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鲍曼不动杆菌 IC2 和 IC5 分离株与 Co ...
1 墨西哥国立自治大学医学院实验医学研究单位感染学、微生物学和临床免疫学实验室，墨西哥城 06720，墨西哥； juliamorenomanjon@gmail.com（JM-M.）; catalina_gayosso@yahoo.com.mx（CG-V.）； joseluis_f@hotmail.com (JLF-V.) 2 墨西哥国家政治科学研究所生物科学研究生院医学细菌学实验室，墨西哥城 11350，墨西哥 3 墨西哥国立自治大学遗传进化项目，库埃纳瓦卡 62209，墨西哥； iago@ccg.unam.mx（SC-R.）； vmateo@lcg.unam.mx (VM-E.) 4 牛津大学生物系，牛津 OX1 3SZ，英国； keith.jolley@biology.ox.ac.uk （KAJ）； martin.maiden@biology.ox.ac.uk (MCJM) * 通信地址：sgiono@yahoo.com (SG-C.); alcantar@unam.mx (MDA-C.)
基于CRISPR的基因编辑鲍曼尼（Baumannii
摘要：抗菌素抵抗（AMR）在全球范围内对健康，社会，环境和经济部门构成了显着威胁，并且需要认真关注解决这一问题。鲍曼尼氏杆菌在传染性细菌中被赋予了头等大事，因为它几乎对所有抗生素类别和治疗选择都具有广泛的耐药性。耐碳青霉苯甲酸杆菌的baumannii被分类为世界卫生组织（WHO）优先级的抗生素耐药菌细菌的重点清单之一。尽管可用的遗传操纵方法在鲍曼尼曲霉的实验室菌株中取得了成功，但在新获得的临床菌株中使用时，它们受到限制，因为这种菌株的AMR水平高于用于选择它们进行基因操作的AMR。最近，CRISPR-CAS（群集定期间隔短的短粒子重复序列/CRISPR相关蛋白）系统已成为基因组编辑的最有效，最有效，最精确的方法之一，并提供了靶标针对AMR基因在特定的细菌菌株中的AMR基因。基于CRISPR的基因组编辑已成功应用于各种细菌菌株中以对抗AMR。但是，在鲍曼曼尼（A. Baumannii）中尚未广泛探索该策略。本评论提供了详细的见解，了解CRISPR-CAS使用对A. Baumannii中与AMR相关的基因操纵的进度，现有情况和未来潜力。
肽聚糖编辑在细菌战中为鲍曼不动杆菌提供免疫力
肽聚糖 (PG) 在大多数细菌中是必需的。因此，它经常成为各种攻击的目标，包括通过 VI 型分泌系统 (T6SS) 的细菌间攻击。本文中，我们报告了革兰氏阴性细菌鲍曼不动杆菌菌株 ATCC 17978 在稳定期产生、分泌并将非规范 d -氨基酸 d -赖氨酸掺入其 PG 中。我们表明，PG 编辑通过提供针对各种细菌竞争对手的肽聚糖靶向 T6SS 效应物的免疫力，提高了鲍曼不动杆菌在细菌战中的竞争力。相反，我们发现 d -Lys 的产生不利于致病机制，至少部分原因是人类酶 d -氨基酸氧化酶 (DAO) 的活性，它会降解 d -Lys 并产生对细菌有毒的 H 2 O 2。系统发育分析表明，鲍曼不动杆菌的最后共同祖先具有产生 d -Lys 的能力。然而，这种特性已独立丧失多次，可能反映了鲍曼不动杆菌作为人类病原体的进化。
抗碳青霉苯甲酸杆菌鲍曼尼（Baumannii）：生物膜 -
摘要：这项研究旨在研究抗碳青霉培养素的生物膜产生能力鲍曼尼（Baumannii）（CRAB）（CRAB），70％乙醇和0.5％钠次氯酸钠的生物膜膜片潜力在生物膜产生和细菌基因型之间。测试了总共111个螃蟹分离株的抗菌易感性，生物膜形成，编码碳青霉酶的基因的存在以及与生物FILM相关的毒力因子。还测试了消毒剂和SENP对CRAB分离株的抗纤维膜作用。绝大多数测试的分离株是生物膜生产者（91.9％）。在57％，70％和76％的螃蟹分离株中发现了BAP，OMPA和CSUE基因，与非生物产生的生产者（25％）相比，在生物纤维生产国（78.6％）中，CSUE在生物纤维生产国（78.6％）中的普遍性更高。测试的消毒剂比对弱生产者的抗纤维膜对中度和强生物膜产生的影响更好（p <0.01）。SENP对所有测试的浮游症状（MIC范围：0.00015至> 1.25 mg/ml）和生物纤维膜包含的蟹表现出抑制作用，最低生物膜抑制浓度低于0.15 mg/ml，生物纤维抑制浓度低于0.15 mg/ml。总而言之，SENP可以用作有前途的治疗和医疗设备涂料剂，因此是预防生物膜相关感染的替代方法。
