定与HBCD生物降解有关的关键基因：元基因组的功能注释和基于机器学习的预测模型的解释。我们的功能分析表明，在丘奇土壤（CCS）元基因组中具有丰富的代谢潜力，尤其是在碳水化合物代谢中。在测试的机器学习算法中，随机森林模型的表现优于其他模型，尤其是在数据集中训练的培训，反映了诸如Dehalococcoides McCartyi和pseudomonas铜绿疾病等物种的降解模式。这些模型突出了EC 1.8.3.2（硫醇氧化酶）和EC 4.1.1.43（苯基丙酮酸脱羧酶）为降解的抑制剂，而EC 2.7.1.83（假氨酸激酶）与增强的降解链接。这种双方法学方法不仅加深
甲状腺癌进展的综合单细胞和空间转录图鉴定了预后成纤维细胞亚群
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年1月9日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.08.631962 doi：biorxiv preprint