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RCSM的临床验证：一种快速敏感的CRISPR-CAS12A测试，用于从唾液中检测SARS-COV-2的分子检测
秘鲁的持有全球人均死亡率最高。这一结果的关键是缺乏可靠，快速和准确的分子测试，无法通过RT-QPCR避免SARS-COV-2检测的成本和物流的升高。为了促进在农村和社会经济剥夺的环境中进行大规模和及时的共同测试，我们实施并验证了RCSM，这是一种快速而敏感的CRISPR-CAS12A测试，用于从唾液中对SARS-COV-2进行分子检测。rcsms使用CRISPR-CAS技术和横向流条的功能，即使在设备有限的实验室中，即使在实验室中，SARS-COV-2也很容易地可视化。我们表明，使用TCEP/EDTA进行低成本的热化学处理足以使唾液中的病毒颗粒和细胞核酸酶失活，从而消除了需要用商业试剂盒提取病毒RNA的需要，以及笨拙的鼻咽猪咽swab手术和生物液级别的需求，以及生物液级别的2级实验室。值得注意的是，在利马两家医院进行的352名患者进行的临床验证中，RCSM在40分钟内检测到每10μL反应的352例患者，其灵敏度和特异性分别为96.5％和99.0％，相对于RT-QPCR。从该字段验证获得的负和正预测值表明，RCSM可以自信地部署在高和低患病率设置中。与其他基于CRISPR-CAS的生物传感器一样，RCSM可以轻松地重新编程以检测新的SARS-COV-2变体。我们得出的结论是，RCSM是RT-QPCR的快速，高效且廉价的替代品，用于扩大秘鲁和其他低收入和中低收入国家的COVID-19测试能力，具有不稳定的医疗保健系统。
肺炎链球菌血清型33G
抽象肺炎链球菌（肺炎球菌）是一种人类病原体，负责肺炎，败血症和脑膜炎等多种疾病。胶囊是主要的肺炎球菌毒力因子，由盖帽小多糖（CPS）基因座编码，这是一种重组热点，已导致迄今为止确定的100多种不同的帽多糖类型（血清型）。最近，提出了33倍（也称为10倍）作为推定的新型血清型，但胶囊结构尚未阐明。在这里，我们提供了33倍的深入研究，证明它是一种新的肺炎球菌血清型。在这项研究中，我们在2015年至2022年期间收集了来自健康儿童和肺炎患者（成人和儿童）的12,850名鼻咽拭子（成人和儿童）。我们确定了20个肺炎球菌33x分离株。使用整个基因组测序，我们发现33x CPS基因座是来自肺炎球菌血清群35、10和33的基因的嵌合体以及其他链球菌。通过Quellung反应对33倍肺球运动的血清分型揭示了独特的血清学特征，键入为10b和33b。竞争ELISAS证实，针对33倍的小鼠产生的抗体受到33倍肺炎球菌的抑制，而不是10b或33b。Lastly, the elucidation of the 33X capsule structure revealed that the polysaccharide is distinct from other serotypes, consisting of an O-acetylated hexasaccharide repeat unit of → 5)-β-Gal f -(1 → 3)- β-Glc p -(1 → 5)-β-Gal f 2Ac-(1 → 3)-β-Gal p NAc-(1 → 3）-α-gal p-（1→4）-rib-ol-（5→P→。因此，33倍符合必要的遗传，血清学和生化标准，该标准被指定为一种新的血清型，我们将其命名为33G。
辅助亚基鼻内疫苗减少SARS-COV ...
