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靶向高通量测序在感染性疾病中应用与实践专家共识
靶向二代测序在传染病应用与实践专家共识 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会 通讯作者：王晖，北京大学人民医院检验科，北京 100044，Email：whuibj@163. com；曹斌，中日友好医院呼吸与危重症医学科，北京 100029，Email：caobin_ben@163.com 【摘要】靶向二代测序（tNGS）技术通过设计特异的引物或捕获探针来检测临床样本中的病原微生物及耐药基因，为传染病的诊断、治疗和监测提供依据。但目前tNGS和宏基因组二代测序（mNGS）的临床应用场景尚不明确，不同厂家的tNGS系统质量和结果差异很大。该技术的临床适应症、实验室流程、质量控制、性能验证和报告解释等都亟待制定共识和标准。为规范tNGS在传染病领域的应用与实践，中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会的微生物学、传染病、呼吸道疾病、流行病学等领域的专家针对上述问题进行了探讨，撰写了tNGS在传染病领域应用与实践专家共识。
特色课程说明（生物信息学讲座）
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高通量锂离子电池研究
zainab.alansari@utas.edu.om *通信：riyaz@gpcet.ac.in收到：2023年4月16日；接受：2023年6月20日；发表：2023年7月1日摘要：在本文中，我们介绍了一种新的方法，用于使用主成分分析（PCA）和逻辑回归（LR）的组合来预测糖尿病的风险。我们的方法提供了一种独特的解决方案，可以导致对糖尿病风险的更准确和有效的预测。要开发一个预测糖尿病的有效模型，重要的是要考虑有助于疾病发育的各种临床和人口统计学因素。这种方法通常涉及在包括这些因素的大型数据集上训练该模型。这样做，我们可以更好地理解不同的特征如何影响糖尿病的发展，并为处于危险中的个人创造更准确的预测。采用PCA方法来减少数据集的尺寸并增强模型的计算功效。LR模型然后将患者分为糖尿病或非糖尿病患者。准确性，精度，召回，F1得分和ROC曲线下的面积（AUC）只是用于评估所提出模型性能的少数指标。PIMA印度糖尿病数据（PIDD）用于评估模型，结果证明了对最新方法的显着改善。该建议的模型提出了一种预测糖尿病风险的有效方法，这可能对改善医疗保健结果和降低医疗保健成本具有重要意义。所提出的PCA-LR模型优于其他算法，例如SVM和RF，尤其是在精度方面，同时优化了计算复杂性。这种方法可能有可能为大型糖尿病筛查计划提供实用有效的解决方案。
基于高通量定量PCR
Aurore Loquet，RémiLeGuern，Teddy Grandjean，Claire Duboyez，Marvin Baudin等。基于高促销定量PCR的孕妇，用于孕妇的Bacertill阴道病诊断的克拉斯菌和回归树。分子诊断杂志，2021，23（2），pp.234-241。10.1016/j.jmoldx.2020.11.004。hal-03311394
高通量从头计算
现有技术要求便携式能源。此类能源应安全、廉价、高效、紧凑且环保。在过去二十年中，锂离子电池在移动电子设备和电动汽车方面取得了令人瞩目的进步 [1,2]。该技术的飞跃得益于锂导电材料的卓越性能，尤其是高能量密度。与此同时，研究人员一直在探索大量用于储能应用的新材料以及提高固态电池性能（比能、循环性等）的途径 [3-8]。另一方面，电池安全性仍然是设计新材料的基石（还记得 2013-2014 年波音商用飞机上发生的电池起火事件）。影响搜索的另一个原因是缺乏用于大规模应用的锂（例如，用于可再生能源的电网储能系统）[9]。这导致人们积极探索钠、钾、铝导电材料作为替代锂导电材料的有希望的候选材料。
一个具有高通量
我们提出了一个用基于晶格的加密性加固的量子后区块链。使用的数字签名算法可确保对量子计算带来的安装威胁的安全性。其加密算法是为整个网络构建完全同态加密（FHE）计算的构建。该授权区块链节点以其加密形式正确处理交易，而在不了解其明文内容的情况下，仅保留独家的解密特权，仅保留给单个资产持有人，以明文授予他们访问其交易详细信息。我们还提出了一项优化的拜占庭式容忍度consus协议，展示了该系统实现每秒30,000笔交易的潜力。我们还提出了一个本机虚拟麦酸（VM），旨在支持诸如加法，减法，比较和密钥切换之类的主要操作。此内在功能使用户有能力开发任意计算逻辑，从而促进了对加密数据的执行。此VM不仅促进了交易的合成性，而且还坚持区块链生态系统内的机密性，中央集权和反审查措施的基本宗旨。我们的合规方法是双重的：单个资产持有人可能会在明文中对其交易历史进行潜在的审查，同时在网络层面上，管理实体保留了整体交易历史记录的加密存储库。管理实体具有解密密钥，可以根据需要揭幕交易详细信息。这种双层分层可确保对我们系统内的合规措施的细微差别遵守。
高通量成像优先级 - ...
