摘要 — 网络长度是标准数字设计流程各个阶段中优化时序和功耗的关键代理指标。然而,大部分网络长度信息直到单元布局之前才可用,因此,在布局之前的设计阶段(例如逻辑综合)明确考虑网络长度优化是一项重大挑战。此外,缺乏网络长度信息使准确的布局前时序估计变得极其困难。时序可预测性差不仅影响时序优化,而且妨碍对综合解决方案的准确评估。这项工作通过一个带有网络长度和时序估计器的布局前预测流程解决了这些挑战。我们提出了一种可定制的图注意网络 (GAT) 方法,称为 Net 2,用于在单元布局之前估计单个网络长度。其面向准确度的版本 Net 2a 在识别长网络和长关键路径方面的准确度比之前的几项工作高出约 15%。其快速版本 Net 2f 比布局快 1000 倍以上,同时在各种精度指标方面仍优于以前的工作和其他神经网络技术。基于网络大小估计,我们提出了第一个基于机器学习的预布局时序估计器。与商业工具的预布局时序报告相比,它将电弧延迟中的相关系数提高了 0.08,并将松弛、最差负松弛和总负松弛估计的平均绝对误差降低了 50% 以上。
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1 威尔康奈尔医学研究院神经科学系,纽约,美国;2 北京大学生命科学学院细胞增殖与分化教育部重点实验室,北京,中国;3 约翰霍普金斯大学医学院 Russell H. Morgan 放射学和放射科学系,巴尔的摩,美国;4 首都医科大学宣武医院神经内科、国家神经疾病中心神经疾病创新中心,北京,中国;5 纽约理工学院计算机科学系,纽约,美国;6 精神病学和行为科学系神经生物学分部;约翰霍普金斯大学医学院 Solomon H.Snyder 神经科学系,巴尔的摩,美国
摘要 本研究旨在利用机器学习技术和便携式无线传感设备 EPOC+,对情绪识别中使用不同长度的时间窗口 (TW) 进行比较分析。本研究以个体在情绪刺激过程中提取的脑电信号数据集为基础,以熵为特征,评估不同分类器模型在不同 TW 长度下的性能。进行了两种类型的分析:被试间和被试内。在五种监督分类器模型中比较了准确率、曲线下面积和 Cohen's Kappa 系数等性能指标:K最近邻 (KNN)、支持向量机 (SVM)、逻辑回归 (LR)、随机森林 (RF) 和决策树 (DT)。结果表明,在两种分析中,所有五种模型在 2 至 15 秒的 TW 中均表现出较高的性能,其中 10 秒 TW 在被试间分析中尤为突出,5 秒 TW 在被试内分析中尤为突出;此外,不建议使用超过20秒的TW。这些结果为研究情绪时EEG信号分析中选择TW提供了有价值的指导。
该预印本版的版权持有人于2024年7月24日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi:medrxiv preprint
Burrows-Wheeler 变换 (BWT) 是 FM 索引不可或缺的一部分,FM 索引广泛用于文本压缩、索引、模式搜索和生物信息学问题,如从头组装和读取比对。因此,在时间和内存使用方面高效构建 BWT 是这些应用的关键。我们提出了一种称为改进桶 Burrows-Wheeler 变换 (IBB) 的新型外部算法,用于构建具有高度多样化序列长度的 DNA 数据集的 BWT。IBB 使用右对齐方法来有效处理不同长度的序列,使用基于树的数据结构来管理相对插入位置和等级,并使用精细桶来减少对外部存储器的必要输入和输出量。我们的实验表明,在大多数数据集上,IBB 比现有的最佳 BWT 构建算法快 10% 到 40%,同时保持有竞争力的内存消耗。
由 REZA YAHYAEI 提交,部分满足中东技术大学健康信息学理学硕士学位的要求,由 Deniz Zeyrek Bozşahin 教授博士 信息学研究生院院长 Yeşim Aydın Son 副教授博士 健康信息学系主任 Tolga Esat Özkurt 副教授博士 主管,健康信息学,中东技术大学 考试委员会成员: Yeşim Aydın Son 副教授博士 健康信息学,中东技术大学 Tolga Esat Özkurt 副教授博士 健康信息学,中东技术大学 Funda Yıldırım 助理教授博士 计算机工程,叶迪特佩大学
基于对流大气边界层的大涡模拟 (LES) 的先验分析,提出了改进的湍流混合和耗散长度尺度,用于基于湍流动能 (TKE) 的行星边界层 (PBL) 方案。湍流混合长度结合了表面层中的表面相似性和 TKE 约束,并对混合层中的横向夹带效应进行了调整。耗散长度是根据考虑剪切、浮力和湍流混合的平衡 TKE 预算构建的。在 TKE 通量中添加了一个非梯度项,以校正 TKE 的非局部湍流混合。改进的长度尺度被应用于 PBL 方案,并使用理想的单柱对流边界层 (CBL) 情况进行了测试。结果在广泛的 CBL 稳定范围内表现出强大的适用性,并且与 LES 基准模拟非常一致。然后将其实施到社区大气模型中,并通过 3D 真实情况模拟进行进一步评估。新方案的结果与其他三种成熟的 PBL 方案的质量相当。模拟和无线电探空仪观测剖面之间的比较表明,新方案在晴朗的日子里表现良好。
此预印本版的版权持有人于2024年7月18日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi:medrxiv preprint