许多生物学过程和机制取决于DNA中碱基配对和氢键的细节。氢键由于难以可视化氢原子位置而通过X射线晶体学和冷冻EM进行量化,但可以通过溶液中的NMR光谱探测到位点特异性,而固态的固态,后者特别适合大型,缓慢滚动的DNA复合物。最近,我们表明低温动态核极化(DNP)增强的固态NMR是在本机样条件下在各种DNA系统中区分Hoogsteen碱基对(BPS)与规范的Watson-Crick BPS的有价值工具。在此使用12型摩尔DNA双工,在Watson-Crick或Hoogsteen确认中含有两个中央腺嘌呤 - 胸腺氨酸(A-T)BPS,我们证明了DNP固态NMR测量值,这些NMR的测量值是胸腺胺N3-H3键的长度,这些长度与N-H-H-H的详细信息敏感,并允许NH-H·n-H·的n-H·n-H·的水性键合敏感。相同的DNA序列上下文。对于此DNA双链体,对于Watson-Crick A-T和HOOGSTEEN A-T和HOOGSTEEN A(SYN)-T碱基对的有效相同的TN3-H3键长的长度为1.055±0.011Å和1.060±0.011Å,相对于参考磁键长度为1.015±0.010Å,分别为N-Acety-ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl,分别为watson-Crick a-t和hoogsteen a(syn)a(syn)-t碱基对。非常明显的是,在模型DNA双链体的背景下,这些结果表明,watson-Crick和Hoogsteen BP构型构象异构体之间N-H··N-t a-t氢键没有显着差异。考虑到零点运动的先前量子化学计算预测有效较长的肽n-h键长度为1.041Å,与溶液和环境温度下的肽和蛋白质的固态NMR研究一致,以促进这些早期的研究tn3-h3键长度的直接比较。 Watson-Crick A-T和Hoogsteen A(Syn)-t BPS相对于1.041Å参考肽N-H键长。更一般地,基于低温DNP固态NMR的方法对N-H键长度进行高精度测量有望促进对一系列DNA复合物和基本配对环境的氢键的详细比较分析。
摘要:多项研究表明,癌症患者的无细胞DNA(CFDNA)在片段长度和片段末端基序(fem)的差异与健康个体不同,但是缺乏对这两个因素如何与癌症和基因转移相关的如何相关的。在这项研究中,我们使用肺癌患者(n = 12)和健康个体(n = 7)的血浆进行了CFDNA片段组学评估。使用H3K36ME3无细胞染色质染色质免疫沉淀测序(CFCHIP-SEQ)从血浆中建立了一个个人基因表达。与低表达的基因相比,具有最高表达的基因表现出富集短的CfDNA片段(中值= 19.99%,IQR:16.94–27.13%,p <0.0001)。此外,在CFCHIP之后,富含富含GC的FEM。将短CfDNA片段的频率与存在不同的FEM的存在相结合,从而进一步富集了表达最多的基因(中位数= 37.85%,IQR:30.10-39.49%,p <0.0001)。<150 bp cfDNA的体外尺寸选择可以分离代表活性基因的cfDNA,尺寸选择富集与CFCHIP-SEQ富集相关(Spearman R范围:0.499-0.882,p <0.0001)。这项研究扩大了有关CFDNA片段学的知识,并阐明了基因活性与CfDNA片段长度和不同的FEM的相关性的新启示。
