Raffone A.,Working A.,Raimondo D.,Neola D.,M.M.,Saint A.和Al。 (2022)。 淋巴结侵袭性侵入性癌:预后因素独立性强烈地分子签名。 165(1),192-197 [10.1016/j.ygyno.202.01.013]Raffone A.,Working A.,Raimondo D.,Neola D.,M.M.,Saint A.和Al。(2022)。淋巴结侵袭性侵入性癌:预后因素独立性强烈地分子签名。165(1),192-197 [10.1016/j.ygyno.202.01.013]
预定的临床评估,监视成像研究和实验室评估。采取了这些措施来评估治疗反应,监测疾病进展或复发以及管理与治疗相关的并发症。这项研究包括在指定期内被诊断出患有HL的患者,年龄在12岁以上,他们在诊断后至少接受了一个诱导化疗周期。在HL诊断之前患有同时发生恶性肿瘤或其他类型的恶性肿瘤,在研究期内未接受或拒绝任何治疗的患者,以及那些缺少三个以上变量的基线评估的患者。在医院USM,2006年1月1日至2018年12月31日之间进行了138例HL患者,其中126名患者符合资格标准。因此,没有采用抽样方法,并且所有合格的患者均纳入研究。使用社会科学(SPSS)版本26.0的IBM统计软件包输入和分析数据。对于分类变量,计算了观测和百分比的频率。生存分析被选择为统计检验,因为研究目标包括事件的时间,即HL的死亡或复发/进展。总生存期(OS)定义为从诊断日期到死亡日期的持续时间。生存时间的事件是在研究期间HL患者的死亡,无论死亡原因如何。对OS的审查观察结果是在研究结束时还活着的患者,或者在研究期间因随访而丧生的患者。无进展生存期(PFS)定义为从诊断日期到疾病复发/进展日期的持续时间。该研究的事件是疾病复发/进展的时候。对PFS的审查观察结果是在研究期间关闭时获得完全反应(CR)的患者,或者在研究期间因随访而失去了随访的患者。对选定的自变量进行了简单的COX比例危害模型,以提供潜在预后重要性的初步概念(P <0.25)。显着水平是从WALD统计数据中获得的。随后,使用多个COX比例危害模型来识别与OS和PF相关的死亡和疾病复发/进展的预后因素。在单变量COX回归分析中,对p值小于0.25的变量执行了两个统计分析:向前逐步(WALD)和向后逐步(WALD)。第二个分析基于模型的统计意义包括模型中的所有自变量。提出了具有调整危险比(HR)和95%置信区间的最终模型,WALD统计量和相应的P值。p值小于0.05被认为具有统计学意义。在126例HL患者中的结果,男性占主导地位,有70名男性(55.6%)和56名女性(44.4%)。中位年龄为28岁(范围12-78岁)。大多数患者不到45岁(84.9%),主要是马来人(97.6%)。
背景:嘧啶代谢是肿瘤代谢重编程的标志,而其对肺腺癌患者(LUAD)患者的预后和治疗意义的重要性仍然不清楚。方法:在这项研究中,使用各种机器学习和深度学习算法的综合框架来开发与嘧啶代谢相关的签名(PMRS)。通过全面的多摩学分析评估了其在基因组稳定性,化学疗法和免疫疗法耐药性方面的功效。也阐明了PMRS亚组之间患者的单细胞景观。随后,在LUAD细胞系中对LYPD3(PMRS模型中最重要的系数因子)的生物学功能进行了实验验证。结果:具有“随机生存森林”算法的PMRS模型表现出最佳性能,并用于进一步分析。它在各种模型评估测定中显示出极好的准确性和稳定性。与PMRS-HIGH亚组相比,PMRS评分较低的患者的生存结果更好,更稳定的基因组特征和对免疫疗法的敏感性更高。单细胞分析表明,随着PMR的增加,上皮细胞逐渐表现出具有增强的嘧啶代谢的恶性表型,而PMRS-HIGH患者表现出肿瘤免疫微环境的抑制状态。进一步的实验表明LYPD3促进了LUAD细胞系中的恶性进展。结论:我们的研究构建了PMRS模型,强调了其在LUAD患者的治疗和预后的潜在价值,并为LUAD患者的个性化精度治疗提供了新的见解。
