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World File Search System错义
在代谢疾病患者中发现的人类 GPR17 错义变异具有不同的下游信号传导特征
来自 1 美国印第安纳州印第安纳波利斯印第安纳大学医学院儿科系 Herman B. Wells 儿科研究中心和 2 糖尿病与代谢疾病中心；3 美国马里兰州罗克维尔国立卫生研究院国家转化科学促进中心；4 美国纽约州纽约市西奈山伊坎医学院伊坎基因组学和多尺度生物学研究所遗传学和基因组科学系；5 美国康涅狄格州斯坦福德西奈山大学 Sema4 项目；6 美国印第安纳州印第安纳波利斯印第安纳大学医学院药理学和毒理学系、7 斯塔克神经科学研究所、8 生物化学和分子生物学系和 9 解剖学、细胞生物学和生理学系
Dnaaf5基因剂量对原发性纤毛运动障碍表型的影响
DNAAF5 是一种运动蛋白组装因子，与常染色体异质隐性遗传的纤毛运动障碍、原发性纤毛运动障碍 (PCD) 有关。等位基因杂合性对纤毛运动功能的影响尚不清楚。我们使用 CRISPR-Cas9 基因组编辑小鼠来重建在轻度 PCD 患者中发现的人类错义变异和 Dnaaf5 中的第二个移码无效缺失。携带 Dnaaf5 异等位基因的幼崽表现出明显的错义和无效基因剂量效应。无效 Dnaaf5 等位基因的纯合是胚胎致死的。具有错义和无效等位基因的复合杂合动物表现出严重疾病，表现为脑积水和早期致死。然而，错义突变纯合的动物存活率提高，超微结构分析观察到纤毛功能和运动组装部分保留。值得注意的是，相同的变异等位基因在不同的多纤毛组织中表现出不同的纤毛功能。对突变小鼠分离的气道纤毛进行蛋白质组学分析，发现 DNAAF5 变体中一些轴丝调节和结构蛋白有所减少，而这些蛋白此前从未被报道过。对小鼠和人类突变细胞的转录分析显示，编码轴丝蛋白的基因表达增加。这些发现表明，纤毛运动组装存在等位基因特异性和组织特异性分子要求，这可能会影响运动性纤毛病的疾病表型和临床轨迹。
ATM和CHEK2中的蛋白质截断和稀有的错义变体以及英国生物库全异位序列数据的癌症
ATM和CHEK2中的抽象背景有害种系变体与乳腺癌风险中等增加有关。其他癌症的风险仍不清楚。方法使用与癌症注册数据相关的英国生物库（348 488名参与者）的全外生态序列数据（348 488名参与者）评估了ATM和CHEK2中编码变异的癌症关联，并将其分析为回顾性病例控制和前瞻性队列研究。的优势比，危险比和组合相对风险（RR）。对蛋白质截断变体（PTV）和罕见的错义变体（RMSV；等位基因频率<0.1％）进行了单独的分析。ATM中PTV的结果与p <0.001（胰腺，食道，肺，黑色素瘤，乳腺，卵巢，前列腺，前列腺，膀胱，膀胱白血病（LL））的九种癌症的风险增加有关，在p <0.05（Colon，diffuse nonnon-Hod-lymphoma）（dn）（dn）（dn）（dn）。RMSV的载体增加了四种癌症的风险（p <0.05：胃，胰腺，前列腺，霍奇金氏病（HD））。RR的乳房，前列腺和RMSV位于脂肪或PIK结构域中的任何癌症中最高，并且在最高五分五五分之一中的注释依赖性耗竭评分。PTV与p <0.001（乳腺癌，前列腺，HD）的三种癌症相关，而ptv则与p <0.05（食管，黑色素瘤，卵巢，卵巢，肾脏，DNHL，髓样白血病）时相关。RMSV载体的风险增加了五种癌症（p <0.001：乳房，前列腺，LL； p <0.05：黑色素瘤，多发性骨髓瘤）。这些发现可以为载体的遗传咨询提供信息。ATM和CHEK2中的PTV结论与广泛的癌症有关，ATM PTV载体中胰腺癌的RR最高。
饱和量表功能证据支持林奇综合征的临床变异解释
林奇综合征 (LS) 是一种癌症易感综合征，全球每 300 人中就有 1 人以上患有此病。LS 的临床基因检测可以挽救生命，但由于意义不明确的变异 (VUS)，尤其是错义变异的沉重负担而变得复杂。为了应对这一挑战，我们利用了变异效应多重分析 (MAVE) 图，该图覆盖了关键 LS 基因 MSH2 中 17,746 种可能的错义变异中的 94% 以上。在此，为了确定这些功能数据的临床有效性并证明其在大规模变异重新分类中的实用性，我们将它们叠加在包含 15,000 多名在临床基因检测中发现 MMR 基因变异的个体的临床数据库中。对于 47 种具有可用分类的对照变异中的每一个，我们的功能测量结果与临床解释一致，满足了支持或反对致病性的“强”证据的公认阈值。然后，我们使用这些分数尝试对 682 个独特的错义 VUS 进行重新分类，其中 34 个（5.0%）在我们的功能图中被评为有害，与之前公布的其他癌症易感基因的比例一致。与其致病性一致，功能异常的错义变异与 LS 相关癌症的风险显著增加相关。结合功能数据和其他证据，十个变异被重新归类为致病/可能致病，497 个可以移至良性/可能良性。最后，我们将这些功能评分应用于配对的肿瘤正常基因测试，并确定了一组具有双等位基因躯体功能丧失的患者，反映了一种散发性的林奇样综合征，对治疗和亲属风险有明显的影响。这项研究展示了高通量功能分析如何增强可扩展的 VUS 分辨率并前瞻性地为变异分类生成强有力的证据。