摘要:光纤尖端上功能材料和结构的集成使在微观磁镜中的各种应用(例如感应,成像和光学诱捕)中的各种应用。直接激光写作是一种3D打印技术,有望在纤维尖端上制造高级微光学结构。迄今为止,材料的选择仅限于基于有机聚合物的光蛋白师,因为现有的3D直接激光编写无机材料的方法涉及与光纤不兼容的高温处理。但是,有机聚合物的稳定性和透明度与无机玻璃的稳定性和透明度相当。在此,我们演示了3D直接激光写入无机玻璃,并在光纤尖端上具有亚波长度分辨率。我们展示了两种不同的打印模式,可分别启用实心二氧化硅玻璃结构(“统一模式”)和自组织的亚波长光栅(“纳米式模式”)。我们通过打印两个功能设备来说明方法的实用性:(1)折射率传感器,可以在近边缘波长下测量丙酮和甲醇的二进制混合物的索引,以及(2)紧凑型极化光束旋转器在全纤维系统中进行偏光控制和光束转向。通过将玻璃的优质材料与光纤的插头性质相结合,该方法可以在诸如纤维传感,光学微电机机电系统(MEMS)和量子光子学等领域中实现有希望的应用。关键字:直接激光写作,微结构纤维,3D玻璃,光纤感应,极化束分配器i
摘要。本研究检查了雄性白藜芦醇摄入是否影响了由年轻和老年男性小鼠父亲的胚泡中的线粒体DNA拷贝数(MT-CN)和端粒长度(TL)。C57BL/6N雄性小鼠在14-23和48-58周龄时使用含有0.1 mM白藜芦醇的水或水的水或水。从超卵形雌性小鼠的输卵管(8-15周大)的输卵管中收集两细胞阶段的胚胎,并培养3天直到胚泡阶段。 通过实时聚合酶链反应测量 MT-CN和TL水平。 白藜芦醇摄入量不会影响体重或消耗。 白藜芦醇摄入量增加了肝脏中SIRT1的表达水平,血清的抗氧化能力和心脏延伸的TL,而精子中心脏或TL中MT-CN没有显着差异。 老年小鼠的胚泡发育速率明显低于年轻小鼠,白藜芦醇摄入量增加了源自年轻和老年男性的胚泡总数。 白藜芦醇摄入量不会影响源自年轻小鼠的胚泡胚胎的囊泡体中的MT-CN或TL,但在源自老年父亲的胚泡的胚泡中,MT-CN和TL都显着增加了MT-CN和TL。 总而言之,白藜芦醇摄入量增加了源自老年雄性小鼠的胚泡中的MT-CN和TL水平。 关键词:胚胎,线粒体,父亲衰老,白藜芦醇,端粒两细胞阶段的胚胎,并培养3天直到胚泡阶段。MT-CN和TL水平。白藜芦醇摄入量不会影响体重或消耗。白藜芦醇摄入量增加了肝脏中SIRT1的表达水平,血清的抗氧化能力和心脏延伸的TL,而精子中心脏或TL中MT-CN没有显着差异。老年小鼠的胚泡发育速率明显低于年轻小鼠,白藜芦醇摄入量增加了源自年轻和老年男性的胚泡总数。白藜芦醇摄入量不会影响源自年轻小鼠的胚泡胚胎的囊泡体中的MT-CN或TL,但在源自老年父亲的胚泡的胚泡中,MT-CN和TL都显着增加了MT-CN和TL。总而言之,白藜芦醇摄入量增加了源自老年雄性小鼠的胚泡中的MT-CN和TL水平。关键词:胚胎,线粒体,父亲衰老,白藜芦醇,端粒
1 国际癌症研究机构/世界卫生组织 (IARC/WHO) 基因组流行病学分部,法国里昂;2 牛津大学癌症流行病学系,英国牛津;3 布里斯托尔医学院 (PHS) 布里斯托尔人口健康科学研究所 MRC 综合流行病学系,英国布里斯托;4 莱斯特大学心血管科学系,英国莱斯特;5 NIHR 莱斯特生物医学研究中心,格伦菲尔德医院,英国莱斯特;6 瑞士洛桑生物与医学学院路德维希洛桑分校;7 贝勒医学院临床与转化研究所,美国休斯顿;8 西奈健康中心 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所,加拿大多伦多;9 斯坦福大学流行病学与人口健康系,美国斯坦福
课程名称:探索技术 课程编号:8600020 课程长度:学期 课程描述:本课程旨在让学生有机会探索技术领域以及技术领域的相关职业。学生将有机会解决技术问题,同时了解技术对我们日常生活的影响。