人类遗传学是加速目标选择并增加药物开发成功的可能性的强大工具。对疾病的遗传基础的越来越多的理解提供了识别可能针对潜在分子病理和发展疾病修饰疗法的靶标。在这里，我们开发了一个工作流程，以测试来自高吞吐量筛选（HTS）中人类遗传学的感兴趣基因（GOI）。使用有关心脏结构，功能和疾病风险的公开可用的人遗传数据，我们优先考虑100多个心肌病疾病的靶标。siRNA和AAV-ORF文库，以促进人类诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞（HIPSC-CMS）和心脏成纤维细胞（CF）中这些基因的敲低或过表达。开发了两个定制的MATLAB HTS图像处理脚本，称为“ tamarack”和“豪猪”，用于量化HIPSC-CM肉瘤形态和CF激活，分别使用小波转换来检测亚细胞结构。tamarack可以量化肌节计数，长度和方向。豪猪能够定量成纤维细胞激活指标，包括α-平滑肌肌动蛋白，应力纤维计数，长度，方向，核α-SMA重叠和F-肌动蛋白α-SMA重叠。我们确定了CM和CF屏幕的最高命中，以进行进一步的分析。
高通量锂离子电池研究
可用的电池测试通道可能会部分解释为什么某些电池材料性能研究仅包含少数重复的数据。但是，与电解质配方，处理电极和电池组装相关的人体错误会导致电池性能变化。为了依靠结果，应最大程度地减少细胞间的可变性。Dechent等人的研究。10提出至少9个重复，以便能够使用一个参数来构建电池老化模型。系统的复杂性在很大程度上影响了提供可靠结果所需的重复数量，以使系统中的各种效果和反应分解。此外，主动学习和机器智能决策是o的，加上自动化，以形成“闭环”研究方法，在此之前，所有先前完成的步骤/实验都会为以下步骤提供信息，从而消除了古老的“试验和纠正”方法。2,11 - 13对于新的电池材料发现，闭环实验可以快速优化设计空间内的材料选择，发现比随机过程快的速度更快，并且经验更少。14在闭环方法中，高通量筛选使用自动化或半自动设置，以允许以高速率自动测量DE ned设计子空间。15高通量筛查的成功是显而易见的；杨等。16使用高通量光学测量来识别三阵金属氧化物组成空间中的区域，其光学趋势不是简单的相混合物，而McCalla等人。17证明了一个工作 - 能够每周同时收集数百种X射线差异模式和电化学阻抗光谱光谱。在这项工作中，我们描述了在环境实验室环境中用于电解质配方，组装和循环的电解质配方，组装和循环的自动机器人设置。在环境气氛中工作比保持干燥的室的成本效率要高得多，该室有可能用电池材料允许环境氛围打开未铺设的电解质设计空间。我们的功能和易于修改的设置可以适应不同的系统（例如非水电器的非水解）；可以在维护，调整或增强功能的同时轻松地集成硬件组件的添加或去除，以将Odacell描述为模块化设置。使用Odacell进行多种化学的可能性概括了其探索液体电解质的高研究潜力的适用性，由于庞大的设计空间，这仍然是对光学的挑战。13到达这一目标，这项工作的目标是（1）设计和构建具有电解质配方和分配能力的可效率的，模块化的电池组装和测试设置，（2）确定细胞对细胞之间的可变性以及在环境氛围中组装的单元系统的可变性，以及在环境中组装的细胞，并表明设置的实用性和性能，（3），（3）溶剂，即在全细胞结合中的水和二甲基亚氧化二甲基氧化二甲基。
高通量 - 电子化学特征 -
图2：0.1 M DPPEAQ pH 14对称细胞的CV循环（4.0 mL CLS vs 6.0 mL NCL）。（a）基于时间和循环容量的半神志图； （b）循环过程中的细胞和手套箱温度； （c）库仑效率。