TBX5变体和心脏表型
T-box转录因子5（TBX5）变体与Holt-Oram综合征相关。HOLT-ORAM综合征显示表型变异性，有关上肢缺陷，先天性心脏缺陷和心律不齐。为了研究TBX5变体与心脏病之间的基因型 - 表型关系，我们对文献进行了系统的综述。通过系统评价，我们确定了277名患者中与心脏表型相关的TBX5中的108种变体。心律不齐在错义变异的患者中（48％vs 30％，p = 0.009），并且上肢异常在蛋白质闭合变异的患者中更常见（85％vs 64％，p = 0.0008）。我们发现T-box域中的错义变体的聚类。此外，我们向一个家庭中隔膜缺陷呈现一个家庭。通过整个外显子组测序，我们在TBX5中确定了一种新型的错过变体P.phe232leu。心脏表型包括心房间隔缺陷，心律不齐，心力衰竭和扩张的心肌病。临床检查显示出细微的上肢异常。因此，家庭COR对Holt-Oram综合征的诊断标准做出了反应。我们提供了与TBX5变体相关的心脏表型的概述，并显示出与蛋白质扭曲变体相比，与错位变体相关的心律不齐的风险增加。我们报告了一个非典型HOLT-ORAM综合征表型的TBX5中的新型错义变体。
原始文章formononetin通过抑制自噬
摘要：目的：这项研究的主要目的是研究新型COL4A5 MIS感官突变对IV胶原型的影响。方法：收集了临床数据和详细的家族病史。靶向下一代测序（NGS）用于检查概率中的COL4A3，COL4A4，COL4A5基因中的潜在致病变异，然后使用生物信息学工具和谱系分析对变体进行分析。CRISPR/CAS9基因编辑用于敲击人足细胞中潜在的致病变异，然后使用蛋白质印迹分析和免疫荧光测定法来测量COL4A5蛋白的表达。结果：三名患者（I：2，II：1和II：2）出现了微观的血尿和蛋白尿，以及患者II：1：Pro t. pro nod of F.一种新型的错义变体C.2641G> A（p。Gly881arg），位于Col4a5基因的外显子31中，被选为可能的致病变体。在CRISPR/CAS9基因编辑的Podocytes中，变体显着降低了胶原蛋白IVα5链的表达。结论：通过进行NGS和CRISPR/CAS9基因编辑Podocytes，一种新型的COL4A5错义变体，C.2641G> A（p。Gly881arg），被确认为中国家族中X-C-C-C-C-C-C-C-C-C-连接Alport综合征的遗传缺陷。我们的发现扩展了具有COL4A5突变的X连锁Alport综合征的遗传谱，并提供了一种评估新型COL4A5错义变体的功能意义的方法。
针对FDA批准和临床试验的P53突变的药物。
简单的摘要：肿瘤抑制p53（p53）的突变发生在约50％的人类癌症中，其中大多数是错义突变。p53中的突变不仅损害了肿瘤抑制功能，而且还赋予了与野生型p53（WTP53）无关的致癌活性的错义突变体P53（MUTP53）。Since p53 mutations are cancer-specific, several approaches targeting them have been taken to develop novel cancer therapies, including restoration or stabilization of wtp53 conformation from mutp53, rescue of p53 nonsense mutations, depletion of mutp53 proteins, and induction of p53 synthetic lethality or targeting of vulnerabilities imposed by p53 deficiencies （激活的逆转座子）或突变（增强的YAP/TAZ）。在这里，我们总结了临床可用的研究和FDA批准的药物，这些药物针对p53突变，以抑制癌症进展的作用和活动机制。
![新型Imidazo [2,1-B]恶唑衍生物抑制上皮细胞转化和三重阴性乳腺癌肿瘤发生](/simg/8\8cb41599534813df43fef0fecba9a9d026b41d93.webp)
新型Imidazo [2,1-B]恶唑衍生物抑制上皮细胞转化和三重阴性乳腺癌肿瘤发生
摘要。背景/目标：进行了这项研究，以评估面板下一代测序（NGS）的临床实用性，并研究遗传改变的频谱及其在神经母细胞瘤中的临床意义。患者和方法：来自41例神经母细胞瘤病例的福尔马林固定的，被填充的档案样品用于靶向测序。结果：总共确定了145个体细胞突变，包括51个同义词，86个错义，3个废话，2个Frameshift删除，2个剪接位点和1个框内缺失突变。最常见的突变基因是碱（9个错义突变）。公共拷贝数变化（CNV）在2p24.2处放大，并在11q22.3和1p36.21处删除。ALK突变在4S或4S的患者中更常见（0％vs. 33.3％，P = 0.017）。在27例高风险疾病患者中，5-