使用 Biomni 工具和 Amazon Bedrock AgentCore Gateway 构建生物医学研究代理

在这篇文章中,我们演示了如何通过将 Biomni 的专业工具与 Amazon Bedrock AgentCore Gateway 集成来构建可投入生产的生物医学研究代理,使研究人员能够通过安全、可扩展的基础设施访问 30 多个生物医学数据库。该实施展示了如何将研究原型转变为具有持久记忆、语义工具发现和科学再现性的综合可观察性的企业级系统。

来源:亚马逊云科技 _机器学习
这篇文章是与斯坦福大学 Biomni 小组共同撰写的。生物医学研究人员大约 90% 的时间都花在手动处理大量分散的信息上。 Genentech 面临的挑战就是证明这一点:处理 PubMed 中的 3800 万份生物医学出版物、人类蛋白质图谱等公共存储库,以及涉及数百种疾病的数亿细胞的内部存储库。跨不同模式(包括基因组学、蛋白质组学和病理学)的专业数据库和分析工具迅速激增。研究人员必须跟上各种工具的潮流,减少用于推动突破性发现的假设驱动工作的时间。由基础模型驱动的人工智能代理通过自主规划、执行和调整复杂的研究任务,提供了一种有前景的解决方案。斯坦福大学的研究人员构建的 Biomni 证明了这种潜力。 Biomni 是一种通用生物医学 AI 代理,集成了 150 个专用工具、105 个软件包和 59 个数据库,用于执行复杂的分析,例如基因优先级排序、药物再利用和罕见疾病诊断。但是,在生产中部署此类代理需要强大的基础设施,能够处理计算密集型工作流程和多个并发用户,同时保持安全和性能标准。 Amazon Bedrock AgentCore 是一套综合服务,可使用任何框架或模型部署和操作高性能代理,并具有企业级安全性和可扩展性。在这篇文章中,我们将向您展示如何使用 AgentCore 实现研究代理,并访问 Biomni 的 30 多种专业生物医学数据库工具,从而加速科学发现,同时保持企业级安全性和生产规模。此解决方案的代码可在 Amazon Web Services (AWS) 上生命科学入门代理的开源工具包存储库中找到。分步说明