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ProVenTL:用于预测源自蛇毒的肽-蛋白质相互作用的迁移学习框架,用于癌症治疗

ProVenTL: a transfer-learning framework for predicting peptide–protein interactions derived from snake venom for cancer therapeutics

ProVenTL:用于预测来自蛇毒的肽-蛋白质相互作用用于癌症治疗的迁移学习框架摘要肽-蛋白质相互作用(PepPI)的准确预测对于推进基于肽的抗癌药物设计至关重要。在本研究中,我们介绍了 ProVenTL,这是一种计算机辅助分子设计框架,它利用迁移学习和蛋白质语言模型嵌入来增强 PepPI 预测的准确性和可解释性。探索了两种互补策略:(i) 使用 Calloselasma rhodostoma 毒液肽和癌症相关蛋白的精选数据集对来自蛋白质数据库 (PDB) 的大规模 PepPI 数据进行预训练的 CAMP 模型,以及 (ii) 将 ProtT5 嵌入与堆叠自动编码器深度神经网络 (SAE-DN

识别法学硕士的大规模互动

Identifying Interactions at Scale for LLMs

了解复杂机器学习系统的行为,特别是大型语言模型 (LLM),是现代人工智能的一项关键挑战。可解释性研究旨在使决策过程对模型构建者和受影响的人类更加透明,这是迈向更安全、更值得信赖的人工智能的一步。为了获得全面的理解,我们可以通过不同的视角来分析这些系统:特征归因,它隔离驱动预测的特定输入特征(Lundberg & Lee,2017;Ribeiro et al.,2022);数据归因,将模型行为与有影响力的训练示例联系起来(Koh&Liang,2017;Ilyas 等人,2022);以及机械可解释性,它剖析了内部组件的功能(Conmy 等人,2023;Sharkey 等人,2025)。在这些观点