第一作者 Ragini Singh 是电子和通信工程师,目前正在印度博帕尔 (MP) RGPV 攻读微电子和 VLSI 设计硕士学位。第二作者 Sandip Nemade 教授拥有 VLSI 设计学位,目前担任印度博帕尔 (MP) 技术学院电子和通信系助理教授。
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图2:MD模拟。(a)不同LI +协调环境的示意图。(b-d)显示了liotf和(e-g)的结果:(b,e)配位矩阵,该矩阵对来自OTF-的氧和氧气对Li +的总协调的相对贡献,来自OTF-和来自聚合物终端组的硝化物。通过红色和黄线传递的网格代表了最有利的4和5的总坐标数。Pij是模拟时间内每个协调组合的概率。(c,f)阳离子,阴离子和聚合物链的MSD图。(d,g)离子聚类统计,其中网格通过红线代表中性簇。αIJ是模拟期间每个群集的平均计数。
b细胞是自适应免疫系统的关键组成部分,并且在通过产生浆细胞和记忆细胞实现的病原体的长期病原体方面起着关键作用。浆细胞具有称为抗体的特定受体,这是体液免疫反应中抗原 - 抗体(AG -AB)相互作用的重要组成部分。尽管抗原通常更大,但抗体或B细胞受体特异性识别并与称为抗原决定剂或表皮的某些抗原区域结合(Jespersen等,2019)。抗体通过与它们的结合位点或副型的相互作用来识别这些区域,并在引发免疫反应中起着至关重要的作用(Jespersen等,2019)。因此,准确表征和识别B细胞表位(BCE)是用于开发基于表位的疫苗(Russi等,2018),疾病预防和免疫学诊断工具(Schellekens等人,2000年)。值得注意的是,已经表现出很高效力,选择性和安全性的治疗性抗体已在文献中进行了广泛的研究和报道(Kam等,2012; Manavalan等,2018; Potocnakova et al。bces是表面加速的氨基酸簇,基于它们的规范结构属于两个主要类别:连续(线性或顺序)和不连续(非线性或构象)(Atassi&Smith,1978; Jespersen et al。,2019; Potocnakova et al。,2016年)。序列决定了与顺序表位的抗体结合,并且不取决于抗原的三级结构。因此,顺序表位是称为抗原区域的蛋白质的小段。相反,与构象表位结合的抗体依赖于抗原的三维(3D)结构(Benjamin等,1984; Gershoni等,2007; Kulkarni- Kale等,2005)。大约90%的总BCE是不连续的,这意味着该序列中的残基彼此遥远,并通过蛋白质折叠在附近靠近,形成了功能性抗原性决定因素(Kringelum等,2013)。因此,没有关于AG - AB复合物的准确的高分辨率结构信息,而是识别停药的表位是具有挑战性的(Haste Andersen等,2006; Najar等,2017)。研究还表明,几组连续的表位毗邻与停止表位相邻,这模糊了连续和不连续的表位之间的界线(Galanis等,2021; Van Regenmortel,2006)。准确确定共同的BCES高度取决于抗原的3D结构(Jespersen等,2019; Raoufi等,2020; Sharon等,2014)。在下一代测序时代,由于测序技术的进步,已经对许多病原体进行了测序。需要在
多靶点药物的设计是药物化学领域的一个重要的研究领域,因为它们已被提议作为治疗复杂疾病的潜在疗法。然而,定义一种多靶点药物并不是一件容易的事。在这项工作中,我们提出了一种矢量分析来测量和定义“多靶点性”。我们开发了诸如配体的顺序和力等术语,最终得出两个参数:多靶点指数 1 和 2。这两个指数的组合可以区分多靶点药物。我们构建了几个训练集来测试这些指数的实用性:一个具有实际亲和力的实验训练集、一个在理论值范围内的对接训练集和一个广泛的数据库训练集。这些指数被证明是有用的,因为它们在计算机和实验数据中独立使用,在大多数训练集中识别出实际的多靶点化合物甚至选择性配体。然后,我们应用这些指标来评估与多发性硬化症相关的靶标的潜在配体虚拟库,根据其在计算机中的行为确定了 10 种可能成为多靶点药物开发先导的化合物。通过这项工作,我们在定义多靶点和药物设计方面树立了新的里程碑。
• 频繁模式由与疾病或药物无直接关联的介质介导 • 疾病相关蛋白、介质蛋白和靶蛋白各自形成簇 • 靶蛋白往往位于膜内,而疾病相关蛋白位于细胞内。介质往往位于内质网、细胞核和黑素体中
1 浙江省重点实验室,杭州 311121;20112020109@fudan.edu.cn (YL);qhu@mail.ustc.edu.cn (QH);hanyk@zhejianglab.com (YH);pengb806@nenu.edu.cn (BP);jianghaijun@zhejianglab.com (HJ) 2 复旦大学微电子学院,上海 200433;xuexiaoyong@fudan.edu.cn 3 中国科学技术大学微电子学院,合肥 230026;wuqiqiao@mail.ustc.edu.cn (QW);xuanzhi@mail.ustc.edu.cn (XL); chengjinhui@mail.ustc.edu.cn (JC) 4 中国科学院微电子研究所微电子器件集成技术重点实验室,北京 100029,中国;zhaoyulin@ime.ac.cn (YZ);zhangdonglin20@mails.ucas.ac.cn (DZ);hanzhongze@ime.ac.cn (ZH);dingqingting@ime.ac.cn (QD);lvhangbing@ime.ac.cn (HL) * 通讯地址:yangjianguo@ime.ac.cn;电话:+86-10-82995585
优点,如有利的尺寸、靶位的稳定性、多聚阳离子活性以及 11
适用于基于磁转移技术的 32 位或 96 位核酸提取仪。如 BIO-DL 32 , TIANGEN TGuide S32 , TIANLONG NP968-C ,
其中一项活动涉及“加速器、靶和辐照设施的屏蔽方面”(SATIF)。过去 20 年里已经举办了一系列研讨会:SATIF-1 于 1994 年 4 月 28-29 日在德克萨斯州阿灵顿举行;SATIF-2 于 1995 年 10 月 12-13 日在瑞士日内瓦的 CERN 举行;SATIF-3 于 1997 年 5 月 12-13 日在日本仙台的东北大学举行;SATIF-4 于 1998 年 9 月 17-18 日在田纳西州诺克斯维尔举行;SATIF-5 于 2000 年 7 月 17-21 日在法国巴黎的 NEA 举行;SATIF-6 于 2002 年 4 月 10-12 日在加利福尼亚州门洛帕克的 SLAC 国家加速器实验室 * 举行; SATIF-7 于 2004 年 5 月 17-18 日在葡萄牙萨卡韦姆 ITN 举行;SATIF-8 于 2006 年 5 月 22-24 日在韩国浦项的浦项加速器实验室举行;SATIF-9 于 2008 年 4 月 21-23 日在美国田纳西州橡树岭的橡树岭国家实验室 (ORNL) 举行;SATIF-10 于 2010 年 6 月 2-4 日在瑞士日内瓦的欧洲核子研究中心举行;SATIF-11 于 2012 年 9 月 11-13 日在日本筑波的高能加速器研究组织 (KEK) 举行;SATIF-12 于 2014 年 4 月 28-30 日在美国伊利诺伊州巴达维亚的费米国家加速器实验室 (FNAL) 举行。