阻止病毒传播是有效疫苗的重要功能。从公共卫生的角度来看，防止SARS-COV-2向其他易感人士传播至关重要。但是，大多数Covid-19-19疫苗临床试验仅研究了疫苗受体的安全性和保护，但不能预防向他人传播。的确，当前有执照的SARS-COV-2疫苗成功地减轻了19次与19例相关的住院和死亡，但对收购感染和继续传播的有效性较小（1-3）。尽管对SARS-COV-2突破性感染的研究表明，在未接种疫苗的个体中，疫苗突破性感染的感染性不及原发性感染（4，5），但这些疫苗对降低传播性的影响尚未得到很好的评估。作为SARS-COV-2传播主要是通过鼻咽传播，粘膜免疫可以潜在地降低或流产入口门户（Nasopharynx）的SARS-COV-2复制，以防止病毒传播给其他人。当前疫苗的鼻内给药导致与SARS-COV-2感染的结果不一致（6，7）。辅助亚基粘膜疫苗可诱导上和下呼吸道中剧烈的粘膜免疫（8-10），并且比给定的（IM）给定的类似亚基疫苗（IM）更有效地清除上呼吸道病毒，它可能具有更好地降低SARS-COV-2上的SARS-COV-2。作为SARS-COV-2病毒可以有效地在仓鼠之间传播，这代表了更自然的剂量和感染/传播的途径（11）。在这里，我们评估了辅助亚基疫苗（SARS-COV-2 SPIKE S1+S2+S2差异D614G和B.1.1.529在dotap纳米颗粒中以及辅助物质poly I：CPG，CPG和重组型鼠类的传播都可以保护固有的hamarsic-sars-sars-sars-cov in n o sarsic cov in n nanoparticles in dotap纳米颗粒中是否可以在辅助I：CPG和重组型较高的模型中。 疫苗。
表 1 COVID-19 患者特征
在这项描述性回顾性研究中，我们旨在描述这些患者的严重程度和死亡率相关特征以及免疫调节药物对感染病程的影响。研究对象为 2020 年 2 月 25 日至 2020 年 6 月 8 日期间在拉巴斯大学医院风湿病科就诊的患有 COVID-19 感染和风湿性炎症疾病的患者。共纳入 122 名患者。其中 100 名（82.0%）通过鼻咽拭子确诊。22 名患者（18.0%）表现出相符的症状，且肺部影像学检查结果相符和/或血清学检查呈阳性。患者特征如表 1 所示。单因素分析显示（表2），与住院相关的变量包括年龄（5年间隔；OR 1.34，95% CI 1.17-1.55）、泼尼松剂量>5mg/天（OR 2.55，95% CI 1.07-5.59）、慢性肺部疾病（OR 5.34，95% CI 1.47-19.35）和高血压（OR 4.06，95% CI 1.79-9.19）。住院的独立危险因素是甲氨蝶呤（OR 2.06，95% CI 1.01-5.29）和年龄（5年间隔；OR 1.31，95% CI 1.11-1.48）。未发现与羟氯喹、其他常规抗风湿药物 (cDMARDs)、靶向合成抗风湿药物或生物抗风湿药物 (bDMARDs) 或实验室参数有任何关联。甲氨蝶呤治疗与年龄、性别、糖皮质激素或风湿病亚型无关。14 名患者 (11.5%) 死于呼吸衰竭。9 名患者使用 cDMARDs（单药或联合治疗），1 名使用 bDMARD（利妥昔单抗），4 名仅服用口服糖皮质激素。羟氯喹在死亡率方面没有差异。单变量分析显示，与死亡率相关的因素包括年龄（OR 1.60，95% CI 1.20-2.01）、动脉高血压（OR 12.17，95% CI 2.58-57.38）、
Panther Fusion SARS的多中心临床评估
