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新研究发现微生物组在全球范围内相互关联
一项研究发现，通用微生物通过基因转移将不同的生态系统连接起来，揭示了它们在全球微生物组中的作用。这强调需要对人类之外的地球健康有一个整体的看法。
来源:Scientific Inquirer在《Cell》杂志上发表的一项新研究中，EMBL 海德堡博克小组的科学家们揭示，生活在相似栖息地的微生物比生活在同一地理区域的微生物更加相似。通过分析数以万计的宏基因组，研究小组发现，虽然大多数微生物适应特定的生态系统，但一种被称为“通才”的罕见子集可以在截然不同的栖息地中繁衍生息。
通才以生态耐受性而闻名，能够从一个栖息地迁移到另一个栖息地，与其他微生物相互作用并将其基因转移到其他微生物，从而创建团队所描述的相互关联的全球微生物组网络。
更全面地了解微生物组
到目前为止，由于全球分析带来的技术和后勤限制，大多数大规模微生物组研究都是在特定的生态系统基础上进行的。 EMBL 的科学家及其国际合作伙伴最近开发了 SPIRE（可搜索的行星规模微生物组资源）等数据库，使全球范围的研究变得更加可行。
作为一个公开可用的数据库，SPIRE 集成、处理和注释了来自世界各地不同栖息地的微生物数据。 EMBL 研究人员利用 SPIRE 数据库中的 85,604 个宏基因组样本，确定了 40 种不同的微生物栖息地类型。
“我们不是假设哪些环境驱动因素塑造了微生物组结构，而是让微生物自己告诉我们，”EMBL 研究科学家、该论文的共同第一作者 Daniel Podlesny 说。 “我们量化了数据集中每个微生物组与所有其他微生物组的相似性，并确定了 40 个组成相似的微生物组簇，每个簇都包含来自多个独立研究的数百到数千个样本。然后，我们使用 Metalog 数据库中精选的上下文元数据，确定了簇内微生物组的共同点，例如宿主年龄或海洋温度。”
通才微生物作为遗传“桥梁”