XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System靶链
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关 9 (CRISPR/Cas9) 酶的三种工程化 HNH 内切酶 Lys-to-Ala 突变体动力学降低的结构基础
许多细菌对入侵的噬菌体或质粒具有 II 型免疫力，称为成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关 9 (Cas9) 系统，用于检测和降解外来 DNA 序列。Cas9 蛋白有两个负责双链断裂的核酸内切酶（分别称为 HNH 结构域，用于切割 DNA 双链的靶链，RuvC 结构域用于切割非靶链）和一个单向导 RNA (sgRNA) 结合结构域，其中 RNA 和靶 DNA 链是碱基配对的。三种工程化的单 Lys-to-Ala HNH 突变体（K810A、K848A 和 K855A）表现出对靶 DNA 链切割的增强的底物特异性。我们在本研究中报告，在野生型酶中，在 1mM EDTA 存在下，与催化位点相邻的含 Y836 环（包括 E827-D837）内的 D835、Y836 和 D837 具有无法表征的加宽 1 H 15 N NMR 共振，而环中其余残基具有不同程度的加宽 NMR 光谱。我们发现，野生型酶中的该环在分子动力学 (MD) 模拟期间表现出三种不同的构象，而三个 Lys-to-Ala 突变体
引导编辑系统研究进展
flap 之间存在动态转换，使所需 DNA 信息有机会 与基因组的靶标链结合，之后 5' flap 会在细胞修复 的过程中被切除，经过 DNA 修复过程，最终实现基 因组信息的修改 ( 图 1 ) 。在这个过程中，融合蛋白 承担了切割目标位点非靶标链和逆转录的双重功 能，而 pegRNA 既引导 PE 识别目标位点，又包含了编辑 所需的信息。通过这 2 个组分， PE 系统实现了识 别、切割、起始逆转录的引物序列结合、逆转录等一 系列过程，并将所需 DNA 信息直接逆转录至目标 位点的断裂处 [ 26 ] 。 PE 系统的设计非常简单精巧，无 需引入 DNA 模板，也不产生双链断裂，是一种非常
DNA 缺口会诱发与 BRCA1 缺陷相关的突变特征
与 Brca1 +/+ 细胞相比，Brca1 m/m 细胞中的 LTGC 偏向性下降（图 2e、f 和扩展数据图 4c、d）。然而，在 RNA-DNA 杂交体中的靶链上和 nCas9-sgRNA-DNA 复合物中的非靶链上诱导的缺口之间，BRCA1 介导的 LTGC 偏向性抑制没有显著差异（扩展数据图 5a）。对于 nCas9-sgRNA，Watson 链和 Crick 链上的 PAM 之间的这种抑制也几乎没有改变（扩展数据图 5b）。总之，这些数据表明，链不对称加剧了 Brca1 缺陷引起的 nCas9 诱导的 LTGC 偏向性，这与
基于多链区块链的水果和蔬菜供应链的优质可追溯性系统
为了提高水果和蔬菜行业的可追溯性效率和安全性，本文提出了一种基于多链区块链技术的优化模型。首先，对水果和蔬菜行业的供应链信息进行了分析，该信息的可追溯性代码和产品信息来自供应链的各个阶段。接下来，基于区块链技术建立了可信赖的可追溯性优化模型。最后，使用HyperLeDger Fabric实现了VFSC的信息可追溯性系统，并提出了改进的Kafka负载平衡算法来提高消息传输效率。仿真结果表明，当数据记录数量超过1000时，多链可追溯性模型就查询效率而言优于传统的单链区块链模型。在区块链上部署了10000个数据记录后，与传统的单链模型相比，多链模型的效率提高了90％以上。
机器学习预测肥胖相关肠道菌群：确定假链双歧杆菌作为潜在治疗靶点