摘要由于严重的急性呼吸综合症冠状病毒-2（SARS-COV-2），流感A/B病毒和呼吸道合胞病毒（RSV），症状与呼吸道感染重叠。准确检测对于适当的医疗管理决策至关重要。这项研究评估了来自所有年龄段的个体的鼻咽拭子（NPS）标本中Panther Fusion SARS-COV-2/FLU A/B/RSV测定法的临床性能，该标本具有与COVID-19，流感或RSV一致的呼吸感染症状和呼吸感染症状。回顾性已知阳性和前瞻性获得的残留NPS标本。通过将Panther Fusion SARS-COV-2/流感测定结果与SARS-COV-2的三分子测定复合比较器解释以及所有非SARS-COV-2目标的SARS-COV-2/FLU和FDA清除的Panther融合流感A/B/RSV测定结果进行比较，建立了临床性能。分析中总共包括1,900名前瞻性和95个回顾性NPS规格。SARS-COV-2的预期标本的总体患病率为20.7％，流感为6.7％，RSV为0.7％；所有流感B阳性标本都是回顾性标本。SARS-COV-2的Panther Fusion Assay的正百分比一致性为96.9％（378/390），流感型A型病毒为98.0％（121/123），流感B Virus为95.2％（20/21），用于RSV的RSV，为96.6％（57/59）。所有目标病毒的负百分比一致性为≥98.5％。带有不一致的Panther Fusion SARS/FLU/RSV测定结果的标本均具有周期阈值≥32.4（通过比较器或Panther Fusion SARS/FLU/RSV测定）。在研究标本中仅检测到五个共同限制。Panther Fusion SARS-COV-2/FLU/RSV测定法提供了NPS标本中的SARS-COV-2，流感病毒，流感B病毒和RSV的高度敏感和特异性检测。
菌株对元基因组数据的知情解释可以使上空气道微生物组的应变保留分析
抽象的shot弹枪元基因组测序有可能提供细菌应变水平的分辨率，这对于解决许多临床问题至关重要。尽管可以使用实现应变水平的生物信息学工具，但需要进行彻底的基准测试，以验证其用于较少研究和低生物质微生物组（如上呼吸道中的生物量微生物）的使用。我们分析了先前发表的数据集，这些数据集是从孟加拉国婴儿（微生物群和健康研究）和来自瑞士囊性纤维化儿童的口咽样品的新型数据集的纵向收集的鼻咽样样品。来自细菌培养物的数据用于对菌株3的参数进行基准测试，这是一种用于应变水平分辨率的生物信息学工具。此外，将菌株3的结果与从Strainge和新得出的全基因组测序数据中得出的Metage Notic组件进行了比较。优化分析参数后，我们比较了菌株3的结果与培养金标准方法，并实现了87％（链球菌肺炎链球菌），80％（莫拉氏菌Cartarrhalis），75％，75％（嗜血杆菌）和57％（57％）（57％的葡萄球菌AUREUSNASNASEFRENN），HERISN NASEFREN NASEFREN NASEFREN N.NASEFREN N.NASEFREN N. ）和46％（金黄色葡萄球菌），用于260个口咽样品。比较50 s的核心基因组的系统发育树。金黄色葡萄球菌分离株，由菌株3产生的相应标记基因树发现，除三个样品外，所有除三个样品外，都有相似的相似性，表明有足够的应变分辨率。总而言之，菌株3的结果与细菌培养物的数据进行比较表明，尽管仔细优化参数以适合低生物量微生物组时，宿主DNA的含量较高，但呼吸微生物组的应变水平跟踪是可行的。
s41375-023-01938-5.pdf