鲍曼不动杆菌对 d-甘露糖敏感的菌毛与生物膜形成和粘附在呼吸道上皮细胞上有关
摘要背景/目的：鲍曼不动杆菌是一种重要的院内病原体。为了更好地了解鲍曼不动杆菌 CsuA/BABCDE 菌毛在毒力中的作用，进行了细菌生物膜形成、粘附和碳水化合物介导的抑制研究。方法：克隆鲍曼不动杆菌 ATCC17978 的 CsuA/BABCDE 菌毛产生操纵子（简称 Csu 菌毛），以分析非生物塑料平板上的生物膜形成、细菌对呼吸道上皮人 A549 细胞的粘附和碳水化合物介导的抑制。用于抑制生物膜形成和对 A549 细胞粘附的碳水化合物包括单糖、吡喃糖苷和甘露糖聚合物。结果：将鲍曼不动杆菌ATCC17978的Csu菌毛克隆表达到不产生菌毛的大肠杆菌JM109中，并将其敲除。在电镜和原子力显微镜下观察大肠杆菌JM109/rCsu菌毛产生克隆上重组Csu（rCsu）菌毛丰富，而Csu敲除的鲍曼不动杆菌ATCC17978
鲍曼不动杆菌 ST374 的基因组见解揭示了广泛且不断增加的耐药组和病毒组
基于 WGS 的监测大大提高了追踪临床相关病原体多药耐药克隆的全球传播和出现的能力。在本研究中，我们对属于序列类型 ST374 的鲍曼不动杆菌 (菌株 Ac56) 进行了基因组表征和比较分析，该菌株于 1996 年首次在巴西分离。Ac56 的基因组分析预测了总共 5373 个基因，其中 3012 个基因在来自欧洲、亚洲、北美和南美国家的 ST374 鲍曼不动杆菌分离株的九个基因组中是相同的。GoeBURST 分析将 ST374 谱系分为克隆复合体 CC3（国际克隆 IC-III）。ST374 克隆的抗性基因组分析预测了与重金属和临床相关的 β-内酰胺类和氨基糖苷类抗生素耐药性相关的基因。在这方面，在两种密切相关的鲍曼不动杆菌菌株中，内在的 bla ADC 基因与插入序列 IS Aba1 相关；包括 Ac56 菌株，该基因可能与对美罗培南的中等敏感性相关。其他四种耐卡巴培南的鲍曼不动杆菌菌株携带 IS Aba1/bla OXA-23 基因阵列，该基因阵列与转座子 Tn 2008 或 AbaR4 型耐药岛中的 Tn 2006 相关。虽然 ST374 的鲍曼不动杆菌菌株大多数毒力基因是相同的，但来自泰国的三种分离株含有 KL49 荚膜基因座，该基因座先前在高毒力鲍曼不动杆菌 LAC-4 菌株中发现。对三十四种预测质粒的分析显示八个主要组，其中 GR-6（LN − 1）和 GR-2（LN − 2）占主导地位。所有菌株（包括最早的分离株 Ac56）都含有至少一个完整的原噬菌体，但未检测到任何 CRISPR 相关 (cas) 基因。总之，A. baumannii ST374 的基因组数据显示该谱系有潜力成为成功的克隆。
在鲍曼尼杆菌中描绘了针对GACS传感器激酶的免疫主导抗原疫苗肽：一种硅硅含量研究方法
结果：从137个表位中选择了最高分数的九种肽（20AA），并将五个肽视为抗原表位（E1 – E5）。E3作为有效抗原（得分：0.939537）和E1作为最佳疫苗候选者（得分：0.9803）。Solpro将所有表位视为可溶性肽。Protparam预测显示E3和E5作为稳定蛋白，保质期为3.5和1.9 h，具有负肉汁值。PSORTB服务器预测GACS蛋白序列作为细胞质膜蛋白的最终定位评分为7.88。IEDB保护分析显示，GACS序列中的100％保守序列，I类保护均为所有表位产生正值。聚类分析显示出很强的相互作用，并且与TLR-2最终检测到的E5的蛋白质肽相互作用是最佳相互作用的肽（H键= 14），其次是E3（H键= 12）。
不动杆菌_鲍曼杆菌.pdf
由 PACHON IBAÑEZ MARIA EUGENIA - 48806201V 数字签名 识别名称 (DN)：c=ES、serialNumber=IDCES-48806 201V、givenName=MARIA EUGENIA、sn=PACHON IBAÑEZ、cn=PACHON IBAÑEZ MARIA EUGENIA - 48806201V 日期：2020.04.23 09:13:44 +02'00'
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