发现391,106例肺癌患者被鉴定出来,其中43,359例接受了晚期pembrolizumab的晚期疾病。男性有67%(29,040/43,359),诊断年龄的中位年龄为65岁。中位随访时间为25.9个月(最小值 - 最大,[0-97.6]),pembrolizumab启动后的总体生存期(OS)中位数第一线的中位数为15.7 [CI 95,15.3 - 16.0]。在多变量分析中,几个协变量与较差的OS独立相关,包括男性性别免疫疗法,年龄,医院类别,高剥夺指数,第一次pembrolizumab的住院住院治疗,以及糖尿病,糖尿病,利尿剂,贝塔阻滞剂,止痛药的病史。在pembrolizumab启动后29个月的里程碑时间,延续超过2年与OS相比,与固定的2年治疗更好,HR = 0.97 [0.75 - 1.26] p = 0.95。
3 University of California San Diego, San Diego, California, USA 4 Sorbonne University, Public Assistance-Hospitals of Paris ,, Inserm, Department of Cardiology, CIC-901, Unico-Greeco Cardio-Ons Program, Saint-Antoine Hospital, Paris, France 5 Hopital Ambroise-Péré, Neuilly sur Seine, Immunotherapy, Department of Oncology, PSL Research University, Institut法国居里,法国7索邦大学,巴黎公共援助室,生物化学激素学,托农医院,巴黎,法国8索邦大学,公共援助 - 巴黎公共援助 - 巴黎,INSERM,INSERM,内科,Pitié-Salpêtrière医院,巴黎,巴黎,巴黎9号公共部门。法国巴黎F-75013Pitié-Salpêtrière医院
1 南特大学医院颌面外科系,法国 44000 南特 2 CRCI2NA-南特-昂热癌症和免疫学研究中心,法国 44000 南特 3 图卢兹癌症生物库,图卢兹大学医院 IUCT Oncopole,法国 31100 图卢兹 4 UMR1246 SPHERE(以患者为中心的结果和健康研究方法),南特大学,法国 44000 南特 5 蒂莫内医院病理学系,法国 13005 马赛 6 里尔大学医院病理学系,法国 59000 里尔 7 南锡大学医院病理学系,法国 54000 南锡 8 科钦医院病理学系,法国 75014 巴黎 9 图尔大学医院病理学系,法国 37000 图尔 10南特大学医院骨科,44000 南特,法国 * 通讯地址:helios.bertin@chu-nantes.fr;电话:+33-(0)2-40-08-36-79;传真:+33-(0)2-40-08-36-68
背景:卵巢癌(OC)和宫颈癌(CC)是女性死亡的主要原因。因此,确定早期检测和治疗的标记至关重要。CDK1控制细胞周期的G2/M转变,是周期的重要调节蛋白。RO-3306和UBE2C与CDK1表达有关,并可能共同促进OC的发展。CDK1和CDK2磷酸化MLK3,在OC细胞的侵袭和增殖中起重要作用。此外,miR-490-3p靶向CDK1并限制卵巢肿瘤的生长。CDK1在CC的进展中也起着至关重要的作用。例如,CDK1的过表达可以挽救与关键过程有关的RCC1敲低的影响,例如胞质转运,对G1细胞周期进程。使用生物信息学分析,我们评估了共表达基因CDK1在这两种癌症中的功能富集和作用及其对预后的影响。方法:首先,我们筛选了与OC和CC相关的DEG的公共数据集并确定了相交基因。这些基因的富集分析揭示了关键的生物学途径和过程。然后,我们生成蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,以鉴定中央基因和重要基因模块。结果:其他富集分析表明,细胞周期调节和生殖细胞成熟是这些核心基因调节的主要过程。我们还检查了CDK1在OC和CC中的功能,证明了其过表达及其与特定的免疫细胞浸润模式的关联。此外,CDK1突变负担,拷贝数变化和患者生存分析表明,CDK1可能是有用的预后标记。最后,免疫组织化学检查证实了某些候选基因在临床样品中的表达。结论:这些发现阐明了OC和CC的分子原因,并将有助于确定有关这些癌症的未来研究的新目标,包括它们的诊断和治疗。