致编辑： 2022 年，第 9 届欧洲白血病感染会议 (ECIL-9) 发布了血液系统恶性肿瘤 (HM) 和造血细胞移植 (HCT) 患者严重急性呼吸道综合征感染 (SARS-CoV-2) 和疾病 (COVID-19) 管理指南 [ 1 ]。2022 年，由于公共卫生和社会措施的积极作用、大规模疫苗接种运动、抗病毒药物和抗刺突单克隆抗体 (MoAbs) 的可用性，全球流行病学、发病率和死亡率与大流行前两年相比有所改善 [ 2 ]。这些成就在一定程度上受到令人担忧的高度传染性变种的不断出现的阻碍，这些变种逃脱了通过感染或疫苗接种获得的免疫力。考虑到这些重大变化，2022 年 9 月 14 日至 15 日在法国尼斯举行的 ECIL-9 会议上更新了 SARS-CoV-2/COVID- 19 建议，并在 ECIL 网页上发布（https://www.ecil-leukaemia.com/en/program）。表 1 显示了关于预防、诊断、疫苗接种和治疗的最新建议。在预防部分，新增的建议强调了根据个体风险/收益比评估，个性化决定推迟化疗、造血干细胞移植、嵌合抗原受体 T (CAR-T) 疗法和其他非细胞疗法对无症状患者或病毒脱落时间较长的患者的重要性。推迟治疗以避免发展为严重 COVID-19 的风险不再被视为强制性要求，而应权衡患者治疗的紧迫性、推迟治疗对潜在疾病复发或进展风险的影响、免疫功能低下的程度、缓解状态与使用抗病毒药物和/或单克隆抗体控制病毒复制的可能性。在诊断部分，新建议强调需要对新出现的（亚）变异株的核酸检测和快速抗原检测进行监测和外部质量保证。虽然鼻咽标本的核酸检测仍然是参考，但使用侵入性较小的样本（如口咽漱口水或唾液）只对有症状的患者才是一种可靠的替代方法。取样
意大利产科调查的前瞻性队列研究-IRIS
目标：关于SARS-COV-2 Omicron变体对接种疫苗和未接种疫苗的孕妇的影响的证据很少。根据疫苗保护，这项研究旨在比较意大利的Omicron波浪中感染SARS-COV-2的妇女的孕产妇和围产期结局。方法：这项国家前瞻性队列研究在2022年1月1日至5月31日住院后7天内招募了SARS-COV-2鼻咽为正的孕妇。怀孕期间至少接受了一剂疫苗的妇女，以及第一次助推器完成疫苗周期的妇女被认为是免受中度或重度COVID-19（MSCD）的保护。多变量逻辑回归模型评估了疫苗保护与疾病严重程度之间的关联。产妇年龄，教育水平，公民身份，出生领域，以前的合并症和肥胖症被分析为潜在的危险因素。结果：MSCD很少见（41/2147，1.9％; 95％CI，1.4 E 2.6），并且未经保护的妇女的开发几率明显更高（OR，2.78; 95％CI，1.39 E 5.57）。与受保护的妇女（n¼1069）相比，未受保护的（n¼1078）更年轻，教育程度较低和外国人。在先前合并症（OR，2.86; 95％CI，1.34 E 6.12）和出生在亚洲国家（OR，3.05; 95％CI，1.23 E 7.56）的女性中发现了MSCD的较高概率。与温和病例相比，MSCD女性的早产百分比更高（32.0％[8/25]，而8.4％[161/1917]，p <0.001）以及剖宫产的百分比（52.0％[13/25] ves 31.6％[606/1919]，p 0.0029）。讨论：尽管严重的母亲和围产期结局很少见，但其患病率显着 - 没有疫苗保护的妇女较高。怀孕期间的疫苗接种有可能保护母亲和婴儿，因此强烈建议使用。Edoardo Corsi Exenti，Clin Microbiol Infect 2023; 29：772©2023欧洲临床微生物学和传染病学会。由Elsevier Ltd.发布的所有权利保留。
给药四价活体流感疫苗
flumist®四价是鼻内喷雾剂，不用于注射。该产品以牢固的设备的“喷雾器”提供，该设备看起来像是注射器，一端是带有尖端保护器的注射器，另一端带有剂量分隔夹的柱塞。详细信息和有关如何管理产品的图表包含在产品专着中。1 1。卸下橡胶尖端保护器。请勿在喷雾器的另一端卸下剂量分解夹。2。将接收者直立地坐着，将喷雾器的尖端放在鼻孔内，以确保将疫苗输送到鼻子中。3。在一个运动中，尽可能快地将柱塞降低，直到剂量分解夹使您无法进一步前进。4。紧缩并从柱塞上取出剂量分隔夹。5。