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在药物治疗过程中,药物通过靶向基因、RNA 和通路影响细胞的作用和反应,药物-靶标相互作用对于阐明药物作用机制和促进药物研发至关重要。目前,存在许多药物-靶标相关数据库,但它们在结构和功能上相互独立,缺乏一致性。在 HCDT 1.0 中,我们收集了高度可信的药物与靶基因相互作用。在此基础上,我们开发了 HCDT 2.0,这是一个更新版本,它整合了药物-基因数据,并扩展到包括涉及药物-RNA 和药物-通路的相互作用。它涉及 20 个药物相关数据库,使用一致的标识符对药物、RNA、基因和通路名称进行标准化,以确保数据的一致性。在 HCDT 2.0 中,共识别出 1,304,370 个高可信度药物-靶标相互作用,其中包括 678,564 种药物与 7,297 个基因之间的 1,244,791 个相互作用、316 种药物与 6,430 个 RNA 之间的 11,770 个相互作用以及 6,290 种药物与 3,143 个通路之间的 47,809 个药物-通路相互作用。它将在预测药物疗效和不良反应、开发新型治疗策略和促进药物再利用方面发挥重要作用。
量子密钥分发 (QKD) 使两个远程方之间能够进行密钥交换,其信息论安全性植根于量子物理定律。将密钥信息编码为连续变量 (CV),例如光相干态的正交分量的值,使实现更接近标准光通信系统,但这是以低信噪比操作所需的数字信号处理技术的复杂性为代价的。在这项工作中,我们希望通过提供高度模块化的开源软件来降低与此困难相关的 CV-QKD 实验的进入门槛,该软件原则上与硬件无关,可用于多种配置。我们使用带有本地生成的本地振荡器、频率复用导频和 RF 异差检测的实验装置对这款名为 QOSST 的软件进行了基准测试,并在渐近极限下获得了城域距离上 Mbit/s 数量级的最先进的密钥速率。我们希望 QOSST 可用于促进 CV-QKD 的进一步实验进展,并由社区改进和扩展,以在各种配置中实现高性能。
基因组对于理解微生物生态学和进化至关重要。高通量、长读长 DNA 测序的出现使得从环境样本中大规模恢复微生物基因组成为可能。然而,由于这些环境极其复杂,扩大土壤和沉积物的微生物基因组目录一直具有挑战性。在这里,我们对在丹麦收集的 154 个土壤和沉积物样本进行了深度、长读长纳米孔测序,并通过优化的生物信息学流程恢复了 15,314 个新微生物物种的基因组,其中包括 4,757 个高质量基因组。恢复的微生物基因组涵盖 1,086 个新属,并为 612 个先前已知的属提供了第一个高质量参考基因组,将原核生物生命树的系统发育多样性扩大了 8%。长读长组装体还能够恢复数千个完整的 rRNA 24 操纵子、生物合成基因簇和 CRISPR-Cas 系统,而这些系统在之前的陆地基因组目录中都未被充分代表且高度碎片化。此外,将恢复的 MAG 整合到公共基因组数据库中可显著提高土壤和沉积物宏基因组数据集的物种级分类率,从而增强陆地微生物组表征。通过这项研究,我们证明了长读长 29 测序和优化的生物信息学能够以经济高效的方式从高度复杂的生态系统中恢复高质量的微生物 30 基因组,而生态系统仍然是最大的未开发生物多样性来源,可用于扩展基因组数据库和填补生命之树的空白。32
成功的关键之一是尽早决定在他们技能有限的业务领域寻求帮助。克里斯蒂安和朱莉娅向在环境、社会和治理 (ESG)、食品行业、通信和公关、技术、自动化和风险投资法方面经验丰富的顾问提供了公司的小部分股权。这样做的好处不仅是提供建议和降低业务发展风险,而且还能建立远超他们自己的人脉网络。
价值主张大多数细胞毒性和靶向治疗方法都通过细胞凋亡的线粒体途径杀死细胞,这可能导致某些患者同类的获得化学耐药性和治疗失败。通过小分子筛选采取公正的方法已将HDAC6确定为耐凋亡的TNBC细胞中的新治疗靶标。这代表了从常规方法转向TNBC药物发现的范式转变,该发现主要或没有故意有效地在识别通过线粒体凋亡机制杀死的治疗剂迅速发展化学抗性。我们的代表性小分子铅化合物BAS-2(MW <300)是铅优化的有吸引力的候选者,并且正在进行医学化学计划,以实现临床前研究的进展。其他未发表的数据还表明,在神经退行性疾病中,BAS-2作为HDAC6靶向治疗的潜力。
1美国约翰·霍普金斯大学生物物理学系,马里兰州巴尔的摩21218,美国2霍华德·休斯医学研究所和蜂窝和分子医学的医学研究所和计划约翰·霍普金斯大学生物学,马里兰州巴尔的摩,21218,美国5 Sharp Diagnostics,1812 Ashland Avenue,Baltimore,马里兰州21205,美国6美国6儿科学院,马萨诸塞州波士顿,马萨诸塞州,美国马萨诸塞州,02115,美国,美国,美国02115 (PCR)需要热循环以熔化DNA,并进行随后的指数扩增所需的DNA合成循环。以前,我们以增强的加工性和速度设计了一种超螺旋酶,以替代酶促DNA替代这种传统的PCR熔融步骤,同时保留所需的PCR特性,例如多-KB扩增子大小以及对克隆和基因编辑结果评估的适用性。这种等温扩增方法被称为Sharp(SSB-螺旋酶辅助快速PCR),因为单链DNA结合蛋白(SSB)和超螺旋酶被添加到标准的PCR试剂中。在这里,我们表明Sharp对于PCR无法放大或产生副产物的DNA序列有效。夏普被证明能够扩增多达601个核小体定位序列的六个相同的重复序列,并最多可扩大35个相同的Ankyrin序列重复序列。我们还表明,可以使用SHARP进行扩增91%AT-含量的序列,并且可以使用单分子光学镊子实验来验证放大产品。
使用用石墨烯纳米复合材料从固体废物制备的石墨烯纳米复合材料中去除高度爆炸性的三硝基醇的痕迹:循环经济的一个例子