头颈癌在全球恶性肿瘤中排名第七[1,2],其中90%以上的恶性肿瘤是来自该地区粘膜表面的头颈部鳞状细胞癌(HNSC)[1,2]。在手术,放疗和化学疗法仍然是主要治疗方式,因为它们可以增强临床环境中的患者预后,但晚期病例仍然表现出50%的复发率,并具有威胁生命的后果[3]。这种高复发率可以部分归因于复杂的肿瘤微环境(TME),该环境包括各种肿瘤免疫浸润细胞(TIICS)和其他成分以及癌细胞和基质细胞以及其他成分[4]。基于最近文献中TME的研究,新兴的免疫检查点抑制剂(ICIS)显示出有望改善精选患者的预后[3]。然而,限制仍然是,只有少数患者从ICI中获得益处,因此需要在临床实践中鉴定更有效的治疗靶标[5,6]。
宫颈癌(CCa)仍然是全球重大的公共卫生问题,早期诊断和治疗至关重要。此外,其发病机制背后的分子机制仍未完全阐明。F2RL1 与各种肿瘤密切相关。然而,它与 CCa 的关系尚不清楚。我们从 TCGA 数据库中访问了 309 名被诊断为 CCa 的患者的数据。Limma 包促进了差异表达分析以识别差异表达的 mRNA(DEmRNA)。通过 XIANTAO 数据库进行生存分析和 ROC 分析。通过 ImmPort 数据库分析将免疫相关基因与 F2RL1 相关基因一起识别。使用 GO、KEGG 和 GSEA 进行功能富集分析。我们收集了参与者的宫颈细胞和血清以检测 HPV 和 TCT,然后使用 qPCR 检查 F2RL1 mRNA 表达水平。我们还通过 WB 和 ELISA 技术验证了 F2RL1 蛋白的表达。我们的研究发现了一个有趣的现象:与正常组织相比,CCa 组织中 F2RL1 的表达水平明显升高,显示出不同病理类型之间存在有趣的差异。此外,高 F2RL1 表达与总生存期 (OS)、无进展间隔 (PFI)、无进展生存期 (PFS) 的降低有关。F2RL1 以 0.996 的 AUC 震撼了 ROC 分析。此外,F2RL1 表达水平对不同 N 阶段、病理组织类型、治疗状态和种族群体的 CCa 有显著影响,使我们能够开发出一个预测模型。此外,我们还确定了 43 个免疫相关基因。富集分析突出了它们与细胞运动和 T 细胞活化相关通路的关联。通过分析,我们发现 F2RL1 表达与大多数免疫细胞(特别是 TFH 和细胞毒性细胞)的浸润呈反比,这表明可能与 CCa 的免疫逃避有关。分子生物学实验也证实了F2RL1在宫颈脱落细胞和血清中的表达显著增加。本研究首次揭示了F2RL1在CCa中的预测和早期检测意义及其与免疫浸润的相关性。F2RL1与CCa的进展密切相关,可以作为CCa患者早期诊断和预后的生物标志物。
胆管癌(CCA)是一种高度致命的恶性肿瘤,是肝胆系统中最常见的腺癌。pgm2l1属于α-D-磷酸化酶超家族,作为葡萄糖1,6-双磷酸(G16BP)合酶的作用。越来越多的证据可以提供其与癌症代谢和进展的关联。然而,PGM2L1在CCA发育中的分子机制仍然缺乏证据。在这项研究中,我们发现PGM2L1表达高的CCA患者预后最差。我们确定了PGM2L1基因中的两个甲基化位点(CG15214137和CG03699633)及其预后相关性。我们进一步研究了PGM2L1表达与肿瘤浸润的免疫细胞之间的关系,特别关注CCA中性粒细胞。功能富集分析进一步表明,高PGM2L1表达与Wnt信号通路,糖酵解代谢和中性粒细胞的募集有关。共同表明,PGM2L1可以用作独立的预后生物标志物,并且与CCA中的肿瘤免疫浸润和代谢重编程密切相关。