超重和肥胖是全球重大的公共卫生挑战，带来了巨大的临床困难（Laine 和 Wee，2023 年）。肥胖是各种广泛性疾病的主要前兆，包括 2 型糖尿病、高血压、非酒精性脂肪肝、癌症和阻塞性睡眠呼吸暂停综合征（Tsai 和 Bessesen，2019 年；Quek 等人，2023 年）。尽管为治疗、缓解和预防做出了许多努力，但全球肥胖的患病率和严重程度仍在持续上升（Heindel 等人，2024 年）。从病因上讲，肥胖是一种复杂的疾病，主要由遗传和环境因素的相互作用驱动（Laine 和 Wee，2023 年）。因此，有效的肥胖治疗需要采用多学科方法（Velazquez 和 Apovian，2018 年），凸显了对创新预防和治疗策略的迫切需求。
利用链路：通过更高海拔链路改善卫星通信
大多数小型卫星操作（包括立方体卫星社区中的操作）都会最大化与地面站的单次通信持续时间，但这样做并不能最大化传输的总数据量。在本文中，我们研究了通过等待以非直观的高仰角开始传输来最大化数据下载的方法。此仰角缩短了倾斜距离，并允许以更高的固定数据速率关闭链路。虽然传输时间较短，但下载的总数据量较大。我们针对各种通道配置检查了这种方法，并将其与世界各地已知地面站的通道分布进行了比较。本研究的结果（分析和数值）与最大化给定卫星轨道传输数据量的策略建议一起呈现。这些方法依赖于在轨时改变无线电数据速率的能力，这通过使用灵活速率无线电来实现。我们通过检查一年内单个地面站的传输数据量来扩展这项研究。结果表明，可以找到最佳固定数据速率，从而使全年下载的数据量最大化。最后，为小型卫星社区提供了无线电开发建议。
“多靶点”的定义：通过载体分析识别潜在的多靶点和选择性配体
多靶点药物的设计是药物化学领域的一个重要的研究领域，因为它们已被提议作为治疗复杂疾病的潜在疗法。然而，定义一种多靶点药物并不是一件容易的事。在这项工作中，我们提出了一种矢量分析来测量和定义“多靶点性”。我们开发了诸如配体的顺序和力等术语，最终得出两个参数：多靶点指数 1 和 2。这两个指数的组合可以区分多靶点药物。我们构建了几个训练集来测试这些指数的实用性：一个具有实际亲和力的实验训练集、一个在理论值范围内的对接训练集和一个广泛的数据库训练集。这些指数被证明是有用的，因为它们在计算机和实验数据中独立使用，在大多数训练集中识别出实际的多靶点化合物甚至选择性配体。然后，我们应用这些指标来评估与多发性硬化症相关的靶标的潜在配体虚拟库，根据其在计算机中的行为确定了 10 种可能成为多靶点药物开发先导的化合物。通过这项工作，我们在定义多靶点和药物设计方面树立了新的里程碑。
药物靶点挖掘机（DTX）用于药物发现靶点发现
• 频繁模式由与疾病或药物无直接关联的介质介导 • 疾病相关蛋白、介质蛋白和靶蛋白各自形成簇 • 靶蛋白往往位于膜内，而疾病相关蛋白位于细胞内。介质往往位于内质网、细胞核和黑素体中
加速器、靶和辐照的屏蔽方面...
其中一项活动涉及“加速器、靶和辐照设施的屏蔽方面”（SATIF）。过去 20 年里已经举办了一系列研讨会：SATIF-1 于 1994 年 4 月 28-29 日在德克萨斯州阿灵顿举行；SATIF-2 于 1995 年 10 月 12-13 日在瑞士日内瓦的 CERN 举行；SATIF-3 于 1997 年 5 月 12-13 日在日本仙台的东北大学举行；SATIF-4 于 1998 年 9 月 17-18 日在田纳西州诺克斯维尔举行；SATIF-5 于 2000 年 7 月 17-21 日在法国巴黎的 NEA 举行；SATIF-6 于 2002 年 4 月 10-12 日在加利福尼亚州门洛帕克的 SLAC 国家加速器实验室 * 举行； SATIF-7 于 2004 年 5 月 17-18 日在葡萄牙萨卡韦姆 ITN 举行；SATIF-8 于 2006 年 5 月 22-24 日在韩国浦项的浦项加速器实验室举行；SATIF-9 于 2008 年 4 月 21-23 日在美国田纳西州橡树岭的橡树岭国家实验室 (ORNL) 举行；SATIF-10 于 2010 年 6 月 2-4 日在瑞士日内瓦的欧洲核子研究中心举行；SATIF-11 于 2012 年 9 月 11-13 日在日本筑波的高能加速器研究组织 (KEK) 举行；SATIF-12 于 2014 年 4 月 28-30 日在美国伊利诺伊州巴达维亚的费米国家加速器实验室 (FNAL) 举行。