GO注释(GO:0043231;GO:0044444)。非同义突变的ORF33基因在SwissProt数据库中被注释为与extensin相关。此外,该基因还被发现与烟草中的伸肌蛋白相关。研究表明,伸肌蛋白是植物细胞壁中重要的结构蛋白,在细胞壁强化中发挥作用。研究还表明,伸肌蛋白的表达与细胞扩张程度呈负相关,增加伸肌蛋白的表达可能促进其表达的组织或器官局部区域细胞密度的增加(Roberts等,2006)。ORF25编码一种参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质,根据其功能学,被认为是一种类formin蛋白。
蓝相(BPS)是手性液晶,具有拓扑缺陷的常规晶格。通过分子自组装,BPS独特的软性对称性提供了许多与常规液晶不同的优秀特性。,已经开发出化学图案的表面,以将BP的自组装引导为具有所需晶格方向的完美单晶,从而进一步受益于光子学和智能电子光学设备的设计。然而,BP的相关长度(定义为保持相同BP时间端方向的距离,这是一个必不可少的设计参数)迄今仍未透露。在这里,纳米级化学模式设计的替代平面和同型锚固条纹的设计允许系统地研究沿不同动力学途径的图案化区域以外的BP的生长,以及相关长度的时间演化。对相关长度的新理解可用于指导BPS宏观的单晶的合理设计,该设计依赖于减少的图案表面,这为基于BPLC的新功能和开发提供了令人兴奋的材料,以将基于BPLC的功能和开发用于高级光学设备或软材料设计或软材料设计。
大脑是一个复杂而动态的系统,由相互作用的集合及其时间演化组成。脑电图 (EEG) 记录的大脑活动在学习研究和应用领域中对解读人类的认知过程起着至关重要的作用。在现实世界中,人们对刺激的反应不同,并且大脑活动的持续时间因人而异。因此,实验中收集的试验中 EEG 记录的长度是可变的。然而,当前的方法要么固定每次试验的 EEG 记录长度,这会丢失隐藏在数据中的信息,要么使用滑动窗口,这会在切片的重叠部分消耗大量计算量。在本文中,我们提出了 TOO(仅遍历一次),一种处理可变长度 EEG 试验数据的新方法。TOO 是一种卷积仲裁投票方法,它通过卷积实现滑动窗口并用 1×1 卷积层替换全连接层来打破模型的固定结构。 1×1 卷积层生成的每个输出单元对应于滑动时间窗口创建的每个切片,这反映了认知状态的变化。Ten,TOO 对输出单元采用群体投票,并确定代表整个单次试验的认知状态。我们的方法为不同长度的试验提供了一个自适应模型,只需遍历每个试验的 EEG 数据一次即可识别认知状态。我们设计并实施了一个认知实验并获取了 EEG 数据。利用从该实验收集的数据,我们进行了评估,将 TOO 与最先进的滑动窗口端到端方法进行比较。结果表明,TOO 在试验级别获得了良好的准确率(83.58%),而计算量却低得多(11.16%)。它还可能用于其他应用领域的变量信号处理。
我们利用孟德尔随机化(MR)来评估白细胞端粒长度(LTL)和肌醇侧面硬化症(ALS)之间的因果关系以及基因组范围研究的汇总统计数据(n = 〜38,000 n = 〜38,000 for ltl and 〜31,000 for ltl and 〜81,000,欧洲人群中的ltl;我们进一步评估了脂质在从LTL到ALS的途径中的介导作用。在欧洲人群中,ALS上LTL的每标准偏差降低为1.10(95%CI 0.93-1.31,p = 0.274),在亚洲人群中为0.75(95%CI 0.53–1.07,p = 0.116)。在欧洲人口中的LTL和额颞痴呆之间也发现了这种无效的关联。但是,我们发现LTL对ALS的间接影响可能是由低密度脂蛋白(LDL)或总胆固醇(TC)介导的欧洲人群。这些结果对广泛的灵敏度分析是可靠的。总的来说,我们的MR研究不支持LTL与ALS风险之间的直接因果关系,而是为LDL或TC对LTL和ALS在欧洲人群中的影响提供了暗示性的证据。