将喷雾器的尖端放在另一个鼻孔的内部，并用单个运动尽快将柱塞降低以输送其余疫苗。经常询问与LAIV-Q管理有关的问题，如果孩子在接受LAIV-Q后直接打喷嚏怎么办？加拿大免疫指南支持，如果疫苗受体在给药后立即打喷嚏，则不应重复剂量。病毒与上皮细胞的结合非常迅速，并且疫苗中的病毒颗粒多于建立免疫力所需的。因此，用LAIV-Q免疫后会打喷嚏或吹鼻子不会影响免疫力。2如果孩子在同一鼻孔中同时接受半剂量的LAIV-Q怎么办？建议将LAIV-Q用于2个分裂的喷雾剂（进入每个鼻孔0.1 mL），以最大化鼻咽上皮细胞的接触表面积。没有使用单核管理进行临床试验。但是，无需重复免疫，因为每半剂量（0.1 mL）包含足够的病毒颗粒以诱导免疫反应。3如果在LAIV-Q管理期间，将儿童喷在眼睛而不是鼻孔中该怎么办？立即用水或盐水冲洗区域；如果刺激持续存在，则指的是医师评估可能的结膜炎。如果将LAIV-Q剂量的至少一半（0.1 mL）施用到鼻孔中，则当时客户不需要进一步的疫苗。但是，如果疫苗剂量的一半进入眼睛，则应提供剂量的第二半（0.1 mL）。如果当时孩子或
SARS-COV-2检测试剂套件 - 使用说明
Intended Use The SARS-CoV-2 DETECTR TM Reagent Kit is a CRISPR-based, reverse transcription and loop- mediated amplification (RT-LAMP) test intended for the qualitative detection of nucleic acid from the SARS-CoV-2 in upper respiratory specimens (nasopharyngeal swabs, oropharyngeal (throat) swabs, mid-turbinate nasal swabs, anterior nasal棉签，鼻咽清洗/抽吸物或鼻吸血鬼来自其医疗保健提供者涉嫌Covid-19的个体。测试仅限于根据1988年临床实验室改进修正案（CLIA）的实验室，美国法典42。§263a，满足执行高复杂性测试的要求。结果用于检测SARS-COV-2 RNA。在急性感染期间，通常可以在呼吸标本中检测到SARS-COV-2 RNA。阳性结果表明存在SARS-COV-2 RNA；为了确定患者感染状况，必须与患者病史和其他诊断信息进行临床相关性。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒的共同感染。检测到的药物可能不是疾病的明确原因。美国及其领土的实验室必须向适当的公共卫生当局报告所有结果。负面结果并不排除SARS-COV-2感染，不应用作患者管理决策的唯一基础。负面结果必须与临床观察，患者病史和流行病学信息相结合。SARS-COV-2检测TM试剂盒仅在食品药物管理局的紧急使用授权下使用。SARS-COV-2检测TM试剂盒旨在由合格的临床实验室人员使用，专门指导和培训了RT-LAMP，CRISPR检测和体外诊断程序的技术。摘要和解释于2019年12月31日向中国湖北省武汉市的世界卫生组织报告了无法解释的肺炎病例的爆发。爆发的原因被确定为一种新颖的冠状病毒，该病毒最初名为2019-NCOV（1），然后更名为SARS冠状病毒2（SARS-COV-2）（2）（2）。爆发首先在中国境内，然后在全球多个国家中传播。SARS-COV-2引起的疾病被世界卫生组织命名为Covid-19，该病毒现在是全球大流行感染的原因，超过1,760万人，截至2020年8月1日，全球67.9万人死亡。尽管大多数感染是无症状或仅与轻度疾病有关（80％）（3,4），但一些Covid-19患者可能会出现严重的肺炎，导致死亡，在老年人和/或患有